王志鵬,景軍紅,周萌
(1.農業部雞遺傳育種重點試驗室,哈爾濱 150030;2.黑龍江省普通高等學校動物遺傳育種與繁殖重點試驗室,哈爾濱 150030;3.東北農業大學動物科學技術學院,哈爾濱 150030)
雞全基因組選擇信號篩選研究進展
王志鵬1,2,3,景軍紅1,2,3,周萌1,2,3
(1.農業部雞遺傳育種重點試驗室,哈爾濱 150030;2.黑龍江省普通高等學校動物遺傳育種與繁殖重點試驗室,哈爾濱 150030;3.東北農業大學動物科學技術學院,哈爾濱 150030)
人工選擇對家雞馴化及品種形成具有重要作用,基因組上留有選擇痕跡。隨著基因組技術和選擇信號檢測方法完善,在基因組上檢測選擇信號成為進化生物學領域研究熱點。文章主要描述選擇信號定義,總結檢測選擇信號的重要統計方法,分析雞基因組選擇信號檢測結果,以期為雞全基因組領域研究提供參考。
雞;基因組;選擇信號
王志鵬,景軍紅,周萌.雞全基因組選擇信號篩選研究進展[J].東北農業大學學報,2016,47(10):100-106.
Wang Zhipeng,Jing Junhong,Zhou Meng.Genome-wide scan of selection signatures in chicken[J].Journal of Northeast Agricultural University,2016,47(10):100-106.(in Chinese with English abstract)
雞起源于雉科原雞屬,家雞簡稱Gallus domes?ticus。研究表明,南亞、東南亞和我國北方地區是重要家雞起源地[1]。原雞經長期自然選擇和人工選擇已產生形態迥異、各具特色的品種,主要包括蛋用型、肉用型、兼用型、觀賞型、藥用型等。雞種選育歷史不同,體型、外貌、羽色及生產性狀方面差異顯著。由于人工或自然選擇干預,生物群體在世代傳遞過程中,某種基因型個體比例變化,基因
組上會相應留下明顯特征,即選擇信號。目前,利用高密度SNP標記、重測序數據等DNA的多態信息已在雞基因組中篩選出多個存在選擇信號區域。……