張盡美 趙蕾 吳亞菲
牙齦卟啉單胞菌第Ⅸ型分泌系統的研究進展
張盡美 趙蕾 吳亞菲
口腔疾病研究國家重點實驗室,國家口腔疾病臨床醫學研究中心,四川大學華西口腔醫院牙周病科,成都 610041
牙齦卟啉單胞菌第Ⅸ型分泌系統(T9SS)是新近發現的一種新型蛋白分泌系統,又被稱為Por分泌系統(PorSS)。與以往發現的8個蛋白分泌系統不同,T9SS系統是一個僅存在于擬桿菌中的多蛋白復合體,其分泌的蛋白質N端均具有Sec依賴的Ⅰ型信號肽,C端均含有保守結構域(CTD)。牙齦卟啉單胞菌T9SS包括了內膜、外膜、細胞質以及細胞周質等重要組成部分的蛋白質,至少包括34種包含CTD的蛋白,這些蛋白參與調控的相關毒力因子包括牙齦素、菌毛、脂多糖、HBP35、CPG70蛋白和蛋白質-肽基精氨酸脫亞氨酶等。這些包含CTD的毒力蛋白通過T9SS轉定位在細胞外膜上,然后釋放至胞外,從而對牙周組織起破壞作用。本文對牙齦卟啉單胞菌T9SS的研究進展作一綜述,以便于深入理解該菌的毒力機制。
牙齦卟啉單胞菌; 第9型分泌系統; C端保守結構域; 牙齦素
牙齦卟啉單胞菌是一種革蘭染色陰性專性厭氧菌,具有包括脂多糖、菌毛、血細胞凝集素和胞外蛋白酶等在內的多種毒力因子,在慢性牙周炎的發生發展中發揮重要的致病作用[1]。研究[2]發現,牙齦卟啉單胞菌在已發現的8個分泌系統外,還具有一種新型的蛋白分泌系統——Por分泌系統(Por secretion system,PorSS),通過該系統分泌的蛋白質均具有N端和C端,N端均具有Sec依賴的Ⅰ型信號肽,C端含有保守結構域(C-terminal conserved domain,CTD)。由于與以往的任何8個分泌系統不同,也被稱為第Ⅸ型分泌系統(type Ⅸ secretion system,T9SS)。T9SS可協助牙齦卟啉單胞菌將胞內合成蛋白分泌到菌體細胞表面。CTD對于相關分泌蛋白通過T9SS易位到外膜的過程至關重要。進一步研究[3]發現,牙齦卟啉單胞菌的T9SS與其毒力因子(牙齦素以及其他胞外蛋白酶等)的加工及分泌密切相關。本文就牙齦卟啉單胞菌的T9SS作一綜述,以便加深理解該菌的毒力機制。
Nakayama[4]通過比較牙齦卟啉單胞菌菌株ATCC-33277與W83的基因組,確定了ATCC33277的461個和W83的415個特異性編碼區,進一步比較兩菌株之間175個區域的重排基因組后,發現牙齦卟啉單胞菌的某些基因組不編碼已知的任何一種分泌系統蛋白質,如Ⅱ和Ⅲ型分泌系統等,這表明牙齦卟啉單胞菌存在一種新型分泌系統,因此他們利用基因同源重組原理,通過韋恩圖鑒別分析已知的蛋白分泌系統,同時構建與牙齦素相關的46個牙齦卟啉單胞菌基因突變體。該研究[4]發現:在細胞和培養上清液中,有10個基因突變體導致了精氨酸-牙齦素(Arginine-gingipains,Rgps)和賴氨酸-牙齦素(Lysine-gingipain,Kgp)活性降低。因此,研究者將這一新型分泌系統命名為PorSS分泌系統,現稱為T9SS[4-5]。
研究[6]顯示:T9SS是一個僅限于擬桿菌門的多蛋白復合體,負責各種蛋白質的分泌和細胞表面沉積,參與細菌S層形成及滑翔運動。目前,研究者們已經證實T9SS廣泛存在于擬桿菌門中,特別是牙周致病菌中。除牙齦卟啉單胞菌外,還有福賽斯坦納菌、黃褐二氧化碳嗜纖維菌、中間普雷沃菌等。福賽斯坦納菌的T9SS主要參與最外層S層組分的運輸[7],而黃褐二氧化碳噬纖維菌的T9SS主要涉及細菌生物膜形成[8]。
T9SS是一個多蛋白復合體,現有研究[9]顯示:牙齦卟啉單胞菌T9SS包括了內膜、外膜、細胞質及周質蛋白等重要組成部分,至少有34種包含CTD的蛋白,主要包括PorK、PorL、PorM、PorN、PorP、PorQ、PorT、PorU、PorV、PorW、PorX、PorY和Sov等,分別由porK(PGN_1676)、porL(PGN_1675)、porM(PGN_1674)、porN(PGN_1673)、porP(PGN_1677)、porQ(PGN_0645)、porT(PGN_778)、porU(PGN_0022)、porV(PGN_0023)、porW(PGN_1877)、porX(PGN_1019)、porY(PGN_2001)和sov(PGN_0832)等編碼。它們分別存在于牙齦卟啉單胞菌的細胞內膜、外膜、細胞質或細胞周質中[5]。
2.1 細胞內膜及細胞質中的T9SS成分
