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腫瘤蛋白翻譯控制1的反義RNA 1在肺癌中的表達及其對肺癌細胞增殖、遷移和侵襲的影響

2022-04-04 07:09:08張龍王瑞趙佳
安徽醫藥 2022年4期
關鍵詞:肺癌檢測

張龍,王瑞,趙佳

肺癌早期缺乏明顯臨床癥狀,易復發和轉移,五年生存率依然較低[1-3]。探究肺癌發生發展的分子機制可為其治療提供分子靶點[4-6]。腫瘤蛋白翻譯控制1(TPT1)的反義RNA 1(TPT1-AS1)是一種在胃癌[7]、上皮性卵巢癌[8]等腫瘤中表達升高的長鏈非編碼RNA(lncRNA),其促進這些腫瘤的發展進程。然而,TPT1-AS1 能否影響肺癌的發生發展還未知。Starbase 生物信息軟件預測顯示,TPT1-AS1 可能與微小RNA-671-5p(miR-671-5p)結合。miR-671-5p在肺癌組織中表達下調,可作為肺癌診斷的生物標志物[9]。本研究以TPT1-AS1/miR-671-5p軸為切入點,探究了肺癌發生發展的分子機制,報告如下。

1 資料與方法

1.1 一般資料46 例肺癌組織和對應癌旁組織取自于2017 年1 月至2018 年12 月在信陽市中心醫院確診并行手術治療的肺癌病人,其中男28 例,女18例,年齡(63.25±8.76)歲;肺腺癌21 例,肺鱗癌25例。納入標準:(1)經病理確診為非小細胞肺癌病人;(2)術前未進行放療、化療。病人知情同意,本研究符合《世界醫學協會赫爾辛基宣言》相關要求。

1.2 試劑A549 細胞系,中國科學院上海細胞庫;BCA 蛋白檢測試劑盒、RPMI 1640 培養基、Annexin V-FITC/PI 細胞凋亡試劑盒、MTT 和LipofectamineTM2000 試劑盒,北京索萊寶;PCR 實驗相關試劑盒,大連寶生物工程有限公司;胎牛血清,浙江天杭;引物序列、TPT1-AS1小干擾RNA(si-TPT1-AS1)和過表達載體(pcDNA-TPT1-AS1)、小干擾RNA陰性序列(si-NC)、空載體(pcDNA)、TPT1-AS1野生型(WT)和突變型(MUT)熒光素酶報告載體、miR-671-5p 模擬物(mimcs)、抑制劑陰性序列(anti-miR-NC)、miR-671-5p抑制劑(anti-miR-671-5p)、模擬對照序列(miR-NC),上海吉瑪制藥技術有限公司;蛋白質印跡實驗所需抗體,美國Santa Cruz公司。

1.3 實驗方法

1.3.1 實時熒光定量PCR(RT-qPCR)檢測組織中TPT1-AS1 和miR-671-5p 表達組織中總RNA 經Trizol試劑提取后,逆轉錄互補DNA(cDNA),行PCR擴增。擴增程序:先設置溫度為95 ℃,進行預變性處理,時間為10 min。然后95 ℃條件下變性30 s,之后設置溫度為58 ℃進行退火,時間為30 s;最后再設置溫度為72 ℃進行延伸,時間為30 s,循環此過程,共35 個循環。引物序列見表1。2-ΔΔCt法計算組織中TPT1-AS1 相對GAPDH、miR-671-5p 相對U6 的表達量。

表1 引物序列

1.3.2 細胞培養和轉染 用完全培養基(含10 %FBS的RPMI 1640培養基)培養A549細胞。將A549細胞接種于6 孔板中,每孔接種細胞數為1×105個。培養12 h 后,將LipofectamineTM2000 試劑分別與si-NC(si-NC 組)、si-TPT1-AS1(si-TPT1-AS1 組)、pcDNA-TPT1-AS1(pcDNA-TPT1-AS1 組)、pcDNA(pcD-NA組)、共轉染si-TPT1-AS1與anti-miR-NC(si-TPT1-AS1+anti-miR-NC 組)、si-TPT1-AS1 與anti-miR-671-5p(si-TPT1-AS1+anti-miR-671-5p 組)混合均勻,取100 μL 混合液緩慢加至6 孔板中,孵育細胞6 h。然后利用RT-qPCR 法檢測細胞中TPT1-AS1 或miR-671-5p表達,驗證轉染效果后用于后續實驗。

