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野生疣鼻天鵝洛菲不動(dòng)桿菌的分離鑒定與藥物敏感性分析

2022-11-07 03:11:20彭志鋒高如意朱亞博邊傳周
野生動(dòng)物學(xué)報(bào) 2022年4期

彭志鋒 張 菡 高如意 朱亞博 董 青 王 軍 霍 軍 邊傳周*

(1.河南牧業(yè)經(jīng)濟(jì)學(xué)院動(dòng)物醫(yī)藥學(xué)院,鄭州,450046;2.三門(mén)峽天鵝湖國(guó)家城市濕地公園,三門(mén)峽,472100)

Acinetobacterlwoffii;Identification;Drug susceptibility tes洛菲不動(dòng)桿菌(Acinetobacterlwoffii)通常被認(rèn)為是一種條件性致病菌,普遍存在于土壤、水或干燥的環(huán)境中,對(duì)免疫力低的動(dòng)物或人來(lái)說(shuō)是一種潛在的病原,不僅可引起醫(yī)院內(nèi)感染,造成敗血癥、肺炎、腦膜炎、尿道感染、皮膚傷口感染或急性胃腸炎[1-6],而且近年來(lái)感染嚙齒動(dòng)物、禽畜和水生動(dòng)物的報(bào)道增多,如鼠、鴨感染洛菲不動(dòng)桿菌死亡[7-8]、奶牛生乳中分離出洛菲不動(dòng)桿菌[9]、兔感染洛菲不動(dòng)桿菌死亡[10],以及2016—2017年四川省普遍發(fā)生裂腹魚(yú)(Schizothoraxspp.)因感染洛菲不動(dòng)桿菌造成皮膚潰爛和內(nèi)臟出血[11]。目前為止,還沒(méi)有野生動(dòng)物感染洛菲不動(dòng)桿菌的報(bào)道。2020年8月,三門(mén)峽天鵝湖國(guó)家濕地公園的野生疣鼻天鵝(Cygnusolor)陸續(xù)發(fā)病,采食量嚴(yán)重下降,排水樣、白色和黃綠色糞便,不愿下水,站立不穩(wěn),最終消瘦死亡。筆者從病死疣鼻天鵝臟器(肝臟和心臟)中分離到1株細(xì)菌,經(jīng)染色鏡檢、MALDI-TOF鑒定和16S rDNA序列分析,確定為洛菲不動(dòng)桿菌。對(duì)該分離菌株進(jìn)行藥物敏感性試驗(yàn),依據(jù)試驗(yàn)結(jié)果選用敏感藥物治療,取得較好的效果,野生疣鼻天鵝陸續(xù)恢復(fù)健康。

1 材料與方法

1.1 病料和菌株來(lái)源

病料為河南省三門(mén)峽天鵝湖國(guó)家城市濕地公園送檢的病死疣鼻天鵝肝臟和心臟。藥敏試驗(yàn)質(zhì)控菌株大腸桿菌ATCC25922購(gòu)自中國(guó)普通微生物菌種保存中心。

1.2 分離純化及革蘭染色

無(wú)菌取病死疣鼻天鵝肝臟和心臟,放置在生物安全柜內(nèi),用酒精棉球?qū)ζ浔砻嫦?,然后用無(wú)菌接種環(huán)接觸肝臟和心臟的新鮮切面,將接種環(huán)上物質(zhì)接種于鮮血瓊脂平板和LB平板,于恒溫培養(yǎng)箱中37 ℃培養(yǎng)12~24 h后,挑取單菌落革蘭氏染色和鏡檢。取單菌落接種于LB液體培養(yǎng)基,于恒溫振蕩培養(yǎng)箱中37 ℃培養(yǎng)12 h,-80 ℃保存?zhèn)溆谩?/p>

