張燕 岳壽松 陳高 游銀偉 鐘懷榮 于金慧



摘要:組蛋白乙?;D移酶上調表達與抗逆性有一定相關性。集胞藻Synechocystis sp. PCC 6803 Slr1501是一個未知蛋白,預測其屬于組蛋白乙?;D移酶GNAT家族N-乙?;D移酶。為了進一步明確slr1501基因功能,本研究從集胞藻6803中克隆slr1501基因,成功構建了pET-28a(+)-slr1501原核表達載體,并轉化至大腸桿菌BL21(DE3)進行分析。經1 mmol/L IPTG誘導2 h后Slr1501蛋白成功表達,表達量隨誘導時間的延長而增加,且主要以包涵體形式表達。Western blot檢測結果顯示Slr1501重組蛋白特異性表達。本試驗結果為進一步研究該基因的功能奠定了基礎。
關鍵詞:集胞藻6803; 乙?;D移酶; slr1501; 原核表達; 基因功能
中圖分類號:S555+.6:Q785文獻標識號:A文章編號:1001-4942(2019)07-0001-05
集胞藻Synechocystis sp. PCC 6803 (以下簡稱集胞藻6803)歸屬于藍藻門集胞藻屬,是一種單細胞藍藻,其基因組序列遺傳背景清楚、結構簡單,是基因工程研究的模式藻類。Slr1501是集胞藻6803中的一個未知蛋白,根據序列相似性和相應蛋白功能比對結果,預測其為組蛋白乙?;D移酶GNAT家族N-乙?;D移酶(http://bacteria.kazusa.or.jp/cyanobase)。組蛋白乙?;山M蛋白乙?;D移酶(histone acetyltransferase,HAT)和組蛋白去乙?;福╤istone deacetylases,HDAC)共同參與,過程動態可逆。組蛋白乙?;潜碛^遺傳調控的重要機制,在HAT的作用下,將乙?;鶊F轉移到目標受體氨基酸位點的過程,是細胞控制基因表達、蛋白質活性或生理過程的一種機制[1]。HAT對細胞核內轉錄調控因子的激活起到非常重要的作用,已證實乙酰化參與原核生物的轉錄后修飾,涉及轉錄調控和信號轉導蛋白[2]。
集胞藻6803 slr1501與逆境適應相關,如鹽脅迫、滲透脅迫、酸脅迫和堿脅迫等[3-7]。當轉至pH值為10條件下,集胞藻6803細胞中slr1501轉錄水平升高;而再次轉至中性pH值條件時,slr1501轉錄水平迅速下降至高pH條件時表達水平的1/40左右,1 h后,檢測不到slr1501的表達。這種快速的基因表達反應,目前尚未在其它pH逆境反應相關基因中發現[6]。slr1501可能在更大范圍的逆境適應中具有潛在作用,它的表達上調不僅只發生在pH值升高時,在高鹽、黑暗、冷脅迫、熱脅迫、缺鐵、缺氮、缺磷等逆境條件,特別是強光下上調最顯著[8]。但Taylor[7]的研究表明,在多重逆境(如高鹽、高光和高滲透壓)條件下,slr1501基因對集胞藻6803細胞生長具有負調控效應;在單逆境高pH條件下,缺失slr1501基因時,集胞藻6803細胞的生長不受影響。
目前,對集胞藻6803 slr1501的研究多停留在各種逆境條件下該基因的表達水平及抗逆反應上[3-7],具體功能并未開展研究?;诖耍狙芯繑M通過構建pET-28a(+)-slr1501表達載體,并在大腸桿菌中表達Slr1501蛋白,旨在為進一步研究該基因的功能奠定基礎。
1 材料與方法
1.1 材料
集胞藻Synechocystis 6803基因組,本實驗室提取保存;pET-28a(+)載體,本實驗室保存;大腸桿菌DH5α和BL21 (DE3)感受態,購自北京全式金生物技術有限公司。
1.2 主要試劑
DNA凝膠回收試劑盒、質?;厥赵噭┖芯徸設MEGA公司;限制性內切酶和T4 DNA連接酶均購自TaKaRa公司;PCR擴增高保真酶和PCR檢測用酶均購自青島擎科梓熙生物技術有限公司;his tag兔多克隆抗體、辣根過氧化物酶(HRP)標記的羊抗兔二抗和ECL高靈敏度化學發光檢測試劑盒購自康為世紀生物科技有限公司。
1.3 slr1501基因克隆
根據Cyanobase中集胞藻6803基因組序列,應用Primer Premier 5.0設計擴增slr1501基因全長引物:slr1501-NdeⅠ-F:5′-ACTCCATATGGTGATGTCAACCACGCTAAA-3′和slr1501-XhoⅠ-R:5′-ACTCCTCGAGTTAGTTGAGACGCATACCAA-3′,上下游引物5′端分別引入NdeⅠ和XhoⅠ兩個酶切位點(下劃線處)。由青島擎科梓熙生物技術有限公司合成引物。
以集胞藻6803基因組DNA為模板,對slr1501基因進行擴增。PCR反應體系為50 μL:I5 PCR mix 25 μL,上下游引物各1 μL,DNA 1 μL,加ddH2O至50 μL。PCR反應程序:98℃ 2 min;98℃ 10 s,55℃ 10 s,72℃ 15 s,35個循環;72℃ 5 min。
1.4 pET-28a(+)-slr1501載體構建和轉化
分別用NdeⅠ和XhoⅠ限制性內切酶雙酶切slr1501目的基因和 pET-28a(+)質粒,后經1%瓊脂糖凝膠電泳回收目的基因和pET-28a(+)線性片段。經T4 DNA連接酶16℃過夜連接后,轉化大腸桿菌DH5α感受態細胞,Kan抗性篩選。挑取單克隆進行PCR和雙酶切驗證,并將陽性克隆送至青島擎科梓熙生物技術有限公司進行測序。
將測序正確的pET-28a(+)-slr1501質粒轉化大腸桿菌BL21(DE3)感受態,用Kan抗性進行篩選,挑取陽性克隆進行菌落PCR驗證。
1.5 重組蛋白誘導表達
挑取含有重組質粒pET-28a(+)-slr1501的BL21(DE3)陽性菌落接種于5 mL含Kan抗性的LB液體培養基中,37℃振蕩(180 r/min)過夜培養。取培養過夜的菌液按照1∶100的接種量接種至新的含Kan抗性的LB液體培養基上,37℃振蕩培養2~3 h,至菌液OD600值達到0.6~0.8時,加IPTG(終濃度為1 mmol/L)開始誘導Slr1501蛋白表達,繼續振蕩培養,分別于誘導開始后0、2、4、6 h取 1 mL菌液離心收集菌體,加入100 μL的1% SDS,重懸菌體,70℃孵育10 min,后加入5×SDS蛋白上樣緩沖液,混勻后于沸水中煮10 min,進行SDS-PAGE(12%分離膠,5%濃縮膠)電泳,90 V恒壓至樣品跑至分離膠內時,電壓調至120 V,直至蛋白電泳結束。收集誘導6 h的pET-28a(+)-slr1501菌液3 mL,離心后加1 mL PBS懸浮菌體進行超聲破碎,分別將上清和沉淀SDS-PAGE電泳,檢測誘導的Slr1501重組蛋白可溶性。