1.3.3 雙熒光素酶報告基因實驗 將A549 細胞接種于6 孔板中,每孔接種細胞數為1×105個。培養12 h 后,將LipofectamineTM2000 試劑分別 與TPT1-AS1-WT 和miR-671-5p mimic(或miR-NC)、TPT1-AS1-MUT 和miR-671-5p mimic(miR-NC)混合均勻,取100 μL 混合液緩慢加至6 孔板中,孵育細胞6 h。然后收集細胞細胞并裂解,3 500 r/min 離心10 min。取20 μL 上清液,將其與100 μL 1×螢火蟲或海腎熒光素酶反應工作液混合均勻,檢測螢火蟲或海腎的熒光強度。細胞熒光素酶活性=螢火蟲熒光強度/海腎熒光強度。

1.3.4 MTT 檢測細胞增殖 將各組轉染細胞接種于96 孔板中,每孔接種細胞數為2.5×104個。同時設對照組:接種未進行轉染的A549細胞。培養24 h后,取5 g/L 的MTT 加至各孔(20 μL/孔),將細胞孵育4 h。棄培養基,加二甲基亞砜(150 μL/孔),反應5 min,振蕩均勻。將96 孔板放入酶標儀檢測卡槽中,設置λ 為490 nm,測各孔吸光度(A)值。存活率(%)=A實驗組/A對照組×100%。

1.3.5 Transwell 檢測細胞遷移和侵襲 遷移:取100 μL 各組轉染細胞加至Transwell 小室上室,每室細胞數為1.0×104個。另取500 μL 完全培養基加至下室。培養24 h 后,棄培養基,將下室細胞依次固定、染色后,顯微鏡觀察,拍照并計數。侵襲:將Matrigel 基質膠均勻地鋪在Transwell 上室,待其干燥后,按照遷移實驗的步驟操作。

1.3.6 蛋白印跡法檢測細胞周期蛋白D1(CyclinD1)、基質金屬蛋白酶(MMP)-2 和MMP-9 蛋白表達 各組細胞中總蛋白經RIPA 試劑提取后,用BCA法定量,然后用SDS-PAGE實驗分離。將分離蛋白轉至PVDF膜,用5%脫脂奶粉封閉1 h。于4 ℃冰箱中分別用CyclinD1(1∶800)、MMP-2(1∶1 000)、MMP-9(1∶1 000)和GAPDH(1∶1 500)一抗孵育,過夜后洗膜。再置于山羊抗兔二抗(1∶5 000)中,37 ℃孵育1 h。加顯影液顯影,曝光拍照。

1.4 統計學方法用SPSS 22.0 軟件進行統計學分析。實驗數據均符合正態分布,以表示。癌旁組織和癌組織中TPT1-AS1 和miR-671-5p 表達量的比較采用配對t檢驗;肺腺癌組和肺鱗癌組TPT1-AS1和miR-671-5p表達量的比較及熒光素酶活性檢測結果的比較用獨立樣本t檢驗;對照組、si-NC 組、si-TPT1-AS1 組、si-TPT1-AS1+anti-miR-NC 組 和si-TPT1-AS1+anti-miR-671-5p 細胞存活率、遷移數和侵襲數及CyclinD1、MMP-2、MMP-9蛋白表達的比較均先用單因素方差分析,然后再用LSD-t檢驗進行組間兩兩比較。肺癌組織中TPT1-AS1 和miR-671-5p 表達的相關性采用Pearson 相關性分析。差異有統計學意義以P<0.05表示。

2 結果

2.1 TPT1-AS1 和miR-671-5p 肺癌組織中的表達46 例肺癌病人癌組織中TPT1-AS1 表達量為1.88±0.12,較癌旁組織TPT1-AS1 表達量1.01±0.08顯著升高(t=38.37,P<0.05);癌組織中miR-671-5p表達量為0.45±0.04,較癌旁組織中miR-671-5p 表達量1.01±0.06顯著降低(t=46.14,P<0.05)。

