云南環(huán)境微生物資源數據化及其應用

云南省微生物研究所

云南省微生物研究所在云南省生物醫(yī)藥重大專項“生物資源數字化開發(fā)應用” 202002AA100007項目經費的支持下，在多組學水平上，進行了系統的微生物資源數據的整理，截至目前，建立了云南大學云南省微生物所菌種保藏中心網站(yimcc.cn)，已完成17 000多株微生物菌株的可共享數據在云南省生物資源數據化大數據中心上鏈。聯合云南省農科院，云南省微生物發(fā)酵工程研究中心有限公司，共同構建了拮抗云南高原特色農作物主要病原菌的活性篩選平臺及相關本土微生物資源功能性菌劑/菌肥產學研平臺，已完成3000多株菌的活性篩選，開展了7個功能性菌劑的田間試驗示范；參與云南宏斌食品有限公司申報并于2021年獲批的云南省發(fā)酵蔬菜重點實驗室，開展了云南發(fā)酵食品乳酸菌資源的收集，并從中篩選出2株乳酸菌，開展了以核桃蛋白為原料的乳酸菌飲料、純植物基風味發(fā)酵乳、氣泡乳酸菌飲料產品研發(fā)，通過昆明雪蘭牛奶有限責任公司的測試，具有轉化商品的價值，為云南核桃產業(yè)的健康發(fā)展，提供了一個解決思路。

同時，系統開展了從放線菌新物種資源收集到新藥研發(fā)的系統研究。聯合云南大學化工學院/醫(yī)學院、昆華醫(yī)院，構建了拮抗臨床超級耐藥菌的活性篩選平臺，以完成2500株菌的活性篩選，部分高活性菌株已開展代謝產物研究。通過數據整理發(fā)現，1358個放線菌記錄種，占全球已生效發(fā)表物種的34.60%，而在產生抗生素最多的鏈霉菌、擬無枝菌酸菌、小單孢菌三類放線菌種，共發(fā)現519、55、46個記錄種，分別占全球已生效發(fā)表物種的74.2%、63.95%、41.4%。同時在基因組學水平，開展了云南環(huán)境放線菌菌株的分類鑒定，發(fā)現大量的放線菌潛在新物種資源。新物種資源具有新功能基因，是獲得原創(chuàng)藥物分子的重要保障。這些寶貴的放線菌資源發(fā)現及應用開發(fā)，必將加速原創(chuàng)藥物分子的發(fā)現。

圖1 豐富的云南放線菌物種多樣性

圖2 巨大潛力的云南鏈霉菌物種資源

圖3 巨大潛力的云南擬無枝菌酸菌物種資源

圖4 發(fā)現新物種