美國《Emerging Infectious Diseases》2021年第5期有關(guān)人獸共患病論文摘譯

P1259 美國猶他州基于模型的2019冠狀病毒病決策支持工具的協(xié)調(diào)策略//Hannah R.Meredith, Emerson Arehart, Kyra H.Grantz, 等

2019冠狀病毒病大流行凸顯了流行病學(xué)模型在公共衛(wèi)生決策支持中的關(guān)鍵作用。尤其在數(shù)據(jù)稀少而決策至關(guān)重要且緊急的情況下，這些模型提供了對暴發(fā)可能性的估計(jì)。我們記錄了2019冠狀病毒病大流行早期在美國猶他州 使用的綜合建模反應(yīng)，它匯集不同領(lǐng)域的技術(shù)專家和公共衛(wèi)生保健官員，引導(dǎo)大流行的循證反應(yīng)。我們描述了如何修正標(biāo)準(zhǔn)化的流行病學(xué)模型，協(xié)調(diào)各建模組的輸出結(jié)果，與各級政府的決策者保持經(jīng)常性對話，以便在大流行的第一波疫情期間提出及時(shí)、循證和協(xié)調(diào)的公共衛(wèi)生建議及干預(yù)措施。這一框架繼續(xù)支持州政府對正在發(fā)生的疫情做出反應(yīng)，并可應(yīng)用于其他環(huán)境，以應(yīng)對罕見的公共衛(wèi)生挑戰(zhàn)。

P1266 2020年美國球孢子菌病與COVID-19的混合感染//Alexandra K.Heaney, Jennifer R.Head, Kelly Broen, 等

我們回顧了2019冠狀病毒病(COVID-19)及球孢子菌病(一種粉塵中粗球孢子菌孢子導(dǎo)致的吸入性呼吸道感染)間的交互作用。我們在建筑工人、農(nóng)業(yè)工人、被監(jiān)管人員、黑人和拉丁美洲人以及生活在高粉塵地區(qū)的人群中調(diào)查混合感染的危險(xiǎn)性，并進(jìn)一步確定了混合感染常見的危險(xiǎn)因素，包括老年人、糖尿病、免疫抑制、種族或少數(shù)民族身份以及吸煙。由于這些疾病引起的癥狀相似，COVID-19的流行可能加劇球孢子菌病診斷的延遲，潛在干擾抗真菌治療的及時(shí)實(shí)施。最后，我們研究了感染的臨床意義，包括嚴(yán)重COVID-19以及隱匿性球孢子菌病的再激活。醫(yī)師在治療呼吸系統(tǒng)癥狀的病例時(shí)，應(yīng)考慮球孢子菌病診斷的可能性。戴口罩等預(yù)防措施，可減少對粉塵及SARS-CoV-2的暴露，從而對兩種感染均產(chǎn)生保護(hù)作用。

P1274 新西蘭邊境檢疫和航空旅行期間SARS-CoV-2的傳播//Nick Eichler, Craig Thornley, Tara Swadi, 等

新西蘭消滅2019冠狀病毒病的戰(zhàn)略要求國際航班旅客接受有管理的隔離檢疫以及強(qiáng)制性SARS-CoV-2檢測。綜合基因組及流行病學(xué)資料，我們對一例急性2019冠狀病毒病病例進(jìn)行溯源調(diào)查，該病例經(jīng)過14 d管理隔離檢疫，2次檢測結(jié)果陰性后，在社區(qū)確診。結(jié)合基因組序列分析及流行病學(xué)調(diào)查，我們確定了該病毒的多分支傳播鏈，包括在國際及國內(nèi)航班上的傳播，以及1例無直接人-人接觸的氣溶膠傳播的疑似病例。這些發(fā)現(xiàn)顯示了基因組和流行病學(xué)的集成數(shù)據(jù)為疫情調(diào)查提供信息的能力。

P1279 澳大利亞西澳大利亞州使用游輪作為檢疫場所成功控制了船上COVID-19暴發(fā)//Tudor A.Codreanu, Sera Ngeh, Abigail Trewin, 等

