從保護遺傳學到保護基因組學

譚鑫鑫，李 明

(1. 中國科學院動物研究所 動物生態與保護生物學重點實驗室，北京 100101；2. 中國科學院大學，北京 100049)

生物多樣性(biological diversity)是人類生存的物質基礎，而全球生物多樣性正以驚人的速度不斷喪失[1].保護生物學(conservation biology)是研究如何保護生物及其生存環境，從而保護生物多樣性的科學[2].保護生物學發展迅速并形成許多分支學科，涉及生物學研究的不同領域，例如保護生態學、保護行為學、保護生理學、保護遺傳學等[3].近年來，由于高通量測序技術的發展，使得保護生物學面臨著新的挑戰和機遇：即如何將大規模基因組數據技術有效地整合到保護生物學的應用之中，實現從保護遺傳學到保護基因組學的轉變？

1 保護遺傳學

1.1 保護遺傳學的發展

保護遺傳學(conservation genetics)是指利用遺傳數據和研究來指導生物多樣性保護和物種及種群管理的學科[4]，其研究包括遺傳多樣性量化、物種鑒定、親緣關系鑒定、歷史動態追溯、有效種群大小的監測管理、種群結構和生境適應的探究等內容[5-18].隨著遺傳標記的不斷發展，保護遺傳學研究逐漸成為保護瀕危物種的重要手段，相關報道也逐年穩定增加[6].在過去的幾十年里，保護遺傳學已經從基于理論的種群生物學發展為一個成熟的、有積累的學科[19].

作為保護遺傳學研究中的重要工具，遺傳標記經歷了多次的變革，推動了保護遺傳學的發展.同工酶(allozyme)是最早的遺傳標記[20]，它的出現可以使研究者基于多個位點對任意物種進行……