2023年度腫瘤單細(xì)胞與空間多組學(xué)研究進(jìn)展盤點(diǎn)

呂藝蓁 孫世權(quán)，3

作者單位：710061 西安 1.西安交通大學(xué)公共衛(wèi)生學(xué)院?jiǎn)渭?xì)胞組學(xué)與健康研究中心；2.陜西省絲路區(qū)域地方病與健康促進(jìn)協(xié)同創(chuàng)新中心；3.西安交通大學(xué)環(huán)境與疾病相關(guān)基因教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室

腫瘤是由環(huán)境與基因交互而形成的一種非傳染性復(fù)雜疾病。世界衛(wèi)生組織最新報(bào)道，癌癥仍是全球主要的致死疾病之一［1］，且部分癌癥新發(fā)病例數(shù)呈逐年上升趨勢(shì)，嚴(yán)重危害了人民的生命健康，是當(dāng)前重大的公共衛(wèi)生問(wèn)題。腫瘤的發(fā)生、發(fā)展與轉(zhuǎn)歸通常要經(jīng)歷（非必須）癌前病變演變?yōu)槟[瘤，原位到轉(zhuǎn)移擴(kuò)散，干預(yù)后產(chǎn)生耐藥性，康復(fù)與預(yù)后等過(guò)程［2］。在這些過(guò)程中常會(huì)涉及基因組、表觀遺傳組、轉(zhuǎn)錄組、蛋白質(zhì)組和代謝組等多層面組學(xué)連續(xù)分子變化及調(diào)控［3］。在過(guò)去10 年里，單細(xì)胞與空間多組學(xué)技術(shù)在繪制腫瘤細(xì)胞圖譜、解析腫瘤異質(zhì)性、探究腫瘤微環(huán)境和臨床應(yīng)用等方面取得了重要突破。在2023 年度，單細(xì)胞與空間多組學(xué)創(chuàng)新技術(shù)曾多次被報(bào)道，如單細(xì)胞代謝組學(xué)被國(guó)際期刊Nature評(píng)為2023 年值得關(guān)注的7項(xiàng)技術(shù)之一［4］，單細(xì)胞組學(xué)與空間多組學(xué)技術(shù)則再次被NatureMethods雜志評(píng)為2023年度最值得關(guān)注技術(shù)之一［5］。在腫瘤應(yīng)用方面，2023年腫瘤單細(xì)胞與空間多組學(xué)技術(shù)相關(guān)論文共發(fā)表3 586篇，相較于2022年的2 745篇及2021 年的2 006 篇，數(shù)量持續(xù)增加，可見(jiàn)腫瘤單細(xì)胞與空間多組學(xué)技術(shù)的研究熱度仍處于迅速增長(zhǎng)期，這一趨勢(shì)不僅反映了單細(xì)胞與空間多組學(xué)技術(shù)在腫瘤研究中得到認(rèn)可，也標(biāo)志著新技術(shù)在揭示腫瘤發(fā)展復(fù)雜機(jī)制方面的重要性。本文針對(duì)2023 年度單細(xì)胞與空間多組學(xué)技術(shù)在腫瘤細(xì)胞圖譜、腫瘤異質(zhì)性、腫瘤微環(huán)境和臨床應(yīng)用與藥物研發(fā)中的應(yīng)用研究進(jìn)展進(jìn)行盤點(diǎn)與討論。

1 腫瘤細(xì)胞圖譜

人類腫瘤圖譜網(wǎng)絡(luò)（human tumor atlas network，HTAN）啟動(dòng)于2018年9月，這項(xiàng)研究計(jì)劃從時(shí)間及空間方面在單細(xì)胞分辨率上對(duì)腫瘤發(fā)展過(guò)程進(jìn)行闡述和總結(jié)，構(gòu)建了單細(xì)胞多參數(shù)縱向網(wǎng)絡(luò)圖譜并將其與臨床結(jié)果相結(jié)合，這有利于識(shí)別新的生物標(biāo)志物以及疾病相關(guān)細(xì)胞類型、細(xì)胞狀態(tài)和癌變過(guò)程的細(xì)胞相互作用，從而有助于腫瘤的預(yù)防和治療［2］。2023 年11 月20 日發(fā)布的最新數(shù)據(jù)（4.1 版本）包括了來(lái)自21 個(gè)主要腫瘤部位的腫瘤樣本，以及20 種不同類型的檢測(cè)手段的組學(xué)數(shù)據(jù)［6］。

