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海洋細菌低溫葡萄糖氧化酶基因克隆及其在大腸桿菌中的表達

2019-06-26 09:08:32劉春瑩胡善松張慶芳李美玉于爽遲乃玉
食品與發酵工業 2019年11期

劉春瑩,胡善松,張慶芳,李美玉,于爽,遲乃玉*

1(大連大學 生命科學與技術學院,遼寧 大連,116622) 2(遼寧省海洋微生物工程技術研究中心,遼寧 大連,116622)

葡萄糖氧化酶(glucose oxidase, GOD)的系統名稱為β-D-葡萄糖氧化還原酶(E.C.1.1.3.4)[1],最先于1904年在黑曲霉和灰綠青霉中發現[2-4]。它能夠催化β-D-葡萄糖被氧化成葡萄糖酸-δ-內酯,進而被水解成葡萄糖酸,并生成過氧化氫[5]。因此,GOD因其具有脫氧和防腐的功能,而應用在食品保鮮方面。GOD還具有消除腸道病原菌、解除腸道霉菌毒素中毒、改善腸道酸性消化環境、保護腸道上皮完整的功能[6-7],被廣泛應用在畜牧業和養殖業[8-9]。由于GOD的專一氧化葡萄糖的特性,在生物傳感器、醫學檢驗等領域是重要分析用酶[10-13]。

野生菌株中GOD活力較低,利用基因工程進行改造成為一種有效的手段。20世紀KOVACEVIC等[14]與GUO等[15]在畢赤酵母中成功表達黑曲霉GOD。PULCI等[16]也將青霉GOD的基因成功克隆到酵母中并實現表達。隨著GOD需求的增加,我國相關研究也逐漸增多。周亞鳳等[17]將黑曲霉GOD基因克隆到酵母中并高效表達。高慶華等[18]也將青霉GOD基因克隆到酵母中并表達。大腸桿菌一直作為外源蛋白表達的首選系統[19],但很少應用在GOD外源表達方面。現有報道僅WITT等[20]及顧磊等[21]嘗試在大腸桿菌中表達黑曲霉GOD。細菌與大腸桿菌的同源性更高,可能更適合在大腸桿菌中表達,但此類的研究此前未見報道。

本研究以海洋細菌Citrobacterssp. 8-III為出發菌株,采用E.coliBL21(DE3)為表達宿主,構建GOD高產大腸桿菌工程菌株,實現GOD在大腸桿菌中的高效表達,并對重組GOD酶學性質進行分析。

1 材料與方法

1.1 實驗材料

1.1.1 菌株與質粒

Citrobacterssp. 8-III:遼寧省海洋微生物工程中心提供(分離自大連渤海海域,深度約30 m的海泥中。);E.coliDH5ɑ:構建和克隆目的基因;E.coliBL21(DE3):表達宿主;質粒pMD9-T:克隆載體;質粒pET-28a(+):表達載體。

1.1.2 試劑與儀器

PCR相關試劑、克隆相關試劑和限制性內切酶:Takara公司;PCR產物純化試劑盒等:上海生工生物有限公司;瓊脂糖、辣根過氧化物酶和鄰聯茴香胺等試劑:Sigma公司。

PCR儀和電轉化儀,Eppendorf公司;Multiskan1510酶標儀,Thermo Fisher Scientific;LDZX-40BI立式壓力蒸汽滅菌鍋,上海申安醫療器械廠;LTI-700恒溫培養箱,上海愛郎儀器有限公司;HZP-250全溫振蕩培養箱,上海精宏實驗設備有限公司;HD-1360 超凈工作臺,北京東聯哈爾儀器制造有限公司;AL-204電子天平,梅特勒-托利多儀器有限公司;RDY-SP1Z型核酸電泳儀,北京榮陽靜電科技有限公司

1.1.3 培養基

LB培養基:10 g/L NaCl、5 g/L酵母提取物、10 g/L蛋白胨;種子培養基:10 g/L蛋白胨、5 g/L牛肉膏、10 g/L NaCl;發酵培養基:60 g/L葡萄糖、3 g/L蛋白胨、2 g/L K2HPO4、0.7 g/L MgSO4、0.5 g/L KCl、4 g/L NaNO3,pH 6.5。

1.2 實驗方法

1.2.1 菌株8-III GOD基因的獲取

挑取菌株8-III的單菌落于8 mL種子培養基,于25 ℃下160 r/min振蕩培養48 h,以2%的接種量接種到含有100 mL種子培養基的250 mL搖瓶中,160 r/min,25 ℃搖床中培養48 h。取2 mL的菌液于8 000 r/min離心,去掉上清液,用PBS洗滌2次,再次離心收集菌體。利用基因組大量提取試劑盒(powermax TMSoil DNA isolation kit)提取基因組DNA。所提DNA送到北京百邁克生物科技有限公司進行DNA質量檢測,并使用Illumina Hiseq X10高通量測序平臺進行雙端測序(PE150),得基因組草圖。對測序數據過濾低質量后,利用Velvet軟件[18]進行初步組裝,得到最終基因組框架圖(draft genome)。根據GenBank公布GOD基因序列通過BLAST比對確定目的基因。交由Synbio Technologies公司對8-III菌株的GOD基因進行基因全長合成,并構建于克隆載體pMD-9-T,命名pMD-9-T-GOD。