Kadowaki等[10]發現,PorY和PorX分別存在于細胞內膜和細胞質中,且PorY(PGN_2001)-PorX(PGN_1019)-SigP(PGN_0274)在T9SS的作用機制中存在一定的相關性。PorX蛋白由porX基因編碼,存在于細胞質中。PorX是由兩個區域組成的細胞質蛋白,即一個N端接收區域的CHeY家族和一個C端效應區域的PgIZ家族[6]。CHeY是一種參與趨化作用的磷酸蛋白,通過化學感受器感知鞭毛旋轉方向[11];而pglZ區域的功能至今未知。Vincent等[6]研究發現,敲除牙齦卟啉單胞菌的porX會導致其他一些T9SS基因的表達下降,包括sov、porT、porP、porL、porK、porN、porY等。T9SS有一個參與旋轉調節的機制,約氏黃桿菌的T9SS可促進SprB絲狀附著的旋轉運動到達細胞表面[12],這與CHeY的功能極其相似,因此,Vincent等[6]猜想,與CHeY類似,PorX可能是T9SS的基本組成成分之一,CHeY-like PorX蛋白可能參與了T9SS的動態調節。
PorY蛋白由porY基因編碼,可能通過兩個轉移膜固定在內膜上。PorY細胞質區域采用經典信號轉導的模式,即BaeS家族組氨酶激酶折疊,該折疊具有三磷酸腺苷(adenosine triphosphate,ATP)結合位點,且在第193位氨基酸上具有保守組氨酸殘基的磷酸受體結構域。表面等離子體共振(surface plasma rwsonance,SPR)分析顯示,交互重組的PorY(rPorY)和PorX(rPorX)之間有直接關系。當二價錳離子存在時,rPorY自身磷酸化,并結合一群磷酰基轉移至rPorX。這些結果說明盡管PorX和PorY各自編碼于不同的染色體上,但分別作為反應調節器和組氨酸激酶這兩種組件共同構成了一個雙組分系統(two component system,TCS),作為牙齦卟啉單胞菌T9SS的重要組成從而調節毒力因子的分泌[9]。
有研究[13-14]證明,SigP(PGN_0274)是6個ECF(extracytoplasmic function)σ因子之一,在牙齦卟啉單胞菌ATCC33277菌株中參與牙齦素的表達。研究[9]發現,缺乏SigP(PGN_0274)的突變體類似于porX突變體,其T9SS成分編碼基因呈下調趨勢。凝膠電泳結果顯示:重組SigP(rSigP)可綁定到T9SS編碼基因的啟動子區域,且在PorX缺陷的突變體中缺乏SigP蛋白的表達。免疫共沉淀和SPR分析也揭示了SigP和PorX之間的直接交互關系。這些結果提示,PorXY雙組分系統通過SigP ECFσ因子調節T9SS蛋白的分泌[10]。此外,還有研究[15]顯示,PorL、PorM也存在于內膜上,其功能有待進一步分析。
2.2 外膜及細胞周質中的T9SS成分
在已發現的CTD蛋白中,PorK、PorP、PorN、PorU、PorW、PorV、Sov等都是通過T9SS轉定位于外膜上。研究[16]發現,T9SS的靶向信號位于CTD的C末端最后22個殘基內。de Diego等[9]發現,牙齦卟啉單胞菌T9SS的外膜上有一個輸出信號結合位點,該輸出信號為保守的C末端β-夾心結構域,即CTD。CTD具有典型的Ig樣折疊,包含兩個β-折疊中的7個反向平行β-鏈,被包裝成可通過C末端鏈自發交換的β-夾心結構。該研究[9]還顯示:CTD中兩個相鄰Ig樣結構域中的結構基序決定了T9SS對它的加工及分泌。多種牙齦卟啉單胞菌毒力因子依賴CTD結構,通過T9SS系統加工分泌至胞外,例如牙齦素從細胞周質跨越至外膜的移位分泌。在牙齦素移位跨越外膜的過程中,CTD首先發揮PorU切割作用以分選蛋白酶[17],隨后與陰離子脂多糖(anionic-lipopolysaccharide,A-LPS)共價連接,進而錨定到外膜上,使牙齦素釋放至胞外[18]。當CTD缺失最后幾位C末端殘基時,將影響T9SS外膜對CTD的加工,從而導致牙齦素在細胞質中的堆積[19]。
牙齦卟啉單胞菌T9SS分泌的蛋白質具有N端和一保守的C端區域,N端均具有Sec依賴的Ⅰ型信號肽,C端含有CTD[20]。研究[2]發現,牙齦卟啉單胞菌基因組編碼了大約34種包含CTD的蛋白質,這些蛋白參與調控的牙齦卟啉單胞菌毒力因子有:Kgp、Rgps、Mfa5、A-LPS、HBP35,以及由PGN_0335基因編碼的CPG70蛋白和PGN_0898基因編碼的蛋白質-肽基精氨酸脫亞氨酶(peptidyl-arginine deiminase,PAD)。這些包含CTD的蛋白質均通過T9SS轉定位在細胞外膜上,通過T9SS釋放[16,21]。
