
英國《自然》《自然·通訊》《自然·醫學》雜志近日同時發表來自多家研究機構的一系列報告,集中描述了對一個匯集了逾14萬人樣本的數據庫——基因組聚集數據庫(gnomAD)的應用,該數據庫擁有迄今最大規模的人類遺傳變異體公開目錄,是我們深入認識人類基因功能、發現新疾病相關基因的寶貴資源。
人類基因組中絕大多數基因的功能依然未知。揭示基因功能的一種方法是觀察基因發生突變后的結果。這些變異體往往會產生不良結果,但通常較為罕見。大規模基因測序研究有助于考察這些功能喪失型變異體的效應,或能帶來對人類生物學特征和疾病的重要見解。
此次《自然》發表的一篇概述性報告中,美國麻省理工學院—哈佛大學博德研究所科學家康拉德·卡澤維斯基及其同事,描述了從125748個全外顯子組和15708個全基因組測序數據集中鑒定出的443769個預測的功能喪失型變異體。鑒于這些變異體預計會影響其編碼蛋白的正常運作,團隊進而評估了這些變異體對生理機能的影響:究竟是幾乎沒有影響,還是會導致嚴重的健康問題。
卡澤維斯基與同事指出,他們距離鑒定出人類全部的預測功能喪失型變異體還很遙遠,盡管如此,他們認為這項資源能夠提升我們對罕見和常見遺傳病的評估。