普通煙草CCCH 類鋅指蛋白家族的全基因組鑒定和表達分析

唐春閨，鄧兆龍，劉 瓊，金維環，向世鵬，謝鵬飛，郭紅祥，劉衛群

（1. 湖南省煙草公司長沙市公司，湖南 長沙 410011；2. 河南農業大學生命科學學院，河南 鄭州 450002）

植物中，CCCH 類鋅指蛋白不僅參與植物的生長發育過程[1‐2]，同時也參與植物對生物和非生物脅迫的響應[3]。植物CCCH 類鋅指蛋白通常包含1～6個保守CCCH 基序[4]，CCCH 基序最初被定義為CX6～14-C-X4～5-C-X3～4-H（X 代表任意氨基酸）[5]，但后續在擬南芥和水稻中發現了不同于原始分類的CCCH 基序[6]，因此，CCCH 基序被定義為C-X4～15-CX4～6-C-X3～4-H[6]。不同植物包含有相同的CCCH 基序[7]，并且C-X7-8-C-X5-C-X3-H 為最常見的基序[8]。TZF（Tandem CCCH zinc‐finger）蛋白通常包含有串聯重復的CCCH 基序[2]，到目前為止，CCCH 蛋白功能研究主要集中在TZF 類蛋白上，非TZF 類CCCH類鋅指蛋白研究較少[2‐3]。

CCCH 類鋅指蛋白在脫落酸（ABA）、赤霉素（GA）等激素介導的信號通路中發揮作用[9‐10]。擬南芥中，SOMNUS 蛋白通過調節內源ABA 和GA 含量從而調控ABA 和GA 的代謝[11]；AtTZF1、AtTZF4、AtTZF5 和AtTZF6 通過ABA 和GA 信號途徑，調節擬南芥對高鹽、冷和干旱脅迫的耐受性[12‐13]。OsC3H47 通過降低對ABA 的敏感性從而增加水稻對干旱脅迫的耐受性[14]。棉花GhTZF1、水稻OsTZF1 和OsTZF2 、擬南芥AtTZF2 和AtTZF3 都通過茉莉酸（JA）信號途徑調節植物葉片衰老[9，15‐17]。除了激素信號途徑之外，CCCH 鋅指蛋白還參與其他多種生物和非生物脅迫[3，18]。盡管在擬南芥、水稻等物種中發現CCCH鋅指蛋白家族基因參與多種脅迫過程，但煙草CCCH 類鋅指蛋白基因家族成員的鑒定、環境信號感知以及激素信號響應研究鮮有報道。鑒于此，運用生物信息學方法，以擬南芥CCCH類鋅指蛋白家族成員蛋白質基序為基礎，在煙草基因組數據庫中進行煙草CCCH 類鋅指蛋白家族鑒定，并從系統進化、染色體分布、蛋白質理化性質、Motif 預測等方面分析煙草CCCH 類鋅指蛋白家族成員的特性；……