陳曉飛,李珊珊,刁文濤,徐紫瑜,劉德海*
(1.河南省科學院 生物研究所有限責任公司,河南 鄭州 450008;2.河南省微生物工程重點實驗室,河南 鄭州 450008;3.河南農業大學 生命科學學院,河南 鄭州 450046)
甘露聚糖是自然界中半纖維素的第二大組分[1],普遍存在于植物性食品及動物飼料中,它是一種抗營養因子,在家禽和豬等單胃動物體內會形成凝膠,使消化道內容物有很大的黏性,從而影響營養物質的消化吸收[2-3]。β-1,4-D-甘露聚糖酶(β-1,4-D-mannanase)是一類水解甘露聚糖、半乳甘露聚糖、葡萄甘露聚糖以及半乳葡萄甘露聚糖中β-1,4-D-吡喃甘露糖苷鍵的內切酶[4-6],廣泛存在于動植物和微生物中。β-甘露聚糖酶用于飼料工業,不僅可以消除飼料中的抗營養因子甘露聚糖,其水解產物甘露低聚糖還可以改善飼料營養、提高飼料利用率、促進畜禽生長[7],同時還能促進雙歧桿菌和乳酸桿菌等有益菌的增殖,抑制病原菌生長,改善腸道微生態環境,顯著提高動物免疫功能,減少飼料中抗生素等化學藥物的使用,從而減少養殖污染[8]。β-甘露聚糖酶在自然界中普遍存在,微生物是其最主要的生產來源。雖然目前國內外已有很多通過分子技術手段,使β-甘露聚糖酶異源表達水平大大提高的報道[9-10],但現有的微生物β-甘露聚糖酶因生物安全性問題,限制了其在飼料生產領域的應用[11],因此篩選更為安全的生產菌株,增加野生β-甘露聚糖酶生產菌的種質資源至關重要。
本試驗通過剛果紅平板初篩和液體發酵復篩的方法,從不同地區的魔芋生產基地土壤中,篩選分離β-甘露聚糖酶高產菌株;通過形態學察、生理生化試驗及分子生物學的方法對所篩選的菌株進行鑒定,并對其所產β-甘露聚糖酶的酶學性質進行了研究,以期為β-甘露聚糖酶在飼料工業中的廣泛應用奠定基礎。
1.1.1 材料
土壤樣品:采自河南省南陽西峽縣、河南省南陽西峽縣后塘溝村、云南省昆明市盤龍區新發村、福建省南平市政和縣天井洋村等地的魔芋生產基地。
1.1.2 主要試劑
胰蛋白胨、酵母膏、瓊脂粉、乙二胺四乙酸(ethylene diamine tetraacetic acid,EDTA)、魔芋粉:北京索萊寶生物科技有限公司;甘露糖:麥克林生物技術有限公司;甘露聚糖:美國Sigma公司;瓊脂糖:北京鼑國生物技術有限責任公司;API 50CHB、ZYM鑒定試劑盒:物梅里埃中國有限公司;DNA Marker、2×EsTaq脫氧核糖核酸(deoxyribonucleic acid,DNA)聚合酶:北京康為世紀生物科技有限公司;3,5-二硝基水楊酸(dinitrosalicylic acid,DNS):北京酷來搏科技有限公司;Ezup柱式細菌基因組DNA抽提試劑盒:美國Omega Bio-Tec公司;細菌16SrDNA通用引物27F和1492R:深圳華大基因科技有限公司。試驗所用試劑均為分析純或生化試劑。
1.1.3 培養基
富集培養基:魔芋精粉5 g/L,蛋白胨6 g/L,酵母膏1 g/L,NaCl 0.05 g/L,蒸餾水1 000 mL,pH值7.0。121 ℃滅菌15 min。
初篩分離培養基:魔芋精粉3 g/L,蛋白胨6 g/L,酵母膏1 g/L,K2HPO41 g/L,MgSO40.25 g/L,剛果紅0.5 g/L,瓊脂15 g/L,蒸餾水1 000 mL,pH值7.0。121 ℃滅菌15min。
發酵培養基:魔芋精粉15g/L,蛋白胨8g/L,酵母膏4g/L,K2HPO41 g/L,MgSO40.25 g/L,蒸餾水1 000 mL,pH值7.0~7.2。121 ℃滅菌15 min。
種子培養基采用LB培養基:胰蛋白胨10 g/L,酵母膏5 g/L,NaCl 5 g/L,蒸餾水1 000 mL,pH 值7.0。121 ℃滅菌15 min。
K-8D電熱恒溫水槽:上海精宏實驗設備有限公司;QYCAxioImageM2全自動熒光顯微鏡:德國Zeiss公司;Thermoblock梯度電泳儀:德國Biometra公司;TCYQ全溫搖瓶柜:太倉市豪成實驗儀器制造有限公司;Varioskan Flash全波長掃描式多功能讀數儀:美國Thermo公司;DChemiDoc XRS+化學發光成像分析系統:美國Bio-Rad公司;DYY-6C電泳儀:北京六一生物科技有限公司;Biometra TGRADIENT聚合酶鏈式反應(polymerase chain reaction,PCR)儀:德國Waterman公司。
1.3.1 高產β-甘露聚糖酶菌株的篩選
