孫 婷,黨瑞華,黃永震,藍賢勇,梁小軍,陳 宏,雷初朝﹡
(1.西北農林科技大學動物科技學院,陜西 楊凌 712100;2.寧夏農林科學院動物科學研究所,寧夏 銀川 750002)
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科學試驗
黃陂牛mtDNA D-loop區(qū)遺傳多樣性研究
孫 婷1,黨瑞華1,黃永震1,藍賢勇1,梁小軍2,陳 宏1,雷初朝1﹡
(1.西北農林科技大學動物科技學院,陜西 楊凌 712100;2.寧夏農林科學院動物科學研究所,寧夏 銀川 750002)
【目的】探究黃陂牛的遺傳多樣性與母系起源。【方法】采用PCR擴增、測序及生物信息學方法。【結果】在21頭黃陂牛mtDNA D-loop區(qū)共檢測到55個變異位點,定義了10個mtDNA單倍型,平均單倍型多樣度為0.7760,平均核苷酸多樣度為0.0234,表明黃陂牛具有豐富的遺傳多樣性。構建的NJ系統(tǒng)發(fā)育樹表明黃陂牛具有瘤牛和普通牛兩個母系起源。【結論】黃陂牛有豐富的遺傳多樣性,有瘤牛和普通牛兩個母系起源,且受瘤牛的影響較大。
黃陂牛;mtDNA D-loop;遺傳多樣性;母系起源
中國黃牛的品種數(shù)量多且分布范圍廣泛,是世界牛屬遺傳資源的重要組成部分。目前,我國有53個地方黃牛品種[1]。按地理分布區(qū)域的不同,將中國黃牛分為北方黃牛、中原黃牛和南方黃牛三大類[2]。黃陂牛屬于南方黃牛,是一個役肉兼用型優(yōu)良地方品種,主要分布在武漢市黃陂區(qū),故被命名為黃陂牛[3]。1982年,全國品種志編委會將分布在大別山及其周邊地區(qū)的黃牛統(tǒng)一命名為大別山黃牛,黃陂牛也屬于此類[3]。
哺乳動物線粒體DNA(mitochondrial DNA,mtDNA)是一個雙鏈閉合的環(huán)狀DNA分子,具有結構簡單、遵循母系遺傳、無重組、進化速度快等特點,在動物的系統(tǒng)發(fā)育、演化及遺傳多樣性方面得到廣泛應用[4]。……