中世紀噴泉側重于其宗教的含義

到了中世紀時期，羅馬人修建的水渠因為年久失修而坍塌并失去了作用，因此大多數的噴泉遭到了廢棄。噴泉，原本在歐洲隨處可見的飲水公共設施，除了在一些宮殿或者是修道院里仍有留存，在歐洲人的生活中已經絕跡了。

因為底層的人民很難接觸到噴泉，因此噴泉在這個階段開始被賦予各種各樣的象征意義，能夠設置噴泉的庭院往往被看做是“伊甸園”，因此噴泉也就帶有了“生命之水”“純潔”“智慧”“無辜”的含義。

中世紀時期著名的繪本書籍《貝里公爵的豪華時禱書》中，伊甸園就是由一座典雅的哥特噴泉作為中庭裝飾的。而后為書做續作的尼德蘭巨匠凡·艾克也通過用噴泉來裝飾“天堂”。

修道院作為逃避世俗生活的“伊甸園”，與黑暗的中世紀生活幾乎完全隔絕開來，對于噴泉這種象征伊甸園的產物，往往格外注意。因此很多修道院里仍舊保存著一些中世紀的噴泉，比如說在普羅旺斯的托洛內修道院內的噴泉仍在流淌。當然，這樣的噴泉除了象征意義之外，也有一定的實用價值，最直接的就是讓人們在宗教儀式之前凈手。

在宮廷以及貴族的庭院中也會有噴泉，這些也是富有象征意義而并非實用意義的，在當時的貴族階層看來，噴泉象征的是愛情之水源源不斷地流淌。中世紀時期的法國浪漫詩歌《玫瑰傳奇》中，就描繪了這么一座封閉的庭院，正中央有一座小噴泉，噴出的水直接進入了旁邊的花叢，養護了花園中的花花草草。

中世紀的噴泉上愛用浮雕來進行裝飾，一般來說裝飾的紋樣采用的是圣經故事、當地歷史傳說以及當時比較流行的美德和寓言故事。比如說意大利佩魯賈的馬焦雷噴泉，建于1278年，就刻有星座以及羅馬歷史中的人物。