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基于基因片段和形態(tài)特征分析的山西鬼筆屬物種多樣性分析

2023-08-07 10:56:14張澤乾
山西農(nóng)業(yè)科學(xué) 2023年8期
關(guān)鍵詞:物種

張澤乾 ,毛 寧 ,劉 虹

(1.山西農(nóng)業(yè)大學(xué) 山西功能食品研究院,山西 太原 030031;2.首都師范大學(xué) 生命科學(xué)學(xué)院,北京 100048)

鬼筆屬Phallus是一類形態(tài)特征獨特、子實體質(zhì)地海綿狀、氣味濃郁的大型真菌,分類上隸屬于傘菌綱(Agaricomycetes)鬼筆亞綱(Phallomycetidas)鬼筆目(Phallales)鬼筆科(Phallaceae)。早期基于形態(tài)特征的分類學(xué)將鬼筆類真菌分為鬼筆屬(Phallus)和竹蓀屬(Dictyophora),區(qū)別在于竹蓀屬孢托組織下沿有一個網(wǎng)格狀裙子。現(xiàn)在的DNA分子研究顯示,這2 個類群屬于一個系統(tǒng)演化譜系,因此,Dictyophora被認(rèn)為是Phallus的異名,其中的物種全部轉(zhuǎn)移到鬼筆屬。鬼筆屬包括著名的商業(yè)食用菌品種竹蓀Dictyophoraindusiata(Vent.Pers.)Fisch.,因此受到了廣泛關(guān)注[1-4]。在分子系統(tǒng)研究出現(xiàn)之前,鬼筆屬另外一個常見物種是白鬼筆,廣布于世界各地,中國各地的白鬼筆幾乎全部被鑒定為歐洲的P.impudicusL.,并以此名稱出現(xiàn)在中國早期的所有菌類文獻中[1-4]。然而,最近一項分子數(shù)據(jù)分析研究顯示,中國分布的白鬼筆與歐洲的白鬼筆不是同一個物種,而是一個東亞地區(qū)特有的本土物種,并將其命名為冬蓀Phallus dongsunT.H.Li et al.[5],以區(qū)別于歐洲本土物種白鬼筆。白鬼筆是一種子實體中大型的珍稀食用真菌,在我國南部常見且已有人工培育產(chǎn)品,商品名稱為白冬蓀,是一種受歡迎的食用菌品種,其營養(yǎng)價值和風(fēng)味口感與著名的竹蓀相同。

鬼筆類真菌多數(shù)可以藥用和食用,在世界范圍內(nèi)各大洲均廣泛分布,我國鬼筆類真菌資源豐富,目前已報道有27 個種,主要分布在西南和華南地區(qū)[2-3],北方地區(qū)分布較少。自2017 年開始,山西農(nóng)業(yè)大學(xué)山西功能食品研究院野生菌團隊連續(xù)在山西各地采集調(diào)查大型食用真菌物種多樣性,在多地采到多份鬼筆類真菌樣本,其中一個重要的發(fā)現(xiàn)是在山西南部中條山脈中部和東部區(qū)域發(fā)現(xiàn)2 種大型鬼筆,一種為白色,一種為黃色。白色鬼筆屬于中國常見的白鬼筆(冬蓀鬼筆),黃色樣本顏色類似于黃脈鬼筆Phallus flavocostatusKreisel 和細鬼筆Phallus tenuis(E.Fisch.)Kuntz.[5-6],但這2 種黃色的鬼筆子實體均為小型,除去顏色外,其他特征都明顯不同。

為明確這種黃色鬼筆以及山西其他鬼筆類樣本的準(zhǔn)確分類學(xué)定位,本研究通過采用ITS 和LSU這2 個位點的基因片段進行建樹分析,結(jié)合形態(tài)學(xué)特征,共鑒定出鬼筆屬3 個物種,其中黃色樣本被鑒定為冬蓀鬼筆的黃色品種,這是黃色冬蓀鬼筆在世界上首次發(fā)現(xiàn),它的存在和發(fā)現(xiàn)為冬蓀品種的人工馴化培育和育種提供了新的材料和理論依據(jù)。

