陳猛猛, 陳俊宇, 高 燕, 房正軒, 趙淑華, 鄭晶瑩, 劉淑香
(1.吉林大學(xué)護理學(xué)院康復(fù)治療學(xué)教研室,吉林 長春 130021;2.吉林大學(xué)第二醫(yī)院婦產(chǎn)科,吉林 長春 130021;3.延邊大學(xué)藥學(xué)院藥劑學(xué)教研室,吉林 延吉 133002)
卵巢癌是致死率最高的婦科腫瘤之一,其中上 皮性卵巢癌(epithelial ovarian cancer,EOC)占所有卵巢癌的80%~90%[1-2]。目前,EOC 的標準治療是腫瘤細胞減滅術(shù)聯(lián)合以鉑類為基礎(chǔ)的化療,但患者的5 年生存期僅為46%[3]。腫瘤的耐藥及復(fù)發(fā)是 EOC 病死率高的主要原因,此過程涉及多基因的變化[4]。研究[5-10]顯示:消皮素家族基因表達與泛癌的腫瘤免疫及癌癥藥物敏感性有關(guān),特別是膜穿孔蛋白E(gasdermin E,GSDME)的活化能夠抑制多種腫瘤細胞集落形成和增殖。作為細胞焦亡的最終執(zhí)行蛋白,GSDME 的表達可能與EOC的發(fā)生發(fā)展有關(guān),但其表達水平對 EOC 臨床進展影響的研究尚未見相關(guān)報道。本研究利用生物信息學(xué)數(shù)據(jù)分析、免疫組織化學(xué)(immunohistochemistry,IHC)染色和Western blotting 法等方法,探討GSDME 在EOC 組織中的表達,分析GSDME 在EOC 發(fā)生發(fā)展過程中的作用,以期對EOC 臨床治療提供潛在的分子靶點。
1.1 生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫EOC 中GSDME 的差異表 達 數(shù) 據(jù) 是 來 自 UCSC Xena (https://xenabrowser.net/datapages/)經(jīng)Toil 流程統(tǒng)一處理的腫瘤基因組圖譜(The Cancer Genome Atlas,TCGA)和 基 因 型- 組 織 表(Genotype-Tissue Expression,GTEx)的TPM 格 式RNAseq 數(shù) 據(jù)。共對515 例非配對樣本進行了差異表達分析,其中包含88 例來自GTEx 數(shù)據(jù)庫的正常卵巢樣本,427 例 來 自TCGA (https://portal.gdc.cancer.gov/)的腫瘤樣本。所有的統(tǒng)計分析與可視化均使用R(3.6.3 版本)完成。
1.2 EOC 組織中GSDME 基因表達譜差異分析采用Mann-WhitneyU檢驗(Wilcoxon rank sum test)對EOC 組織中GSDME 基因的表達譜進行差異分析。采用Shapiro-Wilk normality test 對非配對樣本中GSDME 的表達數(shù)據(jù)進行正態(tài)性檢驗,并使用兩獨立樣本t檢驗對非配對樣本中的數(shù)據(jù)進行差異分析。……