999精品在线视频,手机成人午夜在线视频,久久不卡国产精品无码,中日无码在线观看,成人av手机在线观看,日韩精品亚洲一区中文字幕,亚洲av无码人妻,四虎国产在线观看 ?

副豬嗜血桿菌Wza基因表達與結構預測分析

2021-08-27 12:46:00伊立超婁安鋼
山東畜牧獸醫 2021年8期
關鍵詞:結構

伊立超,婁安鋼

副豬嗜血桿菌Wza基因表達與結構預測分析

伊立超,婁安鋼*

(延邊大學農學院,吉林 延吉 133000)

為了表達副豬嗜血桿菌Wza基因并獲得表達產物的理化性質,試驗參考GenBank中發表的副豬嗜血桿菌Wza基因序列(KC795491.1)進行重組真核表達質粒(pcDNA3.1-Wza)的構建,并在哺乳動物細胞293細胞鑒定蛋白的表達,同時分析Wza蛋白的理化性質,并預測其二級結構,并用在線軟件預測Wza蛋白質的三級結構,為進一步探究其致病性提供理論基礎。結果表明,成功構建pcDNA3.1-Wza質粒,并表達Wza蛋白。理化性質分析表明,其抗原指數較高。二級結構主要是β-折疊和無規卷曲,并且有許多抗原表位區域。

副豬嗜血桿菌;Wza基因;基因擴增;克??;理化性質分析

副豬嗜血桿菌(Haemophilusparasuis,HPs)是一種多態性,非運動性,革蘭氏陰性微細菌,屬于巴斯德桿菌科的嗜血桿菌屬。在某些情況下,它會侵入人體并引起以纖維性多發性漿膜炎、關節炎和腦膜炎為特征的全身性疾病。它已成為我國豬保育期間最普遍的繼發性細菌感染和仔豬死亡的主要原因之一,因此,找到關鍵的致病因素拮抗細菌的致病尤為重要。副豬嗜血桿菌的致病因素研究一直是該領域的重點之一。目前,神經氨酸酶、菌毛、轉鐵蛋白和脂多糖都被認為是HPs的致病因子[1-2]。研究表明,有毒力的菌株可以抑制豬肺泡巨噬細胞(PAM)的吞噬作用,并且在與PAM相互作用后可以形成更明顯的莢膜;而無毒力的菌株則不能形成莢膜[3-4]。但是,一些研究還發現,從健康豬的上呼吸道分離出的HPs菌株也有莢膜,但從病變部位中分離出的HPs沒有莢膜產生,這表明HPs莢膜多糖合成基因(CapD)存在于HPs毒力菌株[1]??傊?,盡管莢膜多糖是巴斯德氏菌細菌的公認毒力因子,并且已經進行了涉及莢膜與HPs毒力和致病性之間關系的研究,但已經進行了許多臨床試驗。分離株是通過對相關毒力因子進行比較研究得出的結論,因此除莢膜外可能還有其他毒力因子會影響實驗結論。

目前的研究已經完成了一些不同菌株HPs的全基因組測序,并鑒定出HPs脂多糖O抗原基因簇,該基因簇的長度約為15 kb。同時,在基因簇中,已經鑒定出Wzx,Wzy,Wzc,Wzb和Wza基因。這些基因在O抗原的加工和呈遞中發揮作用[5],并且還在莢膜多糖的生物合成中起重要作用。其中,Wza基因在莢膜多糖的轉運中起著重要作用[6],Wza是完整的外膜蛋白,可為大分子量莢膜多糖的輸出提供通道[7]。Wza蛋白是由340 kDa大分子物質組成的八聚體蛋白,其跨膜區為α螺旋,其結構與三個新的細胞質區域相連,被認為是一種新的具有代表性的外膜蛋白[8]。它位于該基因簇的11~12 kb之間,大小約為1 200 bp,G+C含量約為37 %。它屬于外膜跨膜通道蛋白。它嵌合在脂多糖的外部,并與其他蛋白質如Wzc相互作用,把組裝的莢膜多糖分子運輸到細菌的表面。因此,本試驗以副豬嗜血桿菌為研究對象,對Wza基因進行真核載體的構建與表達,并對表達蛋白的結構進行預測分析,旨在為進一步揭示Wza蛋白的功能和機制奠定基礎。

1 材料與方法

1.1 材料

1.1.1 質粒和基因 pcDNA3.1(+)為本實驗室保存。Wza基因序列由南京金斯瑞公司合成。

1.1.2 主要試劑 質粒小提試劑盒,DNA回收純化試劑盒購自天根(TIANGEN)生化科技(北京)有限公司;限制性核酸內切酶購自Thermo Scientific,T4 DNA連接酶購自大連TaKaRa公司。