船上隔離對控制游輪2019冠狀病毒病暴發(fā)只能起部分作用。我們描述了停靠在澳大利亞西澳大利亞州的Artania號游輪疫情暴發(fā)反應(yīng)期間，該船作為檢疫場所的成功應(yīng)用。以健康為主導(dǎo)的14天檢疫制度是基于疫情管理的既定原則及其他地方游輪上暴發(fā)2019冠狀病毒病的經(jīng)驗(yàn)。船員的罹患率在檢疫前為6.0%(30/503),船上檢疫期間為4.8%(21/441)。檢疫結(jié)束后，沒有船員出現(xiàn)癥狀。感染監(jiān)測包括電話通訊、面對面隨訪及SARS-CoV-2檢測。沒有報(bào)告嚴(yán)重的健康問題，沒有工作人員受到感染，全體船員中只發(fā)生了1起違規(guī)檢疫事件。船上檢疫在疫情應(yīng)對上具有財(cái)政及操作上的優(yōu)勢，并為沿海面積寬廣社區(qū)的感染風(fēng)險(xiǎn)控制提供保證。

P1288 美國康涅狄格州養(yǎng)老院在3個(gè)月連續(xù)全場所時(shí)點(diǎn)患病檢測后SARS-CoV-2的感染情況//Hanna Y.Ehrlich, Adora Harizaj, Lauren Campbell, 等

養(yǎng)老院收容極易受2019冠狀病毒病感染的人群。時(shí)點(diǎn)患病率調(diào)查(PPSs)提供有關(guān)養(yǎng)老院工作人員及其居住者SARS-CoV-2感染狀況的信息，使感染者得以隔離，阻止疾病傳播。我們收集了美國康涅狄格州部分養(yǎng)老院(34/212)16周的公共衛(wèi)生監(jiān)測數(shù)據(jù)。我們以連續(xù)PPS啟動為起點(diǎn)，擬合了一個(gè)泊松回歸模型以評估發(fā)病率與發(fā)病時(shí)間的關(guān)聯(lián)，調(diào)整了逐步下降的社區(qū)發(fā)病率及其他因素。養(yǎng)老院合計(jì)在員工中實(shí)施了205次PPSs，在居住者中實(shí)施了232次PPSs。PPS與41%～80%養(yǎng)老院發(fā)病率降低相關(guān)。我們的研究結(jié)果為在養(yǎng)老院工作人員及居住者中重復(fù)PPSs的使用提供了支持，結(jié)合強(qiáng)有力的感染預(yù)防措施，如集中安置，有助于暴發(fā)控制。

P1301 美國加州圣克拉拉縣前200例2019冠狀病毒病病例調(diào)查及密接追蹤的流行病學(xué)發(fā)現(xiàn)//Nancy Ortiz, Elsa Villarino, James T.Lee, 等

2020年1月，美國加州圣克拉拉縣啟動居民2019冠狀病毒病實(shí)驗(yàn)室確診鑒定。縣工作人員組織了以家庭為重點(diǎn)的病例及密接調(diào)查，詳細(xì)收集了病例的人口學(xué)、職業(yè)、暴露以及結(jié)果信息。我們對2020年1月31日至3月20日間，前200例檢測陽性病例進(jìn)行描述，為進(jìn)一步病例及密接調(diào)查提供信息。可能的感染來源包括社區(qū)傳播(104例)，已知與確診病例密切接觸(66例)及旅行(30例)。跨種族和民族、職業(yè)及家庭因素的疾病模式表明存在多重感染危險(xiǎn)因素。種族和族裔亞組中，病例患者在外工作比例過高(西班牙裔[86%]及菲律賓裔[100%]，家庭傳播在越南裔中更為常見(53%)。即使初始病例很少，對家庭接觸者進(jìn)行詳細(xì)的病例及密接調(diào)查，獲取職業(yè)及種族和民族的分項(xiàng)數(shù)據(jù)，有助于確定高危人群及疾病控制的重點(diǎn)解決方案。

P1317 新西蘭使用基因組學(xué)追蹤2019冠狀病毒病的暴發(fā)//Jemma L.Geoghegan, Jordan Douglas, Xiaoyun Ren, 等