在2023 年度，泛癌細(xì)胞圖譜研究依舊具有較高熱度。自然殺傷（natural killer，NK）細(xì)胞在對(duì)抗腫瘤進(jìn)展的免疫反應(yīng)中發(fā)揮著重要作用。有研究納入516例癌癥患者涵蓋24種癌癥類型的NK 細(xì)胞單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)，系統(tǒng)刻畫了泛癌細(xì)胞圖譜中NK 細(xì)胞在不同癌癥類型之間的共性與特性，發(fā)現(xiàn)了一群在腫瘤中特異性富集的NK 細(xì)胞群，其表現(xiàn)出抗腫瘤功能受損，且與不良預(yù)后和免疫治療耐藥性相關(guān)，顯示了NK細(xì)胞亞群作為潛在治療靶點(diǎn)的臨床價(jià)值［7］。腫瘤浸潤(rùn)T 細(xì)胞是腫瘤免疫微環(huán)境的重要組成部分，且其抗腫瘤功效已被證實(shí)［8］，但其狀態(tài)尚未完全確定。有研究通過(guò)繪制來(lái)自16 種癌癥類型的308 048 個(gè)T 細(xì)胞的轉(zhuǎn)錄圖譜，發(fā)現(xiàn)了一種以表達(dá)熱休克蛋白基因等應(yīng)激相關(guān)基因?yàn)樘卣鞯腡 細(xì)胞應(yīng)激反應(yīng)狀態(tài)（TSTR），這種細(xì)胞的高表達(dá)與免疫檢查點(diǎn)阻斷治療無(wú)響應(yīng)有關(guān)［9］。還有研究通過(guò)建立泛癌細(xì)胞圖譜發(fā)現(xiàn)了41 個(gè)不同腫瘤的共有元程序，每一個(gè)元程序都由數(shù)10 個(gè)基因組成，這些基因在許多腫瘤的細(xì)胞亞群中協(xié)調(diào)上調(diào)，這一泛癌細(xì)胞圖譜的構(gòu)建為精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)研究提供了新的思路［10］。此外，有研究建立了泛癌單細(xì)胞表觀遺傳和單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組圖譜，揭示了不同癌癥和正常組織的細(xì)胞類型，通過(guò)將腫瘤基因的表達(dá)與增強(qiáng)子的可及性相關(guān)聯(lián)，評(píng)估了腫瘤基因的表觀遺傳調(diào)控［11］。

空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)與單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)的整合分析研究，可從空間維度構(gòu)建腫瘤細(xì)胞圖譜，有助于研究者更全面地了解腫瘤的發(fā)生、發(fā)展過(guò)程。有研究對(duì)31 例結(jié)直腸癌患者樣本的免疫熒光、空間轉(zhuǎn)錄組及單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組進(jìn)行分析，構(gòu)建了結(jié)直腸癌演化的分子圖譜，揭示了結(jié)直腸癌細(xì)胞的個(gè)體化生長(zhǎng)軌跡［12］。另有研究通過(guò)將組織學(xué)與通過(guò)循環(huán)免疫熒光（cyclic immunofluorescence，CyCIF）獲得的單細(xì)胞成像數(shù)據(jù)相結(jié)合，繪制了結(jié)直腸癌的二維圖譜，并將二維圖譜拼接重建三維圖譜，這有助于更加深入理解有關(guān)正常組織和結(jié)直腸癌組織之間的差異以及腫瘤異質(zhì)性等關(guān)鍵問(wèn)題［13］。

