陳 帥,羅錦琳,羅 霽,張超杰,鄒聯洪,3,范培芝
(1.湖南師范大學第一附屬醫院/湖南省人民醫院,長沙 410002;2.湘雅常德醫院,常德 415003;3.急危重癥代謝組學湖南省重點實驗室,長沙 410002)
甲狀腺癌是內分泌器官最常見的惡性腫瘤,其發病率在過去三十年間增加了三倍多[1][2],雖然甲狀腺乳頭狀癌(thyroid papillary carcinoma,PTC)患者可獲得良好的預后[3],但仍有一部分的甲狀腺乳頭狀癌的患者會發生復發和遠處轉移[4]。目前有許多關于疾病的生物信息學研究,但有關PTC 的生物信息學研究卻不多見,固在本研究中,我們期望通過生信的方法來初步探索PTC 在分子水平的機制研究。
臨床資料:在2016 年9 月~2018 年9 月就診于湖南省人民醫院診斷為PTC 的患者中隨機選取3 位患者,在術中收集PTC 患者的甲狀腺乳頭狀癌組織及相對應的癌旁組織標本(距腫瘤大于2cm),我們將其收取的標本用于轉錄組芯片的相關研究。本研究收集相關標本均得到湖南省人民醫院倫理委員會的批準同意,患者或其法定監護人對本次研究方法及內容均知情同意,并簽字認可。所有的患者病理和臨床相關資料均齊全。

表1 甲狀腺乳頭狀癌患者一般臨床資料
1.1 轉錄組芯片檢測 用Trizol 試劑組織RNA 試劑盒分別從冷凍組織中提取總RNA。采用基因芯片技術對基因化學進行LncRNA、mRNA 分析。簡單地說,將rRNA 去除后,制備生物素化Arna(CrNA)。得到原始視圖人類基因表達陣列(CAT)。再進行雜交和掃描。所有樣品均經技術復制件處理。基因芯片掃描儀GeneChip Scanner 3000 7G 用于掃描完成的陣列。圖像用基因芯片命令控制臺(AGACC)提取,用表達式控制臺軟件進行分析。……