取10 g土壤樣品于裝液量為100 mL/250 mL富集培養基中,在30 ℃、180 r/min條件下搖床培養24 h,將富集培養液用無菌水梯度稀釋成10-1、10-2、10-3、10-4、10-5后,取100 μL涂布于初篩分離培養基上,置于30 ℃培養箱倒置培養48 h后,記錄透明圈直徑(D)與菌落直徑(d)之比(D/d),作為產β-甘露聚糖酶菌株能力的初篩標準。選用D/d值較大即產酶能力較強的菌株,接入種子培養基,30 ℃、180 r/min搖床培養18 h后,按3%(V/V)的接種量轉接到發酵培養基中,相同條件搖床培養24 h,在4 ℃、10 000 r/min條件下離心10 min,上清液即粗酶液,測定β-甘露聚糖酶酶活,復篩菌株。
1.3.2 分析檢測
β-甘露聚糖酶的酶活測定按照國標GB/T 36861—2018《飼料添加劑β-甘露聚糖酶活力的測定分光光度法》[13]。β-甘露聚糖酶酶活定義:在37 ℃、pH值為5.5條件下,每分鐘從質量濃度為3 mg/mL甘露聚糖溶液中釋放1 μmol還原糖所需要的酶量為1個酶活力單位(U/mL)。
1.3.3 高產β-甘露聚糖酶菌株的鑒定
形態學觀察:對篩選分離純化的菌株進行菌落和細胞形態觀察,并進行革蘭氏染色[12]。
生理生化鑒定:通過API 50CHB和ZYM鑒定試劑盒,對所篩選的菌株進行生理生化鑒定。
分子生物學鑒定:將菌株接種于LB液體培養基上,在30 ℃、180 r/min條件下搖床培養過夜,采用Ezup柱式細菌基因組DNA抽提試劑盒提取篩選菌株的基因組DNA,以其為模板,采用16S rDNA通用引物27F和1492R擴增目標菌株的16S rDNA序列。PCR反應體系(30 μL)為:脫氧核糖核苷三磷酸(deoxyribonucleoside triphosphate,dNTP)1 μL,2×EsTaq酶15 μL,引物27F和1492R(20 μmol/L)各1 μL,無菌雙蒸水12 μL,混勻。PCR擴增程序:94 ℃預變性10 min;94 ℃變性30 s,52 ℃復性40 s,72 ℃延伸90 s,25個循環;72 ℃延伸5 min,4 ℃終止反應。PCR產物經1%瓊脂糖凝膠電泳檢測后,送至華大基因公司進行測序。將所得序列結果提交至美國國家生物技術信息中心(national center of biotechnology information,NCBI)的GenBank基因庫中進行基本局部比對工具(basic local alignment search tool,BLAST)檢索,選取同源性較高的已知菌種的16S rDNA序列,采用MEGA 7.0軟件中的鄰接(neighbor-joining,NJ)法構建系統發育樹。
1.3.4β-甘露聚糖酶酶學性質分析
參考張建新等[14]的雙水相萃取法,在16%(NH4)2SO4、18%PEG2000和2%NaCl的雙水相體系條件下,對粗酶液進行純化,純化后的酶液用于酶學性質分析。
最適反應pH值:采用不同緩沖體系配成一系列濃度0.1 mol/L的緩沖液,緩沖體系和pH值范圍分別為:甘氨酸-HCl緩沖液(pH 3.0)、檸檬酸-檸檬酸鈉緩沖液(pH 4.0、pH 5.0)、磷酸鈉緩沖液(pH 6.0、pH 7.0、pH 8.0)、甘氨酸-NaOH緩沖液(pH 9.0、pH 10.0)。底物分別用上述不同pH值的緩沖液配制后,在pH 3.0~10.0反應體系下,37 ℃條件下保溫30 min,測定β-甘露聚糖酶活力。
pH值穩定性:將酶液與不同pH值(3.0、4.0、5.0、6.0、7.0、8.0、9.0、10.0)緩沖液混合,37 ℃保溫2 h后,測定β-甘露聚糖酶活力,計算相對酶活。
最適溫度:在pH5.5、0.1 mol/L的乙酸-乙酸鈉緩沖液體系中,在不同溫度(30 ℃、35 ℃、40 ℃、45 ℃、50 ℃、55 ℃、60 ℃、65 ℃、70 ℃)條件下反應30 min,測定β-甘露聚糖酶活力。
溫度穩定性:酶液在pH 5.5 0.1 mol/L的乙酸-乙酸鈉緩沖液體系中,不同溫度(40 ℃、45 ℃、50 ℃、55 ℃、60 ℃、65 ℃、70 ℃)條件下,保溫30 min,立即冰水浴冷卻,用未經溫度處理的酶液作對照,測定β-甘露聚糖酶活力,計算相對酶活。
金屬離子和乙二胺四乙酸(EDTA)對酶活力的影響:在酶反應體系中,分別加入金屬離子(Na+、K+、Mn2+、NH4+、Mg2+、Fe2+、Cu2+、Li+、Ca2+、Co2+)和EDTA溶液(使終濃度為2.5 mmol/L),以未加金屬離子和螯合劑為對照,測定β-甘露聚糖酶活力。
2.1.1β-甘露聚糖酶高產菌株的分離篩選
通過平板初篩的方法,從不同地區魔芋生產基地的土壤中,共分離篩選得到32株在初篩平板上D/d值較大的菌株,其中6株有代表性的菌株在初篩平板上形成的透明圈見圖1。32株菌經液體發酵24 h復篩后,上清液酶活見表1。由表1可知,分自河南省南陽西峽縣后塘溝村土壤樣品的菌株HTGC-10經液體發酵24 h后,發酵液中β-甘露聚糖酶活力最高,可以達到61.75 U/mL,其產酶能力顯著高于現有報道的多數野生菌株[15-17],且經反復發酵后產酶能力穩定。因此,進一步對菌株HTGC-10進行鑒定。

