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基于熵權(quán)法構(gòu)建真菌對(duì)木質(zhì)纖維降解速率模型

2022-05-20 03:50:16黃怡嘉呂祥旭林佳偉
科技視界 2022年12期
關(guān)鍵詞:因素模型

黃怡嘉 呂祥旭 林佳偉

(江南大學(xué)物聯(lián)網(wǎng)工程學(xué)院,江蘇 無錫 214122)

0 引言

森林在調(diào)節(jié)氣候、維持生態(tài)平衡和地球物質(zhì)循環(huán)中的作用至關(guān)重要。森林凋落物的分解是驅(qū)動(dòng)生物地球化學(xué)循環(huán)的重要過程,真菌是森林凋落物分解中最主要的微生物。在凋落物分解的不同階段,參與的真菌種類也有不同;不同真菌對(duì)凋落物的分解速率受環(huán)境溫濕度、土壤基質(zhì)和養(yǎng)分等多種因素的影響。真菌群落還受氣候、土壤、樹種等因素影響。因此,森林凋落物分解是一個(gè)涉及多種因素的復(fù)雜問題。

鑒于碳、氮等物質(zhì)循環(huán)在地球生物化學(xué)循環(huán)中的重要性,準(zhǔn)確估算凋落物分解速率對(duì)于地球物質(zhì)循環(huán)研究有重要意義。然而,凋落物分解試驗(yàn)受時(shí)間和環(huán)境條件等多因素的限制,一般都以小規(guī)模試驗(yàn)為主。早期研究者以凋落物的失重率來描述,后來開始用數(shù)學(xué)建模的方式進(jìn)行研究,從簡單的線性模型發(fā)展到后來的單指數(shù)模型、 雙指數(shù)或三指數(shù)模型等。Lustenhouwer 等在PNAS 上發(fā)表了對(duì)34 種腐生真菌降解木質(zhì)纖維做的長達(dá)五年的研究,結(jié)果發(fā)現(xiàn)真菌生長速率、耐濕性等特性對(duì)木質(zhì)纖維分解速率有著極為重要的影響。2021 年2 月美國大學(xué)生數(shù)學(xué)建模競賽(Mathematical Contest In Modeling,MCM)A 題基于此研究成果建模,筆者有幸參加并獲得了Honorable Mention 獎(jiǎng)(二等獎(jiǎng)),現(xiàn)將建模思路和過程報(bào)道如下,以供參考。

1 真菌群落分解水平評(píng)價(jià)模型的建立

基于Lustenhouwer 等的成果,選取真菌生長速率、 耐濕性兩個(gè)重要特性作為參考因素,用熵權(quán)法(Entropy weight method,EWM)建立總歸因指標(biāo)(Total attribution index,)來衡量真菌群落的分解水平,再用分位圖法檢驗(yàn)與參考因素之間的相關(guān)性,最終通過Sobol 法檢驗(yàn)?zāi)P偷目煽啃浴?/p>

在信息論中,熵可以用來度量某一狀態(tài)數(shù)據(jù)的有效信息量,熵權(quán)表示項(xiàng)目因素在系統(tǒng)中的權(quán)重。影響森林凋落物分解的因素有很多,以凋落物的分解速率為總歸因指標(biāo),采用熵權(quán)法對(duì)影響因素分別賦權(quán),來衡量真菌對(duì)纖維木質(zhì)的分解水平。由于不同真菌種類對(duì)木質(zhì)纖維的分解能力有差異,用目標(biāo)差異(Goal difference,)來描述真菌種類的分解效果差異,用目標(biāo)方差來衡量真菌種類的實(shí)際分解效果。最后,分析總歸因指標(biāo)與實(shí)際分解效果之間的相關(guān)性。基于文獻(xiàn)[1]的真菌分解木質(zhì)纖維的研究報(bào)告及數(shù)據(jù),選擇了濕度生態(tài)位寬度(以下簡稱耐濕性)、群落間競爭、真菌生長速率和木塊腐朽時(shí)間共4 個(gè)因素來評(píng)價(jià)木質(zhì)纖維的分解速率。先分別將以上4 個(gè)因子定義為、、和,使用熵權(quán)法,經(jīng)數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn)化、求熵值,計(jì)算4個(gè)因素的權(quán)重,再對(duì)這些因素進(jìn)行加權(quán),得到總歸因指標(biāo)計(jì)算公式:

2 真菌特性相關(guān)性與模型的求解

為了了解群落實(shí)際分解目標(biāo)差異()與得到的總歸因指標(biāo)()之間是否存在相關(guān)關(guān)系,使用分位圖(Quantile-Quantile)對(duì)它們進(jìn)行分析,結(jié)果如圖1 所示。

圖1 目標(biāo)差異(GD)與總歸因指標(biāo)(TAI)的分位圖

從圖可知,二者呈顯著的正相關(guān)(=0.927),擬合方程為=2.059+0.659。說明獲得的總歸因指標(biāo)能夠反映木質(zhì)纖維凋落物的分解速率,分解速率與菌絲延伸率和耐濕性這兩個(gè)性狀高度相關(guān)。