2 腫瘤異質(zhì)性

腫瘤異質(zhì)性可分為腫瘤間異質(zhì)性（intertumoral heterogeneity）和腫瘤內(nèi)異質(zhì)性（intratumor heterogeneity）。腫瘤內(nèi)異質(zhì)性源于腫瘤細(xì)胞間的遺傳以及表觀遺傳等產(chǎn)生表型的差異，對(duì)腫瘤細(xì)胞耐藥和癌癥治療研究至關(guān)重要［14］。即使是來(lái)自同一腫瘤的癌細(xì)胞，也可能在其基因組、轉(zhuǎn)錄組和蛋白質(zhì)組水平上展現(xiàn)出細(xì)胞（表型）異質(zhì)性。單細(xì)胞組學(xué)技術(shù)可用于研究細(xì)胞異質(zhì)性（cellular heterogeneity），揭示瘤內(nèi)細(xì)胞的遺傳和表型差異，即細(xì)胞狀態(tài)或細(xì)胞分群。同時(shí)，細(xì)胞并非游離存在于組織中，而是具有時(shí)空特異性。空間組學(xué)技術(shù)主要用于解析空間異質(zhì)性（spatial heterogeneity）。但現(xiàn)有的空間組學(xué)技術(shù)在分辨率和基因水平通量上不能兼顧［15］。空間組學(xué)技術(shù)與單細(xì)胞組學(xué)聯(lián)合分析為探索腫瘤異質(zhì)性提供了一個(gè)多維度、全面的視角，因?yàn)橥ㄟ^(guò)整合分析，有望提高空間組學(xué)數(shù)據(jù)的分辨率。因此，通過(guò)單細(xì)胞與空間多組學(xué)技術(shù)研究腫瘤內(nèi)異質(zhì)性已成為當(dāng)前癌癥研究領(lǐng)域一大熱點(diǎn)［16-18］。

在2023 年度，研究者針對(duì)腫瘤亞型的組織病理分層解析腫瘤異質(zhì)性的不足，采用成像質(zhì)譜流式細(xì)胞術(shù)（imaging mass cytometry，IMC）和單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序技術(shù)來(lái)表征416 例肺腺癌患者樣本的腫瘤和免疫學(xué)景觀，通過(guò)深度學(xué)習(xí)模型，僅用1 mm2大小的腫瘤就可以準(zhǔn)確地預(yù)測(cè)患者術(shù)后病情進(jìn)展［19］。眾所周知，癌細(xì)胞轉(zhuǎn)移是癌癥死亡的主要原因，但是原發(fā)腫瘤與轉(zhuǎn)移到靶器官腫瘤的差異性目前尚未明確。有研究利用單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組技術(shù)對(duì)結(jié)直腸癌肝臟轉(zhuǎn)移或卵巢轉(zhuǎn)移進(jìn)行研究，發(fā)現(xiàn)一群PTPRO 和ASCL2 的干細(xì)胞樣細(xì)胞群與腫瘤轉(zhuǎn)移密切相關(guān)，這對(duì)闡明結(jié)直腸癌轉(zhuǎn)移機(jī)制至關(guān)重要［20］。也有研究對(duì)原發(fā)性胰腺導(dǎo)管腺癌和肝轉(zhuǎn)移的腫瘤細(xì)胞進(jìn)行單細(xì)胞數(shù)據(jù)分析，發(fā)現(xiàn)CEACAM5/CEACAM6 導(dǎo)管細(xì)胞的積累與低生存率相關(guān)，提示其可能與促進(jìn)腫瘤發(fā)展有關(guān)［16］。還有研究發(fā)現(xiàn)肌纖維母細(xì)胞的癌癥相關(guān)成纖維細(xì)胞RGS5亞群可能在原發(fā)性胰腺導(dǎo)管腺癌轉(zhuǎn)移中發(fā)揮關(guān)鍵作用［21］。此外，大量的腫瘤單細(xì)胞數(shù)據(jù)產(chǎn)生也對(duì)區(qū)分腫瘤細(xì)胞的惡性和非惡性提出了挑戰(zhàn)。為此，有研究者開(kāi)發(fā)了scATOMIC 工具，其在區(qū)分惡性和非惡性細(xì)胞以及預(yù)測(cè)轉(zhuǎn)移性癌癥的原發(fā)腫瘤來(lái)源方面有所幫助［22］。

3 腫瘤微環(huán)境

腫瘤內(nèi)的異質(zhì)性強(qiáng)調(diào)了細(xì)胞或細(xì)胞群的差異性，而腫瘤微環(huán)境則強(qiáng)調(diào)腫瘤發(fā)生、發(fā)展的系統(tǒng)性［23］。腫瘤微環(huán)境由免疫細(xì)胞、間質(zhì)細(xì)胞、活性介質(zhì)及腫瘤細(xì)胞組成，可分為免疫細(xì)胞為主的免疫微環(huán)境和成纖維細(xì)胞為主的非免疫微環(huán)境。單細(xì)胞與空間多組學(xué)技術(shù)為深入剖析腫瘤微環(huán)境中的細(xì)胞多樣性和復(fù)雜性，明確腫瘤發(fā)生、發(fā)展及腫瘤逃逸機(jī)制等提供了新的途徑［24-27］。

