弓雪 姜敏 齊欣
摘要:蔗糖轉運蛋白(sucrose transporters,SUCs或SUTs)是蔗糖裝載、卸載、分配的重要載體,ZmSUT4是玉米低親和、高轉運能力SUT4亞族的唯一成員。以黃早四ZmSUT4全長cDNA序列為模板,設計帶有限制性內切酶位點的特異性引物,PCR擴增獲得正向、反向2個片段,將反向、正向片段雙酶切后依次插入pGreen-HY104植物表達載體中,從而構建由35S啟動子調控的ZmSUT4基因RNA干擾(RNAi)的植物表達載體HY104-A-S,然后通過凍融法將載體質粒轉入含有pSoup質粒的農桿菌EHA105中。ZmSUT4基因RNAi的植物表達載體的構建為研究ZmSUT4基因的功能奠定了基礎。
關鍵詞:玉米;ZmSUT4基因;RNAi植物表達;載體構建
中圖分類號:S513.03;Q782 文獻標志碼: A 文章編號:1002-1302(2016)07-0042-03
玉米的籽粒產量主要取決于籽粒形成過程中成熟葉片(源)光合產物的生產、韌皮部的運輸(流)以及在籽粒(庫)中的積累。光合產物的分配運輸是植物體內源、流、庫相互協調的結果,源足、庫大、流暢是高產的基礎[1-2]。目前對源、庫的特性研究較多,但是由于受研究方法和條件等限制,如對DNA序列了解的限制,對流的了解還相當不足。研究發現,隨著種植密度增加,收獲指數快速下降,表明在較高密度條件下,流對產量的限制作用在增加[3]。流包括韌皮部的裝載、篩管中運輸、韌皮部卸出和同化物的重新吸收。蔗糖作為高等植物光合同化物運輸的主要形式,也是聯系源庫之間主要的糖類[4]。細胞膜上的蔗糖轉運蛋白(sucrose transporters,SUCs或SUTs)承擔著蔗糖從源細胞的外運、韌皮部的裝載和卸載,以及向庫細胞的裝入功能,從而影響蔗糖的運輸方向、速率和分配,其基因表達受多種環境因子的調控。ZmSUT4是玉米體內唯一的高蔗糖轉運能力SUT4亞族成員,在植物體內的蔗糖運輸和分配過程中發揮著不可替代的重要作用。但是,關于玉米SUT4的研究才剛剛起步,李志鵬僅利用逆轉錄PCR(RT-PCR)技術檢測ZmSUT4在玉米籽粒灌漿期花柄、籽粒等庫器官的表達情況,未構建RNA干擾載體,分析ZmSUT4表達被抑制對植株生長發育及相關基因表達的影響[5]。本研究利用ZmSUT4基因的全長cDNA序列,構建ZmSUT4基因RNA干擾載體,為進一步研究ZmSUT4基因的生理效應及作用機制奠定基礎,也為研究其他SUTs基因的功能提供參考。
1 材料與方法
1.1 材料與試劑
所用玉米材料為玉米優良自交系黃早四。
KAPA Hifi高保真DNA聚合酶,購自美國KAPA Biosystems公司;T4-DNA連接酶、限制性內切酶,購自NEB公司;植物總RNA提取試劑盒、Quantscript RT Kit(cDNA第1鏈合成試劑盒)、質粒小提試劑盒以及瓊脂糖凝膠回收試劑盒,購自北京TIANGEN公司;pEASY-T、大腸桿菌DH5α,購自北京全式金生物技術有限公司;DNA marker DL2000,購自TaKaRa公司。引物合成和測序由上海立菲生物技術有限公司完成。Taq酶、卡那霉素(Kan)、利福平(Rif)等試劑,購自生工生物工程(上海)股份有限公司。植物表達載體pGreen-HY104質粒及含有pSoup質粒的農桿菌EHA105,均由國家玉米改良中心徐明良實驗室提供。
1.2 試驗方法
1.2.1 玉米ZmSUT4基因cDNA序列的獲得 利用植物總RNA提取試劑盒提取黃早四幼苗總RNA,利用反轉錄試劑盒獲得黃早四全長cDNA序列。
1.2.2 干擾片段的選擇及引物設計 根據NCBI(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/)上已發表的玉米ZmSUT4基因的全長cDNA序列,選擇該序列上的特異片段及表達載體pGreen-HY104的限制性內切酶酶切位點,并設計引物。分別在5′端加上PstⅠ-EcoRⅠ、BamHⅠ-XhoⅠ酶切位點,引物序列為:F:5′-GCTGCAGAATTCGTCTGGAAACTCTTTGTGGGT-3′;R:5′-CGGATCCTCGAGCTCCTGTAACTTTTATTCATTGCT-3′。預期擴增片段長度為219 bp。
