2020—2022年閩粵贛地區PRRSVORF5基因的分子流行病學調查

呂紫欣, 張鑫杰, 薛少華, 金艷冬, 陳林熙, 黃喜榮, 羅國清, 蒙 寧, 陳 瑤, 戴愛玲,4

(1.福建農林大學動物科學學院,福建 福州 350002;2.龍巖學院生命科學學院,福建 龍巖 364012; 3.三明市動物疫病預防控制中心,福建 三明365001;4.福建省生豬疫病防控工程技術研究 中心/福建省家畜傳染病防治與生物技術重點實驗室,福建 龍巖 364012)

豬繁殖與呼吸綜合征是由豬繁殖與呼吸綜合征病毒(porcine reproductive and respiratory syndrome virus, PRRSV)引起的重要病毒性疫病之一,臨床上主要導致妊娠母豬繁殖障礙以及其他階段的豬群,尤其是仔豬出現呼吸障礙等癥狀[1]。PRRSV屬于套式病毒目,是一種極易發生變異和重組的有囊膜的單股正鏈RNA病毒,包括至少10個開放閱讀框(open reading frame, ORF)。其中,ORF5基因編碼的GP5蛋白是PRRSV中最易變異的結構蛋白之一,通常作為PRRSV變異的主要依據,大量研究表明ORF5基因也可作為PRRSV基因組分型的重要依據[2-4]。

分子流行病學研究顯示,我國流行的PRRSV可分為4個譜系:譜系8(JXA1-like株、CH-1a-like株)、譜系5(VR2332-like株、BJ-4-like株)、譜系3(GM2-like株、QYYZ-like株)、譜系1(NADC30-like株、NADC34-like株)[5]。近年來,PRRSV在我國的流行變異情況愈加復雜[6],2006年我國暴發由HP-PRRSV株引起的高致病性豬繁殖與呼吸綜合征,2012年起我國陸續出現與NADC30-like株同源性較高的PRRSV,如NADC31-like株、QYYZ-like株、NADC34-like株[7]。NADC30-like株自2016年已超過HP-PRRSV株成為我國當前主要的流行毒株[8],給我國豬繁殖與呼吸綜合征的防控帶來了巨大的挑戰。

為調查閩粵贛地區PRRSV的分子流行動態,本研究收集了2020—2022年閩粵贛地區1 475份發病豬組織和血清樣品,采用實時熒光定量PCR(quantitative real-time PCR, qRT-PCR)對樣品中的PRRSV進行了病原檢測,對陽性樣品ORF5基因進行了擴增、測序、序列比對及遺傳進化分析。……