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基于CiteSpace的微小RNA在腦缺血再灌注損傷中的研究現狀及熱點分析

2024-01-12 07:17:12羅亞男李景煒李若冰梅志剛
中國醫藥科學 2023年23期
關鍵詞:可視化英文分析

羅亞男 李景煒 李若冰 梅志剛

1.三峽大學健康醫學院國家中醫藥管理局中藥藥理學三級實驗室,湖北宜昌 443002;2.湖南中醫藥大學中西醫結合心腦疾病防治湖南省重點實驗室,湖南長沙 410208

腦缺血再灌注損傷(cerebral ischemia-reperfusion injury,CIRI)是缺血性腦卒中溶栓后的二次腦損傷,具有高致殘率、高病死率的特征,目前尚無統一的防治CIRI 方法[1-4],深入揭示CIRI 發病機制并尋找其潛在的干預靶點仍是研究CIRI 的熱點。

微小RNA(microRNAs,miRNA)是一類普遍存在的內源性非編碼單鏈RNA,通過調控下游靶基因和蛋白質網絡的表達參與細胞增殖、分化、凋亡等生理過程[5-6]。隨著對miRNA 研究的不斷深入,發現其在CIRI 的發生發展過程中發揮著不可或缺的作用。目前,該領域研究越來越廣泛,但相關文獻冗雜,尚無有關miRNA 在CIRI 的知識圖譜分析。

作為一款可視化文獻分析軟件,CiteSpace 能夠顯示一個知識域在一定時期發展的趨勢與動向[7-9]。本研究運用CiteSpace 分別對國內外miRNA 在CIRI相關文獻進行可視化分析,梳理miRNA 在CIRI 的研究熱點及發展趨勢,以期為今后相關研究者提供參考和借鑒。

1 資料與方法

1.1 檢索策略

以中國知網(China national knowledge infrastructure,CKNI)和Web of Science(WoS)數據庫為本研究文獻來源;發表時間設定為建庫至2022年6 月30 日; 以“micro RNA”“mi RNA”“mi RNAs”“micro RNAs”“miR”“腦缺血再灌注損傷”“Cerebral Ischemia/Reperfusion Injury”和“Brain Ischemia-Reperfusion Injury”為檢索詞進行檢索。

1.2 納入及排除標準

納入標準:公開發表的與檢索主題詞相關的完整、真實可靠的研究。排除標準:信息不全、不能獲得全文的文獻或重復文獻;會議論文、新聞報道、圖書等非期刊論文。

1.3 方法

使用CiteSpace 5.8.R3 軟件對納入的文獻進行可視化分析并繪制圖譜。節點類型(node types)包括作者(author)、機構(institution)、關鍵詞(keyword)。

2 結果

2.1 文獻檢索結果

CNKI 和WoS 初篩分別納入496 篇和492 篇中、英文文獻。刪除數據不完整、會議記錄和修訂等非期刊論文,最后納入165 篇中文文獻、433 篇英文文獻。

2.2 作者合作網絡分析

中文作者合作網絡圖譜共有211 個節點、321條連線,提示有211 位作者被納入分析,形成了以何灝龍、彭麗佳等為主的核心研究團隊,團隊間合作關系較為緊密;英文圖譜共有286 個節點、394條連線,提示有286 位作者被納入分析,形成了以LI ZHANG、HONG WANG 等為主的核心研究團隊,這些核心團隊內部相互合作,見圖1。

圖1 中、英文作者合作網絡圖譜

2.3 機構合作網絡分析

中文文獻機構合作圖譜中共獲得126 家研究機構,其中湖南中醫藥大學針灸推拿學院和昆明醫科大學第一附屬醫院發文量最多,均為4 篇;英文文獻共包含181 家研究機構,其中發文前3位的機構均來自中國,分別為首都醫科大學(13篇)、重慶醫科大學(11 篇)和鄭州大學(10 篇)。見圖2。