3.1 牙齦素
牙齦素是存在于牙齦卟啉單胞菌的外膜、膜泡或胞外的一組蛋白酶,包括Kgp和Rgps,Kgp由kgp基因編碼,Rgps由rgpA和rgpB兩個基因編碼。kgp、rgpA和rgpB基因可編碼含有信號肽、前肽、蛋白酶、黏附域和含CTD的多聚蛋白。Kgp和Rgps在細胞質中以預酶原形式合成,并通過Sec機制跨內膜移位,再通過T9SS穿過外膜分泌[3,5]。隨后,Kgp和Rgps或以成熟蛋白酶形式被分泌到細胞外環境,或以與黏附蛋白區域相關的非共價性復合物形式位于細胞表面,從而對牙周組織起破壞作用[3]。
3.2 菌毛
菌毛是基于蛋白質的絲狀附屬物,從細菌細胞表面突出并且可促進宿主黏附。牙齦卟啉單胞菌的兩種菌毛FimA和Mfa1負責黏附其他細菌和口腔中的宿主細胞。兩種菌毛形式均由5種蛋白質組成,分別為FimA~E和Mfa1~5。Hasegawa等[22]為推斷Mfa5 CTD和T9SS之間的關系,構建了CTD突變體和porU突變體(此突變體與T9SS的C末端區域相關的信號肽酶相關)。該研究顯示:敲除CTD的突變菌株呈現與mfa5破壞突變體相似的表型,可降低輔助蛋白菌毛的表達。敲除porU突變菌株和敲除CTD突變菌株的Mfa5可以在細胞內積累。這些結果表明,Mfa5具有T9SS的CTD,Mfa5需要轉定位于T9SS外膜上,通過T9SS釋放,隨后進入纖維中。
3.3 脂多糖(lipopolysaccharide,LPS)
LPS是牙齦卟啉單胞菌外壁層中特有的一種化學成分,由核心多糖、O-多糖側鏈和脂質A組成。脂質A是構成內毒素活性的糖脂。LPS又分為O抗原LPS和A-LPS。研究[17]發現,在缺乏A-LPS的wbaP突變體中,CTD蛋白被廣泛裂解為糖基化殘余物;而在野生型中,CTD蛋白在C端處被修飾,并通過肽鍵與含A-LPS的成分結合。該結果表明,A-LPS可對CTD蛋白進行修飾,并且可使CTD蛋白附著于細胞表面。此外,研究者[17]推測,牙齦卟啉單胞菌需通過一種分選酶機制進行T9SS底物修飾和表面附著。
3.4 CPG70蛋白
cpg70(PGN_0335和PG0232)編碼了相對分子質量為6.98×104的CPG70蛋白,CPG70蛋白屬于金屬羧肽-肽酶(metallocarboxy peptidase),它能裂解C端賴氨酸和精氨酸殘留肽。純化的CPG70是cpg70基因編碼的N端和C端截短了相對分子質量為9.15×104的前肽[23]。在小鼠的皮下感染實驗中,cpg70突變體的毒性低于野生型。此外,有研究[24]顯示,RgpA和Kgp的黏附性由CPG70的CTD處理。
3.5 HBP35
hbp35基因編碼的HBP35蛋白擁有硫氧化蛋白的活性,且具有結合海明的作用,對牙齦卟啉單胞菌而言,這也是HBP35細胞表面易位和糖基化的必須條件[16]。
3.6 蛋白質-肽基精氨酸脫亞氨酶(peptidyl-arginine deiminase,PAD)
PAD由pad(PGN_0898和PG1424)基因編碼。通過分析牙齦卟啉單胞菌PAD的生化性質和酶學性質發現,PAD與精氨酸蛋白酶具有類似的性質,即通過增強細菌的生存能力和介導宿主體液防御機制從而促進牙周袋內致病菌的生長[25]。還有研究[26]表明,感染野生型牙齦卟啉單胞菌可顯著增加Ⅱ型膠原蛋白的自身抗體,PAD敲除株則不會引起類似的免疫反應。與PAD敲除株相比,牙齦卟啉單胞菌野生株可加劇小鼠動物模型關節炎的發生,早期即可導致顯著的骨和軟骨破壞,由此推測,牙齦卟啉單胞菌的毒力因子PAD可能是牙周炎與類風濕性關節炎具有相關性的橋梁介質之一[27]。
3.7 Pepk蛋白
pepK(PGN_1416和PG0553)基因編碼Pepk蛋白,通過T9SS分泌錨定在細胞表面,并與A-LPS相結合。外膜組分酶解分析表明,PepK蛋白具有賴氨酸特異性絲氨酸內肽酶活性,pepK的活化經由Rgps處理[28]。
目前有關牙齦卟啉單胞菌T9SS的研究還處于確定具體組分及其可能作用這一階段,尚待進一步研究。然而,隨著T9SS研究的深入,其相關基因及分泌蛋白與牙齦卟啉單胞菌致病機制的關系將越來越明了。對T9SS的了解將有助于更加全面地從分子生物學的角度研究牙齦卟啉單胞菌的毒力,從而對治療牙周疾病的預防和治療開辟新途徑。
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(本文編輯 吳愛華)