1.2.2 目的基因的克隆

5′端引物序列P1為:5′-ATGAAGTCCACTATTATCACCTCCA-3′,其3′端引物序列P2為:5′-CTAGGCACTTTTGGCA-TAGTCTTCA-3′,用這對引物以pMD-9-T-GOD為模板進行PCR擴增。反應體系為50 μL:基因組DNA 100 ng,引物各0.2 μmol/L,dNTPs 250 μmol/L,5×Q5高保真DNA聚合酶緩沖液10 μL,Q5高保真DNA聚合酶0.5 μL。PCR反應條件:98 ℃、5 min;98 ℃、 30 s,65 ℃、30 s,72 ℃、60 s,共30個循環;72 ℃、10 min。PCR產物于1%瓊脂糖凝膠上電泳鑒定純度和分子量的大小。PCR產物經DNA回收試劑盒回收。

1.2.3 原核表達載體的構建

將pET-28a(+)用NcoⅠ和XhoⅠ進行雙酶切,與目的基因連接,重組質粒命名為pET-28a(+)-GOD。該表達質粒的構建方式刪除了pET-28a(+)質粒載體上的全部標簽,可用來構建無標簽的基因表達工程菌。將該表達質粒轉化至E.coliBL21(DE3)感受態細胞,陽性的轉化菌命名為E.coliBL21(DE3)/pET-28a(+)-GOD。送至Synbio Technologies公司測序驗證,保存測序正確的菌株。

1.2.4 目的蛋白的誘導表達與純化

將E.coliBL21/pET-28a(+)-GOD接種于10 mL含卡那霉素的LB液體培養基中,160 r/min,25 ℃,過夜培養。取上述菌液按2%接種量接種于100 mL含卡那霉素的LB液體培養基中,160 r/min,25 ℃培養4 h,加入IPTG誘導表達。收集菌體發酵液于10 000 r/min,4 ℃,離心20 min,棄上清。菌體沉淀以pH 7.4的PBS洗滌,重復洗滌3次。洗滌后用10 mL的PBS重懸。將重懸液超聲裂解15 min(開3 s,間隔5 s,功率200 W)。將裂解液以10 000 r/min,4 ℃,離心20 min,上清液為粗酶液。粗蛋白用Ni2+-NTA柱(Novagen)進行親和層析純化,洗脫的蛋白液4 ℃保存,蛋白樣品經變性聚丙烯酰胺凝膠電泳(SDS-PAGE)檢測,同時以空載體和未誘導作對照,記錄并分析結果。

1.2.5 酶活力測定[22]

于96孔板中依次加入5%葡萄糖溶液150 μL,鄰聯茴香胺溶液150 μL,辣根過氧化物酶溶液10 μL,25 ℃反應10 min,加入待測液10 μL。酶標儀波長460 nm,每間隔1 min測定1次,共測定5次。以在25 ℃,pH 6.5的磷酸緩沖溶液的反應條件下,每分鐘將1 μmol的葡萄糖催化氧化為葡萄糖酸和過氧化氫所需要的GOD的量定義為1個GOD的活力單位。根據公式計算酶活[19]。

1.2.6 酶學性質研究

溫度對重組GOD影響:將適當稀釋的酶液分別在15、20、25、30、35、40、45、50、55、60和65 ℃下進行反應,以酶活最高者為100%計算相對酶活,從而確定該酶的最適作用溫度。將適當稀釋的酶液分別放到0、10、20、30、40、50和60 ℃下保溫1 h,每隔30 min取樣,在冰上放置5 min后進行酶活測定。以未進行熱處理的酶液的酶活為100%計算相對酶活,確定重組GOD的熱穩定性。

pH值對重組GOD影響:配制pH值分別為4.0、4.5、5.0、5.5、6.0、6.5、7.0、7.5、8.0、8.5、9.0的PBS緩沖體系,將酶液分別用這些緩沖液稀釋后進行反應,以酶活最高者為100%計算相對酶活,從而確定GOD酶的最適pH值。分別將酶液在pH值為4.0、4.5、5.0、5.5、6.0、6.5、7.0、7.5、8.0、8.5、9.0、9.5和10.0的PBS緩沖液中保溫30 min(溫度為25 ℃),以未經保溫處理的酶活為100%計算殘余酶活力,從而確定GOD酶的pH穩定性。