圖2 中、英文文獻機構合作圖譜

2.4 關鍵詞共現分析

中、英文關鍵詞共現網絡分別由121 個節點、183 條連線和287 個節點、977 條連線組成。根據關鍵詞共現頻次篩選分析,該領域側重于miRNA 對CIRI 作用機制的探索,包括凋亡、氧化應激、自噬、炎癥;干預手段以針刺、電針為主;基礎研究、綜述為主要文獻形式,見圖3。深入挖掘關鍵詞共現網絡中出現的miRNA,有近百種(表1),提示這些miRNA 為CIRI 中的研究熱點。

表1 中、英文文獻出現頻次前5位的miRNA

圖3 中、英文文獻關鍵詞共現圖譜

2.5 關鍵詞聚類分析

CNKI 和WoS 圖譜中聚類模塊指數Q>0.3、輪廓指數S>0.7,說明聚類板塊是顯著的。中文文獻獲得凋亡(#0)、大鼠(#1)、針刺(#2)等6 個主要聚類標簽;英文文獻顯示down-regulating ddr1(#0)、injure-induced cell apoptosis(#1)等11 個主要聚類標簽,代表了miRNA 在CIRI 的主要研究方向,見圖4。

圖4 中、英文文獻關鍵詞聚類圖譜

3 討論

隨著測序技術和生物信息學分析的發展,miRNA 在CIRI 中的作用逐漸受到眾多學者的廣泛關注,文獻年發文量持續增長。近年來活躍在國內期刊的學者何灝龍主要研究miRNA 在針刺改善CIRI 中的調控作用[10-11],彭麗佳則主要研究miRNA 在CIRI 中的機制探討[12]。

關鍵詞可以反映當前研究現狀及預測未來熱點趨勢[13]。綜合分析關鍵詞共現及聚類圖譜,發現目前對miRNA 在CIRI 中的機制調控、干預方法、文獻類型等方面均展開了研究。該領域在機制探索上非常廣泛,miR-155、miR-29 等是國內外文獻中重點關注的miRNA。Shi 等[14]發現MiR-155-5p 通過調節NF-κB 和MAPKs 通路靶向DUSP14 加重CIRI。相關研究[15]發現外泌體內miRNA 作為細胞間的交流信使,在CIRI中發揮著不同作用,Xu 等[16]發現神經元通過分泌含有miR-132 的外泌體作用于血管內皮細胞Eef2k 基因,增強血管完整性。因此,研究外泌體內miRNA 的作用靶點、調控機制以及特異性分子標志物可能會為CIRI 的診療帶來新的突破。調控miRNA 可作為CIRI 的潛在治療靶標,根據它們在CIRI 發展中的不同作用,除了通過siRNA[17]、過表達[18]、shRNA[19]等多種技術手段,還可通過一些治療方法在體內外模型上得到驗證,如針刺[20]、電刺激[21]、左旋樟腦[22]、缺血預處理[23]等。Zhang等[24]發現電針通過外泌體miR-146b 促進內源性神經干細胞分化;Yao 等[25]發現人參皂甙可能通過miR-139-5p/FoxO1/Keap1/Nrf2 軸的抗焦亡作用改善CIRI。可見,調控miRNA 的研究為當前改善CIRI 提供了相關的靶點,但miRNA 在CIRI 中的作用還沒有詳細的報道,其在神經元或腦組織相關信號通路中的協調或拮抗作用機制還需進一步研究。在研究類型上,國內外均以基礎研究、綜述為主。基礎研究主要集中在MCAO/R 模型和OGD/R 細胞模型,其在臨床上的應用仍需更高水平的臨床證據支持。

本研究使用CiteSpace 軟件對CIRI 相關文獻中的miRNA 進行可視化分析,初步展示了該領域的研究現狀及發展動態,但也存在一定的局限性。由于軟件閾值設置的主觀性,關鍵詞突現統計結果可能存在一定片面性。隨著可視化軟件不斷完善,將進一步深入挖掘,以便更加科學、嚴謹地探討miRNA 在CIRI 的研究熱點及趨勢。

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