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B7-H1基因rs4143815位點多態(tài)性與結(jié)直腸癌發(fā)病風(fēng)險的關(guān)聯(lián)研究

2019-12-03 09:07:20馬曉骉潘定國
癌變·畸變·突變 2019年6期
關(guān)鍵詞:研究

馬曉骉,張 麒,潘定國

(云南省腫瘤醫(yī)院生物治療中心,云南 昆明 650118)

程序性死亡因子1配體B7同系物1(B7 homology 1,B7-H1),又稱CD274,是共刺激分子B7超家族中最重要的成員之一,可通過負向調(diào)節(jié)免疫反應(yīng)抑制T細胞活化和增殖,促進癌細胞的免疫逃逸。人類多種腫瘤類型,包括結(jié)直腸癌中B7-H1呈高表達,是患者預(yù)后不良的指標之一[1-4]。微小RNA(microRNA,miRNA)是內(nèi)源性的長度約為18~24個核苷酸的非編碼RNA,通過與靶基因 3′-非翻譯區(qū)(3′-untranslational region,3′-UTR)互補結(jié)合,發(fā)揮mRNA降解或蛋白抑制作用。miRNA靶位點的單核苷酸多態(tài)性(single nucleotide polymorphism,SNP)可影響基因表達,進而影響腫瘤的易感性[5-6]。前期有研究顯示位于B7-H1基因3′-UTR區(qū)的rs4143815位點的等位基因突變破壞了miR-570介導(dǎo)的轉(zhuǎn)錄后調(diào)控,增加了胃癌的發(fā)病風(fēng)險[7-8]。本研究探討B(tài)7-H1基因rs4143815位點多態(tài)性與中國人群結(jié)直腸癌發(fā)病風(fēng)險的關(guān)聯(lián),并分析其與B7-H1 mRNA表達的相關(guān)性。

1 材料與方法

1.1 研究對象

病例組來源于云南省腫瘤醫(yī)院2012年3月至2017年5月入院無親緣關(guān)系的215例結(jié)直腸癌患者,均為漢族,取EDTA抗凝外周靜脈血標本。入選標準:①病理學(xué)確診為結(jié)直腸癌患者;②未經(jīng)放化療治療。排除標準:①結(jié)直腸癌手術(shù)復(fù)發(fā)者;②結(jié)直腸轉(zhuǎn)移癌而非原發(fā)性腫瘤者。對照組外周靜脈血標本236例選自同期到醫(yī)院進行體檢的健康人群。排除有腫瘤病史、腫瘤家族史和非漢族個體。其中,病例組男性125例,女性90例,平均年齡(59.0±12.3)歲。臨床I-II和III-IV期患者各108和107例,高分化和中低分化癌各158和57例,有無淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移各77和138例。對照組男性148例,女性88例,平均年齡(58.4±9.7)歲。性別和年齡在病例和對照組中的分布差異無統(tǒng)計學(xué)意義(P>0.05)。

另外,收集手術(shù)切除結(jié)直腸癌和癌旁正常組織樣本(距癌組織5 cm以上的遠端組織)65例,液氮速凍,-80℃冰箱保存?zhèn)溆谩?/p>

1.2 試劑和儀器

血液和組織DNA提取試劑盒、Trizol試劑、TIANScriptⅡ RT Kit、FastFire qPCR PreMix(SYBR Green)均購自北京天根生化科技有限公司;PCR儀和定量PCR儀均為德國Eppendorf公司產(chǎn)品。

1.3 DNA提取及序列測定

采用血液基因組DNA提取試劑盒(提取全血基因組DNA,分光光度法測定DNA濃度和純度。運用直接測序法對B7-H1基因rs4143815位點進行分型。參考文獻[9]合成引物,引物序列如下:5′-GATACACATTT GGAGGAGACG-3′(上游),5′-CAAATACTCCATGTTT TACTAG-3′(下游)。PCR反應(yīng)體系 50 μL,包含2 ×PCR buffer 25 μL、上游引物 2 μL、下游引物 2 μL、模板DNA 2.5 μL和去離子水18.5 μL。混勻,置于PCR儀中,設(shè)置如下反應(yīng)條件:94℃預(yù)變性5 min;94℃變性30 s,55℃退火30 s,72℃延伸1 min,共35個循環(huán);72℃終延伸10 min。PCR產(chǎn)物送擎科生物科技有限公司測序。

另外,采用組織DNA提取試劑盒提取65例結(jié)直腸癌和癌旁正常組織樣本DNA,采用上述方法對B7-H1基因rs4143815位點進行PCR擴增,擴增產(chǎn)物送擎科生物科技有限公司測序。

