蔣少杰
在全球癌癥相關的死亡數目中,結腸腺癌排在第四位[1]。結腸腺癌的形成是一個復雜而漫長的過程,甚至可以達到20年。在過去的20年中,隨著早期診斷技術不斷發展,基因檢測技術的不斷完善,雖然結腸癌癥的病死率明顯降低,但是發生率依然很高[2],新的治療手段也比較缺乏。有些研究[3-4]表明,20%~30%的結腸癌患者具有遺傳變異的性質,其中包括基因APC和TP53在癌前病變或腺瘤的形成中起著重要的作用。目前在人類疾病與腫瘤中的非編碼基因的作用也受到很大的關注,包括miRNAs或lncRNA,這些非編碼RNA可以為結腸癌的診治和預防提供新的靶點及策略。microRNAs是一類由內源基因編碼的長度約為22個核苷酸的非編碼單鏈RNA分子,主要通過抑制靶基因的功能來實現的。有些研究結果顯示,miRNAs是調控細胞增殖、分化、侵襲和轉移的重要調控因子[5]。本研究中使用生物信息學方法來處理miRNA表達譜數據,這些數據都是來自于國際腫瘤數據庫(TCGA)中結腸腺癌患者,然后得到差異表達的miRNAs,探討這些表達差異的miRNAs是否與結腸腺癌患者預后有關系,現報道如下。
1.1 數據下載 從TCGA網站上下載miRNAs表達譜數據,這些數據包括結腸腺癌患者組織與癌旁組織,還有相對應的臨床數據。其中男234例,年齡31~90歲,平均(67±12)歲;女217例,年齡34~90歲,平均(66±14)歲。樣本納入標準:經病理證實為原發性結腸腺癌,術前無任何放化療經歷;完整的臨床分期數據和預后的詳細信息。經過分析后共計451例結腸腺癌患者納入臨床分析,臨床分期:I+II 193例,III+IV 247例,無法確定11例。……