圖1 6株代表性菌株在初篩平板上形成的透明圈Fig.1 Transparent circles formed by 6 representative strains on the primary screening plate

表1 32株分離菌株的β-甘露聚糖酶活力Table 1 β-mannanase activity of 32 isolated strains
2.1.2 高產β-甘露聚糖酶菌株的鑒定
菌株HTGC-10的菌落及細胞形態見圖2。由圖2A可知,菌落呈圓形,無色半透明,表面光滑濕潤,邊緣整齊,將菌落挑起后有明顯拉絲現象。由圖2B可知,經革蘭氏染色結果發現,菌株HTGC-10產橢圓形芽孢,芽孢呈藍紫色,因此鑒定其為革蘭氏陽性菌。

圖2 菌株HTGC-10的菌落(A)及細胞(B)形態Fig.2 Colony (A) and cell (B) morphology of strain HTGC-10
菌株HTGC-10的接觸酶反應(contact enzyme reaction,ZYM)和可利用碳源(API 50CHB)試驗結果分別見表2、表3。

表2 菌株HTGC-10的接觸酶反應結果Table 2 Contact enzyme reaction results of strain HTGC-10

表3 菌株HTGC-10的碳源利用能力Table 3 Carbon source utilization capacity of strain HTGC-10
菌株HTGC-10的16S rDNA PCR擴增產物電泳結果見圖3。由圖3可知,菌株HTGC-10在1 500 bp附近有明顯條帶,經過測序,菌株HTGC-10的16S rDNA序列長度為1 493 bp。

圖3 菌株HTGC-10的16S rDNA聚合酶鏈式反應擴增產物電泳結果Fig.3 Electrophoresis results of 16S rDNA polymerase chain reaction amplification products of strain HTGC-10
菌株HTGC-10的系統發育樹見圖4。由圖4可知,菌株HTGC-10與Bacillus amyloliquefaciens的相似度最高,結合菌株HTGC-10的菌落形態特征、生理生化試驗結果和16SrDNA分析,該菌株被鑒定為解淀粉芽孢桿菌(Bacillus amyloliquefaciens)。

圖4 基于16S rDNA序列菌株HTGC-10的系統發育樹Fig.4 Phylogenetic tree of strain HTGC-10 based on 16S rDNA sequence
2.2.1 pH值對酶活力的影響
pH值對甘露聚糖酶活力的影響見圖5。由圖5可知,在pH3.0~6.0時,隨著pH值的升高,酶活力迅速升高,并在pH值為6.0時其酶活達到最高,為54.94 U/mL;而在pH 6.0~10.0時,酶活力隨著pH值的升高則逐漸下降,在pH10.0時的酶活力僅為pH 6.0時的2.7%,說明該酶適合在弱酸性的條件下發揮作用。因此,菌株HTGC-10產β-甘露聚糖酶的最適反應pH值為6.0,偏酸性,這與已報道[18-20]的芽孢菌產生的β-甘露聚糖酶的酶學性質相似。