1.2 方法

1.2.1 Wza基因引物的設計與合成 根據NCBI上Wza基因(GenBank登錄號為KC795491.1)序列,N端添加6×-His標簽,由南京金斯瑞公司合成,引物由長春庫美有限公司合成。

1.2.2 Wza基因的PCR擴增與克隆 以合成的PUC57-Wza為模板,利用引物Wza-F:5'-GCATGCATCATCACCATC-3',Wza-R:5'-CCCTCGAGTTACCAATTCCTCACTCTTA A-3'進行PCR擴增。利用常規分子克隆方法對Wza目的基因片段進行純化回收,并克隆至pcDNA3.1(+)載體連接,PCR鑒定、雙酶切鑒定,均為陽性的克隆質粒送往吉林省庫美生物科技有限公司測序。

1.2.3 Wza蛋白表達與鑒定 重組質粒pcDNA3.1-Wza脂質體轉染293細胞后48 h收集細胞沉淀并破碎,12 000 rpm 2 min離心,收集上清,Western blot鑒定蛋白表達情況。

1.2.4 Wza蛋白理化性質分析與二級結構預測 應用DNAStar軟件對Wza蛋白理化性質進行分析,并預測其二級結構。

1.2.5 Wza蛋白三級結構預測 應用SWISS-model(https://swissmodel.expasy.org/)在線預測Wza蛋白的三級結構。

2 結果與分析

2.1 Wza基因PCR擴增與克隆

以合成質粒為模板,經PCR擴增得到大小為1180bp的Wza目的基因片段(圖1),與預期大小相同?;厥漳康臈l帶并克隆至pcDNA3.1(+)載體,PCR鑒定和雙酶切鑒定兩種方法鑒定重組真核表達質粒(圖2),在1 000 bp ~ 2 000 bp處可見單一條帶,表明pcDNA3.1(+)-Wza質粒構建成功。

2.2 Wza蛋白表達

Western blot方法鑒定目的蛋白的表達,結果表明Wza蛋白成功表達,與預期大小一致(約43 kDa)(見圖2)。

圖1 Wza基因的PCR擴增結果和雙酶切鑒定

M1.DL-2000;1-2.Wza基因的PCR擴增產物;3.水對照;M2. DL-5000;4-5.Nhel和Xhol雙酶切結果;6.pcDNA3.1(+)-Wza

圖2 Wza蛋白表達結果

M.蛋白Marker;1-2.Wza蛋白

2.3 Wza蛋白理化性質分析

DNAStar軟件分析顯示:Wza蛋白分子質量約為43 kDa;其親水指數>0;抗原指數>0;表面可能性>1;肽鏈的可塑性好、活動性強,容易與抗體結合。Wza蛋白具有較高的抗原指數,存在多個潛在抗原表位位點,見圖3。

2.4 Wza蛋白二級結構預測

Wza蛋白的結構中有22個α-螺旋且分布均勻,29個β-折疊,19個β-轉角和17個無規則卷曲,見圖4。

2.5 Wza蛋白三級結構預測

SWISS-model軟件預測結果見圖5,圖6,Wza蛋白三級結構預測結果與二級結果預測結果相符。

圖3 Wza蛋白抗原表位預測結果

圖4 Wza蛋白二級結構預測結果

圖5 Wza單體三級結構預測結果

圖6 Wza八聚體三級結構預測結果

3 討論與結論

副豬嗜血桿菌是常見的條件致病細菌,通常定植在上呼吸道。它的主要特征是漿膜發炎反應,包括胸膜炎,心包炎和腹膜炎。它通常會引起腦膜炎和關節炎和肺炎[9],稱為格拉瑟氏病(Glasser's disease)。格拉瑟氏病在生產商品豬的國家中更為普遍。目前,該病已成為保育仔豬死亡的主要原因之一,給全球養豬業造成巨大的經濟損失。鑒于莢膜多糖在革蘭氏陰性菌中是一個很重要的毒力因子,而HPs危害的嚴重性及其在這方面研究的貧乏,因此很有必要對莢膜多糖相關基因的功能進行研究。副豬嗜血桿菌Wza基因編碼的蛋白與Wzb、Wzc等蛋白相互作用來運輸莢膜多糖分子,Wza蛋白的外膜蛋白通常是開放的,但在其胞質區域存在可變的環結構,可以調節通道的打開和關閉。這種結構為研究極性大分子莢膜多糖通過細胞膜的分子機理提供了理論基礎。

本試驗成功構建并表達了Wza基因,并通過DNAStar軟件分析得出,Wza蛋白存在多個抗原表位,Wza蛋白的二級結構多為β-折疊,三級結構為一個完整的八聚體外膜蛋白[10],這些研究為副豬嗜血桿菌疫苗或者拮抗劑的進一步探究提供了依據。

[1] Hongzhuanzhou, et al. Identification of putative virulence-associated genes of Haemophilusparasuis through suppression subtractive hybridization[J]. Veterinary Microbiology, 2010, 144(3): 377-383.

[2] SackMeike, Baltes Nina. Identification of novel potential virulence-associated factors in Haemophilusparasuis[J]. Veterinary microbiology, 2009, 136(3-4): 382-386.

