不同來(lái)源患者分離的常見(jiàn)革蘭陰性桿菌耐藥率分析

李 麗， 喬 丹， 李 飛， 朱詠臻， 韓立中， 周 敏

目前細(xì)菌耐藥已成為全球公共健康領(lǐng)域的重大挑戰(zhàn)，由耐藥病原菌導(dǎo)致的感染發(fā)病率和病死率顯著增加，相關(guān)的醫(yī)療費(fèi)用支出也顯著增加[1]。2017年耐藥菌防控已被列入《十三五衛(wèi)生與健康科技創(chuàng)新專項(xiàng)規(guī)劃》，目的是通過(guò)抗菌藥物的合理使用及感染防控的有效實(shí)施，減少耐藥菌株產(chǎn)生[2]。上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院附屬瑞金醫(yī)院北院為上海在嘉定區(qū)新建的一所三甲醫(yī)院，也是當(dāng)?shù)匚ㄒ灰凰C合性三甲醫(yī)院和急救中心定點(diǎn)醫(yī)院。本研究通過(guò)對(duì)臨床分離率最高的4種革蘭陰性桿菌的耐藥率進(jìn)行分析，并對(duì)同種細(xì)菌不同來(lái)源菌株的耐藥率進(jìn)行比較，為臨床合理使用抗菌藥物和預(yù)防控制感染工作提供實(shí)驗(yàn)室依據(jù)。

1 材料與方法

1.1 材料

1.1.1 菌株來(lái)源 為我院細(xì)菌室2014年4月－2016年12月收集的菌株，剔除同一患者相同部位的重復(fù)菌株。質(zhì)控菌株為大腸埃希菌 ATCC 25922，肺炎克雷伯菌 ATCC 700603，銅綠假單胞菌 ATCC 27853，鮑曼不動(dòng)桿菌 ATCC 19606。

1.1.2 儀器與試劑 法國(guó)生物梅里埃公司VITEK 2-Compact 全自動(dòng)細(xì)菌真菌鑒定及藥敏試驗(yàn)儀器，配套GN鑒定卡，AST GN13、GN09藥敏卡；BASO公司革蘭染液；OXOID公司MH平皿和KB藥敏紙片。

1.2 方法

1.2.1 鑒定和藥敏試驗(yàn) 使用VITEK 2-Compact進(jìn)行細(xì)菌的鑒定和藥敏試驗(yàn)，紙片擴(kuò)散法進(jìn)行補(bǔ)充藥敏試驗(yàn)，藥敏結(jié)果參照2016年CLSI-M100 S26標(biāo)準(zhǔn)進(jìn)行判讀。

1.2.2 耐藥菌數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì) 應(yīng)用WHONET 5.6軟件進(jìn)行多重耐藥和碳青霉烯類耐藥的統(tǒng)計(jì)。

2 結(jié)果

2.1 常見(jiàn)革蘭陰性桿菌標(biāo)本來(lái)源和分布情況

3年來(lái)共分離到革蘭陰性桿菌2 278株，分離占比前20位的細(xì)菌見(jiàn)表1。分離數(shù)最高的4種細(xì)菌分別為大腸埃希菌772株，肺炎克雷伯菌416株，鮑曼不動(dòng)桿菌215株和銅綠假單胞菌205株。標(biāo)本來(lái)源：大腸埃希菌主要分離自門(mén)診患者（49.1%），其次為非ICU住院患者（45.0%）；肺炎克雷伯菌主要分離自非ICU住院患者（70.1%），其次為ICU（14.8%）；鮑曼不動(dòng)桿菌主要分離自非ICU住院患者（66.5%），其次為ICU（27.0%）；銅綠假單胞菌主要分離自非I C U住院患者（67.0%），其次為ICU（17.5%）。標(biāo)本類型：大腸埃希菌主要分離自尿標(biāo)本（84.1%），其次為除血、呼吸道之外的其他標(biāo)本（7.1%）；肺炎克雷伯菌主要分離自呼吸道標(biāo)本（70.9%），其次為尿標(biāo)本（18.6%）；鮑曼不動(dòng)桿菌主要分離自呼吸道標(biāo)本（86.5%），除血、尿、呼吸道外的其他標(biāo)本（7.4%）；銅綠假單胞菌主要分離自呼吸道標(biāo)本（80.5%），除血、尿、呼吸道外的其他標(biāo)本（12.5%）。

