科學家解析一種基因變異的致癌風險

《自然》在線發表的一篇論文對數千種BRCA1的基因變異按功能進行了更精確的分類。這些功能評分對乳腺癌和卵巢癌罹患風險的基因檢測解讀或具有臨床意義。

BRCA1是一種人體腫瘤抑制基因，BRCA1失去功能的突變與易患早發型乳腺癌和卵巢癌有關。雖然已發現的BRCA1基因變異有數千種，但許多都被列為“意義未明的變異”，給患癌風險評估帶來了巨大挑戰。

要弄清這些意義未明的變異，其中一個方法是檢測變異基因的表達是否具有恢復DNA修復的功能，這也是腫瘤抑制過程的一部分。美國華盛頓大學的Jay Shendure及同事運用基因組編輯技術，對BRCA1基因功能至關重要的13個外顯子上的近4000種單核苷酸變異（SNV）的功能進行了評估，并在2000萬個人類單倍體（HAP1）細胞中進行了后續細胞存活率測定。

最后，研究人員識別出了約300種會干擾表達的SNV以及400多種錯義突變的SNV（會導致蛋白質的氨基酸序列改變），發現這些變異并無實際功能（不破壞基因的原有功能）。這些功能評分與已知的致病性變異或良性變異的臨床評估密切相關。

該團隊指出，與其他細胞系相比，HAP1細胞系可能不是生理學上的最優模型，但與臨床評估的高度相關性驗證了數據。研究者肯定了功能評分對變異分類的重要價值，并認為研究結果可直接應用于BRCA1基因篩查的解讀。