劉 艷,邵阿末,曾金艷,胡亞玲, 許 路△
(1.無錫衛生高等職業技術學校,江蘇無錫 214028;2.江蘇省無錫市人民醫院中心實驗室 214023)
膠質瘤是人顱內常見的原發惡性腫瘤,其主要特點是腫瘤細胞彌漫性浸潤生長、邊界不清、無限增殖且有高度侵襲性,治療困難,嚴重影響人類的健康。盡管膠質瘤的治療方法已取得很大的進展,但膠質瘤患者的5年生存率仍較低[1]。微RNA(microRNA,miRNA/miR)是一種內源性長20~25個堿基的非編碼小分子單鏈RNA,可調控人類約1/3編碼蛋白的基因。越來越多的研究表明miRNA異常表達與多種腫瘤的發生發展密切相關,miRNA既可作為癌基因促進腫瘤生長,又可作為抑癌基因抑制腫瘤相關靶基因的表達[2]。近年來,與腫瘤相關的miRNA被陸續發現,多種miRNA參與膠質瘤發生發展。其中,miR-186在包括膠質瘤在內的多種腫瘤中低表達,功能實驗顯示其具有抑癌作用[3-5]。本研究通過生物信息學方法預測miR-186靶基因包括Smad6,并利用雙熒光素酶報告系統進行活性檢測,通過分子生物學技術證實miR-186是否通過作用于Smad6對膠質瘤細胞增殖產生影響,以期解釋兩者在腦膠質瘤發病機制中的作用。
1.1材料 人腦膠質瘤細胞U87購自中國科學院上海細胞所;DMEM培養液、青-鏈霉素混合液購自美國HyClone公司;LipofectamineTM2000、TRIzol等試劑購自美國Invitrogen公司;M-MLV反轉錄酶、DNA聚合酶及緩沖體系購自美國Promega公司;dNTP和相關引物購自上海生工生物工程有限公司;苯甲基磺酰胺(PMSF)、RIPA裂解液、十二烷基硫酸鈉-聚丙烯酰胺凝膠(SDS-PAGE)電泳配制相關產品、CCK-8細胞毒性檢測試劑盒購自上海碧云天生物技術研究所;胎牛血清購自以色列Biological Industries公司;GAPDH、Smad6抗體購自美國Cell Signaling公司;聚偏氟乙烯碳(PVDF)膜、化學發光底物ECL購自美國Millipore公司。野生型和突變型Smad6基因3′-非編碼區(3′-UTR)螢光素酶表達載體的構建和測序由上海吉瑪制藥技術有限公司提供。
1.2方法
1.2.1細胞培養 U87細胞用含10%胎牛血清、100 U/mL青霉素、100 mg/L鏈霉素的DMEM培養基進行培養,置于37 ℃、5% CO2的培養箱內常規傳代培養,定期觀察細胞密度,每2~3天換液1次。實驗所用細胞均為對數生長期細胞。
1.2.2細胞轉染及分組 制備終濃度為80 nmol/L miR-186 mimics 或80 nmol/L miR-186 inhibitor LipofectamineTM2000脂質體復合物。細胞分別加入miR-186 mimcs 或miR-186 inhibitor脂質體復合物(miR-186 mimcs 組、miR-186 inhibitor組),同時設置對應的對照組(分別為miR-186 mimcs NC組、miR-186 inhibitor NC組)。購建Smad6過表達質粒(Smad6組),以及對應的對照質粒(vector組),細胞分別轉染相應質粒;用Smad6過表達質?;驅φ战M質粒與miR-186 mimics或miR-186 mimics NC共轉染,再分miR-186 mimics NC+vector組、miR-186 mimics NC+Smad6組、miR-186 mimcs+vector組和miR-186 mimics+Smad6組4個組。將對數生長期的U87細胞以每孔2 ×105/mL密度接種于六孔板,待細胞融合度達70%左右時行共轉染,置于37 ℃、含5% CO2培養箱中繼續培養48 h。
1.2.4定量反轉錄聚合酶鏈反應(RT-qPCR)檢測 收集各組細胞,用TRIzol裂解并提取各組細胞總RNA。應用紫外分光光度計測定各組細胞的總RNA濃度,然后取2 μg總RNA進行反轉錄,最后取1 μL cDNA模板于25 μL反應體系中進行RT-qPCR,其中分別以U6和GAPDH為內參。擴增條件為95 ℃ 5 min;95 ℃ 30 s、55 ℃ 30 s、72 ℃ 30 s,共40個循環。獨立重復實驗3次,采集數據,最后以2-ΔΔCt相對定量法計算基因的相對表達量。具體引物序列見表1。