2.2 常見(jiàn)革蘭陰性桿菌對(duì)抗菌藥物敏感率和耐藥率變化

分析常見(jiàn)革蘭陰性桿菌對(duì)常用抗菌藥物耐藥率變化。腸桿菌科細(xì)菌：埃希菌屬對(duì)碳青霉烯類抗菌藥物耐藥率變化小于1%，對(duì)妥布霉素、哌拉西林-他唑巴坦和頭孢哌酮-舒巴坦耐藥率有所下降，其他受試的幾種抗菌藥物耐藥率有所升高；克雷伯菌屬對(duì)亞胺培南和美羅培南耐藥率有所升高，分別從2.2%到3.9%和2.2%到5.3%，對(duì)妥布霉素、頭孢曲松、氨曲南和厄他培南耐藥率有所下降，其他受試的數(shù)種抗菌藥物耐藥率有所升高；腸桿菌屬對(duì)亞胺培南、美羅培南和厄他培南耐藥率有所升高，分別從0到1.6%、0到2.0%和0到5.2%，對(duì)環(huán)丙沙星、左氧氟沙星、頭孢吡肟、哌拉西林-他唑他坦、頭孢哌酮-舒巴坦和氨曲南耐藥率有所下降，其他受試的抗菌藥物耐藥率有所升高；變形桿菌屬對(duì)亞胺培南耐藥率有所降低，從9.1%到7.1%；沙雷菌屬2015年分離株對(duì)亞胺培南和美羅培南耐藥率為5.0%，2014年和2016年分離株耐藥率均為0。見(jiàn)表2。枸櫞酸桿菌屬和摩根菌屬3年來(lái)分離菌株少，對(duì)碳青霉烯類抗菌藥物耐藥率很低。不發(fā)酵糖革蘭陰性桿菌中，鮑曼不動(dòng)桿菌對(duì)亞胺培南和美羅培南耐藥率有所下降，分別從42.1%到27.6%和44.6%到28.9%，對(duì)阿米卡星和妥布霉素耐藥率無(wú)變化，對(duì)其他受試的抗菌藥物耐藥率有所下降；銅綠假單胞菌對(duì)亞胺培南耐藥率有所升高，從7.0%到12.5%，對(duì)美羅培南耐藥率有所下降，從4.2%到3.8%，對(duì)阿米卡星、妥布霉素、左氧氟沙星和哌拉西林-他唑巴坦耐藥率有所下降，其他受試的抗菌藥物耐藥率有所升高；嗜麥芽窄食單胞菌對(duì)左氧氟沙星和頭孢哌酮-舒巴坦耐藥率有所升高。見(jiàn)表3。此外，革蘭陰性桿菌苛養(yǎng)菌對(duì)抗菌藥物耐藥率：流感嗜血桿菌對(duì)氨芐西林和甲氧芐啶-磺胺甲唑耐藥率較高，為15%～20%，其次對(duì)環(huán)丙沙星、左氧氟沙星和頭孢克洛耐藥率在10%左右，對(duì)阿莫西林-克拉維酸、頭孢呋辛和頭孢噻肟耐藥率小于10%，對(duì)利福平、阿奇霉素、氯霉素和四環(huán)素耐藥率小于1%。

表1 2014－2016年分離的前20位革蘭陰性桿菌Table 1 The top 20 species of gram negative bacilli isolated during the period from 2014 to 2016

表2 腸桿菌科細(xì)菌3年對(duì)抗菌藥物耐藥率和敏感率變化Table 2 Changing antimicrobial susceptibility profiles of Enterobacteriaceae species in 3 years（%）

