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PARP1單核苷酸多態性與轉移性食管鱗癌順鉑化療敏感性及預后關系*

2022-02-19 01:57:24仇俊蘭許麗華余玲玲
重慶醫學 2022年2期

趙 萬,仇俊蘭,許麗華,張 懷,張 允,余玲玲,奉 林

(南京醫科大學附屬蘇州科技城醫院腫瘤科,江蘇蘇州 215153)

食管癌是第六大常見腫瘤,我國食管癌每年新發病例約占全球的一半[1]。最常見的病理類型是食管鱗癌(esophageal squamous cell carcinoma,ESCC),約占總數的90%。食管癌患者在診斷時多數已處于中晚期,無手術根治機會,化療仍是最重要的治療手段。然而,約半數以上食管癌患者對化療并不敏感,化療耐藥已成為晚期食管癌治療的瓶頸。

聚腺苷二磷酸核糖聚合酶1[Poly(ADP-ribose)polymerase 1,PARP1]是一種核蛋白,參與多種細胞功能,包括基因轉錄調控、染色質重塑及DNA損傷修復[2]。研究發現,在卵巢癌耐藥細胞中PARP1呈高表達,通過下調PARP1水平,可恢復癌細胞對順鉑(cisplatin,DDP)的敏感性[3]。此外, PARP1是食管癌細胞中miR-223的直接靶基因,PARP1表達減少的細胞顯示對化療更加敏感[4]。PARP1表達水平還被證實是卵巢癌[5]和食管癌[6]患者的臨床預后指標。

PARP1單核苷酸多態性能改變PARP1的轉錄和表達[7],進而影響食管癌[8]的發病風險。但是,目前其與腫瘤化療療效的關系仍不清楚。因此,本研究旨在評價PARP1基因rs907187C/G、rs8679T/C和rs1136410T/C單核苷酸多態性對接受DDP為基礎化療的轉移性ESCC患者的化療反應及總生存期(overall survival,OS)的影響。

1 資料與方法

1.1 一般資料

選取2016年7月至2020年1月本院收治的175例轉移性ESCC患者,其中男97例,女78例,年齡27~79歲,中位年齡58歲,均為漢族。本研究經醫院倫理委員會審批(2016KJCYY017),受試者均自愿參加研究并簽署知情同意書。納入標準:(1)經組織病理學確診為ESCC;(2)伴有遠處臟器或組織轉移,無法手術根治切除;(3)至少有1個可經CT掃描測量評價的腫瘤病灶;(4)化療前心電圖、血常規、生化電解質均正常;(5)Karnofsky評分≥70分;(6)預計患者生存期超過3個月。排除標準:(1)年齡<18歲;(2)哺乳期或妊娠期婦女;(3)精神病史或存在認知障礙;(4)屬于化療禁忌證;(5)對研究藥物過敏;(6)既往接受過任何形式的抗腫瘤治療。

1.2 方法

1.2.1化療方案及療效評價

所有受試者均接受DDP聯合卡培他濱(capecitabine,CAPE)化療:DDP(齊魯制藥有限公司)75 mg/m2,加入生理鹽水500 mL靜脈滴注,第1天;CAPE (羅氏制藥有限公司)1 000 mg/m2,第1~14天口服,停藥7 d,21 d為1個周期。2個周期治療后行CT掃描測量腫瘤大小變化,依據RECIST1.1實體瘤評價標準,近期療效分為穩定(SD)、進展(PD)、部分緩解(PR)和完全緩解(CR)。PR、CR屬于化療敏感,而SD、PD對化療不敏感。所有受試者至少完成2個周期的化療,在治療過程的任何時間出現PD,則停止當前方案化療,更改為二線治療方案或予最佳支持治療。

1.2.2隨訪

本研究使用電話、電子郵件、查閱電子病歷系統等方式隨訪,截止時間為2020年12月30日。本組患者隨訪3~32個月,Reverse Kaplan-Meier法計算中位隨訪時間為30.3個月(95%CI:26.56~34.04)。其中19例受試者失訪,失訪患者的生存時間按截尾數據處理。OS:從首次化療開始至因任何原因引起死亡的時間(失訪患者為最后一次隨訪時間)。