1.3 MALDI-TOF鑒定

用無(wú)菌接種環(huán)將純化后的菌株接種于LB平板,于恒溫培養(yǎng)箱中37 ℃培養(yǎng)12 h,取單菌落,通過(guò)MALDI-TOF(Bruker MALDI-Biotyper,購(gòu)自Bruker公司)進(jìn)行菌種鑒定。

1.4 16S rDNA鑒定1.4.1 基因組DNA的提取

取過(guò)夜培養(yǎng)的菌液0.5 mL于無(wú)菌EP管中,煮沸10 min;然后12 000 r/min離心5 min,取上清,-20 ℃保存?zhèn)溆谩?/p>

1.4.2 PCR擴(kuò)增及構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)

用16S rDNA通用引物27F:5′-AGAGTTTGATCCTGGCTCAG-3′和1492R:5′-CTACGGCTACCTTGTTACGA-3′,采用50.0 μL PCR擴(kuò)增反應(yīng)體系:基因組DNA 1.0 μL;27F和1492R各1.0 μL;10×Buffer 5.0 μL;Taq聚合酶1.0 μL;dNTP 1.0 μL,無(wú)菌ddH2O 40.0 μL。PCR擴(kuò)增反應(yīng)程序:95 ℃預(yù)變性5 min;95 ℃變性30 s,58 ℃退火30 s,72 ℃延伸90 s,35個(gè)循環(huán);72 ℃延伸7 min。取5 μL PCR擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行1%瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè),將PCR擴(kuò)增產(chǎn)物送生工生物工程(上海)股份有限公司雙向測(cè)通測(cè)序。

用NCBI中的BLAST工具對(duì)比分析測(cè)得的序列。根據(jù)對(duì)比結(jié)果,選取參考菌株和同科不同屬菌株的16S rDNA序列,用MEGA-X軟件選擇Neighbor-joining法構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)。

1.5 藥物敏感性試驗(yàn)

參照CLSI2020[12]規(guī)定的方法,采用K-B法檢測(cè)分離菌株對(duì)阿米卡星、加替沙星、多西環(huán)素、恩諾沙星、卡那霉素、新霉素、阿莫西林、環(huán)丙沙星、大觀霉素、頭孢噻肟、多黏菌素B、氨芐西林、林可霉素、慶大霉素、氟苯尼考、氧氟沙星、頭孢克肟和克林霉素18種抗菌藥物(購(gòu)自杭州濱和微生物試劑有限公司)的敏感性,用質(zhì)控菌株進(jìn)行質(zhì)控。

2 結(jié)果與分析

2.1 細(xì)菌分離培養(yǎng)

細(xì)菌分離菌株在LB平板中生長(zhǎng)出乳白色、半透明、表面光滑和邊緣整齊的小菌落。革蘭氏染色為革蘭陰性球桿菌,呈單個(gè)、成對(duì)或短鏈排列(圖1)。

圖1 細(xì)菌鏡檢結(jié)果(革蘭氏染色,1 000×)Fig.1 Bacterial microscopic examination results (Gram’s stain,1 000×)

2.2 MALDI-TOF鑒定

分離菌株蛋白質(zhì)譜與Bruker MBT臨床菌種主庫(kù)(DB8468_2969)中的洛菲不動(dòng)桿菌高度一致。

2.3 16S rDNA鑒定

分離菌株16S rDNA序列PCR產(chǎn)物測(cè)序結(jié)果為1 458 bp(圖2),經(jīng)BLAST比對(duì),分離菌株16S rDNA序列與洛菲不動(dòng)桿菌16S rDNA序列相似度達(dá)到99.72%,確認(rèn)該分離菌株為洛菲不動(dòng)桿菌,將其命名為HeNSMX-1。系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)分析顯示:分離菌株HeNSMX-1與洛菲不動(dòng)桿菌處于同一分支,親緣關(guān)系最近(圖3)。

圖2 分離菌株16S rDNA擴(kuò)增產(chǎn)物電泳結(jié)果Fig.2 Electrophoresis results of 16S rDNA amplification of isolated strains 注:M.DL2000 DNA Ladder;1.分離菌株16S rDNA擴(kuò)增產(chǎn)物;2.陰性對(duì)照 Note:M,DL2000 DNA Ladder.1,The 16S rDNA amplification product of the isolated strain.2,Negative control