腫瘤免疫微環(huán)境中細(xì)胞之間的交互形成了腫瘤獨(dú)特的生長(zhǎng)環(huán)境，維持了腫瘤的生長(zhǎng)并促成了腫瘤細(xì)胞的免疫逃逸。在2023 年度，有研究通過(guò)單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)對(duì)早期ER+乳腺癌連續(xù)活檢中的腫瘤相關(guān)細(xì)胞群的“對(duì)話”形式進(jìn)行研究，發(fā)現(xiàn)在癌細(xì)胞進(jìn)化過(guò)程中腫瘤細(xì)胞通過(guò)上調(diào)多種細(xì)胞因子和生長(zhǎng)因子，刺激巨噬細(xì)胞向免疫抑制表型分化，從而獲得對(duì)治療的耐藥性［28］。另有研究通過(guò)對(duì)肺腺癌患者的腫瘤免疫微環(huán)境的空間特征進(jìn)行分析，量化了細(xì)胞空間交互關(guān)系，表征了細(xì)胞之間的直接相互作用和通信模式，同時(shí)使用深度學(xué)習(xí)預(yù)測(cè)臨床表征，以輔助術(shù)后治療方案的制定［19］。腫瘤細(xì)胞的起源及隨時(shí)間動(dòng)態(tài)演化的過(guò)程一直是研究者們關(guān)注的問(wèn)題，但限于當(dāng)前技術(shù)，只能通過(guò)計(jì)算手段進(jìn)行推測(cè)［29-30］。為了解決這一問(wèn)題，有研究開(kāi)發(fā)了一種捕獲細(xì)胞動(dòng)態(tài)的實(shí)證體內(nèi)基因組技術(shù)Zman-seq，其主要用于估計(jì)腫瘤組織中不同免疫細(xì)胞亞群的豐度以及腫瘤微環(huán)境中免疫細(xì)胞狀態(tài)的演化過(guò)程［31］。該技術(shù)在揭示腫瘤免疫微環(huán)境的復(fù)雜性以及免疫治療反應(yīng)方面發(fā)揮著重要作用。

腫瘤的形成不僅與免疫細(xì)胞有關(guān)，而且與非免疫細(xì)胞和細(xì)胞外基質(zhì)的生態(tài)進(jìn)化密切相關(guān)。一項(xiàng)對(duì)乳腺癌的研究通過(guò)整合單細(xì)胞數(shù)據(jù)與空間蛋白組數(shù)據(jù)，確定了9種成纖維細(xì)胞亞型和1類周細(xì)胞的標(biāo)記基因及空間分布，輔助在不同研究中比較成纖維細(xì)胞亞型，以促進(jìn)對(duì)其功能作用的分析［32］。也有研究通過(guò)分析多種常見(jiàn)癌癥，繪制了成纖維細(xì)胞空間分布模式以及與腫瘤微環(huán)境錯(cuò)綜復(fù)雜的細(xì)胞網(wǎng)絡(luò)［33-34］，為開(kāi)發(fā)新的治療策略提供了思路。此外，腫瘤細(xì)胞與其他細(xì)胞之間的交流在腫瘤發(fā)生、惡化和轉(zhuǎn)移中也發(fā)揮著不可替代的作用［35］。對(duì)于胰腺導(dǎo)管腺癌的惡性進(jìn)展，有研究發(fā)現(xiàn)施萬(wàn)細(xì)胞（Schwann cell）通過(guò)Midkine 信號(hào)和白細(xì)胞介素-1α 促進(jìn)胰腺導(dǎo)管腺癌和相關(guān)成纖維細(xì)胞向更惡性的亞型轉(zhuǎn)化［36］。此外，2023年度有研究者發(fā)布了一種實(shí)驗(yàn)-數(shù)學(xué)方法，其將腫瘤微環(huán)境分解為相互作用的細(xì)胞類型相關(guān)小回路，通過(guò)識(shí)別小回路，可以簡(jiǎn)化腫瘤微環(huán)境的復(fù)雜性，從而更好地促進(jìn)對(duì)腫瘤微環(huán)境的認(rèn)識(shí)［37］。

病理切片是解讀腫瘤微環(huán)境的傳統(tǒng)方式，隨著數(shù)字化病理技術(shù)的發(fā)展［38-39］，病理切片與單細(xì)胞組學(xué)數(shù)據(jù)的整合分析為解析復(fù)雜腫瘤微環(huán)境提供了一種新的思路。有研究通過(guò)對(duì)單細(xì)胞形態(tài)學(xué)和拓?fù)鋵W(xué)進(jìn)行建模分析，然后對(duì)腫瘤生態(tài)系統(tǒng)進(jìn)行表征，揭示了人類乳腺癌生態(tài)系統(tǒng)細(xì)胞多樣性及不同乳腺癌生態(tài)型之間的關(guān)聯(lián)，這為了解乳腺癌提供了重要見(jiàn)解［40］。

