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HDAC9基因多態性與東北地區漢族人群腦梗死的相關性分析

2020-09-15 15:57:19靳美宋培蕓曹利
健康大視野 2020年17期

靳美 宋培蕓 曹利

【摘 要】 目的:探討組蛋白去乙酰化酶9(HDAC9)基因單核苷酸多態性(SNP)與東北地區漢族人群腦梗死的相關性。方法:實驗采用病例-對照方法,隨機選取符合研究目的的漢族腦梗死患者201名及漢族健康者139名。采用聚合酶鏈式反應-連接酶檢測反應(PCR-LDR),對所有受試者HDAC9 基因rs2107595位點進行基因分型,統計分析比較病例組和對照組不同基因型(TT/CT/CC)及等位基因(C/T)的差異,并以OR(95%CI)值表示等位基因(C/T)的相對風險。結果:HDAC9基因rs2107595C/T位點,病例組TT基因型及T等位基因頻率明顯高于對照組,差異具有統計學意義(χ2=7.511,P=0.022),T等位基因攜帶者患腦梗死的風險增加(OR=1.490,95% CI:1.081~2.051)。結論:HDAC9 基因 rs2107595 位點 SNP 與腦梗死易感性相關,其中 T 等位基因可能為腦梗死的遺傳易感基因。

【關鍵詞】 HDAC9、基因多態性、腦梗死

【中圖分類號】 R743.3 ? 【文獻標志碼】B ? 【文章編號】1005-0019(2020)17-199-02 ?腦梗死是一種異質性綜合疾病,環境因素和遺傳因素的交互作用在發病中具有重要的作用[1]。基因 HDAC9 是在全基因組測序研究中發現的與腦梗死發生密切相關的基因,我們通過對腦梗死患者基因 HDAC9 rs2107595位點多態性的研究,揭示表觀遺傳學中遺傳變異因素在腦梗死發病過程中所起到的作用。

1 對象與方法

1.1 對象 實驗組為黑龍江省醫院 2017 年 1 月至 2019 年 6 月神經內科 201名腦梗死住院患者,所有研究對象均滿足人體試驗倫理學標準,且已簽署知情同意書。實驗組納入的標準:(1)患者均符合第四屆中國腦血管疾病學術會議關于腦卒中的診斷標準;(2)擁有東北地區戶籍并且在東北地區內居住年數大于 5 年:(3)民族為漢族。排除標準:1、患者既往史中有心臟、腎臟、肝臟、骨骼和癌癥等主要疾病的,以及艾滋病,梅毒等嚴重傳染病史;2、排除患者之間存在血緣關系。

對照組為黑龍江省醫院體檢中心2017年1月至2019年6月健康體檢者139名,排除既往曾有腦卒中、腦外傷、腦血管病,排除曾有心臟、腎臟、肝臟、骨骼和癌癥等主要疾病的,以及艾滋病,梅毒等嚴重傳染病史,排除存在神經功能明顯的缺陷者,對照組均滿足人體試驗倫理學標準。

1.2 方法 清晨空腹肘前靜脈抽取5ml血樣,置于EDTA抗凝管后保存在-80℃冰箱中。應用Axygen公司的AxyPrep-96全血基因組DNA試劑盒提取基因組DNA,置于-80℃冰箱保存備用。使用ABI 公司PRISM3730 電泳測序儀對LDR反應產物進行測序,通過Genemapper 軟件進行數據分析,根據不同峰型及堿基大小進行基因分型。

1.3 統計學分析 使用SPSS 22.0軟件進行統計分析,不同基因型(TT/CT/CC)及等位基因(C/T)等變量屬計數資料,采用頻數及百分比表示,使用χ2檢驗比較病例組和對照組間上述資料的差異,并以 OR(95%CI)值表示等位基因(C/T)的相對風險。

2 結果

病例組及對照組 HDAC9 基因rs2107595位點基因型分布均符合Hardy-Weinberg 遺傳平衡定律(病例組 P=0.273,對照組 P=0.919;認為P>0.05符合Hardy-Weinberg 平衡),故本研究中病例組及對照組均有較好的群體代表性。結果顯示病例組 HDAC9 基因rs2107595 T/C位點TT、CT、CC基因型頻率與對照組比較,差異具有統計學意義(P <0.05)。病例組T等位基因頻率明顯高于對照組,T等位基因攜帶者患腦梗死的風險增加(表 1)。

3 討論

隨著分子生物學研究的深入,遺傳學、表觀遺傳學以及環境因素受到廣泛關注。最近的全基因組關聯研究(GWAS)表明HDAC9基因與腦卒中有關,但可靠性仍存在爭議,尤其是來自不同種族和地理位置的數據。GWAS報道HDAC9基因3端 SPN rs2107595多態性與大動脈腦卒中風險相關[2]。HDAC9缺失可能導致炎癥基因的下調,脂質相關基因的上調,以及小鼠動脈粥樣硬化病變大小的顯著減少[3]。大多數學者表明 rs2107595 僅增加大血管動脈粥樣硬化性卒中風險。然而Akinyemi[4]研究非洲人群 rs2107595 多態性也會增加小血管腦卒中風險。Su[5]研究 rs2107595 與南方漢族人群腦卒中關系,在加性、顯性、隱性和等位基因模型無顯著相關性,表明 rs2107595多態性與腦梗死無關聯。

本研究發現 HDAC9 基因 rs2107595T/C位點與腦梗死的發病可能存在相關性,其中T等位基因可能為腦梗死的遺傳易感基因,進一步提示HDAC9基因rs2107595 T/C位點與腦梗死易感性的關聯。

同時本研究存在一定局限性,該研究為基于醫院的病例對照研究,不能排除有選擇偏倚的可能性。并且,研究結果不應被推斷適用于其他人群,因為該研究群體均為居住于中國東北地區的漢族人群。

綜上所述,本研究提供的數據表明,HDAC9 基因rs2107595 T/C 位點可能與腦梗死的疾病易感性相關。但有關該基因位點與疾病易感性之間的具體病理生理功能及發病機制仍有待進一步的研究。

參考文獻

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[4] Pearce WJ. Epigenetics: an expanding new piece of the stroke puzzle[J]. Transl Stroke Res. 2011 Sep; 2(3):243-247.

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