李志超,張廣昊,黃 雁,陳 明
(大連工業大學 生物工程學院,遼寧 大連 116034)
脂糖肽抗生素A40926是抗感染新藥Dalvance的合成前體[1-2],由野野村放線菌(Nonomuraeasp.)ATCC 39727代謝生成[3-4]。A40926為A0、A1、B0、B1等組分構成的復合物,化學結構上與替考拉寧相似,均含有交聯七肽骨架、兩個氯原子、一個甘露糖和一個脂酰氨基葡萄糖酸,但各組分連接的疏水脂酰側鏈不同[5-6]。研究表明,脂酰側鏈能大大提高A40926的抑菌活性[7]。
然而,A40926生物合成基因簇中并不含合成脂酰側鏈的基因[8]。Beltramatti和Jovetic等[9-10]研究了培養基中添加支鏈氨基酸對野野村放線菌細胞脂肪酸和A40926各組分比例的影響,發現A40926各組分比例與生產菌細胞脂肪酸組成在變化趨勢上存在一致性,推測細胞脂肪酸經β-氧化后生成A40926的脂酰側鏈,而支鏈氨基酸則作為細胞脂肪酸合成的前體物。
Wallace等[11]研究了3種放線菌細胞直鏈、支鏈脂肪酸生物合成的起始物,認為放線菌支鏈脂肪酸的生物合成以異丁酰CoA(對應生成偶數碳的iso-脂肪酸)、3-甲基丁酰CoA(對應生成奇數碳的iso-脂肪酸)、2-甲基丁酰CoA(對應生成奇數碳的anteiso-脂肪酸)為合成起始物,直鏈脂肪酸的合成以丁酰CoA(對應生成偶數碳的n-脂肪酸)、丙酰CoA(對應生成奇數碳的n-脂肪酸)為合成起始物。Nonomuraeasp.ATCC 39727作為一種新發現的放線菌,對其生物特性研究較少[12]。本實驗對該菌利用短鏈羧酸合成細胞脂肪酸進行了研究。
1.1.1 菌 種
Nonomuraeasp.ATCC 39727,實驗室保藏。
1.1.2 培養基
培養基ISP2(g/L):葡萄糖4.0,酵母提取物4.0,麥芽提取物10.0,瓊脂20.0,pH 7.0。
培養基P150(g/L):葡萄糖20,(NH4)2SO43.65,KH2PO40.3,MgSO4·7H2O 0.45,CaCO35,每升加入3 mL微量元素液(g/L,FeSO4·7H2O 5,CuSO4·5H2O 0.39,ZnSO4·7H2O 0.44,MnSO4·H2O 0.15,CuCl20.02,NaMoO4·2H2O 0.011,50 mL 37% HCl)。
培養基P150中分別添加短鏈羧酸(丙酸、丁酸、異丁酸、2-甲基丁酸、3-甲基丁酸),質量濃度0.3 g/L。
1.1.3 試劑與儀器
三氟化硼-甲醇,上海安譜科學儀器有限公司;丙酸、丁酸、異丁酸、2-甲基丁酸、3-甲基丁酸、甲醇、正己烷,均為分析純。
氣質聯用儀,Agilent Technologies GC-MS 7890/5795。
1.2.1 菌體培養
取-80 ℃冰箱中甘油管菌種,涂布至培養基ISP2平板,28 ℃培養7~8 d,挑取單菌落至裝有2 mL無菌水的試管中,加入幾粒玻璃珠,對菌體進行振蕩破碎,取1 mL菌懸液接入25 mL合成培養基中,28 ℃、200 r/min培養72 h。
1.2.2 細胞脂肪酸的甲酯化及組分的GC-MS分析
方法見參考文獻[12]。
菌體經合成培養基P150培養后,對菌體的細胞脂肪酸組成進行GC-MS分析,圖1為培養基P150培養菌體細胞脂肪酸的總離子色譜圖。結果表明,共檢出9種主要脂肪酸,以偶數碳直鏈脂肪酸為主,C16:0脂肪酸質量分數最高(22.08%),C14:0、C16:1、C16:0、C18:0 4種偶數碳直鏈脂肪酸質量分數占總脂肪酸的47.76%;偶數碳支鏈脂肪酸i-C16:0質量分數達21.89%,i-C14:0和i-C16:0兩種脂肪酸質量分數達27.04%;奇數碳的i-C15:0、C15:0、a-C17:0脂肪酸同時被檢出,質量分數見表1。

圖1 培養基P150中細胞脂肪酸總離子色譜圖Fig.1 FAME GC-MS profile of Nonomuraea sp.ATCC 39727 cells grown in medium P150

