PubMed數據庫中參考文獻題名引用和著錄存在問題及分析

齊 燁，鄭雨田，李 娜，蘆 洋

(天津市第三中心醫院生物醫學工程與臨床編輯部 天津300170)

參考文獻是一篇完整的科技論文不可缺少的組成部分，是作者在學術研究中，對某一著作或論文整體的參考或借鑒，是對前人學術研究尊重的表現，同時也可為讀者提供進一步查詢資料或信息的線索。PubMed 數據庫是目前國際公認的檢索生物醫學和生命科學領域文獻的權威性數據庫，旨在提供科研領域信息[1]。為確保編校質量，在編輯工作中，應十分關注稿件中參考文獻的把關與核查。因此，利用PubMed 數據庫中信息查對稿件參考文獻，是編輯工作的一項重要內容。但筆者在編輯工作中發現，PubMed 數據庫在收錄文獻基本信息時，部分存在著錄的文章題名與實際內容不一致的情況，原因可能是對一些特定詞語使用替代性處理[2]，這需要編輯查對原始文獻并予以修改。現針對筆者利用PubMed 數據庫查對參考文獻時，在題名方面容易出現的不一致問題及其表現進行介紹和歸納，有助于減少錯誤著錄的發生。

1 正斜體的核定

科技期刊中外文字母的應用較普遍，一些名詞術語、符號的正、斜體常具有特定意義，這使得規范書寫顯得十分重要。然而PubMed 數據庫中的文獻題名多采用正體，導致參考文獻存在著錄不一致情況。編輯在查對時應特別留意，有針對性地查詢原始文獻并予以修改。

1.1 拉丁文名

一些拉丁詞如 via(通過)、vs(相對)、in vitro/ ex vivo(體外)、in vivo(在體)、in situ(原處)，以及衍生詞 In silico(于電腦中)需要用斜體表示。例如，某投稿文章引用一篇涉及羥基磷灰石生物活性體外評價的參考文獻，該文獻標題中的 in vitro 在作者原稿和PubMed 數據庫[3]中均采用正體表達，而發表在Biomaterials 雜志中的原始文獻[4]則以規范的斜體形式呈現。

1.2 生物物種的學名

目前，生物學名通常采用“雙命名法”規則，其主要結構為：屬名+種名+命名人。其中，屬名應斜體書寫，且首字母大寫；種名采用斜體書寫，全部為小寫；命名人姓名需正體書寫[5]。

在細胞分化和器官發育的研究中，題名常出現動植物學名。例如，一篇關于秀麗隱桿線蟲(Caenorhabditis elegans)轉化的RNAi 載體構建方法的參考文獻，該文獻標題中的Caenorhabditis elegans在作者原稿和 PubMed 數據庫[6]中均采用正體表達，而發表在 Nature 雜志中的原始文獻[7]則以規范的斜體形式呈現。在免疫學文獻題名中，經常出現微生物的學名。例如，一篇關于耐藥金黃色葡萄球菌(Enterococcus faecium)感染的參考文獻，該文獻標題中的Enterococcus faecium 在作者原稿和PubMed 數據庫 [8] 中均采用正體表達，而發表在Pharmacotherapy 雜志中的原始文獻[9]則以規范的斜體形式呈現。

1.3 限制性內切酶

基于內切酶來源的微生物學名命名規則，內切酶前3 個字母采用斜體(第1 個為內切酶來源的微生物屬名首字母需大寫，其后 2 個為微生物種名需小寫)，后面的字母(通常為該變種或品系名稱)和編碼(同一種微生物多種內切酶時便于分離)正體平排，如：BamHⅠ、HindⅢ、Sau3AⅠ等[10]。

1.4 基因和蛋白質

根據遺傳學趨勢(trends in genetics，TIC)遺傳命名指南規定[11]，不同物種有不同的命名規則，但一般來說，基因名稱應寫成斜體，蛋白質名稱與對應的基因/等位基因的名稱相同，則采用正體。大小寫常用于區分不同物種：一般地，對于小鼠、大鼠，基因名稱首字大寫，其余小寫；對于人類、非人類靈長類動物/家畜，基因名稱均使用大寫字母；對于細菌、斑馬魚基因符號用 3 個小寫字母表示；對于果蠅、豌豆，基因符號小寫表示隱性突變基因，首字母大寫表示顯性突變基因。筆者曾編輯一篇關于基因突變的參考文獻，該文獻標題中的人 BTK 基因在作者原稿和 PubMed數據庫[12]中均采用正體表達，而發表在 Gene 雜志中的原始文獻[13]則以規范的斜體形式呈現。