2.3 常見(jiàn)革蘭陰性桿菌不同來(lái)源菌株對(duì)抗菌藥物敏感率和耐藥率比較

比較分離率最高的4種細(xì)菌對(duì)抗菌藥物耐藥率。大腸埃希菌除亞胺培南外，非ICU住院患者分離株對(duì)慶大霉素、阿米卡星、妥布霉素、環(huán)丙沙星、左氧氟沙星、頭孢曲松、頭孢他啶、頭孢吡肟、哌拉西林-他唑巴坦、頭孢哌酮-舒巴坦、氨曲南、美羅培南和厄他培南耐藥率高于門(mén)診患者分離株。肺炎克雷伯菌除對(duì)阿米卡星、妥布霉素和頭孢哌酮-舒巴坦外，ICU患者分離株對(duì)慶大霉素、環(huán)丙沙星、左氧氟沙星、頭孢曲松、頭孢他啶、頭孢吡肟、哌拉西林-他唑巴坦、氨曲南、亞胺培南、美羅培南和厄他培南耐藥率高于非ICU住院患者分離株。鮑曼不動(dòng)桿菌除阿米卡星和妥布霉素外，ICU患者分離株對(duì)慶大霉素、環(huán)丙沙星、左氧氟沙星、頭孢曲松、頭孢他啶、頭孢吡肟、哌拉西林-他唑巴坦、頭孢哌酮-舒巴坦、亞胺培南和美羅培南耐藥率高于非ICU住院患者分離株。銅綠假單胞菌ICU和非ICU住院患者分離株對(duì)各抗菌藥物耐藥

表2 （續(xù)）Table 2（continued）（%）

率比較，前者對(duì)妥布霉素和頭孢他啶耐藥率高于后者，后者對(duì)阿米卡星、環(huán)丙沙星、左氧氟沙星、哌拉西林-他唑巴坦、頭孢哌酮-舒巴坦、氨曲南和美羅培南耐藥率高于前者，而對(duì)慶大霉素、頭孢吡肟和亞胺培南耐藥率兩者無(wú)差異。見(jiàn)表4。

表3 不發(fā)酵糖革蘭陰性桿菌3年對(duì)抗菌藥物耐藥率和敏感率變化Table 3 Changing antimicrobial susceptibility profiles of non-fermentative bacteria in 3 years（%）

2.4 碳青霉烯類耐藥腸桿菌科細(xì)菌對(duì)其他抗菌藥物的敏感率和耐藥率及病區(qū)分布情況

3年逐年分離碳青霉烯類耐藥腸桿菌科細(xì)菌（CRE）分別為10株、13株和16株，其中肺炎克雷伯菌所占比例最高。CRE對(duì)慶大霉素、環(huán)丙沙星、左氧氟沙星、甲氧芐啶-磺胺甲唑、頭孢曲松、頭孢他啶、頭孢吡肟、哌拉西林-他唑巴坦、頭孢哌酮-舒巴坦和氨曲南耐藥率在50%～80%波動(dòng)，對(duì)阿米卡星和妥布霉素耐藥率在10%以下；CRE菌株主要分離自ICU、泌尿外科、呼吸科和腎臟內(nèi)科，其次為急診和普通外科。

3 討論

革蘭陰性桿菌對(duì)抗菌藥物耐藥率不斷升高，尤其是鮑曼不動(dòng)桿菌、銅綠假單胞菌和腸桿菌科細(xì)菌[3]，這些細(xì)菌也是我國(guó)檢出率最高的革蘭陰性桿菌。本研究分析了我院臨床分離的常見(jiàn)革蘭陰性桿菌耐藥情況，并進(jìn)行ICU、非ICU住院、門(mén)診和急診的分組分析，檢出率最高的4種革蘭陰性桿菌分別是大腸埃希菌、肺炎克雷伯菌、鮑曼不動(dòng)桿菌和銅綠假單胞菌。

本研究分析了臨床分離的常見(jiàn)革蘭陰性桿菌對(duì)常用抗菌藥物的耐藥率變化，埃希菌屬對(duì)碳青霉烯類抗菌藥物耐藥率低，耐藥率變化幅度小于1%，除妥布霉素、β內(nèi)酰胺類-β內(nèi)酰胺酶抑制劑復(fù)合制劑外，對(duì)其他受試抗菌藥物耐藥率有所升高；克雷伯菌屬和腸桿菌屬對(duì)碳青霉烯類抗菌藥物耐藥率有所升高，幅度約為5%，前者對(duì)妥布霉素、頭孢曲松、氨曲南和厄他培南耐藥率有所下降，后者對(duì)喹諾酮類、頭孢吡肟、頭孢哌酮-舒巴坦和氨曲南耐藥率有所下降。變形桿菌屬對(duì)亞胺培南耐藥率有所下降，幅度約2%；鮑曼不動(dòng)桿菌對(duì)亞胺培南和美羅培南耐藥率有所下降，下降幅度在15%左右；對(duì)受試的大多數(shù)抗菌藥物耐藥率也有所下降。銅綠假單胞菌對(duì)亞胺培南耐藥率有所升高，從7.0%到12.5%，對(duì)美羅培南耐藥率有所下降，從4.2%到3.8%，對(duì)阿米卡星、妥布霉素、左氧氟沙星和哌拉西林-他唑巴坦耐藥率有所下降。嗜麥芽窄食單胞菌對(duì)左氧氟沙星和頭孢哌酮-舒巴坦耐藥率有所升高。進(jìn)一步分析發(fā)現(xiàn)鮑曼不動(dòng)桿菌2014年分離菌株對(duì)多種抗菌藥物耐藥率高于2015年和2016年分離菌株，其耐藥率水平與同年碳青霉烯類耐藥菌株的檢出率一致，3年中碳青霉烯類耐藥鮑曼不動(dòng)桿菌檢出率分別是46.8%、20.7%和32.0%。此外本研究將4種細(xì)菌對(duì)常用抗菌藥物的耐藥率與CHINET監(jiān)測(cè)網(wǎng)數(shù)據(jù)進(jìn)行了比較[4]，顯示大腸埃希菌對(duì)頭孢吡肟的耐藥率低于CHINET平均水平；肺炎克雷伯菌、鮑曼不動(dòng)桿菌和銅綠假單胞菌對(duì)多種常用抗菌藥物的耐藥率低于CHINET水平。導(dǎo)致耐藥率的區(qū)域性差異考慮可能與患者病情、新建醫(yī)院公共設(shè)施清潔程度高和感染防控的重視程度等因素有關(guān)。