1.2.3DNA提取和基因型分析

首次化療前抽取靜脈血5 mL,外周血DNA提取采用DNA快速抽提純化試劑盒(北京天根生化科技有限公司),DNA樣本置于-20 ℃冰箱保存。使用TaqMan探針法對基因型進行鑒別,PCR引物及探針由上海索寶生物科技有限公司制備,PCR反應預混液(TaqMan Real-Time PCR Master Mixes)由賽默飛世爾科技公司制備,PCR在美國ABI 7900HT實時熒光定量PCR儀上進行。PCR體系:DNA樣本1.0 μL,3.0 μL Mix、上下游引物各0.5 μL、TaqMan探針各0.5 μL、雙蒸水4.0 μL。PCR循環參數:95 ℃預變性3 min,95 ℃變性30 s,56 ℃退火30 s,72 ℃延伸30 s,共38個循環,72 ℃延伸8 min。捕獲熒光信號后,經SDS軟件分析得出基因型結果。rs907187:上游引物5′-TCGAATGTGCACTCAGTGATC-3′,下游引物5′-AGTATATGACGCATCGTCTGT-3′,探針:FAM-TACAGTGCTCACGCCATGGACA-MGB,HEX-TACT GCTCTACTAGCTTCGAT-MGB;rs8679:上游引物5′-AGTTAGCTGTCTAATGTGTC-3′,下游引物5′-CTA GTGGAGACTACGACGTC-3′,探針:FAM-TCACGCATCTAGCTAAGTATC-MGB,HEX-TACATCGGCT GATGATCTACAT-MGB;rs1136410:上游引物5′-ATGAGTCGCTTCGACTAGTGTCT-3′,下游引物5′-ATCCTACTCATGCTAACGTACA-3′,探針:FAM-CATGCTACTACATAGATGCTC-MGB,HEX-ATACT GAGTAGCAGTGTTACT-MGB。

1.3 統計學處理

采用SPSS23.0統計軟件進行分析。擬合優度卡方檢驗Hardy-Weinberg平衡。卡方檢驗分析臨床特征與化療反應的關系;logistic回歸分析基因型對化療反應的影響,計算OR及95%CI,并經性別、年齡、分化等因素調整;Kaplan-Meier法繪制生存曲線;基因型與OS的關系分別用Log-rank檢驗和Cox回歸模型進行單因素和多因素分析。以P<0.05為差異有統計學意義。

2 結 果

2.1 臨床特征對化療反應的影響

175例轉移性ESCC患者2例(1.1%)CR,66例(37.7%)PR,51例(29.1%)SD,56例(32.0%)PD,總化療有效率(CR+PR)為38.8%。患者年齡、性別、飲酒史、吸煙史、腫瘤分化程度、食管癌原發部位與化療反應無關聯(P>0.05),見表1。

表1 175例ESCC患者臨床特征與化療反應的關系[n(%)]

2.2 單核苷酸多態性位點基因型分布

3個單核苷酸多態性位點在175例受試者中均能被明確基因分型。rs907187C/G單核苷酸多態性位點的CC、CG、GG基因型分別為53例(30.3%)、81例(46.3%)和41例(23.4%),rs8679T/C單核苷酸多態性位點的TT、TC、CC基因型分別為51例(29.1%)、77例(44.0%)和47例(26.8%),rs1136410T/C單核苷酸多態性位點的TT、TC、CC基因型分別為57例(32.6%)、79例(45.1%)和39例(22.3%)。以上3個單核苷酸多態性位點基因型分布符合群體遺傳學Hardy-Weinberg平衡(P>0.05)。

2.3 單核苷酸多態性位點基因型與化療敏感性的關系

rs8679T/C、rs1136410T/C單核苷酸多態性與化療反應無關(P>0.05)。rs907187C/G單核苷酸多態性與化療反應明顯相關,CC、CG、GG基因型化療有效率分別為12/53(22.6%)、33/81(40.7%)和23/41(56.1%),差異有統計學意義(χ2=11.116,P=0.004)。CG雜合基因型化療反應率為CC基因型的2.337倍(95%CI:1.068~5.113,χ2=4.516,P=0.034);GG純合突變基因型化療反應率為CC基因型的4.326倍 (95%CI:1.771~10.565,χ2=10.334,P=0.001);CG+GG基因型化療反應率為CC基因型的2.881倍(95%CI:1.379~6.019,χ2=7.927,P=0.005)。此外, GG基因型化療反應率明顯高于CG+CC基因型(OR=2.514,95%CI:1.229~5.142,χ2=6.375,P=0.012),見表2。

表2 rs907187C/G、rs8679T/C和rs1136410T/C單核苷酸多態性位點基因型分布及與化療反應的關系

2.4 單核苷酸多態性位點基因型與患者OS的關系

175例受試者總體中位OS為12.5個月(95%CI:10.912~14.088)。rs8679T/C單核苷酸多態性位點的TT、TC、CC基因型患者中位OS分別為11.6、12.0、14.2個月(χ2=0.955,P=0.620); rs907187C/G單核苷酸多態性位點的CC、CG、GG基因型患者中位OS分別為10.7、12.8、13.9個月(χ2=0.420,P=0.811)。

rs1136410T/C單核苷酸多態性與患者OS顯著相關,隨著等位基因C數目的增加,患者中位OS逐步延長,TT、TC、CC基因型分別為9.3、13.2、15.6個月(χ2=11.846,P=0.003);TC+CC基因型攜帶者中位OS為13.9個月,較TT明顯延長(χ2=7.787,P=0.005),見圖1。

圖1 PARP1基因rs1136410多態性位點不同基因型ESCC患者OS曲線對比

使用Cox模型進行多因素分析(納入年齡、吸煙史、飲酒史、分化程度、腫瘤部位及單核苷酸多態性),結果顯示rs1136410T/C單核苷酸多態性仍是影響ESCC患者OS的獨立預后因素(OR=1.717,95%CI:1.208~2.440,χ2=9.088,P=0.003)。