1 材料和方法

1.1 試驗材料

研究標(biāo)本共8 份,其中黃色冬蓀樣本4 份,采集于我國北方山西省中條山脈和呂梁山脈中段關(guān)帝山。其中,中條山脈位于山西省南部,屬暖溫帶季風(fēng)大陸性氣候,年平均溫度12~14 °C,年降水量600~800 mm,最高點海拔為2 358 m,植被以油松(Pinus tabuliformisCarr.)、華山松(Pinus armandiiFranch.)、多種櫟樹(Quercusspp.)等為建群種的暖溫帶森林為主,局部有亞熱帶小環(huán)境區(qū)域,土壤類型自下而上依次為沖積土、山坡褐土、山地淋溶褐土和山地草甸土。呂梁山脈位于山西省西部大體呈南北走向,中段的關(guān)帝山屬大陸性季風(fēng)氣候,年平均氣溫3.5 °C,年降水量830 mm,最高點海拔為2 831 m,土壤類型主要有山地棕壤、山地褐土、亞高山草甸土和洪泛平原草甸土,植被主要有華北落葉松(Larix principis-rupprechtiiMayr.)、云杉(Piceaspp.)、松樹(Pinusspp.)、楊樹(Populusspp.)、樺樹(Betulaspp.)純林或混交林等。

1.2 試驗方法

1.2.1 形態(tài)特征鑒定 在野外采集標(biāo)本并拍照記錄,然后在40~50 °C 的干燥機中干燥。干燥后的標(biāo)本保存在首都師范大學(xué)植物標(biāo)本室(BJTC)和山西農(nóng)業(yè)大學(xué)山西功能食品研究院植物標(biāo)本室(HSA)。從新鮮標(biāo)本中記錄宏觀特征,標(biāo)準(zhǔn)顏色值依據(jù)ColorHexa(http://www.colorhexa.com/);將干燥樣本手工切薄片放在含有3%氫氧化鉀、剛果紅、梅爾澤試劑[7]或乳酸棉藍的載玻片上,加蓋玻片在顯微鏡下觀察微觀特征。擔(dān)孢子的尺寸使用“(a-)b-c(-d)”形式的符號表示。“b-c”范圍至少包含90%的測量值。括號中給出了極值“a”和“d”。Q 為側(cè)視圖中擔(dān)孢子的長寬比;Qav 是指所有擔(dān)孢子的平均值Q,包括樣品標(biāo)準(zhǔn)偏差。

1.2.2 DNA 提取、PCR 擴增和DNA 測序 本研究獲得了ITS 和LSU 區(qū)域的序列。使用NuClean Plant Genomic DNA Kit(中國CWBIO)從山西省新采集的樣本中提取基因組DNA。使用引物ITS1-F/ITS4 擴增ITS 區(qū)域(White et al.1990;Gardes &Bruns 1993)[8-9],使用引物L(fēng)R0R/LR5(Vilgalys &Hester 1990)[10]擴增28S 大亞基nrDNA(LSU)區(qū)域。PCR 反應(yīng)體系25 μL:2 μL DNA 模板,上、下引物各1 μL(10 μmol/L),12.5 μL 2×Master Mix,8.5 μL ddH2O。PCR 反應(yīng)程序:94 °C 變性5 min;94 °C 30 s,55 °C 45 s(ITS)/60 s(LSU),35 次循環(huán);72 °C 1 min;72 ℃下延長10 min。將PCR 產(chǎn)物送至北京中科西林生物技術(shù)有限公司進行純化、測序和編輯。驗證合格的DNA 序列保存在GenBank數(shù)據(jù)庫中(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/),登錄號如表1 所示。

表1 本研究引證的樣本及其GenBank 登錄號Tab.1 Specimens and their GenBank accession numbers in this study

1.2.3 系統(tǒng)發(fā)育分析 基于ITS-nrLSU 數(shù)據(jù)集進行系統(tǒng)發(fā)育分析。ITS 和LSU 序列數(shù)據(jù)包含:本研究從新標(biāo)本提取測定的序列,一些重要文章先前使用的序列[5],通過Blast 工具從GenBank 檢索下載的一些相關(guān)序列。編輯ITS 和LSU 序列用于鑒定和研究山西省黃色鬼筆類物種的系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系。在默認(rèn)參數(shù)下,每個序列分別在MAFFT v.7.110 中對齊[11],使用默認(rèn)參數(shù)的Gblocks v.0.91b 識別對齊不佳的位點[12],然后將對齊的ITS 和LSU 序列連接起來以進行進一步的系統(tǒng)發(fā)育分析。在進行系統(tǒng)發(fā)育分析之前,排除了所有確定的模糊位點,任氏蛇頭菌Mutinus zenkeri被選作外類群。

