侯俊杰, 米旭光, 李孝男, 李曉男, 楊 影, 蘆小單, 方艷秋, 金寧一
(1. 延邊大學醫學院病理生理學教研室, 吉林 延吉133002;2. 吉林省人民醫院腫瘤綜合治療科, 吉林長春 130021;3. 軍事醫學科學院分子病毒學與免疫學實驗室, 吉林 長春 130122)
肺癌是最常見的惡性腫瘤之一, 其導致的死亡約占所有因癌癥死亡病例的四分之一[1], 其中肺腺癌(lung adenocarcinoma, LUAD) 占肺癌病例的40%~50%[2]。多數LUAD 患者在診斷時已處于晚期, 并可能出現淋巴結和多發轉移[3], 但LUAD患者預后較差, 5 年生存率低于20%[4]。因此, 迫切需要尋找一種有效、準確的LUAD 預后標志物[5]。研究[6-8]顯示:腫瘤微環境中糖酵解產生的乳酸在腫瘤進程中發揮重要作用。癌細胞產生的乳酸分泌到細胞外環境中, 為腫瘤細胞提供能量, 促進血管生成, 并通過誘導和募集免疫抑制相關細胞和分子, 發揮免疫抑制功能, 影響腫瘤的發生發展等, 且主要在基礎研究方面, 國內外關于乳酸直接與患者臨床預后相關性的系統研究報道較少, 因此, 本研究篩選在LUAD 中可能發揮重要作用的乳酸代謝基因, 構建LUAD 患者乳酸代謝評分模型以預測患者預后, 探討乳酸代謝在LUAD 發生發展中的作用, 為LUAD 的防治和預后提供可靠的標志物及預測模型。
1.1 數據收集從癌癥基因圖譜數據庫(The Cancer Genome Atlas, TCGA) 下 載 LUAD FPKM 標準化mRNA 表達數據LUAD-FPKM, 以及患者相應的臨床信息, 包括年齡、性別、腫瘤分期、吸煙史、腫瘤狀態和生存信息。根據人類基因數據庫中的乳酸代謝相關基因列表, 從mRNA 表達數據中提取LUAD 患者癌組織(癌組織組)和癌旁組織(癌旁組織組)的乳酸代謝相關基因表達信息。……