圖5 反應pH值對β-甘露聚糖酶活力的影響Fig.5 Effect of reaction pH value on β-mannanase activity
2.2.2 溫度對酶活力的影響
不同反應溫度對β-甘露聚糖酶活力的影響結果見圖6。由圖6可知,當反應溫度在30~55 ℃時,隨溫度的升高,酶活力逐漸升高,并在溫度55 ℃時β-甘露聚糖酶達到最高,為84.97 U/mL;而當反應溫度>55 ℃之后,酶活力隨溫度的升高迅速下降,70 ℃時的酶活力僅為55 ℃的15.1%。因此,菌株HTGC-10產β-甘露聚糖酶的最適反應溫度為55 ℃,這與黃俊麗等[11]篩選的假單胞菌產生的酶的最適反應溫度相似。

圖6 反應溫度對β-甘露聚糖酶活力的影響Fig.6 Effect of reaction temperature on β-mannanase activity
2.2.3β-甘露聚糖酶的pH穩定性
將酶液與不同pH緩沖液混合,37 ℃保溫2 h后,剩余β-甘露聚糖酶活性見圖7。由圖7可知,在pH 3.0、5.0~9.0保溫后,剩余相對酶活力均在60%以上,表明酶在該pH范圍內時,活性相對穩定,但當pH值等于4.0或大于9.0 時,酶活力迅速下降,相對酶活力均在5%以下,說明該酶偏堿性條件耐受性較差;這里比較特殊的是,在pH4.0保溫2 h后,出現了大量沉淀,酶活力只有最高活力的3.9%,這可能與酶的等電點有關,該觀點需要進一步試驗證明。

圖7 pH值對β-甘露聚糖酶穩定性的影響Fig.7 Effect of pH value on β-mannanase stability
2.2.4β-甘露聚糖酶的熱穩定性
溫度對酶穩定性的影響見圖8。由圖8可知,該酶在40 ℃相對穩定,保溫30 min后剩余酶活力為原酶活力的82.1%,但隨著溫度的升高,酶活力迅速下降,在45 ℃條件下保溫30 min后,活力為原酶活力的24.3%,后隨著溫度的升高,酶活力繼續下降,在溫度達到55 ℃以上保溫30 min后,β-甘露聚糖酶幾乎已經完全失活。由此可知,本試驗篩選菌株HTGC-10產β-甘露聚糖酶的熱穩定性相對較差。

圖8 溫度對β-甘露聚糖酶穩定性的影響Fig.8 Effect of temperature on the β-mannanase stability
2.2.5 金屬離子和EDTA對酶活力的影響
金屬離子和EDTA對酶活性的影響見圖9。由圖9可知,EDTA對酶活有顯著的抑制作用,與對照組相比,酶活力下降了24.3%;金屬離子Li+和Co2+對酶活力基本沒有影響;其余金屬離子Na+、K+、Mn2+、NH4+、Mg2+、Fe2+、Cu2+、Ca2+對酶活力均有不同程度的抑制作用,其中Cu2+對酶活力的抑制作用最顯著,加入Cu2+后,酶活力僅為對照組酶活力的11.9%,這與張建新等[14]報道的Cu2+對枯草芽孢桿菌YZ-21產生的β-甘露聚糖酶活性有顯著抑制作用相似。

圖9 乙二胺四乙酸和金屬離子對β-甘露聚糖酶活力的影響Fig.9 Effect of ethylene diamine tetraacetic acid and mental ions on β-mannanase activity
本試驗經過平板初篩和液體發酵復篩的方法,從不同地區的魔芋生產基地采集的土壤樣品中,篩選出一株高產β-甘露聚糖酶活性菌株HTGC-10,該菌株液體發酵24 h后,β-甘露聚糖酶活力可以達到61.75 U/mL;經過形態學觀察、ZYM和API 50CHB生理生化試驗及16S rDNA序列分析,鑒定菌株HTGC-10為解淀粉芽孢桿菌(Bacillus amyloliquefaciens)。菌株HTGC-10所產β-甘露聚糖酶的最適反應pH值為6.0,具有較強的pH值耐受能力,最適反應溫度為55 ℃,熱穩定性相對較差;EDTA和金屬離子Na+、K+、Mn2+、NH4+、Mg2+、Fe2+、Cu2+、Ca2+對酶活力均有不同程度的抑制作用,其中Cu2+對酶活力的抑制作用最顯著。菌株HTGC-10具有較好的產β-甘露聚糖酶能力,有一定的開發利用價值。