病原體對全球養豬業是一個威脅。它們來自細菌、病毒、真菌和寄生源。數量眾多且往往容易發生突變,隨著時間的推移,其往往會對藥物產生抗性。
北美養豬業的生產流程經常面臨多種病原體的挑戰,北美養豬業每年的防病成本估計在10億美元范圍內;僅豬繁殖和呼吸障礙綜合征(PRRS)一項就估計為6.64億美元。這表明只有擁有更高生存能力、更能應對病原體的豬只才能夠提高養豬行業的效益。
豬只抵御疾病的能力可以通過多種方式來定義,如抵抗力、恢復力、耐受力和健康程度等,都可以用來評估動物應對病原體的能力。每一個概念的遺傳選擇都有其獨特的定義、獨特的實施方式,并且根據具體情況,在不同情況下對養豬生產可能是有益的。而挑選豬只抗病性的基因選擇似乎是最佳的選擇,因為顯而易見對疾病有抵抗力的動物,似乎比無法應對病原體挑戰的動物有優勢。但是,針對特定病原體需要人們進行大量的前期投入,而眾多病原體會產生抗藥性,病毒也容易變異,這些選育并培養出帶有抗病性基因的動物,需要面臨真正的考驗。如果目標病原體一旦突然發生突變,并可以在人群中傳播感染,則可能導致前期投入的血本無歸。
豬只對疾病的耐受性是人們的另一種選擇。人們認識到,較輕的疾病負荷水平不會影響養豬生產效益。然而,選擇疾病耐受性需要同時測量豬只的疾病表現和感染水平,豬只疾病的負荷水平對生產的影響,可能會隨著時間的推移而變化,因此在這兩種情況下,都需要進行新的基因選擇。
然而,事實上,在豬肉品行業所需要構建的高度健康環境,無需病原體負荷,因此人們提出了豬只疾病適應力的概念代替上述方案。
豬只疾病適應力是豬只抵抗力和耐受力的結合,被定義為動物在受到病原體攻擊時,在各種環境中維持正常表現的能力。疾病適應力的獨特之處在于,選擇條件不需要任何特定病原體或挑戰水平的特定條件。并且考慮到在我們目前不知道的新病原體出現時的情況,疾病適應力本質是為人類的未來健康狀況考慮所進行的遺傳選擇。
抗病能力的選擇針對的是那些允許動物產生耐受性結果的基因,或在受到攻擊時能夠使動物更快恢復的基因。 使用Genesus遺傳工具包中的定量和分子工具(如圖1),將選擇置于基因組內的多基因規模上,有利于進行更科學的豬只的疾病抗性表型的遺傳選擇。
Genesus參與遺傳選擇的資助已有10多年了。從全基因組關聯分析中發現了幾種有用的工具,并將其整合到Genesus工具箱中。人們為了提高豬只對豬繁殖與呼吸綜合征病毒(PRRSV)的適應力,而對其基因組區域進行了選擇。同時人們還正在監視豬只對豬圓環病毒相關疾病(PCVAD)易感性的基因組區域。Genesus研究小組與學術界合作,以提高豬只對大腸桿菌(E.Coli)的適應力。此外,最近已經確定了疾病的復原力特征,這將有助于填補以前的表型空缺,這些表型對于進行基因選擇來說是必需的,Genesus現在能夠通過這些特定表型,來識別更具抗病能力的動物,從而篩選更具優勢的基因。
在非洲豬瘟肆虐全球的大背景下,Genesus將繼續參與疾病研究,并正在努力將基因組學和疾病適應性表型結合起來,以選擇出更具優勢的具有抗病基因的動物。