辣椒（Capsicum annuum L.）果實發育及品質相關新microRNA的鑒定與分析

辣椒（Capsicum annuum L.）果實發育及品質相關新microRNA的鑒定與分析

LIU Zhoubin1,2,aZHANG Yuping3,aOU Lijun2,aKANG Linyu1,2LIU Yuhua1,2LV Junheng1,2WEI Ge2YANG Bozhi2YANG Sha2CHEN Wenchao2DAI Xiongze2LI Xuefeng2ZHOU Shudong2ZHANG Zhuqing2,*MA Yanqing2,*ZOU Xuexiao1,2,**
（1. 湖南大學研究生院隆平分院， 長沙 410125； 2. 湖南省蔬菜研究所， 長沙 410125；3. 湖南農業大學資源環境學院， 長沙 410128； a為共同第一作者）

MicroRNA（miRNA）是一種非編碼的小RNA，在各種生物過程中起著重要的調節作用。前人研究表明，模式植物中miRNA與果實發育相關。然而，人們對辣椒（Capsicum annuum L.）果實品質及發育相關的miRNA了解尚不清楚。本研究利用二代測序技術（Next-generation sequencing technology）比較了不同品種辣椒果實在不同發育時期的小RNA。利用miRDeep2軟件從4個樣本中共鑒定出了59個已知miRNA和310個新miRNA。預測了新miRNA的靶基因，共656個，并對其中402個靶基因進行了注釋。GO分析和KEGG途徑表明，某些靶基因與淀粉糖、氨基糖以及核糖代謝相關。qPCR表明一些miRNA的表達模式與其靶向基因相反，該結果為今后研究miRNA調控果實發育和品質形成提供了重要基礎。

辣椒（Capsicum annuum L.）；miRNA；果實發育；果實品質；深度測序；

1 引言

辣椒（Capsicum annuum L.）屬于茄科植物，是種植范圍最廣、最重要的蔬菜作物之一。其果實具有特殊的顏色、辛味和香氣，因此常被作為調味品使用[1]。辣椒果實能夠積累辣椒素、色素（花青素和胡蘿卜素）和維生素A、B、C[2]。一個世紀以來，在辣椒的育種中，產量和果實品質是重要的質量參數[3]。果肉厚度、總可溶性固形物是許多植物果實品質的重要特征[4]。Isabelle 等[5]研究表明，辣椒果實能積累大量的維生素C。相比成熟的果實，處于成熟期的果實維生素C含量更多，還原糖更少[6]。近年來，為研究辣椒果實發育和辣椒素合成，辣椒屬轉錄組得到了分析。Martinez-Lopez等[7]于2014年研究分析了墨西哥辣椒（“Tampique?o 74”）花后（DAA）10、20、40、60天的果實轉錄組數據。……