王 飛,李祥婷,徐莉莉,張雅珍,向 軍,3*
1.復(fù)旦大學(xué)附屬中山醫(yī)院藥劑科,上海 200032
2.復(fù)旦大學(xué)附屬中山醫(yī)院中西醫(yī)結(jié)合科,上海 200032
3.復(fù)旦大學(xué)中西醫(yī)結(jié)合研究院內(nèi)科研究所,上海 200032
羅布麻屬夾竹桃科植物[1],是藥食同源植物,具有廣泛的藥用和保健功效。臨床研究發(fā)現(xiàn)羅布麻葉浸膏片可改善夜尿等部分衰老癥狀,對降低血清過氧化脂質(zhì)、升高發(fā)鋅、提高男性血漿睪丸酮可能具有一定作用[2];可提高老年人自然殺傷細(xì)胞活性及紅細(xì)胞超氧化物歧化酶含量,改善甲皺微循環(huán)的血流狀態(tài),有一定延緩衰老的作用[3]。在動(dòng)物模型中,羅布麻提取物可延長果蠅壽命,促進(jìn)家兔及大鼠的免疫功能,降低大鼠血清過氧化脂質(zhì)水平[4]。鑒于羅布麻抗衰老的多成分、多靶點(diǎn)的藥理學(xué)特征,本研究擬借助網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)結(jié)合動(dòng)物模型進(jìn)一步探討羅布麻的抗衰老作用和機(jī)制。
1.1 網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)研究
1.1.1 羅布麻成分收集和篩選 采用數(shù)據(jù)庫TCMSP(http://ibts.hkbu.edu.hk/LSP/tcmsp.php)、TCMID(http://www.megabionet.org/tcmid/)與文獻(xiàn)檢索相結(jié)合的方法收集羅布麻的主要活性成分。根據(jù)藥物動(dòng)力學(xué)參數(shù)對其進(jìn)行篩選,該參數(shù)為藥物口服生物利用度(oral bioavailability, OB)≥30%以及類藥性(drug likeness, DL)≥0.18。
1.1.2 羅布麻成分靶點(diǎn)預(yù)測 采用中藥成分靶點(diǎn)數(shù)據(jù)庫TCMSP、TCMID 結(jié)合文獻(xiàn)檢索的方法收集和篩選羅布麻的成分靶點(diǎn)。
1.3 衰老的疾病靶點(diǎn)預(yù)測 在疾病靶點(diǎn)數(shù)據(jù)庫OMIM(https://omim.org/)、DisGeNET(https://www.disgenet.org/)、TTD(http://db.idrblab.net/ttd/)、GeneCards(http://www.genecards.org/),以關(guān)鍵詞“aging”獲得衰老的相關(guān)基因。
1.4 靶點(diǎn)的蛋白互作網(wǎng)絡(luò) 利用Venny 2.1 獲得羅布麻成分與疾病靶點(diǎn)的交集,隨后導(dǎo)入STRING(http://stringdb.org/),進(jìn)行蛋白互作分析,結(jié)果 以 TSV 格 式 導(dǎo) 入 Cytoscape 3.8.1(http://www.cytoscape.org/)軟件進(jìn)行網(wǎng)絡(luò)拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)分析,構(gòu)建蛋白-蛋白相互作用網(wǎng)絡(luò)。
