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基因檢測來了,你準(zhǔn)備好了嗎

2017-12-29 00:00:00
科學(xué)導(dǎo)報(bào) 2017年21期

如今,“精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)”“腫瘤治療的伴隨診斷”“個(gè)體化醫(yī)療”等成為媒體熱詞,這預(yù)示醫(yī)學(xué)正在進(jìn)入一個(gè)大眾基因檢測與治療的新時(shí)代。那么,基因檢測到底是什么、能解決什么問題、是否可靠?

越來越低成本的基因檢測技術(shù):

從30億美元到1000美元

要談“基因檢測”,我們還是先聊聊“基因”。“基因”是生命科學(xué)中最核心的概念之一,它是遺傳物質(zhì)的載體,是一段段定位在細(xì)胞染色體上的核苷酸序列。現(xiàn)在我們已經(jīng)知道,基因的序列和表達(dá)調(diào)控模式,決定了人們的生長發(fā)育和與遺傳有關(guān)的健康狀況。

由此看來,掌握體內(nèi)基因的信息,就如同掌握了人體生老病死的密碼,破解這些密碼就能夠預(yù)測、診斷或解釋我們所關(guān)心的健康問題。

已故著名華人生物學(xué)家吳瑞開創(chuàng)的“引物延伸法”為破解基因密碼奠定了第一塊基石,在此基礎(chǔ)上,英國科學(xué)家桑格(F. Sanger)發(fā)展出了基因測序的“末端終止法”,并因此獲得1980年的諾貝爾化學(xué)獎(jiǎng)。桑格測序法的原理催生了第一代測序技術(shù),成就了生命科學(xué)史上具有劃時(shí)代意義的“人類基因組計(jì)劃”,更將“基因”“測序”“遺傳病篩查”等生物學(xué)術(shù)語帶入了大眾的視野。

2001年,人類基因組計(jì)劃發(fā)表了包含30億對核苷酸序列的人類基因組草圖。這項(xiàng)必將彪炳史冊的偉大科學(xué)工程由來自美國、英國、日本、法國、德國、中國的超過3000名科技人員,在16個(gè)測序中心、耗時(shí)13年完成,花費(fèi)超過了30億美元。

其時(shí),人們還無法預(yù)見到基因測序技術(shù)發(fā)展會(huì)如此迅速——到2007年,應(yīng)用第二代測序技術(shù),第一個(gè)完整人類基因組序列圖譜的誕生僅僅用了3個(gè)月,花費(fèi)了150萬美元。在第二代測序技術(shù)市場中,值得一提的是我國科技企業(yè)華大基因研制的BGISEQ系列測序儀近年也已陸續(xù)投放市場,這家發(fā)軔于承擔(dān)1%人類基因組計(jì)劃任務(wù)的公司目前已成為全球最大的基因組學(xué)研發(fā)機(jī)構(gòu)。

今天,新一代基因測序技術(shù)正在萌芽。基于“納米級大小微孔設(shè)備”的單分子測序、基于“大規(guī)模平行標(biāo)簽”的直接判讀測序等方法應(yīng)運(yùn)而生,已經(jīng)能夠?qū)崿F(xiàn)以1000美元成本在一天內(nèi)測完整個(gè)人類基因組的壯舉。

除了基因測序,免疫組織化學(xué)(Immuno-histochemistry,IHC)、熒光原位雜交(Fluorescence in situ hybridisation,F(xiàn)ISH)等也是臨床常用的基因檢測方法。

生物信息學(xué):

從數(shù)據(jù)中辨別信息,護(hù)衛(wèi)健康

測序得到了大量的基因密碼,但枯燥浩繁的數(shù)據(jù)并不能直接告訴人們身體健康的信息。于是,生物信息學(xué)應(yīng)運(yùn)而生——這是專門進(jìn)行基因數(shù)據(jù)比對、拼接、豐度和關(guān)聯(lián)性分析、建立計(jì)算模型的交叉學(xué)科。

生物信息學(xué)為基因科技的發(fā)展插上了翅膀。通過生物信息學(xué)分析,科學(xué)家鑒定了許多與高血壓、哮喘、類風(fēng)濕性關(guān)節(jié)炎、肺癌、前列腺癌等相關(guān)的基因位點(diǎn),一定程度上解釋了這些疾病的遺傳和發(fā)病機(jī)制。特別是在某些與基因高度相關(guān)的遺傳性疾病的鑒別上,比如唐氏綜合癥、地中海貧血等,取得了傳統(tǒng)方法無法比擬的效果。