使用參數(shù)未鏈接的GTRGAMMAI 替代模型(針對所有分區(qū)),使用RAxML 8.0.14[13-15]進行最大似然(ML)分析。使用快速引導(dǎo)分析搜索最簡約的ML樹,在RAxML 中計算ML 引導(dǎo)重復(fù)次數(shù)(1 000),ML 樹用TreeView 32 生成[16]。自舉值(BS)≥70%的進化分支被認(rèn)為得到了大力支持[17];貝葉斯法(BI)使用MrBayes v3.1.2[18]作為評估分支支持的附加方法。在BI 分析中,在選擇由MrModeltest v2.3[19]確定的最佳替代模型GTR+I+G(用于ITS和nrLSU)后,使用默認(rèn)設(shè)置,對10000000 代馬爾可夫鏈蒙特卡羅(MCMC)進行了2 次四鏈獨立運行,每100 代采樣一次。溫度值降至0.20,老化設(shè)置為0.25,一旦分離頻率的平均標(biāo)準(zhǔn)偏差達到0.01 以下,運行就會自動停止。構(gòu)建70%多數(shù)規(guī)則共識樹,用TreeView 32 生成進化樹[16],貝葉斯值(BPP)≥95%被認(rèn)為得到了顯著支持[20]。

2 結(jié)果與分析

2.1 分子系統(tǒng)發(fā)育

本研究中,新標(biāo)本自測產(chǎn)生11 條ITS 和LSU序列。ITS-nrLSU 組合數(shù)據(jù)集矩陣包括來自12個分類單元的56條序列(ITS 29條,nrLSU 27條),包含1 445 個堿基(ITS 562 個,LSU 883 個)。本研究引用的相關(guān)分類群中,從山西省采集的所有黃色鬼筆標(biāo)本都與包含有模式序列的白色冬蓀鬼筆聚為同一個末端分支,并得到了強有力的支持(BS=99%,BPP=1.00)(圖1),Blast 顯示,該末端分支中每個標(biāo)本的ITS 和LSU 序列的相似性都超過98.8%。結(jié)果表明,山西省采集的所有黃色鬼筆在系統(tǒng)發(fā)育上與白色的冬蓀鬼筆屬于同一個物種。

圖1 基于ITS-nrLSU 序列的鬼筆屬Phallus 系統(tǒng)發(fā)育樹(ML)Fig.1 Phylogenetic tree of Phallus based on ITS-nrLSU sequences(ML)

2.2 形態(tài)分類結(jié)果

2.2.1 冬蓀鬼筆Phallus dongsunT.H.Li,T.Li,Chun Y.Deng,W.Q.Deng &Zhu L.Yang,in Li,Li,Deng,Song,Deng &Yang,Phytotaxa443(1):29(2020)

2.2.1.1 黃色品種形態(tài)特征 菌蛋近球形到卵圓形,50~70 mm×45~65 mm,灰白色頭淺灰色,表面光滑,基部有白色菌索與土壤相聯(lián)。外包被膜質(zhì),內(nèi)包被膠質(zhì),無色。成熟子實體高145~250 mm,直徑30~50 mm。孢托鐘形到近圓錐形,淡黃色、黃色到橙黃色,長45~65 mm,直徑30~48 mm,表面不規(guī)則深網(wǎng)格狀,網(wǎng)眼深4~7 mm,頂部鈍圓或平截,具一個3~5 mm 的橢圓或近圓形小孔,初期被綠色產(chǎn)孢組織完全覆蓋。產(chǎn)孢組織橄欖綠色,黏。假柄柱狀或棒狀,通常向頂部漸細、向基部變粗,長150~200 mm,粗40~60 mm,淡黃色或黃色,海綿質(zhì),中空,壁厚5~8 mm,表面具直徑1~3 mm 的不規(guī)則小腔。菌托卵圓形,高40~55 mm,直徑30~40 mm,表面平滑或微皺,灰白色偶然淺灰色。菌索白色,直徑1~2 mm,長可達50 mm(圖2、3)。氣味惡臭,味道沒有記錄。