1.5 成分-靶點(diǎn)-疾病網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建 利用Cytoscape 3.8.1(http://www.cytoscape.org/)將上述所得結(jié)果網(wǎng)絡(luò)拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)分析,構(gòu)建成分-靶點(diǎn)-疾病網(wǎng)絡(luò)。
1.6 靶點(diǎn)功能和通路富集分析 利用基因本體(gene ontology, GO) 數(shù) 據(jù) 庫 和 京 都 基 因 與 基因 組 百 科 全 書(Kyoto encyclopedia of genes and genomes, KEGG) 數(shù) 據(jù) 庫, 以 及R3.6.3 軟 件 運(yùn)行的Bioconductor 生物信息軟件包(http://www.bioconductor.org/)對靶點(diǎn)功能和通路進(jìn)行富集分析。
1.2 動(dòng)物實(shí)驗(yàn)
1.2.1 實(shí)驗(yàn)動(dòng)物 C57-BL/6 小鼠,雄性,8 周齡,體質(zhì)量18~20 g,由復(fù)旦大學(xué)附屬中山醫(yī)院動(dòng)物實(shí)驗(yàn)中心提供。動(dòng)物使用通過復(fù)旦大學(xué)附屬中山醫(yī)院動(dòng)物倫理委員會(huì)審核[動(dòng)物生產(chǎn)許可證號:SCXK(滬)2017-0005;動(dòng)物使用許可證號:SYXK(滬)2016-0006]。
1.2.2 藥物和試劑 羅布麻提取物(日本常盤生藥研究所)、D-半乳糖(美國Sigma 公司)、蘇木精-伊紅(H-E)染液(江蘇凱基生物技術(shù)股份有限公司)、兔抗鼠p53 一抗 (江蘇Immunoway公司)、兔抗鼠GAPDH (江蘇凱基生物技術(shù)股份有限公司)、FITC 標(biāo)記羊抗兔二抗(Jackson ImmunoResearch 公司)、羊抗兔IgG-HRP(江蘇凱基生物技術(shù)股份有限公司)。
1.2.3 實(shí)驗(yàn)儀器 電泳儀(美國Bio-Rad 公司)、Trans-Blot Turbo 全能型蛋白轉(zhuǎn)印系統(tǒng)(美國Bio-Rad 公司)、凝膠成像系統(tǒng)(美國Bio-Rad 公司)、電熱扶風(fēng)干燥箱(上海圣欣科學(xué)儀器有限公司)、BX43 熒光顯微鏡(日本Olympus 公司)。
1.2.4 動(dòng)物分組與給藥 將小鼠隨機(jī)分為對照組、模型組、羅布麻組,每組6 只。參考既往研究[5],模型組和羅布麻組頸背部皮下注射5% D-半乳糖(100 mg·kg-1·d-1),對照組同部位注射等體積生理鹽水。參考既往研究[6]羅布麻給藥劑量,羅布麻組在注射D-半乳糖的同時(shí),給予 100 mg·kg-1·d-1的羅布麻提取物灌胃,模型組每天等體積生理鹽水灌胃,連續(xù)造模和給藥8 周。
1.2.5 組織取材 造模8 周后頸椎脫臼處死小鼠,暴露胸腹部,常規(guī)消毒,打開腹腔,取小鼠肝臟組織,液氮速凍后轉(zhuǎn)入-80 ℃保存,用于后續(xù)H-E 染色、免疫熒光染色和Western 印跡檢測。
1.2.6 H-E 染色 取肝臟組織,4%多聚甲醛固定,脫水、包埋,制備4 μm 石蠟切片,隨機(jī)選取肝臟切片(n=3),經(jīng)梯度二甲苯脫蠟、梯隊(duì)乙醇復(fù)水,行H-E 染色,脫水、透明、封片。光鏡下觀察肝臟組織大體病理改變。
1.2.7 免疫熒光染色 取肝臟組織,制備4 μm 冰凍切片,隨機(jī)選取肝臟切片(n=3),1%丙酮固定,經(jīng)3% H2O2-甲醇溶液滅活、1% BSA 封閉后,p53一抗(1 ∶ 100)37℃孵育 2 h,F(xiàn)ITC 標(biāo)記熒光二抗(1 ∶ 200)37℃孵育 2 h,DAPI 復(fù)染,熒光顯微鏡下觀察p53 的表達(dá)情況。