1.2.3 干擾片段的擴增 以全長cDNA序列為模板進行PCR擴增。反應條件為:熱啟動;94 ℃ 5 min;94 ℃ 30 s,60 ℃ 30 s,72 ℃ 30 s,共30個循環;72 ℃ 10 min。PCR產物經1%瓊脂糖凝膠電泳檢測后,無非特異性條帶,則直接進行后續試驗。
1.2.4 RNA干擾(RNAi)植物表達載體的構建 將PCR產物連接到T載體,獲得T-ZmSUT4,將T-ZmSUT4轉化大腸桿菌DH5α,于37 ℃暗培養12~16 h,進行藍白斑篩選;挑取白色單菌落,進行PCR檢測,將含有目標克隆的單菌落于 37 ℃ 搖菌過夜,送公司測序。提取包含正確序列T載體的質粒,用XhoⅠ、EcoRⅠ雙酶切表達載體pGreen-HY104、T-ZmSUT4質粒,回收酶切產物;用T4-DNA連接酶過夜連接,將干擾片段反向插入表達載體中,得到HY104-A,用其轉化大腸桿菌,Kan抗性篩選目標克隆,提取質粒驗證;用BamHⅠ、PstⅠ酶切載體HY104-A、T-ZmSUT4,回收酶切產物,過夜連接得到HY104-A-S(圖1),轉化大腸桿菌,Kan抗性篩選目標克隆,提取質粒,用EcoRⅠ進行驗證。
1.2.5 RNAi植物表達載體轉化農桿菌EHA105 采用凍融
法[6]將構建好的RNAi植物表達載體HY104-A-S轉化含有pSoup質粒的農桿菌EHA105感受態細胞,涂于含有Rif(50 μg/mL)、Kan(100 μg/mL)的LB固體培養基上,28 ℃暗培養2 d。挑取陽性菌落,進行菌落PCR鑒定。
2 結果與分析
2.1 干擾片段的PCR擴增
以玉米ZmSUT4基因的cDNA序列為模板,利用攜帶酶切位點的特異引物進行PCR擴增,電泳檢測擴增產物。由圖2可知,本試驗得到219 bp的片段。將該片段與T載體連接后轉化大腸桿菌DH5α,菌落經PCR鑒定后,將陽性克隆送公司測序,測序結果與黃早四cDNA序列完全一致(圖3)。
2.2 RNAi表達載體的構建
提取T-ZmSUT4、pGreen-HY104載體的質粒,用 XhoⅠ、EcoRⅠ對2種質粒進行雙酶切,結果見圖4,膠回收連接后轉化到大腸桿菌DH5α中,Kan抗性篩選目標克隆,對菌落進行PCR鑒定。提取正確克隆的質粒HY104-A,利用BamHⅠ、PstⅠ酶切載體HY104-A、T-ZmSUT4,結果見圖5。回收酶切產物,連接后得到HY104-A-S,轉化大腸桿菌,Kan抗性篩選目標克隆,提取質粒驗證,利用EcoRⅠ酶切該質粒,預測應得到約1 000 bp的小片段。圖6電泳結果與預期一致,表明植物表達載體HY104-A-S構建正確。
2.3 表達載體轉化根瘤農桿菌
分別以陽性對照質粒HY104-A-S和含有表達載體的農桿菌菌落為模板,利用特異性引物進行PCR擴增。經1%瓊脂糖凝膠電泳鑒定表明:含有表達載體的農桿菌菌液所得條帶正確(圖7),表明HY104-A-S載體質粒已轉入含pSoup質粒農桿菌EHA105中。
3 討論
RNA干擾(RNA interference,RNAi)是指內源或外源的雙鏈RNA(double-stranded RNA,dsRNA)高效特異性降解與
其高度同源的mRNA,有效地阻斷目的基因的表達,從而獲得功能缺失的突變體,因此該技術可作為研究基因組功能、創造分子育種新材料的有效手段。目前,RNA干擾技術已在玉米、水稻、大麥、小麥、大豆和馬鈴薯等作物中成功應用[7-13]。Wesley等研究發現,雙鏈RNA的長度影響目的基因的沉默效率,干擾片段長度在98~853 bp之間時基因沉默效率較高[14-15]。此外,在插入的正向與反向干擾片段之間應有適當長度的間隔序列,以便RNAi表達載體在轉入玉米后形成含有發夾結構的dsRNA,進而干擾ZmSUT4基因的表達。
Chincinska等利用RNA干擾技術研究發現,與野生型植株相比,馬鈴薯StSUT4-RNAi植株源葉中蔗糖輸出增加,促使蔗糖、淀粉在塊莖等庫器官大量積累,進而引起塊莖產量增加[16-17]。本研究成功構建了玉米ZmSUT4基因的RNAi植物表達載體,不但為探究ZmSUT4基因表達在源庫互作中的功能奠定了基礎,還為進一步研究蔗糖運輸、分配的調節機制提供理論依據,也為利用轉基因技術調節蔗糖的運輸、分配,從而提高玉米籽粒產量提供參考。
參考文獻:
[1]王文靜. 不同穗型冬小麥籽粒灌漿期源庫強度及其與淀粉積累的關系[J]. 作物學報,2004,30(9):916-921.
