古生物學數據庫現狀與數據驅動下的科學研究

鄧怡穎，樊雋軒，王 玥，史宇坤，楊 嬌，魯錚博

1. 中國科學院 南京地質古生物研究所，南京 210008；2. 中國科學技術大學，合肥 230026；3. 內生金屬礦床成礦機制研究國家重點實驗室，南京大學 地球科學與工程學院，南京 210023；4. 美國佐治亞理工學院，亞特蘭大 30332；5. 南京大學 地球科學與工程學院，南京 210023；6. 大陸動力學國家重點實驗室，西北大學 地質學系，西安 710069

1 前言

古生物學是了解地球和生命歷史的基礎學科，古生物化石是地質歷史中地球表層的生物及環境信息的重要載體，也是深時數字地球（Deeptime Digital Earth，DDE）大數據建設的重要組成部分之一。進入信息時代后，如何整合海量古生物學數據，并借助高速發展的計算機技術進行數據的深度挖掘和分析，開展數據驅動下的古生物學研究逐漸成為了熱點（Miller and Foote，2003；Alroy et al.，2008；Miller et al.，2009；Darroch and Wagner，2015；Fan et al.，2020）。一些核心數據庫的建立與重要研究成果的發表，促使各國學者愈發重視古生物學數據的收集、整理、分析與共享，并依此建立了不同類型、不同功能或針對不同門類的古生物專業數據庫。

古生物學數據，廣義上包括了化石數據以及與之關聯的地層學、古生態學、古地理學等信息。從數據來源來看，則主要是以化石為核心的野外標本采集數據、實驗測試數據、解釋數據等。其數據類型豐富，獲取方式差異顯著，保存形式多樣。其中，野外標本采集數據主要包括化石標本、化石分類單元初步鑒定信息、剖面名稱、地理位置、采集層、標本號等。實驗測試數據通常以常規實驗手段，如化石拍照、標本度量、光片和薄片磨制等獲取的數據為主，近年來隨著一些新的實驗技術手段的出現，通過Micro CT、3D掃描等成像技術獲取的數據也開始快速增長。……