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《華西口腔醫學雜志》編輯部
Research progress on the type Ⅸ secretion system of Porphyromonas gingivalis
Zhang Jinmei, Zhao Lei, Wu Yafei.
(State Key Laboratory of Oral Diseases, National Clinical Research Center for Oral Diseases, Dept. of Periodontics, West China Hospital of Stomatology, Sichuan University, Chengdu 610041, China)
Supported by: National Natural Science Foundation of China (81371150); Scientific Research Foundation for the Returned Overseas Chinese Scholars (2013-693-11-11). Correspondence: Wu Yafei, E-mail: yafeiwu@tom.com.
In recent years, the study found that Porphyromonas gingivalis type Ⅸ secretion system (T9SS) is a novel protein secretion system, also known as Por secretion system (PorSS). Unlike the eight protein secretion systems found in the past,the system is a polyprotein complex found only in Bacteroides. The secreted proteins have both N- and C-terminus, where the former includes Sec-dependent typeⅠsignals peptide, and the latter contains conserved domains (C-terminal conserved domain, CTD). Porphyromonas gingivalis T9SS includes proteins such as intima, outer membrane, cytoplasm, and cell cycle,including at least 34 proteins containing CTD. Porphyromonas gingivalis T9SS is involved in regulating associated virulence factors including gingivin, fimbriae, lipopolysaccharide, HBP35, CPG70 protein and peptidyl-arginine deiminase. These CTD-containing virulence proteins are localized by T9SS and then released to the extracellular domain, thereby destroying periodontal tissue. Therefore, this review summarizes the research progress on the T9SS of Porphyromonas gingivalis.
Porphyromonas gingivalis; type Ⅸ secretion system; C-terminal conserved domain; gingipains
R 780.2
A
10.7518/hxkq.2017.05.018
2017-04-02;
2017-07-05
國家自然科學基金(81371150);留學回國人員科研啟動基金(2013-693-11-11)
張盡美,碩士,E-mail:qjzx.zjm.7086@163.com
吳亞菲,教授,博士,E-mail:yafeiwu@tom.com