1.4 定量PCR

Trizol試劑提取65例結(jié)直腸癌和癌旁組織總RNA,分光光度法測定RNA濃度和純度。TIANScriptⅡ RT Kit反轉(zhuǎn)錄合成cDNA,F(xiàn)astFire qPCR PreMix(SYBR Green)進行擴增。B7-H1定量PCR擴增引物:5′-GGTGGTGCCGACTACAA-3′(上游),5′-TAGCCCT CAGCCTGACAT-3’(下游)。以管家基因甘油醛-3-磷酸脫氫酶(glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase,GAPDH)作為內(nèi)參照,引物序列如下:5′-ATGGGGA AGGTGAAGGTCG-3′(上游),5′-GGGGTCATTGATGG CAACAATA-3′(下游)。按照 FastFire qPCR PreMix試劑盒說明配制反應(yīng)體系,混勻,置于定量PCR儀,設(shè)置如下反應(yīng)條件:94℃、5 min,94℃、30 s,60 ℃、35 s,40個循環(huán)。采用 2-ΔΔCT法計算結(jié)直腸癌中B7-H1 mRNA的相對表達水平。

1.5 統(tǒng)計學(xué)方法

采用SPSS 19.0軟件統(tǒng)計分析數(shù)據(jù)。采用擬合優(yōu)度卡方檢驗分析B7-H1基因rs4143815位點在病例組和對照組中的分布是否符合Hardy-Weinberg平衡。運用logistic回歸計算比值比(odds ratio,OR)和95%置信區(qū)間(confidence interval,CI),OR經(jīng)性別和年齡調(diào)整。秩和檢驗分析B7-H1 mRNA在不同組別中表達變化。P<0.05為差異具有統(tǒng)計學(xué)意義。

2 結(jié)果

2.1 Hardy-Weinberg遺傳平衡檢驗

病例組和對照組中均檢測到B7-H1基因rs4143815位點3種基因型,分別為CC、CG和GG基因型,3種基因型在對照組中的頻率分別為37.7%、44.1%和18.2%,在病例組中的頻率分別為27.9%、44.2%和27.9%。經(jīng)檢驗,均符合Hardy-Weinberg遺傳平衡,P值分別為 0.32和0.20。

2.2 B7-H1基因rs4143815位點多態(tài)性與結(jié)直腸癌風(fēng)險的相關(guān)性

運用測序法檢測結(jié)直腸癌組和對照組外周靜脈血中B7-H1基因rs4143815位點多態(tài)性,并分析其與結(jié)直腸癌風(fēng)險的相關(guān)性,見表1。與對照組相比,GG和CG/GG基因型顯著增加了結(jié)直腸癌的發(fā)病風(fēng)險[GG與CC相比:OR調(diào)整=1.99,95%CI(1.19,3.34),P=0.008;CG/GG與CC相比:OR調(diào)整=1.58,95%CI(1.06,2.36),P=0.02]。C和G等位基因在對照組中的頻率分別為59.7%和40.3%,在病例組中的頻率均為50.0%。與對照組相比,G等位基因顯著增加了結(jié)直腸癌的發(fā)病風(fēng)險[OR調(diào)整=1.48,95%CI(1.14,1.93),P=0.004]。分層分析顯示,B7-H1基因rs4143815位點多態(tài)性與結(jié)直腸癌臨床分期、分化程度和淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移等無明顯相關(guān)。

表1 B7-H1基因rs4143815位點多態(tài)性與結(jié)直腸癌的相關(guān)性

2.3 B7-H1基因rs4143815位點多態(tài)性與結(jié)直腸癌中B7-H1 mRNA表達的相關(guān)性

定量PCR檢測B7-H1 mRNA在65例結(jié)直腸癌和癌旁組織中的表達,如圖1A所示,B7-H1 mRNA在結(jié)直腸癌組織中的表達明顯高于癌旁組織(P=0.02)。B7-H1 mRNA在不同腫瘤臨床分期(I-II期和III-IV期)、分化程度(高中分化與中低分化)和淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移狀態(tài)(有和無)等生物學(xué)行為中的差異無統(tǒng)計學(xué)意義(圖1B~D)。進一步對比B7-H1基因rs4143815位點多態(tài)性與結(jié)直腸癌中B7-H1mRNA表達的相關(guān)性,發(fā)現(xiàn)65例結(jié)直腸癌組織中,B7-H1基因rs4143815位點CC基因型18例,CG基因型29例,GG基因型18例。B7-H1基因rs4143815位點GG基因型患者B7-H1 mRNA水平明顯高于B7-H1基因rs4143815位點CC基因型患者(P=0.03),見圖1E。