圖2 黃色冬蓀鬼筆的擔(dān)子果Fig.2 Basidiomata of yellow Phallus dongsun

圖3 山西黃色冬蓀鬼筆的顯微鏡特征Fig.3 Microscopic characteristics of yellow Phallus dongsun

擔(dān)孢子長橢圓形或稍呈圓柱狀,4.4~5.2 μm×1.9~2.5 μm,Q=1.92~2.27,Qm=2.12,無色,非淀粉質(zhì),薄壁,光滑,內(nèi)含一個油滴。孢托組織由膨大的菌絲和間雜的球形或不規(guī)則球形的細胞組成,薄壁,無色,直徑5.0~7.5 μm。假柄擬薄壁組織型,細胞球形或近球形,直徑10~25 μm。菌托菌絲直徑3.0~7.5 μm,分隔,薄壁,具鎖狀聯(lián)合。菌索菌絲直徑3.0~11.0 μm,薄壁,分隔,含分枝,具鎖狀聯(lián)合。

習(xí)性、生境和分布:單生、散生或群生,松樹(Pinusspp.)、櫟樹(Quercussp.)或楊樹(Populussp.)純林或混交林下地上。已知分布于我國山西省。

標(biāo)本:山西省方山縣麻地會鄉(xiāng)關(guān)帝山,楊樹Populussp.林地上,2018年8月31日,曹晉忠,LH329(HSA329);翼城縣中條山脈歷山松樹溝,松樹Pinussp.林地上,2018 年9 月10 日,劉虹,LH511(HSA511);翼城縣中條山脈歷山松樹溝,松樹Pinussp.林地上,2019 年8 月26 日,劉虹,LH1409(BJTC FM1546);夏縣泗交鎮(zhèn)櫟樹Quercussp.林地上,2020 年10 月6 日,毛寧,MN083(FANM1607 BJTC)。

2.2.1.2 白色品種特征 菌蛋近球形到卵圓形,45~75 mm×42~68 mm,污白色、白色、灰白色頭淺灰色,表面光滑,基部有白色菌索與土壤相聯(lián)。外包被膜質(zhì),內(nèi)包被膠質(zhì),無色。成熟子實體高140~260 mm,直徑35~50 mm。孢托鐘形到近圓錐形,白色,長43~67 mm,直徑32~46 mm,表面不規(guī)則深網(wǎng)格狀,網(wǎng)眼深4~6 mm,頂部鈍圓或平截,具一個3~5 mm 的橢圓或近圓形小孔,初期被綠色產(chǎn)孢組織完全覆蓋。產(chǎn)孢組織橄欖綠色,黏。假柄柱狀或棒狀,通常向頂部漸細、向基部變粗,長150~220 mm,粗41~63 mm,白色,海綿質(zhì),中空,壁厚5~8 mm,表面具直徑1~3 mm 的不規(guī)則小腔。菌托卵圓形,高41~55 mm,直徑32~41 mm,表面平滑或微皺,灰白色偶然淺灰色。菌索白色,直徑1~2 mm,長可達55 mm(圖4)。氣味惡臭,味道沒有記錄。

擔(dān)孢子長橢圓形或稍呈圓柱狀,4.0~5.5 μm×1.8~2.5 μm,無色,非淀粉質(zhì),薄壁,光滑,內(nèi)含一個油滴。孢托組織由膨大的菌絲和間雜的球形或不規(guī)則球形的細胞組成,薄壁,無色,直徑5.0~7.5 μm。假柄擬薄壁組織型,細胞球形或近球形,直徑10~25 μm。菌托菌絲直徑3.0~7.5 μm,分隔,薄壁,具鎖狀聯(lián)合。菌索菌絲直徑3.0~10 μm,薄壁,分隔,含分枝,具鎖狀聯(lián)合。

習(xí)性、生境和分布:單生、散生或群生,多種針葉林或闊葉林純林或混交林下地上。已知分布于我國南北各地。冬蓀鬼筆白色品種形態(tài)特征和黃色品種區(qū)別為孢托和假柄為白色。

標(biāo)本:山西省翼城縣中條山脈歷山松樹溝,松樹Pinussp.林地上,2018 年9 月10 日,劉虹,LH504(HSA504);翼城縣中條山脈歷山松樹溝,松樹Pinussp.林地上,2019 年9 月10 日,劉虹,LH444(HSA444)。

2.2.2 紅鬼筆Phallus rugulosus(E.Fisch.)Lloyd,Mycol.Writ.(Cincinnati)2(Letter 31)∶402(1908)菌蛋卵圓形或蛋形,白色或灰白色,基部具白色或灰白色根狀菌索。成熟后菌蛋頂部破裂,孢托組織由假柄支撐伸出,總高100~210 mm,直徑20~30 mm。孢托鐘形或圓錐形,紅色,高15~39 mm,直徑10~20 mm,頂部有一小孔,表面被有橄欖色孢子黏液。假柄圓柱狀,海綿質(zhì),長60~130 mm,直徑10~20 mm,上部淺紅色,向下漸成白色或灰白色,表面有蜂窩狀小孔。菌托包狀或袋狀。氣味惡臭。擔(dān)孢子橢圓形,無色,3.5~4.5 μm×1.5~2.0 μm(圖5)。