實(shí)時(shí)基因組測序在追蹤SARS-CoV-2全球傳播中發(fā)揮了重要作用，為疾病緩解策略做出巨大貢獻(xiàn)。2020年8月，在消滅病毒后，新西蘭經(jīng)歷第2次疫情暴發(fā)。本次暴發(fā)期間，新西蘭將基因組測序作為首要任務(wù)，使得病毒第2次被消除。我們對第2次暴發(fā)中78%的實(shí)驗(yàn)室確診SARS-CoV-2標(biāo)本提取基因組，并將其與現(xiàn)有的全球基因組數(shù)據(jù)庫進(jìn)行比對。基因組測序很快發(fā)現(xiàn)，引起新西蘭第2次疫情的病毒屬于單一基因簇，因此是由單次傳入所引起。然而，由于全球測序數(shù)據(jù)的巨大偏倚及缺口，阻礙了對本次暴發(fā)來源的成功確認(rèn)。為準(zhǔn)確定位任一新暴發(fā)的來源，應(yīng)加大力度，獲得更廣泛、更異質(zhì)的全球基因組數(shù)據(jù)。

P1362 荷蘭第一波2019冠狀病毒病期間貓和狗SARS-CoV-2感染的血清學(xué)篩查//Shan Zhao, Nancy Schuurman, Wentao Li, 等

SARS-CoV-2可以感染包括水貂、貓和狗在內(nèi)的多種動物。為深入了解貓和狗SARS-CoV-2的感染情況，我們建立了一套包括ELISA及病毒中和的血清學(xué)檢測方法并進(jìn)行驗(yàn)證。對動物未感染2019冠狀病毒前的標(biāo)本及來自SARS-CoV-2陽性的水貂養(yǎng)殖場中的貓的標(biāo)本進(jìn)行評估，證實(shí)了這些檢測方法對特異性抗體檢測的適用性。此外，我們發(fā)現(xiàn)SARS-CoV-2核衣殼蛋白不能作為貓和狗標(biāo)本血清學(xué)篩查的抗原。我們在2020年4-5月間分析了荷蘭500份家貓和狗的血清標(biāo)本，發(fā)現(xiàn)0.4%的貓和0.2%的狗呈血清陽性。雖然在第一波2019冠狀病毒病流行期間，未知SARS-CoV-2暴露的貓和狗中血清陽性率較低，我們的數(shù)據(jù)強(qiáng)調(diào)，需要對這兩種動物開展持續(xù)的SARS-CoV-2血清監(jiān)測。

P1405 荷蘭及比利時(shí)通過社區(qū)污水測序監(jiān)測SARS-CoV-2 循環(huán)及多樣性//Ray Izquierdo-Lara, Goff e Elsinga, Leo Heijnen, 等

SARS-CoV-2已迅速成為全球性的重大健康問題，而公共衛(wèi)生監(jiān)測對監(jiān)控和預(yù)防病毒傳播至關(guān)重要。由于約40%感染者糞便中有病毒排出，廢水流行病學(xué)已被提議作為基于疾病監(jiān)測的一個(gè)補(bǔ)充。我們應(yīng)用下一代測序技術(shù)，評估荷蘭及比利時(shí)社區(qū)污水中SARS-CoV-2的多樣性。系統(tǒng)發(fā)育分析揭示了存在的最流行分支(19A, 20A, and 20B)以及污水樣本與同一地區(qū)臨床樣本的聚類結(jié)果。我們使用低頻變異分析來區(qū)分單一污水樣本的多個(gè)分支。此外，在SARS-CoV-2基因組中還發(fā)現(xiàn)了一些新的突變。我們的結(jié)果說明了如何利用廢水調(diào)查SARS-CoV-2社區(qū)傳播的多樣性及確定新的暴發(fā)。

P1446 巴西SARS-CoV-2 再感染人群的遺傳證據(jù)及宿主免疫應(yīng)答//Natalia Fintelman-Rodrigues, Aline P.D.da Silva, Monique Cristina dos Santos, 等

SARS-CoV-2再感染動力學(xué)基礎(chǔ)尚不清楚。我們在巴西發(fā)現(xiàn)了小部分病人在2020年3月及5月下旬經(jīng)歷了兩次COVID-19暴發(fā)。在第1次感染階段，與健康人相比，病人固有免疫反應(yīng)更強(qiáng)，但不能完全實(shí)現(xiàn)中和體液免疫反應(yīng)。第2次感染與不同的SARS-CoV-2病毒株相關(guān)，其病毒載量更高，臨床癥狀明顯。我們研究發(fā)現(xiàn)，輕度SARS-CoV-2感染者可能在沒有產(chǎn)生可檢測的體液免疫反應(yīng)情況下已控制SARS-CoV-2的復(fù)制，表明再感染發(fā)生頻率比預(yù)想的高，但這一假設(shè)證據(jù)不充分。