2.2 不同病理分型肺癌組織中TPT1-AS1 和miR-671-5p 的表達將46例肺癌病人分為肺腺癌組(21例)和肺鱗癌組(25 例)。肺腺癌組、肺鱗癌組病人的癌組織中TPT1-AS1 表達量分別為1.87±0.14、1.89±0.11,miR-671-5p表達量分別為0.47±0.05、0.45±0.04。兩組間TPT1-AS1 和miR-671-5p 的表達比較均差異無統計學意義(tTPT1-AS1=0.54,P=0.590;tmiR-671-5p=1.51,P=0.139)。

2.3 肺癌組織中TPT1-AS1 和miR-671-5p 表達的相關性Pearson 相關性分析顯示,肺癌組織中TPT1-AS1 和miR-671-5p呈負相關(r=-0.63,P<0.05)。見圖1。

圖1 肺癌組織中腫瘤蛋白翻譯控制1(TPT1)的反義RNA 1(TPT1-AS1)和miR-671-5p表達的相關性(線性方程:y=-0.230 65x+0.888,P<0.05)

2.4 肺癌細胞中TPT1-AS1 靶向調控miR-671-5pTPT1-AS1 與miR-671-5p 核苷酸序列的結合位點見圖2。共轉染TPT1-AS1-WT 與miR-671-5p 的A549 細胞熒光素素酶活性為0.42±0.06,較共轉染TPT1-AS1-WT 與miR-NC 的A549 細胞熒光素素酶活性(1.04±0.07)顯著降低(t=20.18,P<0.05);共轉染TPT1-AS1-MUT 與miR-671-5p 的A549 細胞熒光素素酶活性為0.99±0.06,與共轉染TPT1-AS1-MUT與miR-NC 的A549 細胞熒光素素酶活性1.00±0.05比較差異無統計學意義(t=0.38,P=0.706)。si-TPT1-AS1 組A549 細胞中miR-671-5p 表達水平顯著高于si-NC 組[(1.81±0.09)比(1.05±0.05),t=22.15,P<0.05],而pcDNA-TPT1-AS1 組A549 細 胞 中miR-671-5p 表達水平顯著低于pcDNA 組[(0.40±0.05)比(1.01±0.11),t=15.15,P<0.05]。

圖2 TPT1-AS1與miR-671-5p的核苷酸序列結合位點

2.5 各組細胞增殖、遷移和侵襲能力比較si-TPT1-AS1 組A549 細胞存活率、遷移數和侵襲數較si-NC 組均顯著降低(P<0.05)。si-TPT1-AS1+antimiR-671-5p組A549細胞存活率、遷移數和侵襲數較si-TPT1-AS1+anti-miR-NC 組均顯著升高(P<0.05)。對照組與si-NC 組、si-TPT1-AS1 組與si-TPT1-AS1+anti-miR-NC 組各檢測指標比較差異均無統計學意義(P>0.05)。見圖3、表2。

表2 各組細胞存活率及遷移和侵襲細胞數/

表2 各組細胞存活率及遷移和侵襲細胞數/

注:①與si-NC組比較,P<0.05。②與si-TPT1-AS1+anti-miR-NC組比較,P<0.05。

2.6 各組細胞中CyclinD1、MMP-2和MMP-9蛋白表達水平比較CyclinD1、MMP-2 和MMP-9 蛋白在si-TPT1-AS1組A549細胞中的表達量較si-NC組均顯著降低(P<0.05)。CyclinD1、MMP-2和MMP-9蛋白在si-TPT1-AS1+anti-miR-671-5p 組細胞中的表達量較si-TPT1-AS1+anti-miR-NC 組均顯著升高(P<0.05)。對照組與si-NC 組、si-TPT1-AS1 組與si-TPT1-AS1+anti-miR-NC 組CyclinD1、MMP-2 和MMP-9 蛋白表達量比較均差異無統計學意義(P>0.05)。見圖4、表3。

表3 各組細胞中CyclinD1、MMP-2和MMP-9蛋白表達水平/

表3 各組細胞中CyclinD1、MMP-2和MMP-9蛋白表達水平/

注:si-NC 為小干擾RNA 陰性序列組,si-TPT1-AS1 組為TPT1-AS1 小干擾RNA 組,si-TPT1-AS1+anti-miR-NC 組為TPT1-AS1 小干擾RNA 與抑制劑陰性序列共轉染組,si-TPT1-AS1+anti-miR-671-5p 組為TPT1-AS1 小干擾RNA 與miR-671-5p 抑制劑共轉染組,CyclinD1 細胞周期蛋白D1,MMP-2基質金屬蛋白酶-2,MMP-9基質金屬蛋白酶-9。①與si-NC組比較,P<0.05。②與si-TPT1-AS1+anti-miR-NC組比較,P<0.05。

