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FGA基因c.104G>A雜合突變導(dǎo)致的先天性低纖維蛋白原血癥家系的基因分析

2019-04-12 01:36:42蘇正仙畢曉潔金先富張慧斐姜俊宇沈波
浙江醫(yī)學(xué) 2019年6期
關(guān)鍵詞:檢測

蘇正仙 畢曉潔 金先富 張慧斐 姜俊宇 沈波

纖維蛋白原(FIB)是參與機(jī)體止血的關(guān)鍵物質(zhì),具有多種功能,包括纖維蛋白凝塊的形成、與凝血酶的結(jié)合、介導(dǎo)血小板聚集反應(yīng)等[1]。它存在于血漿中,由肝細(xì)胞分泌,分子質(zhì)量為340kD,是通過29個鏈間和鏈內(nèi)二硫鍵連接的兩組三個多肽(Aα、Bβ和γ)組成的完全六聚體[2]。六條鏈排列形成三叉結(jié)構(gòu),通過由包含兩個單獨(dú)三螺旋卷曲螺旋區(qū)域的2個遠(yuǎn)端球形D結(jié)構(gòu)域以及一個中心E區(qū)域組成。每條鏈的N末端有助于構(gòu)成中心E區(qū)域,而Bβ和γ鏈的C末端和卷曲螺旋區(qū)域的一部分形成2個遠(yuǎn)端球形D結(jié)構(gòu)域[3]。形成FIB的3條多肽鏈(Aα、Bβ 和 γ)分別含有 610、461以及 411個氨基酸殘基,每條多肽則分別由相對應(yīng)的不同基因參與編碼翻譯產(chǎn)生[4]。FIB基因缺陷可影響其FIB的表達(dá),或明顯影響其表達(dá)產(chǎn)物與血小板糖蛋白、血漿凝血酶之間的結(jié)合位點(diǎn),更有可能影響到FIB單體的聚合及其蛋白的穩(wěn)定性,由此最終導(dǎo)致機(jī)體表現(xiàn)出與出血、凝血相關(guān)的一系列少見的病癥[5-6]。筆者回顧1例遺傳性低纖維蛋白原血癥患者家系的臨床資料,并通過基因測序來對其家系的發(fā)病機(jī)制進(jìn)行初步研究。

1 資料和方法

1.1 一般資料 本例患者來自浙江臺州地區(qū)的先天性低纖維蛋白原血癥家系。先證者,男,49歲,患痔瘡、反復(fù)滲血前來本院就醫(yī),發(fā)病原因不明。2016年5月患者行凝血功能檢查,結(jié)果FIB為0.68g/L,血常規(guī)顯示為缺鐵性低色素性貧血,且在1個月后凝血功能復(fù)查時FIB值仍處于嚴(yán)重低值,結(jié)合D-二聚體與FIB降解產(chǎn)物(FDP)結(jié)果,排除了原發(fā)及繼發(fā)性纖溶亢進(jìn)后,結(jié)合家系咨詢,初步診斷為先天性低纖維蛋白原血癥。未發(fā)現(xiàn)該患者有腎臟疾病、肝炎肝硬化的發(fā)病歷史;此外其家族內(nèi)部也從未有患腫瘤的病史等。為求進(jìn)一步確診,筆者對該家系進(jìn)行了基因測序。其家系圖譜見圖1。

圖1 先證者家系圖譜

1.2 方法

1.2.1 引物 根據(jù)FIB的基因序列設(shè)計29對引物[7],包含F(xiàn)GA、FGB以及FGG基因的所有外顯子及其側(cè)翼序列和啟動子區(qū),并送上海華大基因公司進(jìn)行合成。

1.2.2 標(biāo)本收集 采血前與其家系成員簽署相關(guān)的知情同意書。采集家系各成員外周靜脈血樣本兩份,一份按照1∶9的比例以0.109mmol/L的枸櫞酸鈉抗凝,行凝血相關(guān)數(shù)據(jù)的檢測;另一份常規(guī)血清分離,用于DNA的抽提,血樣本放置于-80℃的冰箱中冰凍保存。

1.2.3 凝血功能檢測與基因測序 將枸櫞酸鈉抗凝的血樣以3 000r/min離心10min,上層血漿運(yùn)于檢測APTT、PT、FIB、TT、D-二聚體、FDP(法國 STA-R 全自動血凝分析儀以及其配套試劑),F(xiàn)IB抗原含量采用免疫比濁法測定(雅培c16000全自動生化分析儀及其配套試劑)。另將分離出的血清用于肝腎功能檢測(雅培c16000全自動生化分析儀以及其配套試劑)。用采集的全血標(biāo)本進(jìn)行DNA抽提,經(jīng)PCR擴(kuò)增后外送上海華大基因檢測公司進(jìn)行測序,測序結(jié)果與NCBI GenBank中FIB所對應(yīng)的基因測序數(shù)據(jù)做最終地比較分析,并用反向測序予以驗證突變位點(diǎn)。

