研究病毒合作抗疫

一種與呼吸道疾病相關(guān)的新型冠狀病毒

上海公共衛(wèi)生臨床中心和復(fù)旦大學(xué)公共衛(wèi)生學(xué)院教授張永振等人與合作者對(duì)2019-nCov的基因組序列進(jìn)行了分析。相關(guān)研究成果近期發(fā)表于Nature。該病毒基因組從就職于出現(xiàn)病例的海鮮市場(chǎng)的一名病人身上獲得。基因組分析顯示，該病毒與此前在蝙蝠體內(nèi)找到的一組SARS樣冠狀病毒有相關(guān)性。對(duì)從該患者收集的支氣管肺泡灌洗液（肺分泌物）進(jìn)行了基因組測(cè)序，鑒定出了一種新型病毒，發(fā)現(xiàn)該病毒基因組與蝙蝠體內(nèi)發(fā)現(xiàn)的SARS樣冠狀病毒有89.1%的核苷酸相似性，還需要更多研究確認(rèn)病毒來(lái)源。為了進(jìn)一步了解該病毒對(duì)人類(lèi)的潛在感染性，論文還比較了該病毒和SARS冠狀病毒及蝙蝠SARS樣冠狀病毒刺突蛋白上的受體結(jié)合域。

新型冠狀病毒早期進(jìn)化機(jī)制研究進(jìn)展

中國(guó)科學(xué)院上海巴斯德研究所、中科院生物安全大科學(xué)中心上海分部崔杰研究組成員魏小曼、李祥等根據(jù)目前發(fā)表的新型冠狀病毒（2019-nCoV）分析結(jié)果及公共數(shù)據(jù)庫(kù)里上傳的基因組比對(duì)結(jié)果，進(jìn)行綜合分析，推測(cè)出此次暴發(fā)的新型冠狀病毒的早期進(jìn)化機(jī)制。研究結(jié)果發(fā)表于National Science Review。論文指出，新型冠狀病毒在早期進(jìn)化中顯示較弱的感染力，也可在人與人之間傳播，但傳播能力不容忽視。系統(tǒng)發(fā)育分析顯示病毒缺少拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)，聚類(lèi)不明顯。病毒應(yīng)該是在發(fā)生人與人之間傳播后開(kāi)始產(chǎn)生突變。至于病毒有沒(méi)有發(fā)生適應(yīng)性進(jìn)化，目前還無(wú)法定論，需要更多的病毒基因組分析及后續(xù)針對(duì)突變位點(diǎn)的功能實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證。

抗2019新型冠狀病毒藥物篩選方面研究進(jìn)展

中國(guó)科學(xué)院武漢病毒研究所/生物安全大科學(xué)研究中心與軍事科學(xué)院軍事醫(yī)學(xué)研究院國(guó)家應(yīng)急防控藥物工程技術(shù)研究中心研究人員開(kāi)展聯(lián)合研究，在抑制2019新型冠狀病毒（2019-nCoV）藥物篩選方面取得進(jìn)展。相關(guān)研究成果以《瑞得西韋和磷酸氯喹能在體外有效抑制新型冠狀病毒（2019-nCoV）》為題發(fā)表于中國(guó)自主知識(shí)產(chǎn)權(quán)的國(guó)際知名學(xué)術(shù)期刊Cell Research（《細(xì)胞研究》）。研究表明，瑞得西韋（Remdesivir，GS-5734）和磷酸氯喹（Chloroquine）在細(xì)胞水平上能有效抑制2019-nCoV的感染，其在人體上的作用還有合作研究，待臨床驗(yàn)證。

中國(guó)預(yù)先公布新型冠狀病毒3CL水解酶高分辨率晶體結(jié)構(gòu)

上海科技大學(xué)免疫化學(xué)研究所和中國(guó)科學(xué)院上海藥物研究所抗2019-nCoV冠狀病毒感染聯(lián)合應(yīng)急攻關(guān)團(tuán)隊(duì)及時(shí)公布了由上海科技大學(xué)饒子和/楊海濤課題組測(cè)定的2019-nCoV冠狀病毒3CL水解酶（Mpro）的高分率晶體結(jié)構(gòu)（數(shù)據(jù)收集在上海光源完成）。晶體結(jié)構(gòu)的坐標(biāo)已經(jīng)上載于PDB蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫(kù)（Protein Data Bank， PDB）。研究團(tuán)隊(duì)快速表達(dá)了2019-nCoV水解酶（Mpro）并獲得了高分辨率晶體結(jié)構(gòu)，該預(yù)先公布新型冠狀病毒3CL水解酶高分辨率晶體結(jié)構(gòu)能夠方便更多的科技工作者，特別是藥物研發(fā)的科技人員使用，協(xié)助國(guó)內(nèi)外同行專(zhuān)家研發(fā)出更多更好的抗新型肺炎藥物。

