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對瀘寧雞黑羽烏骨家系生長發育性狀的聚類分析

2015-12-31 12:43:50陳兆賢敖學成熊應龍方元麗
四川畜牧獸醫 2015年2期
關鍵詞:分析

熊 斌 ,鄭 璐 ,陳兆賢 ,敖學成 ,熊應龍 ,方元麗

(1.四川省冕寧縣畜牧局,四川 冕寧 615600;2.西昌學院,四川 西昌 615000;3.四川省涼山州畜牧局,四川 西昌 615000;4.四川省涼山州原生農業綜合開發有限責任公司,四川 冕寧 615602)

1 材料與方法

1.1 分析材料 從瀘寧雞擴繁群后代中選擇黑羽烏骨雞組成家系繁育群,按公母1∶10比例采用人工授精配種,在相同孵化飼養條件下,孵化出雛后在脫溫舍飼養35d,35 d后轉到育成舍飼養到90 d,90 d后采用林間放養,飼養到19周齡,然后隨機抽樣測定相關指標作為分析材料。

1.2 測定內容與分析方法 按農業行業標準NY/T 823-2004家禽生產性能名詞術語和度量統計方法,測定體尺體重指標:胸深(X1)、胸寬(X2)、龍骨長(X3)、脛長(X4)、盆骨寬(X5)、脛圍(X6)、體斜長(X7)、體重(X8);利用 Excel和 SPSS軟件,分別進行性狀描述分析、相關分析、主成分分析,獲取主成分值進行聚類分析,分類后按樣本分類作類間性狀方差比較分析。

2 結果與分析

2.1 體重體尺性狀的統計分析 體重體尺數據列表1。從表1可看出各性狀平均值的參數指標與中位數均較接近,表明性狀均值有代表性。各性狀峰度值在-0.02~0.8之間,偏度值在-0.22~0.51之間,各性狀最大值與最小值經處理相差比率在36.10%~183.40%之間,說明各性狀分布離差較大,群體中存在性狀的明顯差異,表型值遺傳差異明顯,存在明顯的可選擇性。

表1 樣本體重體尺性狀的統計分析 cm、g

2.2 主成分分析

2.2.1 性狀相關分析。樣本相關系數列表2,從表2可看出,除胸寬與脛長的相關性較弱,龍骨長與脛長的相關性顯著(P<0.05)外,其余性狀間的相關系數均達到極顯著水平(P<0.01)。說明體重與體尺相關性狀間呈正相關關系,選擇體尺大的將會影響體重性狀和相關性狀的提高。

表2 樣本相關系數

2.2.2 主成分荷載與特征值貢獻率。從表3可知,按不低于85%累計特征值貢獻率算,前4個主成分的

表3 主成分特征值及貢獻率

特征值分別是4.810、0.907、0.682和0.557,方差貢獻率分別是60.121%、11.343%、8.529%和6.957%,累計貢獻率達到86.949%。主成分分析可以將多指標問題轉化為較少的新的指標,從而獲得許多重要信息,并包含樣本的主要信息。此例提取的4個主成分已包含了樣本主要信息,可取代樣本的綜合指標。

2.2.3 依據主成分分析原理,可用提取的主成分荷載進行主成分因子判斷,主成分荷載系數詳見表4。

表4 主成分荷載系數

第一主成分中8個性狀荷載系數在0.451~0.923之間,其中最大的荷載系數是體重(0.923),其次是體斜長(0.884)。當體重大時相應的體斜長等指標會更大,體重會更重,因此第一主成分可定義為體斜長生長發育因子。

第二主成分中突出較大的荷載系數是脛長(0.825),表明當脛長越長時,個體體重會更大,因此可定義為脛長因子。

第三主成分中較大的荷載系數是胸寬(0.537),其次是脛圍,當胸寬較大時,胸圍相應會更大,其個體體重也會更大,可定義為胸寬因子。

第四主成分中較大的荷載系數是并列的胸寬(0.362)和脛長(0.310),當胸寬和脛長同時較大時,將對個體體重產生影響。鑒于第二主成分為脛長因子、第三主成分為胸寬因子,可將第四主成分定義為胸寬脛長互補因子。

綜上分析可知,4個主成分代表的主要因子——體斜長生長發育因子、脛長因子、胸寬因子和胸寬脛長互補因子,是影響黑羽瀘寧雞的主要性狀因素。

2.3 聚類分析 利用所獲得的主成分值進行聚類分析(見聚類成員表5),可將樣本聚為4個大類,按分類性狀進行方差分析(結果列表6)。從表6可看出,各類間性狀中,龍骨長、脛圍類間差異不顯著(P>0.05),胸深、胸寬、脛長、骨盆寬、體斜長類間差異達到極顯著(P<0.01),體重類間差異顯著(P<0.05)。分別命名為第1、2、3因子的性狀——體長、脛長、胸寬類間差異極顯著,說明與影響體重性狀的因子是吻合的。

表5 聚類成員

通過分類性狀排序比較(見表7)可看出,四個類中1類所有性狀為最小,排序均居4;2類、3類與4類的體重相似(平均僅差1.33g和23.63g),在2類中體斜長排序為1,表明和提取主成分的因子命名相吻合,因此按2、4類群性狀特點進行選擇,個體體重會更大,而與此相關的性狀——體斜長、脛長、胸寬等指標將會更大,可見具有選擇意義。

表6 分類性狀比較分析

表7 分類性狀排序比較

3 結論

通過對瀘寧雞黑羽烏骨家系后代進行主成分和聚類分析,揭示出了瀘寧黑羽烏骨雞的選育依據,可初步得出以下結論:

3.1 利用提取主成分最大荷載提供的命名因子,可知影響瀘寧雞黑羽烏骨家系個體體重的主要性狀是體斜長、脛長和胸寬。

3.2 主成分分析所提取的4個主成分,完全包含了樣本的主要信息,可取代樣本的綜合指標;以2、4類群性狀的表現特點作為選育依據,可提高以群體體重為主的綜合性狀。

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