圖1 B7-H1 mRNA相對表達量

3 討論

B7-H1作為重要的免疫治療靶點,在腫瘤的治療過程中已經(jīng)取得了一定效果。作為負性調(diào)控分子,B7-H1在生理狀況下表達較低,腫瘤細胞中表達明顯增加[1-4]。既可與其受體PD1結(jié)合抑制B細胞活化,又可與非PD1受體結(jié)合誘導(dǎo)細胞毒性T淋巴細胞凋亡,參與腫瘤細胞的免疫逃逸。B7-H1表達一致的不同個體罹患腫瘤的風(fēng)險不盡相同,提示遺傳變異可能影響不同個體對腫瘤的易感性不同。以往多項研究均證實該觀點[10-11]。

最近,國內(nèi)外研究表明B7-H1基因rs4143815位點多態(tài)性與多種腫瘤的發(fā)病有關(guān)。Wang等[8,12]研究小組發(fā)現(xiàn)B7-H1基因rs4143815位點GG基因型增加了胃癌的發(fā)病風(fēng)險。Xie等[13]報道B7-H1基因rs4143815位點GG基因型攜帶者血清中B7-H1表達明顯升高,罹患肝癌的風(fēng)險明顯增加[OR調(diào)整=1.62,95%置信區(qū)間(1.26,2.06)],預(yù)示著更差的預(yù)后。相反,程仕光等[9]發(fā)現(xiàn)攜帶B7-H1基因rs4143815位點GG基因型肝癌患者總體生存時間延長。Tan等[14]報道B7-H1基因rs4143815位點GG基因型顯著增加了卵巢癌的發(fā)病風(fēng)險[OR=2.34,95%置信區(qū)間(1.27,~4.30)],但是對應(yīng)的B7-H1 mRNA表達量卻顯著降低。雖然B7-H1基因rs4143815位點多態(tài)性與肺腺癌、鱗狀細胞癌和非小細胞肺癌發(fā)病和預(yù)后無關(guān)[15-16]。但是,攜帶B7-H1基因rs4143815位點CC和CG基因型的晚期非小細胞肺癌患者對尼魯單抗更敏感,經(jīng)過治療后具有更好的客觀緩解率和無進展生存期[17]。然而,Zhou等[18]報道B7-H1基因rs4143815位點多態(tài)性與食管鱗狀細胞癌的發(fā)病風(fēng)險和預(yù)后無關(guān)。與以上陽性結(jié)果相同,本研究發(fā)現(xiàn)B7-H1基因rs4143815位點GG基因型和G等位基因攜帶者結(jié)直腸癌的發(fā)病風(fēng)險分別增加了1.99和1.48倍,提示可能是結(jié)直腸癌的易感基因之一。全基因組關(guān)聯(lián)研究顯示,人類染色體9p24是結(jié)直腸癌的一個易感位點[19],B7-H1基因恰好位于9p24.1,因此,本研究結(jié)果在遺傳學(xué)層面是合理的。

鑒于B7-H1基因rs4143815位點多態(tài)性位于B7-H1基因3′-UTR區(qū)miR-570結(jié)合“種子區(qū)”,C到G的轉(zhuǎn)變破壞了B7-H1基因與miR-570的結(jié)合,影響了B7-H1的表達[8],由此推測,B7-H1基因rs4143815位點多態(tài)性增加結(jié)直腸癌發(fā)病風(fēng)險的可能機制是B7-H1基因rs4143815位點GG基因型通過miR-570調(diào)控B7-H1 mRNA的表達。為驗證該推測,本研究運用定量PCR分析了結(jié)直腸癌組織中B7-H1 mRNA的表達,并分析了其與B7-H1基因rs4143815位點多態(tài)性的關(guān)系,發(fā)現(xiàn)結(jié)直腸癌組織中B7-H1 mRNA高表達,與以往研究結(jié)果一致[1-4];并且攜帶B7-H1基因rs4143815位點GG基因型的結(jié)直腸癌患者B7-H1 mRNA表達量明顯高于CC基因型攜帶者。該研究結(jié)果與Xie等[13]在肝癌中觀察到的結(jié)果一致,證實了B7-H1基因rs4143815位點GG基因型增加了B7-H1 mRNA表達進而增加了結(jié)直腸癌的易感性這一假設(shè)。

本研究存在一定的局限性:①樣本例數(shù)較小,可能沒有足夠的檢驗效能;②2012年設(shè)計收集樣本時,未采用問卷調(diào)查,遺失一些重要信息,例如遺傳結(jié)構(gòu)分析等。未來有必要開展設(shè)計嚴密、大樣本、多群體的前瞻性研究驗證本研究結(jié)果。

綜上所述,B7-H1基因miR-570結(jié)合位點rs4143815的GG基因型增加了中國漢族人群結(jié)直腸癌的發(fā)病風(fēng)險,可能機制是增加了B7-H1 mRNA的表達,提示B7-H1基因rs4143815位點多態(tài)性有望作為新的靶點用于結(jié)直腸癌免疫治療。

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