1.2.4 生物信息學(xué)工具 采用Polyphen-2(蛋白質(zhì)ID:P02671)、MutationTaster(蛋白質(zhì)轉(zhuǎn)錄本 ID:ENST00000 302053)兩種在線軟件分析FGA基因第2外顯子c.104G>A的錯義突變對FGA蛋白結(jié)構(gòu)和功能的影響。

2 結(jié)果

2.1 肝功能、凝血項目檢測結(jié)果 先證者家系成員的肝功能項目檢查結(jié)果均顯示處于正常范圍,排除肝臟功能合成障礙引起的FIB缺陷。見表1。

表1 家系成員的檢測結(jié)果

2.2 基因檢測結(jié)果 基因測序結(jié)果見圖2,先證者FIBFGA基因第2外顯子發(fā)生c.104G>A的堿基雜合點(diǎn)突變(密碼子CGT→CAT),導(dǎo)致Arg16His的雜合突變(16號精氨酸突變?yōu)榻M氨酸)。先證者的父親在該位點(diǎn)的測序結(jié)果與先證者一致,除此以外所有其它的基因測序結(jié)果都顯示為正常。

圖2 先證者FGA基因第2外顯子測序圖

2.3 生物信息學(xué)結(jié)果 兩種在線軟件預(yù)測結(jié)果一致,Pyolphen積分為1,預(yù)測結(jié)果為“PROBABLY DAMAGING”,MutationTaster積分為 0.9999,預(yù)測為“disease causing”。

3 討論

FIB是機(jī)體中含量最高的凝血因子,其在血漿中的正常濃度范圍為2.0~4.0g/L[8]。當(dāng)外界創(chuàng)傷等引起血管出血時,F(xiàn)IB就會在血漿一系列凝血因子及相關(guān)酶類的催化作用中轉(zhuǎn)變成為纖維蛋白,大量纖維蛋白縱橫交叉呈網(wǎng)狀,結(jié)合血小板形成微血栓達(dá)到止血的目的[9],不同原因?qū)е碌腇IB含量或者活性降低都有可能會導(dǎo)致機(jī)體出凝血功能上的一系列障礙,引起出血難止亦或者纖溶激活障礙導(dǎo)致血栓栓塞,最終可能危及生命。

20世紀(jì)終末期,Terasawa等[10]首次發(fā)現(xiàn)低纖維蛋白原血癥存在的具體基因缺陷-雜合的γCysl53Arg,之后陸續(xù)有文章報道新發(fā)現(xiàn)的突變位點(diǎn),截止2017年1月人類基因突變數(shù)據(jù)庫已發(fā)現(xiàn)近300個突變位點(diǎn),而FGA基因上就存在100多個突變位點(diǎn),包括錯義/無義突變、剪切位點(diǎn)突變、小片段缺失等。

遺傳性低纖維蛋白原血癥臨床表現(xiàn)具有較大的異質(zhì)性[11],嚴(yán)重程度與FIB的突變位點(diǎn)及類型相關(guān),同一突變也有可能有不同臨床表現(xiàn)。Stucki等[12]研究顯示Arg16His突變者無出血癥狀。而本文研究家系,先證者表現(xiàn)為痔瘡、反復(fù)滲血,F(xiàn)IB為0.68g/L,明顯低于正常水平,基因測序結(jié)果顯示FGA基因2號外顯子上存在c.104G>A的錯義突變(密碼子CGT→CAT),即Arg16His的雜合突變。這一突變不僅可以導(dǎo)致FIB被凝血酶酶解時FPA釋放速度的減慢[13],更嚴(yán)重的可能是此突變還可引起FIB被酶解過程中產(chǎn)生FPA總量的異常,凝血過程中交聯(lián)纖維蛋白產(chǎn)生量因此減少,導(dǎo)致FIB在機(jī)體血漿中的“量”和活性先天性下降的現(xiàn)象,本文推測導(dǎo)致該突變是導(dǎo)致該家系先證者反復(fù)滲血的主要原因。

綜上所述,本研究明確了FGAArg16His的突變是導(dǎo)致本研究家系遺傳性低纖維蛋白原血癥發(fā)生的分子機(jī)制。但是這其中所蘊(yùn)含的具體機(jī)制則還需要進(jìn)行深入的研究探索,對造成先天性低纖維蛋白原血癥的分子機(jī)制也同樣需要進(jìn)一步地被闡明。目前,國內(nèi)在先天性低纖維蛋白原血癥的相關(guān)研究取得了很大的進(jìn)展,隨著檢測技術(shù)的逐漸進(jìn)步完善,可以通過分析纖維蛋白溶解曲線、FIB凝固率檢測等方法[14]較準(zhǔn)確地評估FIB功能,以此分析突變與疾病之間的關(guān)系[15]。目前該類疾病的治療仍以替代治療為主,基因治療是未來的發(fā)展趨勢[16]。

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