1.5 化學符號

化學中表示旋光性、分子構型、取代基位置和異構體等符號應用斜體排版，并在其后加半字線，置于化合物名稱前。例如，物質旋光性采用左旋 l-、右旋d-表示，官能團在有機化合物位置可以通過臨位 o-、對位 p-表示，其他還包括反式 trans-、順式 cis-。另外，在化合物表示中，共聚物連接用-co-來書寫。例如，一篇關于化合物消旋體的參考文獻，該文獻標題中的 poly(D，L-lactic-co-glycolic acid)在作者原稿和PubMed 數據庫[14]中均采用正體表達，而發表在Tissue Engineering Part A 雜志中的原始文獻[15]則以規范的斜體形式發表。

1.6 醫學統計學符號

統計學符號采用斜體書寫，如t 檢驗、F 檢驗，概率 P，標準差 s 及相關系數 r 等。筆者在編輯加工過程中，曾查對過一篇關于線性回歸模型顯著性檢驗方面的參考文獻，該文獻標題中的F-test 在作者原稿和PubMed 數據庫[16]中均采用正體表達，而發表在Statistics in Medicine 雜志中的原始文獻[17]則是以正確的斜體形式呈現。

1.7 變量符號

在生物醫學科技論文題名中，以斜體形式呈現的情況還包括表示物理量的符號、特征數符號(雷諾數Re、傅里葉數 Fo、格拉曉夫數 Gr、普朗特數 Pr)、數學符號表示變量(變量、坐標系符號、視為常數的參數、函數、矢量和矩陣符號等)的書寫[18]，這些雖暫未出現在筆者查對的參考文獻中，但在編校時也應予以注意，以免出現錯誤使用。

2 上下角標的核定

正確使用上下角標符號對讀者快速、準確理解書稿內容起到畫龍點睛的作用。筆者通過分析上下角標的編輯規范，在期刊中正確標注，對普及國家標準起到推動作用。

2.1 化學式

化和物分子式中表示某種元素原子個數，應標注在相應元素之后并以下角標形式表示，如：乙醇C2H6O。編輯曾收到一篇涉及鎂合金材料的參考文獻，該文獻題名中碳酸鎂(MgCO3)在作者原稿和PubMed 數據庫[19]中均以錯誤形式 MgCO3 出現，而發表在Journal of Biomedical Materials Rresearch 雜志中的原始文獻[20]原子個數則以正確的下角標形式呈現。

2.2 化合物名稱

在一些化合物中會使用不同阿拉伯數字區分同一家族間不同成員，例如維生素 B 族有 12 種以上，主要有維生素(vitamin)B1、維生素 B2、維生素 B6等。該化合物中數字的表示應標注在字母之后并以下角標形式出現。

2.3 物質陰陽性

在一些名詞術語中，加號(+)代表是該細胞含有某種物質分子表達，是陽性；減號(-)就是沒有檢測到某種物質，是陰性。無論該物質為陽性還是陰性，加號、減號均位于該物質后，且以右上角標形式呈現，例如干細胞Lgr5+ve。某作者文章引用一篇涉及表面陽性表達 CD4，CD25 T 細胞的參考文獻，該文獻標題中的 CD4+CD25+FOXP3+Treg 在作者文章原稿和 PubMed 數據庫 [21] 中均以錯誤形式CD4+CD25+FOXP3+Treg 出現，而發表在 Cellular Physiologu and Biochemistry 雜志中的原始文獻[22]陽性加號則以規范的上角標形式呈現。