1.2.8 Western 印跡法 取肝臟組織,提取總蛋白,樣品經(jīng)過蛋白質(zhì)含量測定后,十二烷基硫酸鈉聚丙烯酰胺凝膠電泳、轉(zhuǎn)膜,BSA 封閉,采用1 ∶ 1 000 稀釋的一抗 4℃孵育過夜,1 ∶ 1 000 稀釋的二抗37℃孵育1 h,增強(qiáng)化學(xué)發(fā)光法反應(yīng),曝光,顯影,拍照,光密度定量分析。
1.3 統(tǒng)計(jì)學(xué)處理 實(shí)驗(yàn)所得數(shù)據(jù)均采用SPSS 13.0統(tǒng)計(jì)軟件包進(jìn)行分析,結(jié)果以x±s 表示,多組間比較采用單因素方差分析,檢驗(yàn)水準(zhǔn)(α)為0.05。
2.1 網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)預(yù)測
2.1.1 羅布麻活性成分篩選及其靶點(diǎn) 經(jīng)數(shù)據(jù)庫查找出56 個(gè)活性成分,篩選并去重后獲得谷甾醇(sitosterol)、花青素B1(procyanidin B1)、山奈酚(kaempferol)、(+)-兒茶素[(+)-catechin]、木犀草素(luteolin)、表兒茶素(ent-Epicatechin)6 個(gè)活性成分,及羅布麻寧(apocynin)、金絲桃苷(hyperoside)、蕓香苷(rutin)3 個(gè)活性成分,共計(jì)9 個(gè)活性成分(表1)。利用數(shù)據(jù)庫查詢上述活性成分的靶點(diǎn)信息,篩選并去重后得到122 個(gè)作用靶點(diǎn)。

表1 羅布麻主要活性成分信息
2.1.2 羅布麻抗衰老的潛在靶點(diǎn) 通過GeneCards數(shù)據(jù)庫、DisGeNET 數(shù)據(jù)庫、TTD 數(shù)據(jù)庫、OMIM數(shù)據(jù)庫篩選出共計(jì)2 183 個(gè)與衰老相關(guān)靶點(diǎn),采用Venny 2.1 軟件與羅布麻活性成分靶點(diǎn)交集,得到85 個(gè)共同靶點(diǎn)(圖1)。

圖1 羅布麻活性成分靶點(diǎn)與衰老靶點(diǎn)交集Venny 圖
2.1.3 成分-靶點(diǎn)-疾病網(wǎng)絡(luò) 運(yùn)用Cytoscape 3.8.1軟件構(gòu)建成分-靶點(diǎn)-疾病網(wǎng)絡(luò)(圖2),共132個(gè)節(jié)點(diǎn)和276 條邊。山奈酚、木犀草素以及蕓香苷與靶點(diǎn)的聯(lián)系最為廣泛。

圖2 羅布麻成分-靶點(diǎn)-疾病網(wǎng)絡(luò)
2.1.4 潛在靶點(diǎn)的蛋白-蛋白互作網(wǎng)絡(luò) 根據(jù)蛋白互作網(wǎng)絡(luò)(圖3A),篩選出degree 值排名前30位的靶點(diǎn),其中p53、絲氨酸/蘇氨酸蛋白激酶1(AKT1)、白細(xì)胞介素-6(IL-6)等可能是抗衰老的主要潛在靶點(diǎn)(圖3B)。

圖3 潛在靶點(diǎn)的蛋白-蛋白互作網(wǎng)絡(luò)
2.1.5 GO 分子功能富集分析 結(jié)果(圖4)顯示:通過GO 富集分析,篩選出85 個(gè)靶點(diǎn)116 個(gè)分子功能條目(P<0.05),主要為磷酸酶結(jié)合、泛素樣-蛋白連接酶結(jié)合、蛋白磷酸酶結(jié)合、氧化還原酶活性、細(xì)胞因子受體結(jié)合、血紅素結(jié)合、四吡咯結(jié)合、泛素蛋白連接酶結(jié)合以及細(xì)胞因子活性等。