圖4 各組細胞中CyclinD1、MMP-2和MMP-9蛋白表達

3 討論

TPT1-AS1 位于13 號染色體,其異常表達與多種腫瘤的發展進程密切相關。研究顯示,TPT1-AS1是結腸癌組織中表達上調的lncRNA,與病人預后不良密切相關,其通過上調細胞中VEGFA的表達促進腫瘤血管生成和轉移[10];TPT1-AS1 宮頸癌中TPT1-AS1 呈高表達,敲減TPT1-AS1 可通過負調控miR-324-5p 抑制宮頸癌細胞的惡性行為及上皮間質轉化過程,進而阻礙宮頸癌的發展進程,TPT1-AS1 有可能成為宮頸癌治療的分子靶標[11]。本研究結果顯示,肺癌組織中TPT1-AS1的表達水平顯著高于對應的癌旁組織,與相關報道結果一致[12],這提示TPT1-AS1可能參與肺癌的發生發展。

本研究通過下調肺癌細胞中TPT1-AS1 的表達發現,下調TPT1-AS1 可引起肺癌細胞增殖活性、遷移及侵襲能力均顯著降低,這提示下調TPT1-AS1可能有利于延緩肺癌的發展進程,對改善肺癌病人預后具有積極作用。CyclinD1 對細胞增殖起促進作用,這與其促進細胞周期由G1 期向S 期轉變有關[13]。MMP-2 和MMP-9 是能夠降解細胞外基質的基質金屬蛋白酶家族成員,對腫瘤細胞遷移和侵襲起促進作用[14]。本研究數據顯示,下調TPT1-AS1降低了肺癌細胞中與增殖、遷移及侵襲相關的蛋白CyclinD1、MMP-2 和MMP-9 的表達,與相關報道結果一致[15-16],這進一步從蛋白水平說明下調TPT1-AS1 能夠抑制肺癌細胞的惡性行為,TPT1-AS1 有可能成為肺癌治療的分子靶點。

為了探究下調TPT1-AS1 抑制肺癌細胞惡性行為的分子機制,本研究證實了TPT1-AS1能夠靶向結合并負調控miR-671-5p,這與肺癌組織中TPT1-AS1與miR-671-5p 表達呈負相關的結果一致。研究顯示,miR-671-5p 是乳腺癌[17]、食管鱗狀細胞癌[18]、胃癌[19]等腫瘤組織中表達降低的miRNA,其作為抑癌基因對這些腫瘤的發展起抑制作用。但也有報道稱,miR-671-5p 在透明細胞腎細胞癌組織中呈高表達,發揮促癌基因作用促進該腫瘤細胞的惡性行為[20]。這表明miR-671-5p 在不同的腫瘤中發揮的作用不同。本研究顯示,肺癌組織中miR-671-5p 表達下調,與Nymark 等[9]報道的結果一致,提示miR-671-5p 在肺癌中也起抑癌基因作用。此外,本研究利用恢復實驗發現,miR-671-5p 表達的下調導致下調TPT1-AS1 對肺癌細胞惡性行為的抑制作用顯著降低,與相關研究結果一致[21],進一步提示TPT1-AS1 通過靶向miR-671-5p 影響肺癌細胞惡性行為,但其具體作用的miR-671-5p的靶基因還有待探究。

綜上所述,肺癌組織中TPT1-AS1 表達升高,miR-671-5p 表達降低,且兩者呈負相關;下調TPT1-AS1導致肺癌細胞的增殖、遷移和侵襲性受到抑制,這可能與下調TPT1-AS1 引起細胞中miR-671-5p 的表達上調有關,TPT1-AS1/miR-671-5p軸可能為肺癌的治療提供了新靶點。但本研究僅通過體外細胞實驗探究了TPT1-AS1 靶向miR-671-5p 對肺癌細胞增殖、遷移和侵襲的影響,接下來將通過裸鼠移植瘤實驗在體內觀察TPT1-AS1/miR-671-5p 軸對腫瘤生長和轉移的影響,同時對miR-671-5p 靶基因及下游信號通路進行探究。

(本文圖3見插圖4-2)

圖3 Transwell檢測細胞遷移和侵襲(結晶紫染色×200)

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