圖3 不動(dòng)桿菌屬細(xì)菌基于16S rDNA基因的進(jìn)化樹(shù)Fig.3 Phylogenetic tree of Acinetobacter spp.based on 16S rDNA genes

2.4 洛菲不動(dòng)桿菌分離菌株的藥敏試驗(yàn)

洛菲不動(dòng)桿菌分離菌株對(duì)阿米卡星、加替沙星、多西環(huán)素、卡那霉素、環(huán)丙沙星、頭孢噻肟、慶大霉素和氧氟沙星敏感,對(duì)克林霉素中度敏感,對(duì)阿莫西林、氨芐西林和頭孢克肟耐藥(表1)。

表1 洛菲不動(dòng)桿菌分離菌株HeNSMX-1的藥物敏感性

3 討論

據(jù)報(bào)道,洛菲不動(dòng)桿菌可造成羊駝(Lamaglama)呼吸系統(tǒng)感染[13]、狗腦部積水[14]、魚(yú)內(nèi)臟出血[11]和兔內(nèi)臟出血[10]等。本研究通過(guò)細(xì)菌形態(tài)學(xué)、MALDI-TOF鑒定和16S rDNA序列分析,確認(rèn)從病死野生疣鼻天鵝肝臟中分離得到的唯一菌株為洛菲不動(dòng)桿菌,首次報(bào)道了洛菲不動(dòng)桿菌感染導(dǎo)致野生疣鼻天鵝死亡。

近年來(lái),不動(dòng)桿菌屬細(xì)菌的多重耐藥受到越來(lái)越多研究人員的關(guān)注。本研究中的洛菲不動(dòng)桿菌對(duì)阿莫西林、氨芐西林和頭孢克肟耐藥,魚(yú)源洛菲不動(dòng)桿菌也對(duì)上述藥物表現(xiàn)出耐藥性[11]。盡管抗生素治療是防控野生動(dòng)物細(xì)菌性疾病的重要策略,但隨著野生動(dòng)物病原菌耐藥性的增強(qiáng)及體內(nèi)抗生素的蓄積,洛菲不動(dòng)桿菌可能會(huì)危害環(huán)境,造成耐藥基因種間或跨種的傳播。因此,天鵝源洛菲不動(dòng)桿菌的感染防控策略研究應(yīng)該聚焦于抗生素替代方法上,如免疫接種和中藥療法[15]。

鑒于洛菲不動(dòng)桿菌普遍存在于土壤或水中,且近年來(lái)不斷有水生動(dòng)物感染洛菲不動(dòng)桿菌致病的報(bào)道[11,16],野生疣鼻天鵝可能因接觸被洛菲不動(dòng)桿菌污染的水而感染致病。為避免該病的發(fā)生,建議三門(mén)峽天鵝湖國(guó)家城市濕地公園做好地表水洛菲不動(dòng)桿菌的監(jiān)測(cè),改善水衛(wèi)生狀況。嚴(yán)禁周邊未經(jīng)處理的生活用水向地表水中排放,從源頭上減少含有洛菲不動(dòng)桿菌的污染水源。

洛菲不動(dòng)桿菌被認(rèn)為是醫(yī)院臨床中的一種條件性致病菌,通常與菌血癥、肺炎、腦膜炎、腹膜炎和胃腸炎等有關(guān)[1-3,17-18]。盡管目前沒(méi)有天鵝湖濕地公園員工感染洛菲不動(dòng)桿菌的報(bào)道,但隨著生態(tài)環(huán)境的改善,人們接觸野生天鵝的機(jī)會(huì)增多,應(yīng)加強(qiáng)對(duì)洛菲不動(dòng)桿菌感染因素的研究,盡量避免該菌在天鵝與人之間傳播。

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