表1 引物名稱和序列
1.2.5Western blot檢測蛋白水平 收集各組細胞,用含1% PMSF的RIPA裂解液裂解細胞提取總蛋白,BCA 法檢測各組蛋白濃度,每組取等量蛋白進行SDS-PAGE電泳分離后并將其轉移至PVDF膜,以5%脫脂奶粉-TBST封閉液封閉1 h,一抗4 ℃孵育過夜, TBST洗3遍,HRP標記的二抗室溫孵育2 h,TBST洗3遍,最后掃描PVDF膜并進行結果統計分析,其中以GAPDH作為內參。
1.2.6CCK-8法檢測細胞活力 將細胞按5×103密度接種于96孔板中,每孔加入10 μL CCK-8試劑,37 ℃條件下孵育2 h后酶標儀檢測各孔在490 nm波長下的吸光度(A)值。每組設置3個復孔取平均值,另設單孔作為空白對照。細胞活力(%)=(檢測時間點A值-0 hA值)/(0 hA值-空白對照A值)×100%。
1.2.7集落形成實驗 計數細胞懸液,將細胞接種于6孔板中(每孔1×103個細胞),置細胞于培養箱中培養3周,除去培養液,用PBS洗滌2次,加4%多聚甲醛固定細胞15 min,然后去除固定液,加適量結晶紫染色15 min,然后洗去染色液,自然環境中干燥,最后計算集落形成率。集落形成率(%)=集落形成數/接種細胞數×100%。
1.2.8雙熒光素酶報告實驗 構建野生型和突變型Smad6基因3′-UTR的報告基因質粒(wt-Smad6和mut-Smad6),依照轉染試劑說明將miRNA-186 mimics和wt-Smad6、miRNA-186 mimics NC和wt-Smad6、miRNA-186 mimics和mut-Smad6、miRNA-186 mimics NC和mut-Smad6、miRNA-186 inhibitor和wt-Smad6、miRNA-186 inhibitor NC 和wt-Smad6、miRNA-186 inhibitor 和mut-Smad6、miRNA-186 inhibitor NC和mut-Smad6 共轉染細胞。轉染48 h后,根據試劑盒說明書建議的方法檢測上述各組細胞的相對熒光強度值。

2.1miR-186通過結合Smad6的3′-UTR調控Smad6的表達 通過生物信息學軟件預測miR-186與Smad6的3′-UTR區結合位點。熒光素酶報告實驗結果顯示,相比miR-186 mimcs NC組,miR-186 mimcs組降低了野生型Smad6 3′-UTR轉染細胞的熒光素酶活性(P<0.05);而與miR-186 inhibitor NC組比較,miR-186 inhibitor組 Smad6 3′-UTR轉染細胞的熒光素酶活性增強(P<0.05)。但在轉染突變型Smad6 3′-UTR的細胞中,相比各自對照組,miR-186 mimcs組、miR-186 inhibitor組都不能改變突變型Smad6 3′-UTR細胞的熒光素酶活性(P>0.05),見圖1。

A:生物信息學軟件預測miR-186的下游靶基因;B、C:熒光素酶報告實驗;a:P<0.05
圖1miR-186與Smad6的靶向關系
2.2miR-186負向調控U87細胞Smad6蛋白的表達水平 qRT-PCR檢測結果顯示,miR-186 mimics組miR-186的表達水平較miR-186 mimics NC組顯著升高(P<0.05);miR-186 inhibitor組miR-186的表達水平較miR-186 inhibitor NC組明顯降低(P<0.05),見圖2A。Western blot 實驗檢測結果顯示,與miR-186 mimics NC組比較,miR-186 mimics 組Smad6蛋白表達水平下降(P<0.05);與miR-186 inhibitor NC組比較,miR-186 inhibitor 組Smad6蛋白表達水平升高(P<0.05),見圖2B、C。

A:PCR分析圖;B:Western blot;C:Western blot分析圖;1:miR-186 mimcs NC組;2:miR-186 mimcs組;3:miR-186 inhibitor NC組;4:miR-186 inhibitor組;a:P<0.05
圖2miR-186對U87細胞Smad6蛋白表達水平影響

A:轉染Smad6過表達質粒后U87細胞Smad6 mRNA的表達變化;B:轉染Smad6過表達質粒后U87細胞Smad6蛋白的表達變化;C:Smad6過表達質粒或對照組質粒與miR-186 mimics NC組或miR-186 mimics共轉染后Smad6蛋白的表達變化;1:miR-186 mimics NC+verctor組;2:miR-186 mimics+vector組;3:miR-186 mimics NC+Smad6組;4:miR-186 mimics+Smad6組;a:P<0.05
圖3Smad6過表達恢復miR-186對Smad6蛋白表達的抑制作用