3 討 論

DDP是治療晚期ESCC最常用的化療藥物之一,常與紫杉烷或氟尿嘧啶類藥物組成聯合方案。然而,晚期ESCC對化療反應存在明顯異質性,半數以上患者對化療耐藥,導致預后不良。DDP進入細胞后作用靶點是DNA,可形成鉑-DNA加合物,導致DNA鏈交叉連接,阻斷DNA復制和轉錄、促進凋亡[9]。此外,研究已證實DNA修復能力增強是DDP耐藥的主要原因[10]。PARP1是眾所周知的DNA修復蛋白,在堿基切除修復通路中發揮重要作用[2]。研究顯示,PARP1表達減少使食管癌細胞對化療的敏感性增強[4]。同時,PARP1表達變化還能影響食管癌患者的生存預后[6]。所以,筆者猜測PARP1基因單核苷酸多態性可能與轉移性ESCC患者DDP化療反應及OS相關。

rs907187C/G單核苷酸多態性位于PARP1基因啟動子區,含有E2F1轉錄因子的結合位點。熒光素酶報告顯示,rs907187多態性位點的G等位基因與E2F1結合親和力低,導致啟動子活性下降,并降低神經母細胞瘤細胞株PARP1-mRNA的表達水平 (P=0.003);基因型組織表達分析也發現G等位基因與較低的PARP1蛋白表達相關(P<0.001)[7]。研究顯示,在伊朗人群中,rs907187多態性位點的CC及GG基因型攜帶者發生乳腺癌的風險顯著增高[11]。此前,AVITABLIE等[7]對意大利神經母細胞瘤患者進行研究,發現rs907187多態性位點的G變異等位基因攜帶者擁有更好的化療反應(P=0.02)。本研究也發現了類似的結果,隨著rs907187多態性位點的G等位基因數目的增加,ESCC患者化療有效率逐步升高(CC 22.6%、CG 40.7%、GG 56.1%,P=0.004);CG+GG基因型化療反應率為CC基因型的2.881倍 (95%CI:1.379~6.019,P=0.005)。根據此前的基因功能學研究[7],筆者推測rs907187多態性位點變異等位基因G通過影響與E2F1轉錄因子的結合,下調PARP1的轉錄、表達水平,減弱了DNA修復能力,使得癌細胞無法修復DDP誘導的DNA損傷,這可能是G等位基因攜帶者對DDP化療更加敏感的原因。當然,這種推斷仍需更多的單核苷酸多態性功能學研究來證實。

rs8679T/C單核苷酸多態性位于PARP1基因3′-UTR,能影響microRNA與mRNA的結合,進而調控PARP1基因的表達,最終影響結直腸癌的發病風險[12]。然而,最近的研究并未發現該多態性與食管癌發病易感性存在明顯關聯[8]。此外,ZHAO等[13]對卵巢癌患者進行研究,也未發現rs8679T/C單核苷酸多態性與鉑類化療敏感性相關。同樣,本研究也未發現rs8679T/C單核苷酸多態性與ESCC患者化療反應及OS之間存在關聯(P>0.05)。當前,rs8679T/C與腫瘤化療療效之間的研究較少,二者間的真實關系尚不清楚,需開展更多的研究深入探討。

rs1136410T/C單核苷酸多態性屬于非同義多態性,堿基T變異為C后導致編碼的762位氨基酸殘基由纈氨酸(Val)替換為丙氨酸(Ala) ,導致蛋白結構改變,進而影響PARP1蛋白酶的功能[8]。研究顯示rs1136410T/C單核苷酸多態性與卵巢癌化療反應相關, CC基因型患者對鉑類化療敏感,耐藥風險顯著下降(P=0.001)[13]。另外,在一項食管小細胞癌的研究中,發現rs1136410多態性位點變異基因型TC+CC攜帶者的中位OS較野生純合基因型TT患者明顯延長,分別為17.4個月和14.8個月(P=0.032)[14]。這與本研究結果一致,本研究首次發現rs1136410T/C單核苷酸多態性與轉移性ESCC患者OS相關,變異等位基因C攜帶者中位OS明顯延長(P=0.003);至少攜帶一個C等位基因的患者TC+CC中位OS為13.9個月,較TT明顯延長(P=0.005)。然而,在接受DDP同步放化療的宮頸癌患者中,rs1136410多態性位點變異等位基因C與圍絕經期和絕經后婦女的OS縮短顯著相關(P=0.008)[15]。這與本研究結論并不一致,考慮種族、性別組成、瘤種、腫瘤分期、治療方案的不同導致研究結果存在差異。

綜上所述,本研究發現PARP1單核苷酸多態性能影響轉移性ESCC患者的化療敏感性及生存預后,rs907187多態性位點G等位基因預示更好的化療反應,而rs1136410多態性位點C等位基因與OS延長相關,本研究結果可能對預測轉移性ESCC患者化療反應及預后有一定的作用。

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