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《柳葉刀》新型冠狀病毒肺炎案例分析兩則

2020-04-15 03:49:52
電腦報 2020年5期

PART1.感染病例分析

1.患者特征逐漸明朗

本次的研究為回顧性分析,患者均為在今年1月1日至1月20日。在武漢金銀潭醫院接受治療的確診患者。分析表明,有49名患者曾有華南海鮮市場的暴露史,占比為49%。其中,有47名患者具有長期暴露史(大部分為市場銷售人員或市場管理人員),2名患者只有短期暴露史(顧客)。

從患者的性別和年齡特征上看,本次分析的病例中,男性占了多數,共67名(68%)。這一比例與之前的數據(73%)相當。而從年齡分布上看,最新數據的年齡中位數為55.5歲,較先前的49.0歲有所上升。

世界衛生組織在上周的新聞發布會中多次提到,這次的感染病例中,有不少具有基礎疾病。本次的分析結果與這一觀點具有一致眭。分析表明。在這99名患者中。有50名患者同時具有心血管疾病、內分泌系統疾病、消化系統疾病等慢性疾病,占比約為51%。這些基礎疾病可能削弱了他們的免疫系統。

這些分析結果表明,新型冠狀病毒更有可能感染那些具有慢性疾病(免疫功能較弱)的年長男性。

2.癥狀與治療

論文中作者們也介紹了這些患者的常見癥狀和常用的治療方案。數據表明,有83%的患者出現了發熱,82%的患者有咳嗽。這兩者是最為常見的臨床特征。相比之下,其他的一些疾病特征則相對比較少見——有31%的患者出現了氣短,11%的患者出現了肌肉疼痛,這些都沒有超過半數。而剩余的一些癥狀,則占比不超過10%。

在治療方面,大約四分之三的患者(76%)接受了抗病毒療法。《柳葉刀》論文介紹說,患者使用的藥物包括奧司他韋

(oseltamivir)、更昔洛韋(ganciclovir),以及最近引起廣泛關注的抗HIV感染療法洛匹那韋/利托那韋(lopinavir/ritonavir)。

與此同時,有70%的患者接受了抗生素治療,有15%的患者接受了抗真菌治療。這些是為了應對患者出現的其他感染。

3.其他討論

作者們根據數據,做了一些相關的討論。首先,他們討論了一些“未知”。我們知道,無論是SARS病毒,還是MERS病毒,都從蝙蝠身上起源,且經過中間宿主傳染到人類。然而目前我們還不清楚,本次新型冠狀病毒的來源究竟是何方。另外,病毒的具體傳播率也依然不得而知。

其次,他們討論了感染的死亡率。從本篇論文的數據來看,99名患者中,有11名在論文發表時已經死亡,死亡率為11%。這一死亡率與SARS感染相當(10%),但不如MERS感染那么嚴重(35%)。作者也指出,隨著時間的推移,正在住院的患者中,可能還會有新增的死亡病例。

而從衛生應急辦公室發布的最新公告來看,31個省(區、市)的累計死亡率為2.2%,現有的重癥病例率為20.7%。

作者們還根據實驗室檢測的結果,指出大部分患者的淋巴細胞計數有所降低。這可能是因為在感染之后,體內的細胞因子風暴引發了一系列免疫反應,導致淋巴細胞的數量發生變化。這些結果表明本次新型冠狀病毒可能會影響到淋巴細胞,與SARS類似。而較低的淋巴細胞計數,或許也可以成為臨床診斷的參數之一。

4.小結

本篇論文的樣本數雖有增加,但和總確診病例相比,依然較少。此外,疑似病例的情況也尚未考慮在內。這些信息只能讓我們窺見新型冠狀病毒感染的早期特征。我們也期待隨著更多分析結果的出爐,科研人員和醫務人員們能更好地了解這種疾病,更好地對其進行診治和防控!