金屬離子對酶活影響:在GOD酶與其底物進行反應的體系中,加入Na+、K+、Ca2+、Mg2+、Fe2+、Cu2+、Mn2+、Fe3+、Zn2+、Ba2+及乙二胺四乙酸(ethylenediaminetetraacetic acid,EDTA),使其終濃度為0.35 mmol/L,然后按照1.2.5的方法進行酶活測定。以不加金屬離子的反應體系的酶活定義為100%,表示不同金屬離子或化合物下的相對酶活。

1.2.7 雞飼料的應用

將重組GOD純化后與SiO2以4∶1比例復配后,以0.05%加入雞飼料中,喂養A組雛雞;只加入GOD未與SiO2復配的雞飼料喂養B組雛雞;以未加入GOD的雞飼料喂養C組雛雞。每組12只,喂養14 d,記錄平均每日增重、平均每日攝取量、飼料利用率和腹瀉率。

1.2.8 幼犬飼料保鮮

將重組GOD純化后與SiO2以4∶1比例復配后,以0.05%加入幼犬飼料中,為實驗組A;以陸生霉菌GOD與SiO2以4∶1比例復配后,以0.05%加入幼犬飼料中,為實驗組B;以未加入GOD的幼犬飼料為實驗組C。每組50份0.5 kg飼料,4 ℃儲藏14 d,記錄飼料霉變情況。

2 結果與分析

2.1 目的基因PCR擴增

以pMD-9-T-GOD為模板PCR擴增GOD基因,見圖1。

M-DNA Marker;1~4-PCR擴增產物圖1 目的基因克隆PCR電泳檢測結果Fig.1 PCR assay of the targetgene

目的基因條帶單一、濃度較高。經測序其全長為1 292 bp,提交至Genbank所獲序列登錄號是MK054202,與Genbank中其他GOD基因序列的相似度在92%~98%,預期能夠編碼含有428個氨基酸殘基的蛋白質。對序列進行分析,發現序列中不含有內含子和基因原有的信號肽序列,不含有SacⅠ、NotⅠ和SnabⅠ酶切位點,含有NcoⅠ和XhoⅠ酶切位點,符合之前的預測。

2.2 重組表達載體的構建

分別用NcoⅠ和XhoⅠ對pET-28a-GOD做分步酶切,預期得到大小分別為5.4 kb的載體片段和1.3 kb的目的基因片段。通過1%瓊脂糖凝膠電泳對雙酶切產物進行檢驗,結果見圖2。泳道1為重組質粒的酶切鑒定結果,大小與預期結果一致,將鑒定正確的質粒進行測序,最終確定重組表達質粒pET28a-GOD。

M-DNA Marker;1-酶切處理的質粒;2-質粒DNA圖2 重組質粒pET-28a-GOD的酶切鑒定Fig.2 Restriction pattern of recombinant pET-28a-GOD

2.3 誘導表達與純化

將經鑒定正確的原核重組表達質粒載體pET28a-GOD轉化至表達宿主菌E.coliBL21(DE3)中誘導表達。通過SDS-PAGE分析目標蛋白表達情況。加入IPTG后成功誘導外源蛋白的表達。以沒有裝載GOD的E.coliBL21/pET28a菌體作為對照,在E.coliBL21/pET28a-GOD菌體裂解液全菌、上清液和沉淀的約46 kDa位置出現一條蛋白帶(圖3),該蛋白帶分子質量與重組GOD的理論分子質量(46 kDa)相一致,由此推測該蛋白帶為誘導表達的GOD。此外,由圖(圖3泳道2)可見菌體裂解后的可溶部分也檢測到GOD蛋白條帶,說明克隆菌株不僅能有效表達GOD,而且重組GOD為可溶性表達。

2.4 NI+-NTA柱親和純化

通過Ni+-NTA親和層析柱進行GOD純化,SDS-PAGE檢測洗脫收集液,如圖4所示。目標蛋白被150 mmol/L和200 mmol/L咪唑溶液洗脫下來,大小在46 kDa左右,且洗脫液中雜蛋白較少。

M-標準蛋白;1-E. coli BL21/pET28a-GOD菌體裂解液沉淀;2-E. coli BL21/pET28a-GOD菌體裂解液上清液;3-E. coli BL21/pET28a-GOD菌體裂解液全液;4-E. coli BL21/pET28a(+)菌體裂解液上清液圖3 目的蛋白GOD的SDS-PAGE檢測結果Fig.3 SDS-PAGE analysis of GOD protein

M-蛋白質分子量標準;1-150 mmol/L咪唑溶液洗脫目標蛋白;2-200 mmol/L咪唑溶液洗脫目標蛋白圖4 純化后E. coli BL21/pET28a-GOD的SDS-PAGEFig.4 SDS-PAGE of E. coli BL21/pET28a-GOD after purification