2.1.6 KEGG 通路富集分析 結(jié)果(圖5)顯示:通過KEGG 通路富集分析篩選出85 個(gè)靶點(diǎn)163 條信號通路,主要與磷脂酰肌醇3-激酶-絲氨酸/蘇氨酸蛋白激酶(phosphoinositide3-kinase-Akt, PI3KAkt)信號通路、流體剪切應(yīng)力和動(dòng)脈粥樣硬化、AGE-RAGE(advanced glycation end product-receptor for advanced glycation end product)信號通路、內(nèi)分泌抵抗、IL-17 信號通路、T 細(xì)胞受體信號通路等。

圖5 KEGG 通路富集分析氣泡圖
2.2 羅布麻對小鼠的影響
2.2.1 羅布麻對衰老小鼠一般情況的影響 與對照組小鼠比較,模型組小鼠出現(xiàn)精神萎靡,倦怠嗜睡,喜扎堆,進(jìn)食減少,毛色枯槁無光澤、易脫落,皮膚彈性差等衰老體征,羅布麻組小鼠上述情況改善。
2.2.2 羅布麻對衰老小鼠肝臟組織的影響 對照組小鼠肝小葉、匯管區(qū)等結(jié)構(gòu)基本完整,肝細(xì)胞形態(tài)基本正常,無變性和壞死;模型組小鼠肝組織發(fā)生肝細(xì)胞排列紊亂,肝細(xì)胞脂肪變性、局灶壞死、驗(yàn)證細(xì)胞浸潤等退行性改變;羅布麻組小鼠肝組織肝細(xì)胞排列稍紊亂,肝細(xì)胞脂肪變性、局灶壞死、驗(yàn)證細(xì)胞浸潤等退行性改變較模型組小鼠減輕(圖6)。

圖6 小鼠肝臟組織H-E 染色
2.2.3 羅布麻對衰老小鼠p53 表達(dá)的影響 采用Western 印跡法檢測羅布麻對關(guān)鍵靶點(diǎn)p53 表達(dá)的影響(圖7A、7B):與對照組比較,模型組小鼠p53的表達(dá)水平顯著上調(diào)(P<0.01);羅布麻組小鼠p53 的表達(dá)水平上調(diào),但低于模型組(P<0.05)。采用免疫熒光檢測小鼠p53 的表達(dá)(圖7C):羅布麻組p53 表達(dá)較模型組減弱。

圖7 小鼠肝臟p53 表達(dá)分析
3.1 羅布麻抗衰老機(jī)制的網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)預(yù)測 本研究通過文獻(xiàn)和網(wǎng)絡(luò)數(shù)據(jù)庫篩選出金絲桃苷、木犀草素、蕓香苷、兒茶素、羅布麻寧等關(guān)鍵活性成分。在衰老大鼠模型中,金絲桃苷通過抑制自噬衰老進(jìn)程中的腎臟結(jié)構(gòu)老化、損傷,緩解其功能衰退[7]。蕓香苷可上調(diào)衰老相關(guān)基因叉頭框蛋 白O(forkhead box protein O,F(xiàn)oxO) 及 抗 氧化基因錳超氧化物歧化酶(manganese superoxide dismutase,MnSOD) 和 過 氧 化 氫 酶(catalase,CAT)的表達(dá),進(jìn)而提高高脂飲食飼養(yǎng)的果蠅對冷熱休克、饑餓應(yīng)激的抵抗能力,并延長其壽命[8-10];木犀草素可上調(diào)sirtuin 1 和p53 的表達(dá),進(jìn)而減輕H2O2誘導(dǎo)的氧化應(yīng)激性細(xì)胞衰老[11];兒茶素可提高機(jī)體的抗氧化能力,促進(jìn)大腦單胺能神經(jīng)遞質(zhì)的分泌,改善衰老進(jìn)程中的腦功能和日常生活活動(dòng)能力[12];羅布麻寧是天然的煙酰胺腺嘌呤二核苷酸還原酶(NADH)氧化酶抑制劑,可通過調(diào)控一氧化氮合酶(nitric oxide synthase,NOS)的表達(dá),調(diào)控衰老進(jìn)程中血管結(jié)構(gòu)老化和功能衰退[13-15]。
