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埃博拉病毒傳播模型及規(guī)律預(yù)測

2016-11-19 00:18:10褚雨薇管祥善劉琦王煜凱
中國高新技術(shù)企業(yè) 2016年4期
關(guān)鍵詞:模型

褚雨薇 管祥善 劉琦 王煜凱

摘要:埃博拉病毒是一種能引起人類和靈長類動物產(chǎn)生埃博拉出血熱的烈性傳染病病毒。文章以2014年西非疫區(qū)為參照,建立虛擬環(huán)境的常微分方程組,利用四階龍格—庫塔法求解其數(shù)值解,具體通過C語言程序設(shè)計實現(xiàn),并據(jù)此研究埃博拉病毒的傳播規(guī)律,分析隔離措施的嚴(yán)格執(zhí)行和藥物治療效果的提高等措施對控制疫情的作用。

關(guān)鍵詞:數(shù)學(xué)建模;埃博拉病毒;常微分方程組數(shù)值解;四階龍格—庫塔法;西非疫區(qū) 文獻(xiàn)標(biāo)識碼:A

中圖分類號:O175 文章編號:1009-2374(2016)04-0194-03 DOI:10.13535/j.cnki.11-4406/n.2016.04.096

1 模擬真實環(huán)境

埃博拉病毒的自然宿主雖尚未最后確定,但已有多方證據(jù)表明猴子及猩猩等野生非人靈長類動物有埃博拉感染現(xiàn)象。該病毒的傳播途徑分為人畜傳播、人人傳播兩種。2014年,在幾內(nèi)亞、塞拉利昂和利比里亞等國,許多受埃博拉病毒影響的人口都以叢林肉為重要的蛋白質(zhì)和營養(yǎng)物質(zhì)來源,與叢林中動物接觸頻繁。這為人畜之間的病毒傳播創(chuàng)造了條件。

我們現(xiàn)假設(shè)兩個感染埃博拉病毒的虛擬種群:即某地區(qū)內(nèi)的20萬居民和3000只猩猩。人能以一定的概率接觸到所有的猩猩,當(dāng)接觸到有傳播能力的猩猩后有一定概率感染病毒,而人發(fā)病之后與猩猩的接觸可以忽略。人與猩猩的潛伏期都為2周。并在出現(xiàn)疫情41周后模擬外界醫(yī)療力量的介入,使得人類與猩猩不再發(fā)生接觸,且隔離治療人群的治愈率提高到80%。模擬數(shù)據(jù)詳見附錄。

2 建立數(shù)學(xué)模型

2.1 模型假設(shè)

(1)依據(jù)人或猩猩的健康狀態(tài),將人或猩猩劃分為健康者、埃博拉感染者(也稱患病者)、退出者(含自愈者、死亡者);(2)自然封閉條件下,猩猩無自然遷移,故無病源的流入、流出,種群數(shù)量不變。人類數(shù)量龐大,在無大規(guī)模遷移的情況下,認(rèn)為人類數(shù)目為一定值,保持不變;(3)健康者中不包含退出者;(4)人和猩猩自愈后二度感染的概率均為0,人被治愈后二度感染的幾率為0;(5)不存在有效免疫藥物可使人對埃博拉病毒產(chǎn)生免疫,同時猩猩對病毒也不免疫;(6)人的傳染途徑有人傳染人、猩猩傳染人兩條。兩條途徑的傳染率并不相同,分別假設(shè)為傳染率C1和傳染率C2。C1猩猩與猩猩之間傳染途徑只有猩猩傳染猩猩一條,假設(shè)猩猩之間的傳染率為C0;(7)患病人無法傳染患病猩猩;(8)41周外界介入后,猩猩與人的傳播途徑切斷,隔離患者的治愈率提高到80%,同時未被隔離的患者治愈率不變。

2.2 符號說明

符號說明如表1所示:

3 模型的建立與求解

3.1 數(shù)據(jù)處理

根據(jù)累計死亡個體數(shù),求得每周死亡個體數(shù)。同理,根據(jù)累計自愈個體數(shù),求得每周自愈個體數(shù)。由每周仍處于發(fā)病狀態(tài)的個體數(shù)加本周自愈個體數(shù)和本周死亡個體數(shù)得到每周總患病個體數(shù)。

由每周總患病個體數(shù)比總體數(shù)目得到每周患病個體在總體中的比例A(t);由相鄰兩周每周患病數(shù)相減得到每周新增患病數(shù)。由總體個數(shù)減去新增病例累計和獲得健康個體數(shù),并由此得到健康個體在總體中的比例J(t);由累加自愈治愈人數(shù)與累加死亡人數(shù)得到退出者總數(shù)量,并由此得到退出者在總體中的比例T(t)。

由于埃博拉病毒的潛伏期是兩周,所以任意一周的新增病例是兩周前處于患病狀態(tài)的個體傳染的。由新增病例數(shù)比兩周前處于患病狀態(tài)的個體數(shù)得到該周埃博拉病毒傳染率,由此計算出每一周的傳染率。通過MATLAB繪圖,我們得到其近似曲線為一條平行于X軸的曲線,所以通過加權(quán)平均求得平均傳染率。

因為人類最初患病個體不可能為人類傳染所致,所以兩周內(nèi)出現(xiàn)的患病者必為由猩猩傳播而來的。最初兩周,人每周新增的患病個數(shù)除以處于兩周前患病狀態(tài)的猩猩個數(shù)得到猩猩與人之間平均傳染率C1。