[3] Virginia Aragon, BénédicteBouchet, Marcelo Gottschalk. Invasion of endothelial cells by systemic and nasal strains of Haemophilusparasuis[J]. The Veterinary Journal, 2009, 186(2): 264-267.

[4] Olvera Alexandre, et al. Differences in phagocytosis susceptibility in Haemophilusparasuis strains[J]. Veterinary research, 2009, 40(3): 24.

[5] ZhuoFeixu, et al. Genomic Characterization of Haemophilusparasuis SH0165, a Highly Virulent Strain of Serovar 5 Prevalent in China[J]. Plos One, 2011, 6(5): 28.

[6] Whitfield Chris. biosynthesis and assembly of capsular polysaccharides in escherichia coli[J]. Annual Review of Biochemistry, 2006, 75: 39-68.

[7] DrummelSmith J, Whitfield C. Translocation of group 1 capsular polysaccharide to the surface of Escherichia coli requires a multimeric complex in the outer membrane[J]. The Embo journal, 2000, 19(1): 57-66.

[8] ChangJiangdong, KonstantinosBeis, JuttaNesper, et, al. The structure of Wza, the translocon for group 1 capsular polysaccharides in Escherichia coli, identifies a new class of outer membrane protein[J]. Nature, 2006, 444(7116): 226-229.

[9] Melnikow E, Dornan S, Sargent C, et al.Microarray analysis of Haemophilusparasuis gene expression under in vitro growth conditions mimicking the in vivo environment[J]. Vet Microbiol, 2005, 110(3-4): 255-263.

[10] 曹瑞娟. 副豬嗜血桿菌wza基因在其粘附和抗吞噬中的作用研究[D]. 武漢: 華中農業大學, 2014.

S852.61+2

A

1007-1733(2021)08-0009-04

(2021–05–24)

猜你喜歡
結構
DNA結構的發現
《形而上學》△卷的結構和位置
哲學評論(2021年2期)2021-08-22 01:53:34
論結構
中華詩詞(2019年7期)2019-11-25 01:43:04
新型平衡塊結構的應用
模具制造(2019年3期)2019-06-06 02:10:54
循環結構謹防“死循環”
論《日出》的結構
縱向結構
縱向結構
我國社會結構的重建
人間(2015年21期)2015-03-11 15:23:21
創新治理結構促進中小企業持續成長
現代企業(2015年9期)2015-02-28 18:56:50
主站蜘蛛池模板: h网址在线观看| 凹凸精品免费精品视频| 国产精品福利尤物youwu| 天天综合天天综合| 亚洲精品国产成人7777| 狠狠v日韩v欧美v| 国产色爱av资源综合区| 色香蕉影院| 亚洲中文无码av永久伊人| 91亚洲视频下载| 夜色爽爽影院18禁妓女影院| 一边摸一边做爽的视频17国产 | 国产粉嫩粉嫩的18在线播放91 | 99色亚洲国产精品11p| 久久久91人妻无码精品蜜桃HD| 国产chinese男男gay视频网| 国产一区二区三区免费观看| 欧美日韩精品在线播放| 中文字幕波多野不卡一区| 久久黄色小视频| 国产主播一区二区三区| 91小视频在线观看| 国产成人免费| 亚洲欧美另类久久久精品播放的| 四虎影视库国产精品一区| 青草娱乐极品免费视频| 亚洲va在线观看| 亚洲精品国产首次亮相| 色综合天天视频在线观看| 亚洲日韩精品无码专区97| 亚洲精品黄| 欧美精品影院| 99久久国产精品无码| 国产精品视频猛进猛出| 中文成人无码国产亚洲| 91精品啪在线观看国产91九色| 99热在线只有精品| 国产精品久久国产精麻豆99网站| 日本午夜影院| 99re免费视频| 亚洲一级毛片免费观看| 亚洲乱码视频| 一级毛片免费观看不卡视频| 国产欧美自拍视频| 日日噜噜夜夜狠狠视频| 欧美一区二区三区不卡免费| 亚洲欧美日韩另类在线一| 国产久操视频| 久久中文无码精品| 国产欧美精品专区一区二区| 一本大道香蕉久中文在线播放| 精品国产Av电影无码久久久| 国产精品欧美在线观看| 欧美成人一区午夜福利在线| 国产免费a级片| 亚洲视频在线网| 永久免费无码成人网站| 亚洲aaa视频| 国产网站一区二区三区| 国产理论最新国产精品视频| 亚洲综合第一页| 欧美成人午夜影院| 日韩国产欧美精品在线| 亚洲黄网视频| 少妇露出福利视频| 亚洲综合专区| 91综合色区亚洲熟妇p| 思思热在线视频精品| 国产成人精品高清在线| 青青草原国产| 国产精品女主播| 91成人免费观看在线观看| 自偷自拍三级全三级视频| 片在线无码观看| 欧美在线黄| 亚洲无码高清免费视频亚洲| 久久这里只有精品免费| 亚洲精品制服丝袜二区| 久久永久免费人妻精品| 在线精品欧美日韩| 欧美日本在线一区二区三区| 97人人模人人爽人人喊小说|