圖5 紅鬼筆的擔(dān)子果Fig.5 Basidiomata of Phallus rugulosus

習(xí)性、生境和分布:單生、散生或群生,多種林下地上。已知分布于我國南北各地。

標(biāo)本:山西省沁水縣土沃鄉(xiāng)上沃泉村,楊樹Populussp.林地上,2018年9 月10 日,劉虹,LH1188(BJTC FANM1132)。

2.2.3 超短裙鬼筆Phallus ultraduplicatusX.D.Yu,W.Lv,S.X.Lv,Xu H.Chen &Qin Wang,in Adam?ík et al.,Cryptog.Mycol.36(2):147(2015)菌蛋近球形,白色或灰白色,65~80 mm×70~80 mm,基部具白色或灰白色根狀菌索。成熟后菌蛋頂部破裂,孢托組織由假柄支撐伸出,總高150~230 mm。孢托鐘形或圓錐形,白色或黃白色,高35~50 mm,直徑20~30 mm,頂部有一小孔,深網(wǎng)格狀,表面被有橄欖色孢子黏液。菌裙白色,長20~40 mm,海綿質(zhì),具多角形網(wǎng)眼。假柄圓柱狀,海綿質(zhì),長100~190 mm,直徑20~35 mm,白色或淺黃白色,表面有蜂窩狀小孔。菌托包狀或袋狀。氣味惡臭。擔(dān)孢子橢圓形,無色,4.0~5.1 μm×1.5~2.0 μm(圖6)。

圖6 超短裙鬼筆的擔(dān)子果Fig.6 Basidiomata of Phallus ultraduplicatus

習(xí)性、生境和分布:單生、散生或群生,針葉林下地上。已知分布于山西和中國北部地區(qū)。

標(biāo)本:山西省交城縣關(guān)帝山龐泉溝,云杉Piceasp.林地上,2018年8月31日,劉虹,LH314和LH315;興縣黑茶山,油松Pinus tabulifornis林地上,2018 年9 月6 日,李素玲,LH376。

3 結(jié)論與討論

冬蓀鬼筆在我國南部貴州、云南地區(qū)是一種常被當(dāng)?shù)厝瞬杉秤茫⒁驯蝗斯づ嘤氖秤媚⒐轿锓N[5]。本研究基于ITS 和LSU 聯(lián)合分析證實,山西分布的大型黃色鬼筆在分類學(xué)上屬于冬蓀鬼筆Phallus dongsun,盡管它的子實體顏色與典型的冬蓀鬼筆有所不同。同一物種具有不同顏色的現(xiàn)象在大型菌類中并不罕見,如生長在落葉松林下的厚環(huán)乳牛肝Suillus grevillei(Klotzsch)Singer 典型的子實體顏色為紅褐色,但是黃色的類型并不罕見[21],再如白灰乳菇Lactarius albidocinereus子實體有白色和灰色2 種類型[22],作者在山西多年采集發(fā)現(xiàn)這個物種的2 種顏色個體在山西均有發(fā)生,其中灰色子實體的品種在山西南部更為多見。

本研究共發(fā)現(xiàn)有3個鬼筆屬Phallus物種在山西的分布得到了數(shù)據(jù)支持,即冬蓀鬼筆P.dongsun(包括白色和黃色2 個類型)、紅鬼筆P.rugulosus和超短裙鬼筆(超短裙竹蓀)P.ultraduplicatus。其中,冬蓀鬼筆的白色類型僅見于山西南部的中條山脈,黃色的類型除中條山外,還在呂梁山脈中北部的關(guān)帝山楊樹林下有分布。紅鬼筆見于中條山脈東段的歷山區(qū)域,而超短裙鬼筆分布于呂梁山脈的關(guān)帝山和黑茶山的云杉Piceasp.和油松林下。本研究是首次在自然界發(fā)現(xiàn)冬蓀鬼筆有野生黃色品種存在,這對冬蓀鬼筆的人工培育和育種增加了新的選擇。食用黃冬蓀野生馴化、生物學(xué)特性及其栽培條件是否與白色冬蓀一致,還有待于進一步探索研究。

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