表1 菌體細胞脂肪酸組成Tab.1 Cell fatty acids composition of Nonomuraea sp.ATCC 39727 %
圖2為合成培養基P150添加0.3 g/L丙酸后菌體細胞脂肪酸的總離子色譜圖。與圖1相比,添加丙酸后細胞脂肪酸組成發生了很大變化,奇數碳直鏈脂肪酸質量分數顯著增加,其中C15:0 脂肪酸質量分數由原來的5.96%增加到19.64%,原來未檢出C17:0脂肪酸,后達6.86%(表1),這可能是丙酰CoA為奇數碳直鏈脂肪酸合成起始物所致;添加丙酸后,C14:0、C16:1、C16:0等偶數碳直鏈脂肪酸及anteiso-C17:0脂肪酸質量分數顯著降低,但C18:0脂肪酸質量分數大幅度增加。

圖2 添加丙酸菌體的脂肪酸總離子色譜圖Fig.2 FAME GC-MS profile of Nonomuraea sp.ATCC 39727 cells grown in medium P150 supplemented with propionic acid
圖3為合成培養基P150添加0.3 g/L丁酸后菌體細胞脂肪酸的總離子色譜圖。與圖1相比,添加丁酸后細胞脂肪酸組成變化不大,添加丁酸后,C16:0脂肪酸質量分數下降,C18:0脂肪酸質量分數增加,C14:0、C16:1、C16:0、C18:0等4種偶數碳直鏈脂肪酸質量分數占總脂肪酸質量分數的50.70%,質量分數變化不大(見表1),說明添加丁酸對偶數碳直鏈脂肪酸的合成起始物丁酰CoA質量分數的影響并不大。

圖3 添加丁酸菌體脂肪酸總離子色譜圖Fig.3 FAME GC-MS profile of Nonomuraea sp.ATCC 39727 cells grown in medium P150 supplemented with butyric acid
圖4為合成培養基P150添加0.3 g/L異丁酸后菌體細胞脂肪酸的總離子色譜圖。與圖1相比,添加異丁酸后細胞脂肪酸組成發生了很大變化,偶數碳支鏈脂肪酸i-C16:0質量分數顯著增加,為質量分數最高的脂肪酸,同時C16:0脂肪酸質量分數顯著下降(表1)。異丁酰CoA為i-C16:0 脂肪酸合成起始物,異丁酸的添加導致了i-C16:0脂肪酸質量分數的顯著增加,同時導致偶數碳直鏈脂肪酸C16:0質量分數顯著降低。

圖4 添加異丁酸菌體脂肪酸總離子色譜圖Fig.4 FAME GC-MS profile of Nonomuraea sp.ATCC 39727 cells grown in medium P150 supplemented with isobutyric acid
圖5為合成培養基P150添加0.3 g/L 3-甲基丁酸后菌體細胞脂肪酸的總離子色譜圖。與圖1相比,添加3-甲基丁酸后細胞脂肪酸組成變化不大。3-甲基丁酰CoA為奇數碳iso-脂肪酸的合成起始物,添加3-甲基丁酸后i-C15:0脂肪酸質量分數增幅很小(表1),推測是Nonomuraeasp.ATCC 39727利用3-甲基丁酰CoA為脂肪酸合成起始物的能力較差所致。

圖5 添加3-甲基丁酸菌體脂肪酸總離子色譜圖Fig.5 FAME GC-MS profile of Nonomuraea sp.ATCC 39727 cells grown in medium P150 supplemented with 3-methylbutyric acid
圖6為合成培養基P150添加0.3 g/L 2-甲基丁酸后菌體細胞脂肪酸的總離子色譜圖。2-甲基丁酰CoA為奇數碳anteiso-脂肪酸的合成起始物,但添加2-甲基丁酸卻導致a-C17:0脂肪酸質量分數有所降低(表1),因此Nonomuraeasp.ATCC 39727體內anteiso-脂肪酸的合成還需要進一步的研究。

圖6 添加2-甲基丁酸菌體脂肪酸總離子色譜圖Fig.6 FAME GC-MS profile of Nonomuraea sp.ATCC 39727 cells grown in medium P150 supplemented with 2-methylbutyric acid
對脂糖肽抗生素A40926產生菌Nonomuraeasp.ATCC 39727利用短鏈羧酸合成細胞脂肪酸的能力進行了研究。該菌優先利用異丁酰CoA、丁酰CoA和丙酰CoA為細胞脂肪酸合成起始物,但利用3-甲基丁酰CoA為脂肪酸合成起始物的能力較差。