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茶園土壤中優勢菌株毛霉菌的分離、純化及鑒定

2019-03-14 06:03:06周小露劉麗明宋加艷宋麗莎田茂燕王利榮周才碧
山西農業科學 2019年2期
關鍵詞:優勢

周小露,劉麗明,宋加艷,宋麗莎,田茂燕,王利榮,周才碧

(1.湖南農業大學園藝園林學院,湖南長沙 410000;2.黔南民族師范學院生物科學與農學院,貴州都勻 558000;3.黔南州廣播電視大學物理系,貴州都勻 558000)

貴州是我國唯一兼具低緯度、高海拔、寡日照、多云霧、無污染、全境高原的茶區,截至2017年底,全省茶園面積為47.84萬hm2,其中,黔南州的種植面積為10.73萬hm2,占貴州省茶園總面積的21%,是重要茶區之一。黔南州《關于進一步加快推進茶產業發展的意見》中提出了有機茶的發展方向,其關鍵是增加茶樹專用有機肥的使用。

目前,使用化肥已造成貴州部分地區茶園土壤酸化以及茶樹植株矮小、產量降低等問題[1-2]。農作物秸稈內含有大量的有機物,不僅可以增加土壤的有機含量、補充大量元素,而且是最常見的能作為生物有機肥的原料之一。生物有機肥制作使用的是天然原料,比如秸稈、微生物、腐殖質等,通過有效菌種發酵產生的多種可溶性生理活性物質,如有機酸、維生素等,能被植物迅速吸收,從而達到改善土壤質量的目的。施用有機肥[3-7]可降低土壤的酸化程度,有利于加快土壤中氮、磷等元素循環[8-11],有助于緩解土壤酸化趨勢[12-14],減少Cd等[15]重金屬的累積;促進茶樹提早萌發[16],茶葉長勢良好,芽葉密度大,百芽質量明顯增加,還可增加茶鮮葉中的茶多酚、咖啡堿、水浸出物、可溶性糖的含量,明顯降低茶葉氟含量。

土壤是植物吸收養分的主要來源之一,通過施肥能改良茶樹因缺少大量元素帶來的葉片發黃等問題。茶樹專用有機肥既可作基肥又可作追肥,速效與緩效養分協調、肥料利用率高,可減輕土壤中硝酸鹽積累以及磷鉀肥造成的重金屬污染。因此,茶園專用有機肥的研制具有非常重要的意義。

本試驗以黔南州茶園優質土壤為材料,分離、純化得到優勢菌株,利用形態學和分子生物學方法鑒定,旨在明確優勢菌株的種屬關系,為茶園專用有機肥的開發提供參考。

1 材料和方法

1.1 試驗材料

供試材料為土樣,采集于貴州省黔南州都勻市三江堰茶園。

1.2 試劑與儀器

蔗糖、七水合硫酸鎂、七水合硫酸亞鐵、磷酸二氫鉀(壽光市艾益農生物科技有限公司),硝酸鈉(北京化工廠),氯化鉀(天津市福晨化學試劑廠),均為分析純;瓊脂粉(壽光市艾益農生物科技有限公司)。

試驗儀器為電子顯微鏡(XSP-8C,德卡精密量儀有限公司);電子天平(LTI000B,常熟市天量儀器有限責任公司);恒溫培養箱(BIC-250,德卡精密量儀有限公司);超凈工作臺(SW-CJ1FDA,德卡精密量儀有限公司);高壓蒸汽滅菌鍋(GI54DS,致微儀器有限公司);冰箱(BCD-251WBSV,常熟市天量儀器有限責任公司)等。

1.3 試驗方法

1.3.1 培養基配制 參考周才碧等[17]的方法,按試驗要求進行適當修改。PDA培養基:葡萄糖20 g,馬鈴薯200 g,蒸餾水1 000 mL,瓊脂粉20 g。WA培養基:瓊脂粉13 g,蒸餾水1 000 mL。

1.3.2 菌株分離培養 稱取20 g茶園土樣放入三角瓶,加入80 mL無菌水,搖勻制備成菌種懸液,并將其稀釋成不同濃度菌種溶液,備用。再用接種環蘸取不同稀釋濃度的菌種懸浮液1~2滴,采用涂布法接種于PDA培養基上,每個稀釋濃度做6個重復;將PDA培養基放入28℃恒溫培養箱中,培養6~7 d,有菌落形成時,即對菌株進行純化處理。

1.3.3 菌株純化培養 待培養基上的菌落培養6 d、可以明顯觀察到菌落時,挑選生長旺盛菌落,用平板劃線法接種到PDA培養基上;并將培養基放入培養箱繼續培養,待菌落長出較多時,繼續劃線純化,直到純化出單一菌落。