2.4 離子符號

在元素符號右上角表示出離子所帶正、負電荷數的符號。其中正電荷為+號，負電荷用-號表示。原子量用阿拉伯數字表示，以右下角標形式呈現，放在該元素符號后，如：SO42-，NH4+。例如，某作者文章引用一篇涉及鋁離子對大鼠骨形態影響的參考文獻，該文獻標題中的 Al3+在作者文章原稿中和 PubMed 數據庫[23]中均以錯誤形式 Al3+出現，而發表在 ASAIO Transactions 雜志中的原始文獻[24]離子所帶正電荷符號則以規范的上角標形式呈現。

2.5 同位素符號

原子量用阿拉伯數字表示放在該元素前，以上角標形式呈現，在核素中最常見，如碘的一種放射性同位素131I，放射性核素18F。還有一種形式多為存在于同位素標記的化合物，如氫質子波譜1H-MRS。某作者文章引用一篇涉及不穩定同位素锝(99mTc)在異位甲狀旁腺腫瘤定位診斷的參考文獻，該文獻標題中的99mTc 在作者文章原稿和 PubMed 數據庫[25]中均以錯誤形式出現，而刊載在European Journal of Nuclear Medicine and Molecular Imaging 原始文獻[26]上則以規范的上角標形式呈現。

2.6 受體亞型

一種受體應該根據其內源性激動劑來命名，可以用該受體激動劑的縮寫，如果有確鑿證據可以把一些受體進一步分類時，可以用數字、字母下標的形式表示受體的不同亞型。某作者文章引用一篇涉及血管加壓素受體拮抗劑的參考文獻，該文獻標題中的V1a/V2在作者文章原稿和 PubMed 數據庫[27]中均以錯誤形式V1a/V2 出現，而刊載在 Neurocritical Care原始文獻[28]上則以規范的下角標形式呈現。

2.7 影像技術

在醫學影像稿件中，經常遇到名詞術語使用不規范情況，特別是MRI 掃描序列的表示，阿拉伯數字應以下角標形式書寫，如：T1WI。筆者曾編輯一篇涉及MRI 技術評價心肌功能的參考文獻，該文獻標題中的T1-mapping 在作者文章原稿和PubMed 數據庫[29]中均以錯誤形式 T1-mapping 出現，而刊載在 Eur Heart Journal Cardiovascular Imaging 原始文獻[30]上則以規范的下角標形式呈現。

3 特殊符號的核定

3.1 字母的混用

生物醫學工程稿件中細胞因子、基因名稱等常出現希臘字母，根據其生物學性質不同，腫瘤壞死因子(tumor necrosis factor，TNF)包括 TNF-α、TNF-β，干擾素(interferon，IFN)可分為 IFN-α、IFN-β 及 IFN-γ，淋巴毒素(lymphotoxin，LT)可分為 LT-α、LT-β。例如，某作者文章引用一篇涉及Toller 樣受體介導信號傳導通路的參考文獻，在該表題中的希臘字母κ 在作者文章原稿和 PubMed 數據庫[31]中均以錯誤形式NF-kappaB 出現，而發表在 Nature Immunology 原始文獻[32]上則以正確形式 NF-κB 呈現。

3.2 符號的遺漏

國外產品在中國國內正式注冊后，會用?表示已經注冊過商標的意思。R 是英文 register(注冊)的第一個字母。生物工程類稿件中，偶爾會遇到注冊商標丟失的情況。例如，一篇關于引用使用肝素涂層透析濾器的參考文獻，該文獻標題中的肝素涂層濾器Genius 在作者原稿和 PubMed 數據庫[33]中均未標明注冊符號，而發表在Nephrol Dial Transplant 雜志中的原始文獻[34]則以規范的產品名稱+注冊符號的上角標形式呈現。

4 結 語

PubMed 數據庫是生物醫學科技工作者獲取科研信息的重要途徑，為相關研究工作的開展提供特定的文獻資料。由于數據庫應用系統設計存在弊端，其在收錄、加工處理信息時對一些特定詞語會給予與原文獻有別的處理，通常表現在文章題名上，會出現錯誤的著錄形式。這些問題常常被文獻引用的作者忽視，而導致引用錯誤。編輯在編校工作中應給予足夠的重視，持有嚴謹的科學態度，利用互聯網和數據庫等平臺仔細查詢源文獻，及時核定和更正，避免留下編校差錯，以提高論文水平和期刊質量。