這些成果也很快進(jìn)入臨床。比如,通過生物信息學(xué)分析,分子生物學(xué)臨床應(yīng)用專家、香港中文大學(xué)盧煜明教授發(fā)展了一種無創(chuàng)產(chǎn)前胎兒基因檢測方法,可以準(zhǔn)確鑒別和度量母親外周血中的胎兒DNA,既能避免羊膜腔穿刺對妊娠帶來的可能損傷,也能及早發(fā)現(xiàn)并避免嬰兒罹患唐氏綜合癥等嚴(yán)重遺傳性疾病。

通過生物信息學(xué)分析,北京大學(xué)謝曉亮教授、湯富酬教授與北京大學(xué)第三醫(yī)院喬杰教授合作,利用極體高通量測序結(jié)果,能夠較為精確地推演出母源基因組信息,成功幫助有遺傳疾病的夫婦獲得健康寶寶。

而基因檢測也能讓疾病治療更精準(zhǔn),比如乳腺癌的治療。基于乳腺癌基因表達(dá)譜,科學(xué)家分析將乳腺癌分為管腔上皮A型(Luminal A)、管腔上皮B型(Luminal B)、HER2過表達(dá)型(ERBB2+)、基底樣型(Basal-like)和正常乳腺樣型(Normal breast-like)共5種亞型,每種基因亞型對應(yīng)一定的發(fā)病機(jī)制、惡性化程度、化療反應(yīng)和預(yù)后等。患者通過基因檢測確定基因亞型后,即可制定治療方案——或單純內(nèi)分泌治療,或內(nèi)分泌治療聯(lián)合化療,或內(nèi)分泌治療、化療及抗HER2治療聯(lián)用,這種腫瘤伴隨診斷的精準(zhǔn)醫(yī)療思路提高了腫瘤治療的靶向性,不花冤枉錢,同時(shí)也提高了治愈率。類似非小細(xì)胞肺癌患者EGFR基因突變的檢測對于其靶向用藥也具有重要意義。

基因檢測產(chǎn)業(yè):

理性對待,積極發(fā)展

對于基因檢測技術(shù),大家也有很多擔(dān)心。比如,從目前研究結(jié)果看,基因與疾病的發(fā)生是概率關(guān)系,那么,這種預(yù)測會(huì)不會(huì)給檢測者帶來不必要的心理負(fù)擔(dān)?會(huì)不會(huì)有基因信息泄露的風(fēng)險(xiǎn)?會(huì)不會(huì)帶來新的社會(huì)問題——如果以后入學(xué)、就業(yè),甚至婚姻都加上基因“門檻”,必將引發(fā)基因歧視。

其實(shí),對待任何技術(shù)進(jìn)步,我們都應(yīng)理性看待,基因檢測技術(shù)也是如此。

從目前的科學(xué)發(fā)展看,我們對基因的認(rèn)識還只是一小步,并不完全清楚。而且,越來越多的研究發(fā)現(xiàn),基因與生物體性狀并非是線性對應(yīng)關(guān)系,而是網(wǎng)狀的——一個(gè)基因可能引發(fā)不同性狀,有些是好的,有些可能是不好的,因此很難用“好”與“不好”來判別基因。

而我們也必須要說明的是,對于生物體而言,先天遺傳固然重要,但后天所處環(huán)境、生活方式等影響也會(huì)導(dǎo)致這人基因的變異或者會(huì)影響其基因的表達(dá)調(diào)控模式,進(jìn)而影響個(gè)體的健康狀況——沒有什么命中注定的健康,也沒有什么天賦不通過努力即可顯現(xiàn),健康需要培養(yǎng)良好的生活習(xí)慣,成功需要付出辛苦的汗水。

對于基因檢測這一新技術(shù),我們還要注意別上當(dāng)受騙——一些不法分子和不良企業(yè)以基因檢測為噱頭,欺騙廣大消費(fèi)者,嚴(yán)重?cái)_亂了基因檢測產(chǎn)業(yè)的秩序,阻礙了其正常發(fā)展。筆者在這里提醒大家,如果有基因檢測需要,請一定到有資質(zhì)的醫(yī)療機(jī)構(gòu)進(jìn)行。

基因檢測確實(shí)還存在種種問題,但因噎廢食不是長久之計(jì)。這些阻礙基因檢測產(chǎn)業(yè)健康發(fā)展的問題,有賴國家出臺(tái)具體的監(jiān)管規(guī)范細(xì)則,也有賴生物醫(yī)學(xué)科技工作者向大眾做好科普工作。生命科學(xué)的積累已經(jīng)為基因檢測奠定了基石,在這場呼嘯而來的生命科技產(chǎn)業(yè)革命中,我們不應(yīng)錯(cuò)失良機(jī)。

姜韶東

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