新型冠狀病毒（2019-nCoV）或來(lái)源于蝙蝠

中國(guó)科學(xué)院武漢病毒研究所/生物安全大科學(xué)研究中心、武漢市金銀潭醫(yī)院及湖北省疾病預(yù)防控制中心合作針對(duì)2019新型冠狀病毒（2019-nCoV）展開(kāi)了鑒定研究，揭示新型冠狀病毒（2019-nCoV）或來(lái)源于蝙蝠。相關(guān)研究成果近期發(fā)表于Nature。研究團(tuán)隊(duì)從早期的5位患者樣本中獲得了該病毒的全基因組序列，來(lái)自5位患者的病毒序列相似性達(dá)到99.9%，與SARSCoV的序列一致性為79.5%。進(jìn)一步將2019-nCoV基因組與實(shí)驗(yàn)室早期檢測(cè)的冠狀病毒的部分基因序列進(jìn)行比較，發(fā)現(xiàn)該病毒與來(lái)源于蝙蝠樣本的一株冠狀病毒（簡(jiǎn)稱(chēng)TG13）的基因相似，兩種病毒序列一致性高達(dá)96%。至今，中國(guó)科學(xué)家仍然與各國(guó)科學(xué)家一起致力于開(kāi)展病毒源頭和傳播途徑的全球科學(xué)研究。

新型冠狀病毒的進(jìn)化來(lái)源和傳染人的分子作用機(jī)制研究

中國(guó)科學(xué)院上海巴斯德研究所郝沛、軍事醫(yī)學(xué)研究院國(guó)家應(yīng)急防控藥物工程技術(shù)研究中心鐘武和中科院分子植物卓越中心合成生物學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室李軒合作，闡述了新型冠狀病毒的進(jìn)化來(lái)源和傳染人的分子作用機(jī)制。研究結(jié)果發(fā)表于SCIENCE CHINA Life Sciences。研究者利用新型冠狀病毒和收集到大量冠狀病毒數(shù)據(jù)進(jìn)行了遺傳進(jìn)化分析。由于新型冠狀病毒的進(jìn)化鄰居和外類(lèi)群都在各類(lèi)蝙蝠中有發(fā)現(xiàn)，推測(cè)新型冠狀病毒的自然宿主也可能是蝙蝠。新型冠狀病毒在從蝙蝠到人的傳染過(guò)程中很可能存在著未知的中間宿主媒介。該研究為病毒防控，以及開(kāi)發(fā)檢測(cè)和干預(yù)技術(shù)手段提供了研究基礎(chǔ)。

新型冠狀病毒易感性研究

同濟(jì)大學(xué)附屬東方醫(yī)院左為教授團(tuán)隊(duì)通過(guò)單細(xì)胞測(cè)序RNA-Seq技術(shù)發(fā)現(xiàn)新冠病毒（2019-nCoV）的受體ACE2在亞洲男性肺泡細(xì)胞中高表達(dá)；即僅從病毒受體方面分析，亞裔人群可能更容易感染新冠病毒，尤其是亞裔男性。相關(guān)成果發(fā)表于預(yù)印本文獻(xiàn)庫(kù)bioRxiv。該研究通過(guò)單細(xì)胞RNA測(cè)序技術(shù)以單細(xì)胞分辨率報(bào)道了ACE2在人肺中的RNA表達(dá)譜，并經(jīng)過(guò)統(tǒng)計(jì)分析表明ACE2受體與性別和族裔相關(guān)。嘗試解釋了臨床統(tǒng)計(jì)數(shù)據(jù)中出現(xiàn)的一些科學(xué)問(wèn)題，同時(shí)也猜測(cè)了2019-nCoV大流行的生物學(xué)原因。然而，值得關(guān)注的是，截至論文投遞，該研究進(jìn)行分析的樣品過(guò)少，相關(guān)結(jié)論仍然有待進(jìn)一步驗(yàn)證。

新型冠狀病毒感染的肺炎初期傳播動(dòng)力

中國(guó)疾病預(yù)防控制中心、湖北省疾病預(yù)防控制中心、香港大學(xué)等十幾個(gè)單位的專(zhuān)業(yè)人員協(xié)作，根據(jù)截至2020年1月23日上報(bào)的425例確診病例（包括15名醫(yī)務(wù)人員）所做了回顧性分析，開(kāi)展了新型冠狀病毒感染的肺炎在傳播初期的傳播動(dòng)力學(xué)分析。相關(guān)論文發(fā)表于新英格蘭雜志NEJM。截止到論文投遞的時(shí)間，論文基于425例病例流行病學(xué)調(diào)查資料做出了回顧性推論，提出了“2019年12月份即在密切接觸者中發(fā)生了人際傳播”的觀點(diǎn)。該調(diào)查結(jié)果以科學(xué)專(zhuān)業(yè)的態(tài)度刊發(fā)，有助于國(guó)內(nèi)外專(zhuān)業(yè)同行及時(shí)了解疾病的特征，共同評(píng)估和研判疫情，改進(jìn)防控策略，體現(xiàn)了積極發(fā)揮建設(shè)性引領(lǐng)作用的擔(dān)當(dāng)和科學(xué)精神。