表4 4種常見(jiàn)革蘭陰性桿菌不同來(lái)源菌株對(duì)抗菌藥物耐藥率和敏感率比較Table 4 Comparative antimicrobial susceptibility profiles of four common gram-negative bacilli in different clinical settings（%）

此外，本研究發(fā)現(xiàn)同種細(xì)菌菌株來(lái)源不同對(duì)抗菌藥物耐藥率不同。大腸埃希菌主要分離自門(mén)診和非ICU住院患者尿標(biāo)本，非ICU住院患者分離的大腸埃希菌除亞胺培南外，對(duì)本研究受試的所有抗菌藥物耐藥率高于門(mén)診患者分離株；大腸埃希菌的主要耐藥機(jī)制是產(chǎn)ESBL，ESBL為質(zhì)粒介導(dǎo)，通過(guò)破壞β內(nèi)酰胺環(huán)對(duì)超廣譜頭孢菌素（第三代、第四代頭孢菌素）和單環(huán)類抗菌藥物產(chǎn)生耐藥[5]，并且產(chǎn)ESBL細(xì)菌除對(duì)β內(nèi)酰胺類抗菌藥物產(chǎn)生耐藥外，通常也通過(guò)其他機(jī)制對(duì)非β內(nèi)酰胺類抗菌藥物如喹諾酮類、氨基糖苷類和磺胺類等產(chǎn)生耐藥[6]。有研究報(bào)道，雖然產(chǎn)ESBL大腸埃希菌主要分離于住院患者，但這些耐藥菌可能主要來(lái)源于社區(qū)，尤其是社區(qū)尿路感染患者[7]，這一點(diǎn)與門(mén)診產(chǎn)ESBL大腸埃希菌高檢出率符合；本研究非ICU住院和門(mén)診大腸埃希菌ESBL檢出率分別為51.2%和42.8%。肺炎克雷伯菌主要分離自住院患者的呼吸道標(biāo)本，該菌除阿米卡星、妥布霉素和頭孢哌酮-舒巴坦外，ICU患者分離株對(duì)受試的其他抗菌藥物耐藥率高于非ICU住院患者分離株；本研究產(chǎn)ESBL肺炎克雷伯菌在ICU和非ICU住院患者檢出率分別為16.9%和16.8%，遠(yuǎn)低于大腸埃希菌，因此推測(cè)肺炎克雷伯菌主要耐藥機(jī)制不是產(chǎn)ESBL，而可能是產(chǎn)AmpC酶、碳青霉烯酶和其他如膜孔蛋白（OmpK35、OmpK36）缺失等[8]。本研究共檢出耐碳青霉烯類肺炎克雷伯菌18株，ICU住院患者7株、非ICU 8株，檢出率分別為11.9%（7/59）和2.9%（8/279）。鮑曼不動(dòng)桿菌主要分離自住院患者的呼吸道標(biāo)本，鮑曼不動(dòng)桿菌除阿米卡星和妥布霉素外，ICU患者分離株對(duì)受試的其他抗菌藥物耐藥率高于非ICU住院患者分離株，這與相關(guān)研究結(jié)果一致[9]。研究認(rèn)為碳青霉烯類耐藥鮑曼不動(dòng)桿菌一般不會(huì)引起社區(qū)感染，感染主要發(fā)生在醫(yī)院內(nèi)，耐藥菌多通過(guò)醫(yī)護(hù)人員手、污染的器械和霧化設(shè)備等傳播，且該菌能在干燥條件下長(zhǎng)期存活，醫(yī)院暴發(fā)流行時(shí)常在電腦鍵盤(pán)、門(mén)把手和窗簾等部位檢測(cè)到[10]，由于鮑曼不動(dòng)桿菌是ICU患者感染的主要致病菌，因此其易于在患者之間傳播而導(dǎo)致耐藥率升高。銅綠假單胞菌也主要分離自住院患者的呼吸道標(biāo)本，銅綠假單胞菌ICU患者分離株部分抗菌藥物耐藥率高于非ICU住院患者分離株，而后者對(duì)其他多種抗菌藥物耐藥率也高于前者。此菌在正常人定植率為0～2%，而在醫(yī)院患者定植率超過(guò)50%[11]。因此該菌所致感染多為醫(yī)院感染，多通過(guò)支氣管鏡、內(nèi)鏡、水系統(tǒng)、通氣設(shè)備及清潔系統(tǒng)等途徑傳播[12]。本研究與田小波等[13]研究表明的銅綠假單胞菌重癥組抗菌藥物耐藥率和普通組間有顯著差異的結(jié)果不一致，根據(jù)銅綠假單胞菌的傳播特性，推測(cè)是否為院感干預(yù)不同所致，但真正原因尚需進(jìn)一步分析。

