杜洋,趙曉燕
(鄭州大學第一附屬醫院心血管內科,河南 鄭州 450052)
心肌梗死(myocardial infarction,MI)是一種嚴重的急性缺血性心臟狀態[1],供養心肌的冠脈血管由于各種原因急性閉塞,導致部分心肌血液供應突然中斷,心肌因無法獲取足夠的能量而導致急性損傷以及一系列的后續并發癥。近年來隨著各種新藥、新技術的應用,特別是各地胸痛中心的廣泛建立,MI后得到血管再灌注治療的時間明顯縮短,MI的病死率明顯下降,但同時MI后心力衰竭(heart failure,HF)以及HF導致的心源性休克的發生率明顯提高,它的發生不僅增加了MI的治療難度,而且惡化了MI預后。目前針對HF的治療仍然以藥物為主,主要針對神經體液因素、心肌能量代謝、心室重構以及改善臨床癥狀等。但現有藥物在臨床治療過程中仍有許多不足。基因組學的目的是對生物體所有基因進行集體表征、定量研究及不同基因組比較研究,在表征和量化后研究基因組的結構、功能、進化、定位和編輯等,以及其對生物體的影響[2]。通過基因測序、遺傳分析等手段,對基因組間和組內的相互作用進行研究。本研究采用生物信息學分析工具對MI后HF大鼠的外周血單個核細胞基因組學特征進行分析,為揭示MI后HF的基因組學特征、闡明MI后HF形成過程、尋找藥物治療新靶點提供依據。
1.1 獲取基因數據在GEO DATESETS數據庫中(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/gds)搜索“heart failure”的標本,選擇“大鼠(rattus norvegicus)”作為研究物種,挑選DOROTA TULACZ等提交的名為GSE47495基因芯片數據,這是一組來自Affymetrix Mouse Gene 1.0 ST Array基因表達芯片平臺GPL6247,共有29 214個基因的芯片數據。……