[2]王玲玲,杜吉到,鄭殿峰,等. 大豆源庫流關系的研究進展[J]. 大豆科學,2009,28(1):167-171.
[3]關義新,凌碧瑩,林 葆,等. 高產春玉米群體庫及源庫流的綜合調控[J]. 沈陽農業大學學報,2000,31(6):537-540.
[4]Saint Pierre C,Peterson C J,Ross A S,et al. Winter wheat genotypes under different levels of nitrogen and water stress:changes in grain protein 40 composition[J]. Journal of Cereal Science,2008,47(3):407-416.
[5]李志鵬. 玉米蔗糖轉運載體(ZmSUT2和ZmSUT4)的基因克隆及其功能鑒定[D]. 北京:北京師范大學,2006:45-50.
[6]Sambrook J,Fritsch E F,Maniatis T. Molecular cloning:a laboratory manual[M]. 3rd ed. Cold Spring Harbor Laboratory Press,1989:19-22.
[7]Cigan A M,Unger-Wallace E,Haug-Collet K. Transcriptional gene silencing as a tool for uncovering gene function in maize[J]. The Plant Journal,2005,43(6):929-940.
[8]Miki D,Itoh R,Shimamoto K. RNA silencing of single and multiple members in a gene family of rice[J]. Plant Physiology,2005,138(4):1903-1913.
[9]Gil-Humanes J,Pistón F,Hernando A,et al. Silencing of γ-gliadins by RNA interference (RNAi) in bread wheat[J]. Journal of Cereal Science,2008,48:565-568.
[10]Kasai M,Kanazawa A. RNA silencing as a tool to uncover gene function and engineer novel traits in soybean[J]. Breeding Science,2012,61(5):468-479.
[11]周曉嬰,付三雄,陳搖松,等. 甘藍型油菜CRABSCLAW基因克隆及其RNA干擾載體的構建[J]. 江蘇農業學報,2015,31(4):737-742.
[12]楊瑪麗,趙統敏,余文貴,等. 轉基因RNAi技術在番茄研究中的應用[J]. 江蘇農業學報,2015,31(1):217-221.
[13]楊瑪麗,張保龍,郭佳茹,等. RNAi和GroEL介導的雙價轉基因番茄對TYLCV的抗性[J]. 江蘇農業學報,2014,30(5):1102-1108.
[14]Wesley S V,Liu Q,Wielopolska A,et al. Custom knock-outs with hairpin RNA-mediated gene silencing[J]. Methods in Molecular Biology,2003,236:273-286.
[15]Wesley S V,Helliwell C A,Smith N A,et al. Construct design for efficient,effective and high-throughput gene silencing in plants[J]. The Plant Journal,2001,27(6):581-590.
[16]Chincinska I A,Liesche J,Krügel U,et al. Sucrose transporter StSUT4 from potato affects flowering,tuberization,and shade avoidance response[J]. Plant Physiology,2008,146(2):515-528.
[17]Chincinska I,Gier K,Krügel U,et al. Photoperiodic regulation of the sucrose transporter StSUT4 affects the expression of circadian-regulated genes and ethylene production[J]. Frontiers in Plant Science,2013,4(2):26.