擔子菌門(BasidiomycotaR.T.Moore 1980)真菌是以食藥用菌為代表的大型真菌最主要的種類構成,也包括植物病原菌銹菌和黑粉菌,還有酵母菌等,其物種數占真菌界的1/3,有4萬余種。該類群所涉及的食用菌產業自2014年就已成為農業第5大種植業,藥用菌的活性產物開發前景廣闊。然而由于種類繁多、分類歷史悠久、大量新類群的發現引發分類系統巨大變革,阻礙了相關資源的認識進程。為此,中國科學院微生物所趙瑞琳團隊集結近10年來擔子菌門分類研究的新進展,首先在多基因及基因組層面對整個門的系統發育關系開展研究,并估算了目前擔子菌門內亞門、綱、目、科的演化時間,具體包括:6個基因(LSU、SSU、5.8s、rpb1、rpb2、ef1)的多基因系統發育圖譜、116個代表種的396個直系同源基因的系統發育基因組圖譜研究及771個代表種分子鐘分析推算了科和科以上的分類階元的演化時間。為建立擔子菌門標準化分類系統中的各分類等級的演化時間標準提供了依據。
此外,在理清擔子菌門內主要進化支序的系統發育關系基礎上,趙瑞琳團隊聯合27國專家對擔子菌門中已知的3 198個屬名進行梳理;同時還整理提供了每個合法屬的各類信息,包括分類地位、物種數、模式種、生活類型、生境、分布地、DNA數據以及系統發育等,進一步完善分類系統的各類信息。獲得目前最完整的擔子菌門分類系統:包括4亞門、18綱、68目、241科、1 928屬,共41 270個種(分別增加1亞門、2綱、14目、64科、337屬和9 755種)。研究成果于2019年11月發表于《Fungal Diversity》上。
以該研究成果為基礎的網站https://www.basidio.org正在建設中。該網站將持續對擔子菌門分類系統進行維護和更新,實現大型真菌(蘑菇)為主的這一大類真菌的分類系統的整體性呈現,不僅為分類學家,而且為資源的利用者、生態學家等提供巨大的便利。