金針菇凝集素基因Fv-mJRL1的生物信息學(xué)分析及其共表達

陳仁良,王　威,嚴俊杰,熊宏民,謝寶貴

(福建農(nóng)林大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院菌物研究中心,福建福州350002)

金針菇凝集素基因Fv-mJRL1的生物信息學(xué)分析及其共表達

陳仁良,王威,嚴俊杰,熊宏民,謝寶貴*

(福建農(nóng)林大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院菌物研究中心,福建福州350002)

摘要：Jacalin凝集素(jacalin-related lectins,JRLs)是一類含有一個或多個JRL結(jié)構(gòu)域的蛋白質(zhì),參與生物或非生物環(huán)境刺激應(yīng)答．本研究基于金針菇(Flammulina velutipes)基因組數(shù)據(jù),注釋篩選到其中一個JRL基因Fv-mJRL1,對其基因結(jié)構(gòu)、蛋白質(zhì)性質(zhì)進行了生物信息學(xué)分析,并利用其上游調(diào)控序列進一步預(yù)測到該基因潛在的轉(zhuǎn)錄因子Fv-Mbp1．通過實時熒光定量PCR分析得知,無論是在不同栽培基質(zhì)培養(yǎng)的金針菇菌絲還是在金針菇各發(fā)育時期的組織中,Fv-mJRL1基因與潛在的轉(zhuǎn)錄因子基因Fv-Mbp1之間都存在極強的共表達規(guī)律．生物信息學(xué)及實時熒光定量PCR分析為篩選挖掘基因潛在的轉(zhuǎn)錄因子提供便利,后期仍需利用下游分子實驗進行更為精確的驗證．

關(guān)鍵詞：jacalin凝集素;子實體形成;潛在轉(zhuǎn)錄因子;皮爾森相關(guān)系數(shù)

金針菇營養(yǎng)豐富且味道鮮美,具有很高的食用和藥用價值,是我國和東南亞地區(qū)重要的商業(yè)性栽培食用菌．金針菇屬低溫結(jié)實性食用菌,菌絲生長適宜溫度為20～23 ℃,原基形成適宜溫度為3～18 ℃[1]．菌絲營養(yǎng)生長結(jié)束之后,需要低溫處理刺激原基形成,但這種低溫刺激影響金針菇結(jié)實的分子機理尚不清楚．Jacalin凝集素(jacalin-related lectins,JRLs)作為植物凝集素超家族中新發(fā)現(xiàn)的家族,是能夠與植物來源的糖類化合物……