A:CCK-實驗;B:細胞集落形成實驗及其定量分析;1:miR-186 mimics NC+verctor組;2:miR-186 mimics+vector組;3:miR-186 mimics+Smad6組;4:miR-186 mimics NC+Smad6組;a:P<0.05,b:P<0.01
圖4miR-186靶向Smad6對U87細胞增殖的影響
2.3Smad6過表達可恢復miR-186對Smad6的抑制作用 U87細胞轉染Smad6質粒后,Smad6 mRNA和蛋白質的表達均增加(P<0.05),見圖3。
2.4miR-186靶向Smad6抑制U87細胞增殖 CCK-8檢測結果顯示,與miR-186 mimics NC+vector組比較,miR-186 mimics+vector組U87細胞增殖能力明顯降低,miR-186 mimics NC+Smad6組細胞的增殖能力顯著升高(P<0.05);與miR-186 mimics+vector組比較,miR-186 mimics+Smad6組細胞的增殖能力顯著升高(P<0.05),見圖1A。細胞集落形成實驗顯示,與mimics NC+vector組相比,miR-186 mimics+vector組U87細胞克隆形成率明顯降低,miR-186 mimics NC+Smad6組細胞克隆形成率顯著升高(P<0.05);與miR-186 mimics+vector組相比,miR-186 mimics+Smad6組細胞克隆形成率顯著升高(P<0.05),見圖4。
膠質瘤具有高發病率和低生存率的特點[6]。雖然膠質瘤的手術、放化療等治療技術已取得長足的發展,但膠質瘤患者的預后仍不理想。隨著膠質瘤分子學的研究,發現膠質瘤的本質是一種多基因異常疾病,包括抑癌基因的突變缺失及原癌基因的過表達。因此尋求新的分子基因靶點成為治療膠質瘤新的突破點。
miRNAs具有高度的保守性、組織特異性,可通過3′-UTR堿基互補的方式識別特異靶基因,在轉錄后水平降解靶基因mRNA或抑制靶基因的翻譯,從而在細胞增殖、分化、凋亡中發揮重要作用。近年來的研究發現,在膠質瘤中存在大量miRNA的異常表達,并參與了膠質瘤的增殖、凋亡與侵襲等生物功能[7]。BAO等[8]研究表明miR-519a在膠質瘤標本和細胞系中多表達降低,低表達的miR-519a與膠質瘤患者較差的預后呈正相關。XUE等[9]研究發現,與正常組織相比,膠質瘤組織中miR-221/222的表達明顯升高,惡性程度高的膠質瘤組織的表達高于惡性程度低的組織,高表達miR-221/222的膠質瘤患者生存期較短。miR-186作為miRNAs中的一員,近年已成為研究的熱點,CAI等[10]研究發現miR-186在口腔鱗狀細胞癌組織和細胞系中表達明顯降低,發揮抑癌作用。SU等[11]實驗結果表明與正常細胞系相比,miR-186在人皮膚惡性黑色素瘤細胞系中的表達明顯降低,過表達后可抑制腫瘤細胞增殖,同時也降低細胞的遷移和侵襲能力。另有研究表明該基因在膠質瘤中也是低表達,發揮抑癌功能,但是具體的機制并不明確[12]。本課題組前期研究也發現,與正常星形膠質細胞相比,miR-186在膠質瘤細胞中的表達明顯降低。筆者通過miRanda、miRDB、 miRWalk、 Targetscan數據庫預測出能與Smad6結合的miRNAs包含miR-186,推測miR-186可能通過靶向調節Smad6的表達來發揮作用。
Smad6是抑制性Smad蛋白,是轉化生長因子-β(transformation growth factor-β,TGF-β)信號通路的一類關鍵調控分子。TGF-β家族成員具有廣泛的細胞功能,比如調節細胞增殖與分化、細胞凋亡、細胞遷移和細胞間粘連。另外,它們在胚胎發育、免疫監督及干細胞自我更新和分化中也起著重要的作用。多個證據表明Smad6對腫瘤的發生發展發揮一定的作用。比如Smad6在胰腺癌、口腔鱗狀細胞癌中存在過表達現象,可能是導致該腫瘤發生的原因之一[13]。Smad6影響非小細胞肺癌的生存期,敲降該基因可引起肺癌細胞活力下降、凋亡增加,同時抑制細胞周期,從而重建肺癌細胞TGF-β信號通路的平衡[14]。另有研究表明Smad6在肝癌CD133+干細胞中表達增加[15]。前期研究發現Smad6在膠質瘤中表達亦增加[16]。本研究通過雙熒光素酶報告實驗證實miR-186能直接結合到Smad6 3′-UTR,與生物信息學方法的預測結果一致。與文獻報道的miR-186可通過調控相關靶基因影響腫瘤的生物學功能類似[3-4],本研究也發現轉染miR-186模擬物或抑制物后,Smad6的表達水平明顯降低或升高,說明 miR-186負向調控膠質瘤U87細胞Smad6蛋白的表達水平;轉染miR-186模擬物后,細胞的增殖顯著減弱,共轉染miR-186模擬物和Smad6過表達質粒后,細胞的增殖能力有明顯恢復,故推斷在膠質瘤細胞中miR-186通過靶向調節Smad6影響了細胞的增殖能力。
綜上所述,miRNAs通過調控不同的靶基因參與膠質瘤的發生、發展過程。本文探討了miR-186、Smad6在膠質瘤發生發展中的重要作用,為膠質瘤的防治提供實驗依據,并有可能成為膠質瘤治療的新方向。