1.3.4 菌株形態特征觀察 利用電子顯微鏡對菌種菌落的孢子囊、分生孢子、厚垣孢子及生長速率等形態特征進行觀察記錄,以對該菌種菌落的類型進行初步判斷。

1.3.5 菌株生長速率測定 在無菌環境下,把優勢菌株打成直徑為5 mm的菌餅,再轉移至25℃培養箱中,培養7 d,量取菌落直徑并再次記錄其特征。

1.3.6 菌株分子生物學鑒定

1.3.6.1 DNA的提取 挑取約1 mg優勢種菌絲,研磨,依次加入 500 μL 裂解液,150 μL KAC,50 μL異丙醇,反復離心15 min;收取上清液,加等體積70%的乙醇,離心10 min;等待水分散失,加0.1×TE 30 μL,收集上清液得優勢種菌絲DNA。用1.0%瓊脂糖凝膠電泳檢測DNA的完整性,紫外分光光度法檢測DNA的濃度,再稀釋至30~50 ng/μL,備用。

1.3.6.2 PCR擴增 用于引物篩選的PCR擴增反應的總體積為 25 μL:1 μL DNA 模板,10×buffer的緩沖液體 2.5 μL,dNTPs2 μL,正反向引物各 1 μL,ExTaq DNA聚合酶 0.1 μL,ddH2O17.4 μL。PCR 擴增反應程序:94℃預變性5 min;94℃變性30 s,50~60℃退火30 s,72℃延伸1 min,循環32次;最后72℃延伸5min;12℃保存備用。以通用引物ITS4(5′-TCCT CCGC TTAT TGAT ATGC-3′,蘇州金唯智生物技術有限公司合成)進行PCR擴增,4℃冰箱保存PCR擴增產物。擴增產物經1.2%瓊脂糖凝膠電泳分離檢測,將PCR擴增產物送到測序公司進行測序。

1.4 數據統計

所得序列提交到National Center for Biotechnology Information(NCBI)核酸數據庫,通過 BLAST 程序,將28SrDNA序列與GeneBank中的核酸序列進行對照,并從數據庫中獲得相關序列。采用MEGA 6.0軟件進行多序列比對,并利用Neighbor-Joining方法構建進化樹,確定菌株類別。

2 結果與分析

2.1 目標菌株的分離、純化

以茶園優質土壤為材料,利用稀釋涂布分離得到5種菌;進一步利用平板劃線純化該菌株,最終得到優勢菌株S1(圖1),該菌株在25℃,PDA培養基中生長旺盛,生長周期較長。

2.2 目標菌株的鑒定

2.2.1 形態鑒定 利用傳統形態學鑒定的方法,對2.1分離、純化得到的菌株S1進行觀察。利用電子顯微鏡觀察,優勢菌S1特征鮮明,易識別,菌落大、質地疏松、不透明、白色絨毛、菌絲無隔、多核、分枝狀,孢子呈橢圓形,在培養基內廣泛蔓延。根據菌株S1的菌落和孢子形態等特征,初步推斷該菌屬為毛霉菌(圖 2)。

2.2.2 分子鑒定 提取菌株S1的DNA,進行凝膠電泳及PCR擴增,得到1條515bp的清晰條帶(圖3);將此PCR產物測序后提交到 GenBank中,經BLAST比對后發現,優勢菌S1的rDNA-ITS序列與Rhizomucor(KX343955.1)的序列相似度高達 99%。依據比對結果構建系統進化樹(圖4),結果表明,該菌應歸為Rhizomucor,結合形態學與分子生物學鑒定,確定從茶園土壤中分離純化出的菌為毛霉菌。

毛霉菌(Mucor)的具體分類地位如下:

——真菌界Mycota

——接合菌亞門Zygomycoina

——接合菌綱Zygomycetes

——毛霉目Mucorales

——毛霉屬Rhizomucor

——毛霉菌Mucor

3 結論與討論

以黔南州茶園優質土壤為材料,進行稀釋,并將樣品懸液涂布于培養皿培養得到多種菌種,又對菌種進行分離,再挑取菌種純化得到優勢菌株。

為了明確優勢菌株的種屬關系[18],本研究對于優勢菌株的鑒定首先采用傳統的生物形態學鑒定法,利用電子顯微鏡進行觀察,初步確定該優勢菌株為毛霉屬;其次,對于優勢菌株采用ITS序列(分子)鑒定法,確定其為毛霉菌。

毛霉菌可有效地轉化腺嘌呤[19]、產生脂肪酶[20]和不對稱還原4-甲基苯乙酮[21],在工農業上有著極高的利用價值,且分解能力較強,是有機肥目標菌株之一。

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