2.5 酶學性質分析

2.5.1 酶最適作用溫度

將重組GOD在10~60 ℃處理5 min,結果如圖5-a所示。酶的最適反應溫度為25 ℃,20~35 ℃相對酶活可以保持在80%以上,40 ℃后相對酶活快速降低。此外該酶在0 ℃時可保持50%相對酶活,符合海洋細菌低溫酶特性,在較短的時間產生大量GOD。如圖5-b所示,10~35 ℃時,相對酶活可保持80%以上,表明在該溫度范圍內酶的溫度穩定性良好,其中25 ℃酶活最穩定,相對酶活保持在90%以上,40 ℃后穩定性迅速下降。該酶在0 ℃時可保持60%以上酶活力且穩定性快速提升,10 ℃后可達到60%以上酶活力,說明該酶具有低溫酶特性,且溫度穩定性良好。

a-酶最適作用溫度;b-酶的溫度穩定性圖5 溫度對酶活影響Fig.5 Effect of temperature on enzyme activity

2.5.2 酶最適作用pH

如圖6-a所示,重組GOD的最適pH值為6.0,在pH值為5.5~6.5時,保持85%以上的相對酶活,表明該酶屬于偏酸性GOD。如圖6-b所示,該酶在pH 6.5時穩定性最好,在pH 6.0~7.0時相對酶活可保持80%以上,pH 7.5以后穩定性快速降低。推測GOD中可能存在酸性基團,堿性條件下不能穩定存在。在pH 7.5以上會產生結構變化,影響酶活。

a-最適pH值; b-pH穩定性圖6 pH對酶活影響Fig.6 Effect of pH on enzyme activity

2.5.3 金屬離子及螯合劑對酶活的影響

由圖7可知,K+、Ni2+對重組GOD的活性有明顯促進作用;Na+、Zn2+、Fe3+、Cu2+、Ag+、Ca2+、Fe2+、Mg2+和EDTA對GOD活性有抑制作用,其中Cu2+、Ag+、Ca2+、Fe2+和Mg2+嚴重抑制重組GOD酶活性。推測這可能是由于這些離子與酶中心的功能基團結合,進而引起酶失活。

圖7 金屬離子及螯合劑對酶活力的影響Fig.7 Effects of metalions and chelating agents on enzyme activity

2.6 雞飼料中應用

將重組GOD添加到雞飼料中,飼養結果如表1所示。A組雛雞的平均日增和飼料利用率重要大大高于B、C兩組,其中B組又比C組要高。腹瀉率C組最高,A組最低。結果表明,重組GOD可以通過改善腸道菌群提升對飼料的有效吸收,從而提升雞體重。此外,重組GOD需要與相應載體聯合使用,單獨使用重組GOD效果并不理想。

表1 重組GOD在雞飼料中應用Table 1 Application of recombinant GOD in chicken feed

2.7 幼犬飼料中應用

重組GOD添加到幼犬飼料中,結果如圖8所示。A組的霉變情況最好,C組最差,B組稍好于C組。說明重組GOD確實具備防腐的作用,并且在低溫環境也能有很好的作用,這是陸地來源GOD所不具備的。

圖8 幼犬飼料霉變情況Fig.8 Mildew of puppy feed

3 結論

GOD是一種重要的應用酶,國內外學者在其外源表達方面已進行大量研究[22-26]。葡萄糖氧化酶最適作用溫度為40~45 ℃,在35~50 ℃酶活穩定,屬于中高溫酶。本文首次嘗試將海洋細菌GOD基因在大腸桿菌中表達,并將酶活提升2.72倍。重組GOD分子質量為46 kDa,在25 ℃,pH 6.5的環境下酶活最高,10~20 ℃酶活保持穩定。結果表明,重組GOD具備低溫酶特性,可以填補傳統陸地來源GOD在飼料保鮮等方面的不足。此外大腸桿菌可用于細菌GOD外源表達。同時,克隆菌株自身具有培養條件簡單經濟、生長繁殖快速、蛋白表達水平高等優勢、遺傳背景清晰、基因改造工具多樣等特點[15],與工業生產相契合。

將重組GOD添加到動物飼料中,可起到防腐作用,并提升飼料利用率。重組GOD通過殺滅或抑制病原微生物的生長繁殖維持動物腸道菌群平衡,自身及代謝產物對動物和環境均無毒副作用,且不易誘發耐藥菌產生,也不易誘發交叉耐藥菌的產生,具備加工為飼料添加劑的潛力。此外,已報到的GOD飼料添加劑絕大多數自身不具備防腐功效[27-28],重組GOD的低溫酶特性,可填補傳統GOD在低溫領域的空白。在食品保鮮與以低溫檢測方面有良好的應用前景。

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