通過數(shù)據(jù)庫檢索篩選出85 個(gè)作用靶點(diǎn),其中核心靶點(diǎn)為p53、AKT1、IL-6、INS。p53 是重要的轉(zhuǎn)錄因子,在細(xì)胞應(yīng)激反應(yīng)、細(xì)胞增殖與凋亡、DNA 修復(fù)、衰老細(xì)胞微環(huán)境調(diào)控過程中發(fā)揮重要作用[16]。在線蟲和小鼠衰老模型中發(fā)現(xiàn),p53 通過負(fù)向調(diào)控細(xì)胞自噬延緩衰老[17]。AKT 在細(xì)胞存活和凋亡中起重要作用,活化的AKT 通過磷酸化多種激酶和轉(zhuǎn)錄因子等調(diào)節(jié)細(xì)胞功能,包括p21、p27、Foxo 等衰老相關(guān)分子[18]。胰島素抵抗是衰老在代謝上的重要特點(diǎn)之一[19],并進(jìn)一步介導(dǎo)衰老進(jìn)程中的炎癥環(huán)境改變[20]。衰老狀態(tài)下循環(huán)炎癥標(biāo)志物處于高水平,其中超過800 個(gè)基因轉(zhuǎn)錄與IL-6 有關(guān)[21-22]。
通過KEGG 通路富集分析篩選出PI3K-AKT、流體剪切應(yīng)力和動(dòng)脈粥樣硬化、AGE-RAGE、內(nèi)分泌抵抗、IL-17、TNF-α 等信號轉(zhuǎn)導(dǎo)通路,其在衰老過程中調(diào)控細(xì)胞存活和凋亡、代謝、炎癥反應(yīng)等關(guān)鍵生物學(xué)過程。
3.2 羅布麻的抗衰老作用和靶點(diǎn)的實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證 在以往羅布麻抗衰老研究[2-4,6]基礎(chǔ)上,本研究采用D-半乳糖皮下注射構(gòu)建衰老小鼠模型,觀察到羅布麻可改善衰老小鼠的一般衰老癥狀和體征,減輕衰老導(dǎo)致的肝臟組織病理學(xué)改變,抑制衰老進(jìn)程中肝臟組織p53 表達(dá)的上調(diào)。p53 作為一種轉(zhuǎn)錄因子發(fā)揮作用,通過結(jié)合啟動(dòng)子區(qū)域來上調(diào)或下調(diào)特定靶基因的表達(dá),通過結(jié)合內(nèi)含子位點(diǎn)促進(jìn)選擇性轉(zhuǎn)錄,從而調(diào)控下游靶基因和效應(yīng)器。p53 及其調(diào)控的信號網(wǎng)絡(luò)能促進(jìn)受損細(xì)胞的修復(fù)、存活或消除,在衰老過程中發(fā)揮重要作用。在不同的環(huán)境下,p53 可選擇性臨時(shí)阻止細(xì)胞分裂,啟動(dòng)DNA 修復(fù)機(jī)制,無法使DNA 修復(fù)時(shí)誘導(dǎo)細(xì)胞死亡,或者進(jìn)入DNA復(fù)制性衰老狀態(tài)[23]。動(dòng)物模型中,衰老與p53 活化有關(guān),p53 缺失則可抑制衰老表型的發(fā)生[24-25]。
綜上所述,本研究利用網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)方法預(yù)測了羅布麻抗衰老的多個(gè)成分和多個(gè)靶點(diǎn),并通過動(dòng)物模型驗(yàn)證了羅布麻可能通過下調(diào)p53 的表達(dá)發(fā)揮其抗衰老作用,但其調(diào)控p53 的上游途徑,以及下游靶基因和效應(yīng)器尚有待進(jìn)一步探討。
利益沖突:所有作者聲明不存在利益沖突。