本研究進(jìn)一步分析了CRE對(duì)其他抗菌藥物的耐藥率及病區(qū)分布情況。分析發(fā)現(xiàn)CRE菌株對(duì)常用抗菌藥物的耐藥率多數(shù)＞50%，且有逐年升高趨勢(shì)；此外這些分離菌株主要來(lái)源于ICU、泌尿外科、呼吸科和腎臟內(nèi)科等呼吸道、泌尿道感染患者就診多的病區(qū)。CRE感染危險(xiǎn)因素的研究認(rèn)為社區(qū)感染不常見(jiàn)，最常見(jiàn)原因?yàn)獒t(yī)療相關(guān)性感染，并一致認(rèn)為接受碳青霉烯類和廣譜頭孢菌素治療是耐藥菌感染的危險(xiǎn)因素[14]，因此對(duì)于CRE高分離率的病區(qū)應(yīng)加強(qiáng)抗菌藥物管理及院感控制措施。

綜上所述，本研究臨床分離的常見(jiàn)革蘭陰性桿菌抗菌藥物耐藥率不同于CHINET監(jiān)測(cè)網(wǎng)統(tǒng)計(jì)的全國(guó)19所三甲醫(yī)院耐藥率數(shù)據(jù)，肺炎克雷伯菌、鮑曼不動(dòng)桿菌和銅綠假單胞菌對(duì)受試的多種抗菌藥物耐藥率低于全國(guó)水平。此外同種細(xì)菌菌株來(lái)源不同耐藥率也不同，研究發(fā)現(xiàn)大腸埃希菌在非ICU住院和門(mén)診患者間耐藥率不同，肺炎克雷伯菌和鮑曼不動(dòng)桿菌在ICU和非ICU住院患者間耐藥率不同。臨床醫(yī)師在進(jìn)行抗菌藥物的經(jīng)驗(yàn)性治療時(shí)除考慮患者感染的可能病原菌外，還需結(jié)合本院或當(dāng)?shù)氐募?xì)菌耐藥情況及患者的來(lái)源等因素。值得關(guān)注的是全球CRE檢出率有逐年升高趨勢(shì)，這些菌株主要分離自ICU，且研究認(rèn)為此耐藥菌株產(chǎn)生的原因主要為碳青霉烯類和廣譜抗菌藥物的大量使用，因此感染防控應(yīng)加強(qiáng)抗菌藥物分級(jí)管理制度。此外鮑曼不動(dòng)桿菌和銅綠假單胞菌為醫(yī)院感染的主要致病菌，主要通過(guò)接觸傳播，因此應(yīng)注意手消毒、物體表面消毒、各種器械消毒、對(duì)感染患者進(jìn)行隔離防止交叉感染等，重點(diǎn)尤其在ICU。