PART2.基因組分析

1.與舟山蝙蝠病毒最接近

在這項研究中,科學家們從9名患者的支氣管肺泡灌洗液與培養物中分離出了樣本,進行基因測序工作。從這些樣本中,科學家們一共拼接出了8個完整的病毒基因組,以及2個部分完整的病毒基因組。

在獲得了這些基因組信息后,研究人員們首先比對了它們之間的基因序列。比對結果表明,這8個完整的病毒基因組高達99.98%,幾乎完全一致!考慮到病毒本身較容易突變,這個比對結果告訴我們,從病毒感染人體到醫務人員對病毒進行系統性的檢測,這中間相隔的時間極短。

那么。這些病毒從何而來呢?作者們將其他已知的冠狀病毒基因組也納入了比對的范疇,這也包括了知名的SARS病毒和MERS病毒。比對結果表明,與新型冠狀病毒完整基因組序列最為接近的,是2018年在浙江省舟山市的蝙蝠體內分離出的兩株病毒,相似性達87.99%。相比之下,新型冠狀病毒與SARS和MERS病毒的序列就沒那么相像,相似性分別為79%和50%。

2.基因序列說明了什么?

在進一步的分析中,這些病毒的基因組序列向我們透露了更多細節。先前對于冠狀病毒的研究表明,其表面的S蛋白在病毒的感染和傳播上有著非常重要的作用。S蛋白可以分為兩部分:一塊叫做S1亞基,負責和細胞表面的受體結合;另一塊叫做S2亞基,負責“鉆”入細胞。

前面我們提到,與舟山蝙蝠體內發現的兩株冠狀病毒相比,此次新型冠狀病毒的基因組序列相似性很高。而在S蛋白上,科學家們則看到了一個很有意思的現象——負責“鉆”入細胞的S2亞基,與蝙蝠病毒的相似性達到了93%;而負責識別細胞受體并與之結合的S1亞基,相似性則只有68%。這也表明在感染人類上,新型冠狀病毒可能有著其特殊性。

那么,這種病毒究竟結合的是什么受體呢?研究人員們發現,盡管與SARS病毒總體而言相似性不是那么高,但在S1亞基上,兩者卻有著不少保守的氨基酸。基于這些結果,輔以計算機模型,研究人員們猜測新型冠狀病毒可能和SARS病毒一樣,結合的是人體的ACE2受體。但他們也指出,一些SARS病毒用于和ACE2結合的氨基酸位點,卻在新型冠狀病毒中發生了變異。因此它也有可能結合我們目前未知的某種受體。

3.其他討論

在分離用于測序的樣本時,科研人員們也對患者的來源進行過匯總。這9名患者中,有8名在華南海鮮市場有著暴露史,表明他們有可能是在市場內接觸到了感染源。然而,第9名患者卻從未去過華南海鮮市場,如何感染病毒尚不明確。

作者們做了兩種可能性的分析。首先,由于這名患者曾住在華南海鮮市場附近的賓館,可能通過飛沫傳播,感染上了這種病毒;又或者,這名患者體內的病毒來自某個目前還不明確的來源。現在,我們無法區分這兩種可能性。

《柳葉刀》表示,新型冠狀病毒和蝙蝠中分離出的病毒序列最為相似,但不大可能直接由蝙蝠傳染給人類,理由如下:首先,去年12月,我們才聽到有感染病例的消息,而武漢的蝙蝠在當時大部分已進入冬眠;其次,華南海鮮市場中并沒有發現販售蝙蝠的現象,相反,很多“非海鮮”的動物卻見在其中販售,包括可能作為中間宿主的哺乳動物;再次,盡管新型冠狀病毒的序列和蝙蝠中分離出的序列最為相似,但兩者的相似程度依舊不到90%,表明舟山的蝙蝠體內找到的病毒,不大可能是本次疫情的直接病毒來源,相反,現有的病毒應來自其他的來源;最后,我們已知的兩種嚴重的冠狀病毒SARS和MERS,雖然最初的病毒儲存庫都是蝙蝠,但均通過中間宿主傳給人類。

綜合來看,研究人員們認為,本次新型冠狀病毒可能最初也同樣來自某種蝙蝠,然后通過某種在華南海鮮市場販售,目前還未知的野生動物,傳染給了人類。作者們也在文章的最后指出,本次疫情的暴發,再次強調了野生動物體內未知病毒對人類的潛在威脅。

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