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福建漢族人群PentaD和PentaE基因座遺傳多態性

2018-01-19 11:36:46洪志平
健康大視野 2018年20期

洪志平

【摘 要】目的:調查Penta D和Penta E基因座在福建漢族人群中的遺傳多態性。 方法:應用STRtyper-21G試劑盒對福建地區500名漢族無關個體血樣進行PCR擴增,經3130XL型遺傳分析儀電泳檢測,用GeneMapper ID V3.2軟件進行等位基因分析。 結果:Penta D基因座共檢出11個等位基因,H值為0.794,PIC值為0.78,DP值為0.935,PE值為0.588,Pm值為0.065;Penta E基因座共檢出23個等位基因,H值為0.914,PIC值為0.91,DP值為0.985,PE值為0.824,Pm值為0.015。 結論:Penta D和Penta E基因座屬于高鑒別力、高雜合度、高信息量基因座,適合于福建漢族法醫學個體識別及親權鑒定。

【關鍵詞】法醫遺傳學;STR基因座;遺傳多態性

【中圖分類號】R795.2 【文獻標識碼】A 【文章編號】1005-0019(2018)20-00-02

1 材料與方法

從本實驗室前科違法犯罪人員庫中隨機抽取500份福建省漢族人群無關個體血樣,采用STRtyper-21G直接擴增熒光檢測試劑盒(海爾施基因科技公司),10ul 擴增反應體系,在ABI-9700型PCR儀上進行復合擴增,應用ABI-3130XL 型遺傳分析儀進行STR基因座的檢測與分型。用Data Collection軟件收集數據,GeneMapper ID V3.2軟件進行等位基因分析。按文獻[1-3]方法,采用Modified-PowerState 軟件計算Penta D和Penta E基因座的等位基因分布頻率、雜合度(H)、個體識別率(DP)、多態信息含量(PIC)、非父排除率(PE)、匹配概率(Pm)等群體遺傳學參數。按文獻[4]方法進行Hardy-Weinberg 平衡檢驗。

2 結果與分析

在500份福建漢族人群無關個體樣本中Penta D基因座共檢出12個等位基因,Penta E基因座共檢出23個等位基因。經檢驗,兩個基因座基因型的觀察值和理論值無顯著性差異,其分布均符合Hardy—Weinberg平衡(P>0.05)。兩個基因座等位基因頻率及遺傳學參數見表1、2。

本研究中我們共發現PentaE基因座的23個等位基因型,其中3個稀有等位基因,即18.4、20.4、25,等位基因頻率為0.001~0.002,與賴力等[5]的研究結果相似。低頻率出現的等位基因可能是樣本量少所致,更多稀有等位基因以及微變異體[6]的發現還有待更多的人群調查。

根據文獻[7]標準,DP>0.9,H>0.7的基因座被認為是高鑒別能力遺傳標記,由表2可見,PentaD和PentaE基因座在福建漢族人群中的H值(0.794、0.914)和DP值(0.935、0.985)均高于上述標準。表明這兩個基因座均屬于高鑒別力、高雜合度的基因座,適用于福建漢族法醫學個體識別及親權鑒定。特別值得關注的是Penta E基因座具有較高的多態性和較低的變異率,其稀有等位基因對豐富基因座的遺傳信息,提升多態信息含量具有重要價值。

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