兩周之后人患病可由猩猩和人傳播兩種途徑導(dǎo)致,猩猩每周處于患病狀態(tài)的數(shù)量和C1已知,所以每周由猩猩傳播導(dǎo)致人患病的數(shù)量可求出,用每周新增患病人數(shù)減去每周猩猩傳播導(dǎo)致人患病的數(shù)量,即每周由人傳染導(dǎo)致的患病數(shù)量。由每周人傳染導(dǎo)致的患病數(shù)量除以兩周前未被隔離處于患病狀態(tài)的人數(shù)可得到每周埃博拉人與人之間傳染率C1,通過MATLAB畫出C2的圖像,可以發(fā)現(xiàn)其圖像為平行于x軸的曲線,可通過加權(quán)平均求出人與人之間平均傳染率C2。

死亡率是由本周死亡個數(shù)比本周總病例數(shù)得到。我們由此求得每一周的死亡率。通過MATLAB繪圖我們得到一條同樣近似平行于X軸的曲線,所以通過加權(quán)平均,求得疫情穩(wěn)定后平均死亡率。

每周處于未隔離的患者人數(shù)處于每周的處于患病狀態(tài)的總?cè)藬?shù)可得到每周的未隔離率G,其圖像為平行于x軸的曲線,通過加權(quán)平均求出平均未隔離率G。

同理,我們還得到疫情穩(wěn)定后的平均自愈及治愈率。我們近似地認(rèn)為,在病情爆發(fā)后不久,即疫情穩(wěn)定后,周感染率、周死亡率、周治愈自愈率、周未隔離率都是常值。

3.2 埃博拉病毒的傳播模型

由假設(shè)知,猩猩患病只能由猩猩傳播。每個患病猩猩每周可使得只的健康猩猩變?yōu)榛疾⌒尚桑苫疾⌒尚蓴?shù)量得每周共有只健康猩猩被感染。即患病猩猩的增加率,又因為每周自愈的猩猩數(shù)目為,死亡的猩猩數(shù)目為,所以猩猩患病數(shù)隨時間變化滿足:

同理,我們得到人類的傳播模型(由前述,所有腳標(biāo)為2的符號均為人類相關(guān)數(shù)據(jù),腳標(biāo)為1的符號為與猩猩相關(guān)數(shù)據(jù)):

3.3 模型求解

通過聯(lián)立方程組和數(shù)據(jù)處理,我們使用四階龍格—庫塔法分別求出人和猩猩群體中健康者和患病者的比例的數(shù)值解。

通過C程序設(shè)計編譯程序求解模型所用常微分方程組的數(shù)值解。該程序在前四十組解得檢驗中擬合程度極高,故由此得到較為可靠的預(yù)測數(shù)據(jù)。C語言程序代碼詳見附錄。

數(shù)據(jù)擬合如下:

3.4 建立使用免疫藥物后的模型

未被隔離患者的治愈率和被隔離患者的治愈率加權(quán)平均后得到患者的平均治愈率Zh。1-Zh為死亡率與未被治愈率之和。默認(rèn)死亡率與未被治愈率權(quán)重不變。在(1-Zh)中,可以算出死亡率的權(quán)重和未被治愈率的權(quán)重。在嚴(yán)格控制人類與黑猩猩接觸并使用特效藥后的數(shù)學(xué)模型如下:

將之與隔離前模型對照后發(fā)現(xiàn),特效防疫藥物的使用極大地提高了治愈率Zh,快速地降低了患病數(shù)。而隔離黑猩猩的措施將黑猩猩傳染致病人數(shù)降為0。

綜上,兩種措施都有效地預(yù)防了疾病的進(jìn)一步擴散,抑制了疾病的傳播,使患病人數(shù)的增長率由正變負(fù),從而導(dǎo)致患病數(shù)在短期內(nèi)大量且持續(xù)減少。

4 模型的評價與推廣

4.1 模型優(yōu)勢

(1)種群數(shù)量較小時,通過求解比例的變化得出結(jié)果較為精確;(2)可以動態(tài)地描述種群發(fā)病率、死亡率、自愈率、治愈率、傳染率等多種特征量;(3)四階龍格—庫塔法通過數(shù)值求解常微分方程組,很好地擬合了給定的原始數(shù)據(jù)。

4.2 模型缺陷

(1)由于通過比例而非數(shù)量求解,所以當(dāng)種群數(shù)量較大且比例變化不明顯時誤差較大;(2)認(rèn)為兩個“虛擬種群”內(nèi)部個體總數(shù)在隨時間變化時基本不變,未考慮個體總數(shù)的時間變化率。

5 附錄

5.1 模擬數(shù)據(jù)

模擬數(shù)據(jù)如表2所示:

5.2 C語言程序代碼

參考文獻(xiàn)

[1] 李信真.計算方法[M].西安:西北工業(yè)大學(xué)出版社,2013.

[2] H.Nishiura,G.Chowell.EARLY TRANSMISSION DYNAMICS OF EBOLA VIRUS DISEASE(EVD)[J].WEST AFRICA,2014,(8).

[3] 甄西豐.實用數(shù)值計算方法[M].北京:清華大學(xué)出版社,2006.

[4] 劉來福,何青.用Maple和MATLAB解決科學(xué)計算問題[M].北京:高等教育出版社,1999.

(責(zé)任編輯:王 波)

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