白鷺MHCⅡDABⅠ基因第二外顯子的多態性與進化

李　力，羅斯特，林清賢，2，陳小麟，2*

( 1．廈門大學生命科學學院，2．廈門大學環境與生態學院，濱海濕地生態系統教育部重點實驗室，福建廈門361102)

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白鷺MHCⅡDABⅠ基因第二外顯子的多態性與進化

李力1，羅斯特1，林清賢1，2，陳小麟1，2*

( 1．廈門大學生命科學學院，2．廈門大學環境與生態學院，濱海濕地生態系統教育部重點實驗室，福建廈門361102)

摘要:克隆測序白鷺( Egretta garzetta) 5個種群138份個體組織樣本的主要組織相容性復合體Ⅱ類B基因( MHCⅡDAB Ⅰ)第二外顯子( exon2)序列，分析探討exon2的多態性、進化選擇、系統關系和種群遺傳結構．主要結果如下:白鷺MHC ⅡDABⅠexon2序列長度為270 bp，共計定義了139個等位基因;序列分析顯示exon2有101個核苷酸變異位點( 37．4%)和31個氨基酸變異位點( 34．4%) ;基于貝葉斯法構建的系統樹顯示白鷺MHCⅡDABⅠexon2有5個高支持率的譜系;肽結合位點( PBR)、非肽結合位點( non－PBR)的非同義替換率( dN)和同義替換率( dS)比值計算顯示，PBR的dN/dS為1．99 ( p＜0．05)，而non－PBR的dN/dS則略小于1( p＞0．05)，表明白鷺MHCⅡDABⅠexon2受到正選擇作用;根據等位基因在群體中的分布頻率作分子方差分析( AMOVA)，得到群體間分化指數( F(ST))為0．194 1( p＜0．000 1)，提示白鷺MHCⅡDABⅠexon2存在顯著的種群遺傳結構分化．

關鍵詞:白鷺;主要組織相容性復合體( MHC) ;遺傳變異;進化;系統關系;種群結構

主要組織相容性復合體( major histocompatibility complex，MHC)是一類與免疫密切相關的基因家族，廣泛存在于脊椎動物體內，負責編碼細胞表面糖蛋白，在機體免疫和自身免疫耐受的形成過程中起著重要的作用［1－2］．當抗原進入機體后，MHC分子可與之結合而被T細胞受體識別，進而激發機體產生特異性免疫反應;根據其化學結構、功能……