4 在臨床應(yīng)用與藥物研發(fā)中的應(yīng)用

單細(xì)胞與空間多組學(xué)技術(shù)能準(zhǔn)確獲取單個(gè)細(xì)胞特有的信息表征，并針對(duì)體內(nèi)的不同細(xì)胞類型及其分子機(jī)制進(jìn)行深入研究，準(zhǔn)確定位腫瘤標(biāo)志物，發(fā)現(xiàn)有效藥物靶點(diǎn)。單細(xì)胞與空間多組學(xué)技術(shù)已經(jīng)廣泛應(yīng)用于腫瘤細(xì)胞克隆演化機(jī)制［12］、腫瘤分型［41］、新生物標(biāo)志物鑒定［42］以及耐藥性產(chǎn)生機(jī)制［43］等研究。對(duì)腫瘤患者進(jìn)行單細(xì)胞測(cè)序圖譜分析，可以確定不同分類患者（如疾病分期、分子分型）腫瘤微環(huán)境的差異，或有反應(yīng)和無(wú)反應(yīng)患者的差異，以更好地理解治療的作用機(jī)制，并在此基礎(chǔ)上開(kāi)發(fā)針對(duì)性標(biāo)志物以及新的治療靶點(diǎn)［44］。

免疫療法已經(jīng)改變了許多腫瘤的治療手段［45-48］，遺憾的是，這種治療只對(duì)部分患者有效，而單細(xì)胞組學(xué)技術(shù)能發(fā)現(xiàn)用于預(yù)測(cè)患者對(duì)免疫療法治療效果和毒性反應(yīng)的生物標(biāo)志物［49-50］。免疫檢查點(diǎn)分子在調(diào)節(jié)免疫激活與抑制的平衡中發(fā)揮關(guān)鍵作用，它們?cè)谡Ｉ頎顟B(tài)下有助于自身耐受和免疫防御，但在腫瘤患者中，這些分子的表達(dá)增加會(huì)導(dǎo)致免疫逃逸。最新研究通過(guò)單細(xì)胞CRISPR篩選揭示了因果基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)，發(fā)現(xiàn)了與細(xì)胞毒性T 細(xì)胞分化相關(guān)的檢查點(diǎn)［51］。另有研究對(duì)接受免疫檢查點(diǎn)阻斷治療的患者通過(guò)整合單細(xì)胞與空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)繪制T 細(xì)胞圖譜，發(fā)現(xiàn)了一群以熱休克蛋白高表達(dá)為特征的TSTR細(xì)胞，并推測(cè)其可能在免疫治療抵抗中發(fā)揮重要作用［9］。

識(shí)別不同的刺激抗腫瘤免疫應(yīng)答的方法對(duì)豐富免疫療法工具庫(kù)以及為患者提供更多和更有效的治療選擇也至關(guān)重要。為了能有效預(yù)測(cè)患者對(duì)免疫療法的反應(yīng)，提高抗腫瘤療效，有研究通過(guò)對(duì)膠質(zhì)母細(xì)胞瘤樣本進(jìn)行單細(xì)胞和空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)分析，發(fā)現(xiàn)了一種與腫瘤相關(guān)的巨噬細(xì)胞亞群，該亞群高度表達(dá)免疫抑制SIGLEC9基因，并優(yōu)先在抗PD-1 治療無(wú)效的患者中聚集［52］。該研究進(jìn)一步通過(guò)敲除SIGLEC9 在小鼠中的同源基因Siglece，發(fā)現(xiàn)可顯著抑制腫瘤發(fā)展并延長(zhǎng)生存期，此外敲除Siglece基因的小鼠與抗PD-1/PD-L1 療法協(xié)同作用而有效減少了膠質(zhì)母細(xì)胞瘤的生長(zhǎng)，這一結(jié)果有望促進(jìn)其免疫檢查點(diǎn)阻滯療法向更好和更安全的方向發(fā)展。