為了模擬真菌生長速率、菌絲耐濕性與木質(zhì)降解速率之間的數(shù)學(xué)關(guān)系,從參考文獻(xiàn)[1]中的Figure1 和Figure2 中提取出與菌絲延伸速率有關(guān)的降解速率(Decomposition Rate Relating to hyphae extension rate)和菌絲延伸率(Hyphal Extension Rate)、與菌絲濕度耐受有關(guān)的降解速率(Decomposition Rate Relating to moisture tolerance) 和耐濕性(Moisture Tolerance)的數(shù)據(jù)用于建模。然后,利用k-最近鄰算法(K-Nearest Neighbor,KNN)計(jì)算(設(shè)為)和(設(shè)為)之間的曼哈頓距離(Manhattan Distance)(,)。當(dāng)(,)取得最小值時(shí):

由于不同溫度下(10℃、16℃、22℃)真菌對(duì)木質(zhì)纖維的降解速率不同,基于熵權(quán)法使用MATLAB 計(jì)算了在不同溫度下和的權(quán)重:

=10℃∶=0.409 2∶0.590 8

=16℃∶=0.278 7∶0.721 3

=22℃∶=0.407 0∶0.593 0

由于溫度不是與關(guān)系中的變量,所以分別求和在3 個(gè)不同溫度下的算術(shù)平均值來代表一般溫度情況下和的平均權(quán)重:

則總分解速率(Total decomposition rate,TDR)為:

為了進(jìn)一步獲得與真菌生長速率、 耐濕性的數(shù)據(jù)關(guān)系,進(jìn)一步求出了和與、的數(shù)據(jù)關(guān)系。即根據(jù)參考文獻(xiàn)[1]中Figure 1 的數(shù)據(jù),利用MATLAB 繪制出與的關(guān)系圖,如圖2 所示,獲得的擬合曲線方程如式(5)所示:

同樣,利用MATLAB 對(duì)和繪制散點(diǎn)圖和擬合曲線(見圖2):

圖2 總分解速率(TDR)與菌絲濕度耐受性(R1)和真菌生長速率(R3)的擬合曲線

將模型中和兩個(gè)因素結(jié)合后,最終獲得以真菌生長速率、 耐濕性為主要因子的木質(zhì)纖維分解模型:

3 模型的靈敏度檢驗(yàn)

由于真菌生長速率和競爭能力受環(huán)境條件的影響,基于種群競爭模型中建立的真菌生長速率和耐濕性對(duì)總分解速率的敏感性,計(jì)算出不同種類真菌的平均耐濕性為0.103 5±0.480 5(均數(shù)±標(biāo)準(zhǔn)差),真菌生長速率的平均值為1.758 4±1.618 8(mm·day)。接著,利用Sobol 法檢驗(yàn)的靈敏度。首先,將耐濕性()設(shè)定在平均值上,對(duì)菌絲延伸率進(jìn)行波動(dòng),經(jīng)過數(shù)據(jù)處理,得到的取值范圍:[4.696 9,21.192 3],90%和95%的置信區(qū)間如圖3 所示;同法,菌絲伸長率(R3)在90%和95%的置信區(qū)間分別為[8.386 7,11.152 2]和[8.308 2,11.227 3],無論是菌絲伸長率還是耐濕性的波動(dòng)區(qū)間均在合理范圍內(nèi),與Lustenhouwer 等的實(shí)測數(shù)據(jù)區(qū)間相符,模型行為模式?jīng)]有因參數(shù)的微小變動(dòng)而出現(xiàn)異動(dòng),表明模型可信。

圖3 耐濕性(R1)和真菌生長速率(R3)波動(dòng)時(shí)總分解速率(TDR)的置信區(qū)間

4 結(jié)語

碳循環(huán)作為生態(tài)系統(tǒng)不可或缺的重要組成部分,植物材料和木質(zhì)纖維的分解在其中有舉足輕重的貢獻(xiàn),而這些材料的分解主要依靠著真菌。本文通過對(duì)文獻(xiàn)[1]數(shù)據(jù)的分析,采用數(shù)學(xué)建模的方法模擬了真菌對(duì)木質(zhì)纖維分解速率,并結(jié)合熵權(quán)法進(jìn)行求解,得到了耐濕性與真菌生長速率的定量關(guān)系模型,具有較高的可靠性,是用熵權(quán)法建模以評(píng)估真菌群落分解木質(zhì)纖維速率的一個(gè)有意義的嘗試。從建模角度而言,一方面要盡可能覆蓋不同環(huán)境,包含所有的主要影響因素,才可能使模型更具有普適性;另一方面又要防止因素過多使模型過于復(fù)雜而降低外推的實(shí)用性。當(dāng)然,真實(shí)的木質(zhì)分解過程受到氣候環(huán)境、土壤環(huán)境、真菌群落等多種因素的影響,是一個(gè)相當(dāng)復(fù)雜的過程。該模型的推廣與延伸還需要獲取其他森林環(huán)境下更多數(shù)據(jù)進(jìn)行測試和改進(jìn)優(yōu)化,才能更好適用性的模型。

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