全基因組預(yù)測(cè)枯草芽孢桿菌BEST195的分泌蛋白

任文來(lái) 韓長(zhǎng)志 劉 通 夏秀芹

(1. 廊坊市文安縣農(nóng)業(yè)局，河北 廊坊 065800；2. 西南林業(yè)大學(xué)云南省森林災(zāi)害預(yù)警與控制重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室，云南 昆明 650224)

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全基因組預(yù)測(cè)枯草芽孢桿菌BEST195的分泌蛋白

任文來(lái)1韓長(zhǎng)志2劉 通1夏秀芹1

(1. 廊坊市文安縣農(nóng)業(yè)局，河北 廊坊 065800；2. 西南林業(yè)大學(xué)云南省森林災(zāi)害預(yù)警與控制重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室，云南 昆明 650224)

枯草芽孢桿菌BEST195作為納豆菌的一種，是納豆生產(chǎn)的重要菌株之一。利用SignalP、ProtComp、TMHMM、Phobius、LipoP、TatP等預(yù)測(cè)程序?qū)υ摼? 456條蛋白質(zhì)序列進(jìn)行分泌蛋白找尋，同時(shí)，對(duì)上述分泌蛋白的氨基酸分布、信號(hào)肽長(zhǎng)度大小、信號(hào)肽切割位點(diǎn)等性質(zhì)進(jìn)行分析。結(jié)果表明：枯草芽孢桿菌含有分泌蛋白102個(gè)，其氨基酸長(zhǎng)度、信號(hào)肽長(zhǎng)度與植物病原菌不同；信號(hào)肽切割位點(diǎn)屬于A-X-A類型，與其他已經(jīng)報(bào)道的植物病原真菌、細(xì)菌以及卵菌中分泌蛋白信號(hào)肽切割位點(diǎn)一致。通過(guò)上述生物信息學(xué)分析方法有效地實(shí)現(xiàn)了枯草芽孢桿菌BEST195分泌蛋白的預(yù)測(cè)，分泌蛋白的信號(hào)肽切割位點(diǎn)具有物種保守型特點(diǎn)。

枯草芽孢桿菌；分泌蛋白；信號(hào)肽；預(yù)測(cè)

枯草芽孢桿菌BEST195 (Bacillussubtilissubsp.nattoBEST195) 為納豆菌的一種，是日本三菱化學(xué)生命研究所從納豆中分離到的重要工業(yè)菌株[1]。納豆菌屬于枯草芽孢桿菌屬，與該屬中其他枯草芽孢桿菌不同，其具有將大豆發(fā)酵為納豆的作用，可以產(chǎn)生較多的多聚γ-谷氨酸(γPGA)，這是形成粘性聚合物的主要組成成分[2]。國(guó)內(nèi)外學(xué)者對(duì)納豆菌的研究主要集中在代謝產(chǎn)物納豆激酶[3]、抗菌作用[4]、微生態(tài)制劑[5]等方面。

目前，學(xué)術(shù)界關(guān)于稻瘟菌[6]、大麗輪枝菌[7]、致病疫霉[8]等植物病原菌的分泌蛋白已經(jīng)明確，并逐漸成為植物病理學(xué)研究的熱點(diǎn)之一。……