在藥物研發(fā)方面，已有研究發(fā)現(xiàn)，即使在完全相同的癌細(xì)胞中，通過(guò)藥物干預(yù)仍會(huì)有一部分細(xì)胞產(chǎn)生耐藥［53］，因此耐藥產(chǎn)生的具體過(guò)程仍有待研究。為此，研究人員開(kāi)發(fā)了一種新的單細(xì)胞標(biāo)記技術(shù)FateMap［54］。該研究發(fā)現(xiàn)從單個(gè)癌細(xì)胞衍生的細(xì)胞會(huì)產(chǎn)生在分子、形態(tài)和功能上不同類型的耐藥性，從而導(dǎo)致了耐藥類型的多樣性。這為單細(xì)胞衍生的癌癥細(xì)胞系和接受多種藥物治療后觀察細(xì)胞中的耐藥性提供了證據(jù)。

5 小結(jié)

近年來(lái)，單細(xì)胞與空間多組學(xué)技術(shù)的迅猛發(fā)展，為探索腫瘤生物學(xué)機(jī)制提供了更廣闊的空間。相比于傳統(tǒng)多組學(xué)數(shù)據(jù)，單細(xì)胞與空間多組學(xué)數(shù)據(jù)在解析腫瘤起源與腫瘤異質(zhì)性、腫瘤微環(huán)境和藥物研發(fā)與臨床轉(zhuǎn)化等方面具有不可替代的優(yōu)勢(shì)［55］。然而，早期單細(xì)胞與空間多組學(xué)技術(shù)在腫瘤方面的應(yīng)用仍存在一些挑戰(zhàn)。第一，單細(xì)胞與空間多組學(xué)數(shù)據(jù)獲取成本高且受限制。一方面，實(shí)施這些高級(jí)技術(shù)可能涉及昂貴的儀器和設(shè)備，并需要大量資源。另一方面，該組學(xué)技術(shù)成熟度低、穩(wěn)定性弱且較新的單細(xì)胞平臺(tái)認(rèn)可度不高，導(dǎo)致技術(shù)推廣難度大、技術(shù)革新緩慢、數(shù)據(jù)獲取成本居高不下。第二，腫瘤組織樣本異質(zhì)性高，但缺少規(guī)范化和標(biāo)準(zhǔn)化流程。由于腫瘤組織涉及全器官，不同組織的解離方案、新鮮組織單細(xì)胞懸液制備還是單細(xì)胞抽核等方案的選擇問(wèn)題，會(huì)因課題設(shè)計(jì)或課題目標(biāo)不同而各異。不同的課題設(shè)計(jì)，組學(xué)數(shù)據(jù)和技術(shù)平臺(tái)的選擇也隨之不同。例如，單細(xì)胞和空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)非常適合在無(wú)偏細(xì)胞群體中進(jìn)行全基因組分析，而單細(xì)胞蛋白質(zhì)組學(xué)更適合于旨在對(duì)已知的分子靶點(diǎn)和細(xì)胞類型進(jìn)行概要的研究。因此，如何規(guī)范課題設(shè)計(jì)是獲取可信研究結(jié)果的關(guān)鍵。第三，單細(xì)胞與空間多組學(xué)數(shù)據(jù)處理難，但缺少有效的數(shù)據(jù)分析技術(shù)和規(guī)范。目前，已開(kāi)發(fā)了眾多用于單細(xì)胞與空間多組學(xué)數(shù)據(jù)分析的工具，如何選擇適合課題設(shè)計(jì)的分析方法是獲取可靠研究結(jié)果的基礎(chǔ)［56］。在2023 年，針對(duì)以上3 方面的挑戰(zhàn)，腫瘤單細(xì)胞與空間組學(xué)技術(shù)也有了突破性進(jìn)展，這為將來(lái)深入探索腫瘤發(fā)生、發(fā)展，以及該技術(shù)的臨床應(yīng)用奠定堅(jiān)實(shí)基礎(chǔ)。

腫瘤單細(xì)胞與空間組學(xué)技術(shù)的快速迭代更新無(wú)疑為精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)研究開(kāi)辟了新的思路。在未來(lái)的研究中，該技術(shù)可能在癌癥免疫療法（CAR-T）、類器官腫瘤細(xì)胞異質(zhì)性研究及類器官抗腫瘤藥物篩選中發(fā)揮重要作用。盡管實(shí)現(xiàn)腫瘤防治的終極目標(biāo)還有很長(zhǎng)的路要走，但是我們堅(jiān)信腫瘤單細(xì)胞和空間多組學(xué)技術(shù)的研究將是這一旅程中的重要加速器。