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福建漢族人群PentaD和PentaE基因座遺傳多態(tài)性

2018-01-19 11:36:46洪志平
健康大視野 2018年20期

洪志平

【摘 要】目的:調(diào)查Penta D和Penta E基因座在福建漢族人群中的遺傳多態(tài)性。 方法:應(yīng)用STRtyper-21G試劑盒對(duì)福建地區(qū)500名漢族無關(guān)個(gè)體血樣進(jìn)行PCR擴(kuò)增,經(jīng)3130XL型遺傳分析儀電泳檢測(cè),用GeneMapper ID V3.2軟件進(jìn)行等位基因分析。 結(jié)果:Penta D基因座共檢出11個(gè)等位基因,H值為0.794,PIC值為0.78,DP值為0.935,PE值為0.588,Pm值為0.065;Penta E基因座共檢出23個(gè)等位基因,H值為0.914,PIC值為0.91,DP值為0.985,PE值為0.824,Pm值為0.015。 結(jié)論:Penta D和Penta E基因座屬于高鑒別力、高雜合度、高信息量基因座,適合于福建漢族法醫(yī)學(xué)個(gè)體識(shí)別及親權(quán)鑒定。

【關(guān)鍵詞】法醫(yī)遺傳學(xué);STR基因座;遺傳多態(tài)性

【中圖分類號(hào)】R795.2 【文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼】A 【文章編號(hào)】1005-0019(2018)20-00-02

1 材料與方法

從本實(shí)驗(yàn)室前科違法犯罪人員庫(kù)中隨機(jī)抽取500份福建省漢族人群無關(guān)個(gè)體血樣,采用STRtyper-21G直接擴(kuò)增熒光檢測(cè)試劑盒(海爾施基因科技公司),10ul 擴(kuò)增反應(yīng)體系,在ABI-9700型PCR儀上進(jìn)行復(fù)合擴(kuò)增,應(yīng)用ABI-3130XL 型遺傳分析儀進(jìn)行STR基因座的檢測(cè)與分型。用Data Collection軟件收集數(shù)據(jù),GeneMapper ID V3.2軟件進(jìn)行等位基因分析。按文獻(xiàn)[1-3]方法,采用Modified-PowerState 軟件計(jì)算Penta D和Penta E基因座的等位基因分布頻率、雜合度(H)、個(gè)體識(shí)別率(DP)、多態(tài)信息含量(PIC)、非父排除率(PE)、匹配概率(Pm)等群體遺傳學(xué)參數(shù)。按文獻(xiàn)[4]方法進(jìn)行Hardy-Weinberg 平衡檢驗(yàn)。

2 結(jié)果與分析

在500份福建漢族人群無關(guān)個(gè)體樣本中Penta D基因座共檢出12個(gè)等位基因,Penta E基因座共檢出23個(gè)等位基因。經(jīng)檢驗(yàn),兩個(gè)基因座基因型的觀察值和理論值無顯著性差異,其分布均符合Hardy—Weinberg平衡(P>0.05)。兩個(gè)基因座等位基因頻率及遺傳學(xué)參數(shù)見表1、2。

本研究中我們共發(fā)現(xiàn)PentaE基因座的23個(gè)等位基因型,其中3個(gè)稀有等位基因,即18.4、20.4、25,等位基因頻率為0.001~0.002,與賴力等[5]的研究結(jié)果相似。低頻率出現(xiàn)的等位基因可能是樣本量少所致,更多稀有等位基因以及微變異體[6]的發(fā)現(xiàn)還有待更多的人群調(diào)查。

根據(jù)文獻(xiàn)[7]標(biāo)準(zhǔn),DP>0.9,H>0.7的基因座被認(rèn)為是高鑒別能力遺傳標(biāo)記,由表2可見,PentaD和PentaE基因座在福建漢族人群中的H值(0.794、0.914)和DP值(0.935、0.985)均高于上述標(biāo)準(zhǔn)。表明這兩個(gè)基因座均屬于高鑒別力、高雜合度的基因座,適用于福建漢族法醫(yī)學(xué)個(gè)體識(shí)別及親權(quán)鑒定。特別值得關(guān)注的是Penta E基因座具有較高的多態(tài)性和較低的變異率,其稀有等位基因?qū)ωS富基因座的遺傳信息,提升多態(tài)信息含量具有重要價(jià)值。

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